• 我要登录|
  • 免费注册
    |
  • 我的丁香通
    • 企业机构:
    • 成为企业机构
    • 个人用户:
    • 个人中心
  • 移动端
    移动端
丁香通 logo丁香实验_LOGO
搜实验

    大家都在搜

      大家都在搜

        0 人通过求购买到了急需的产品
        免费发布求购
        发布求购

        筛选miRNA的靶基因

        user-title

        dxy_l1y15rd2

        请问怎么从下载的一个microRNA的靶基因数据中筛选参与肿瘤转移的基因呢?

        wx-share
        分享

        3 个回答

        user-title

        dxyc42u

        有帮助

        首先通过已有文献报道,进行整理大量可信的“靶基因”(尽量选择影响因子高的文献、样本量大)。经NCBI查找基因编码的NM号(注意物种)。根据您自己的科研目的,选择基因序列中的某一段进行研究。之后进入Snpper网站进一度查找到该基因相对应的NM号,进一步可查到该靶基因的研究序列中的多个点突变位点,可获得该位点的RS号,可在Hapmap网站得到进一度的验证,可查看该位点的突变频率。这样就可以筛到相对可靠的位点啦!

        user-title

        汤姆卜丽波

        有帮助

        你可以在肿瘤转移相关数据库中获取基因矩阵,然后和你的基因取交集做韦恩图

        user-title

        loveliufudan

        有帮助

        从下载的microRNA靶基因数据中筛选参与肿瘤转移的基因,可以采用以下方法:

        1.利用肿瘤转移相关的基因数据库,如OncoTarget、OncoLnc、Cancer Gene Census等,查询靶基因是否为肿瘤转移相关基因。

        2.阅读相关文献,查询靶基因在肿瘤转移过程中的作用及其机制。

        3.使用肿瘤转移相关的基因表达资源,如TCGA、GEO等,查询靶基因在肿瘤组织中的表达情况。

        4.使用肿瘤转移相关的基因网络数据库,如STRING、KEGG、Reactome等,查询靶基因与肿瘤转移相关基因之间的关系。

        这些方法都可以帮助你更好的筛选参与肿瘤转移的基因。

        ad image
        提问
        扫一扫
        丁香实验小程序二维码
        实验小助手
        丁香实验公众号二维码
        扫码领资料
        反馈
        TOP
        打开小程序