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        敲除基因后的基因组与野生型基因组如何比对序列?

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        Lee1D7B

        我最近在做敲除实验,敲了很多基因。然后将敲除突变株的基因组做了测序,如何更加快速的查看和比对敲除株跟野生型基因组的差异,从而检查是否出现移码突变等问题?谢谢大佬们!!!

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        3 个回答

        user-title

        Eason老歌迷

        有帮助

        可以通过pcr鉴定的方式来确定。也可以用dna序列软件,进行测序结果与野生型序列进行比对,如果发生非3倍数的indel,则说明该细胞系在基因组水平上已经实现了敲除。

        user-title

        bamboopiggy

        有帮助

        你用软件将测序结果与原始的genomic dna进行比对就可以,看缺了几个碱基,只要不是3的倍数就可以

        user-title

        天一湖医者

        有帮助

        敲除组野生型组和对照组的区别在于根据生存环境不同来做相应对照。一个是通过pcr鉴定的方式来确定,一个通过基因敲除的方法来定性的。

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