用细菌基因组如何分析次级代谢产物？

你可能还会用到次级代谢产物预测网址：https://fungismash.secondarymetabolites.org

可进行细菌、真菌以及植物次级代谢产物的预测。

两种筛选方法：

建基因组随机突变文库 可以用Tn5等转座子插入 看那个突变体不能产你要的代谢产物了 那它的插入位点肯定是和代谢物合成相关的。

或者建质粒文库 把你的微生物基因组随机打碎 连接到质粒载体上去 转入一个不能产这种代谢物的菌株中 看那个克隆可以获得生产这种代谢物的能力 那转入的片段肯定是和代谢物合成相关的。

我找到一个帖子，你可以参考：https://www.sohu.com/a/228784975_761120

微生物次级代谢产物基因簇预测

基因组分析工具包 PRISM ，它可预测基因组编码的非核糖体化学结构。