如何进行肿瘤组织免疫浸润分析？

分析要点

免疫基因集富集情况的比较

免疫细胞评分比较

免疫细胞类型在不同分组中对预后的影响

免疫调节剂基因表达比较

重要免疫特征分布分组比较

使用TCGA数据库肿瘤免疫细胞浸润分析

分析思路：

TCGA数据库下载

CIBERSORT这个软件分析的输入文件

使用免疫细胞矩阵绘图

做免疫细胞的生存分析，并做临床相关性分析、

结合免疫细胞与临床进行分析

1.可用ihc、if评估肿瘤中浸润免疫细胞的种类和数量；2.可分离til，通过计数，比例，分群，免疫细胞vs肿瘤重量等指标反映免疫细胞的浸润