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科研学霸天团,48小时有问必答
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我想请问一下对于糖蛋白组学的数据如何分析呢?
huarenqiang5
这个一般需要专业的数据分析软件进行分析,可以使用GlycanFinder 软件试试。
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问
蛋白组学的组织样品需要进行怎样的处理?
土井挞克树
需要裂解,提取组织匀浆,然后进行组织蛋白组学
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问
组织里的病毒属于低丰度,蛋白组学能够检测出来吗?
土井挞克树
可以的,只要达到一定的浓度值就能够检测出来
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问
蛋白理化分析都有哪些指标及方法?
dxy_mqg1dtg8
1. 分子量:可以通过SDS-PAGE、MALDI-TOF MS、ESI-MS等方法来测定蛋白质的分子量。2. 含量:可以通过BCA、Bradford、Lowry等方法来测定蛋白质的含量。3. 等电点:可以通过IEF、色谱等方法来测定蛋白质的等电点。4. 构象:可以通过CD、FTIR、荧光光谱、X射线晶体学等方法来测定蛋白质的构象。5. 热力学性质:可以通过DSC、ITC等方法来测定蛋白质的热力学
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问
蛋白提取时样品中蛋白的均一性不好怎么办
dxy_mqg1dtg8
可以尝试以下几种方法:1.细胞破碎条件的优化:细胞破碎是蛋白提取的关键步骤,可以选择适当的细胞破碎方法和条件。常见的方法包括超声波破碎、冻融破碎、高压破碎等。不同的样品可能需要不同的破碎方法和条件,因此可以尝试优化细胞破碎条件,如破碎时间、温度、破碎缓冲液的配比等,以提高蛋白的均一性。2.添加蛋白质稳定剂:蛋白质稳定剂可以帮助维持蛋白的稳定性和均一性。常用的蛋白质稳定剂包括蛋白酶抑制剂、还原剂和胺
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问
如何提高bca测蛋白浓度的标准曲线的R值
dxy_mqg1dtg8
以下是一些提高BCA测蛋白浓度标准曲线R值的方法:1. 充分混合工作试剂:在进行BCA测定时,工作试剂的各个成分需要充分混合均匀,否则可能会影响测定结果的准确性和可重复性。因此,在使用BCA试剂盒时,需要充分摇匀工作试剂,确保各个成分均匀混合。2. 优化标准曲线的制备:标准曲线的制备对于BCA测定结果的准确性和可重复性至关重要。为了提高标准曲线的R值,可以优化标准品的浓度和数量,以及标准曲线的拟合
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问
有没有用于生信分析专用的蛋白质组学测序相关的公共数据库?
土井挞克树
可以试一下这个数据库ProteinData Bank
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问
目前单细胞的蛋白质组学测序分析有哪些常用的方法?
dxy_mqg1dtg8
1. 质谱技术:质谱技术是目前最为常用的单细胞蛋白质组学技术之一。最近,研究人员开发了一种称为SLIM(single-cell proteomics by mass spectrometry)的技术,可以在单个细胞中检测到超过500个蛋白质。此外,研究人员还利用微流控技术和质谱技术,开发出了一种名为SCoPE-MS(single-cell proteomics by multiplexed seq
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问
转录组的误差如何通过数据统计规避
土井挞克树
可以在数据分析阶段通过加权的方式进行统计规避
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问
BG11可以用来培养的藻有哪些
土井挞克树
硅藻和浮游藻都可以用bg11来培养
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问
求助铁死亡抑制剂Erastin和RSL3?
于小鱼鱼1998
一般是从0.01的浓度开始,一直可以加到O.1ug/ml
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问
科研技术
于小鱼鱼1998
可以上KEGG数据库进行查询,这个数据库是常用的通路上下游信号分子查询库
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问
求助TEV蛋白酶菌株或者质粒求助TEV蛋白酶菌株或者质粒
土井挞克树
我们实验室可以提供tev质粒。
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问
转染中的氮磷比是氮和磷的什么比,如何计算?
于小鱼鱼1998
氮磷比是指氨氮和总磷的质量比,其计算公式为:氮磷比=NH3-N/TP
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问
新合成化合物的荧光标记
于小鱼鱼1998
可以将抗原和荧光先孵育,连接为共同体之后再与化合物进行连接,从而建立化合物荧光标记
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问
A2780细胞转染
sswei
可以尝试以下几种方法:1. 更换质粒:可能是因为质粒本身的问题导致转不进去。可以尝试更换另一种质粒,以确保其质量和兼容性。2. 优化转化条件:转化条件如质粒浓度、农杆菌菌液浓度、转化时间、转化温度等,都可能影响转化效果。可以尝试调整这些条件,以优化转化过程。3. 使用不同类型的转化方法:如果一种转化方法不成功,可以尝试使用其他类型的转化方法,如电转化、lipofectamine等。4. 检查菌种状
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问
外泌体体外实验用量
loveliufudan
在进行外泌体的细胞实验时,外泌体的用量确实是一个需要优化的重要参数:1. 外泌体的用量没有固定的标准,需要根据不同来源的外泌体自身含量和活性来决定。一般初步实验可以选择添加10-100μg/ml外泌体开始试验,观察其对受体细胞的影响。2. 过量外泌体确实可能会抑制正常细胞的增殖。外泌体中的信号分子或RNA等可能会改变受体细胞基因表达,进而影响增殖。所以用量需要慎重优化。3. 文章中很少具体提及外泌
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问
Illumina基因ID号怎么读取基因名
高山云初
1. 利用数据库进行转换2. 利用API进行转换3. 利用本地文件进行转换
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问
处理后总蛋白减少 可以说明信号通路被抑制吗
feixue7758527w
应该是被抑制了,处理后总蛋白变得少,说明信号通路是被抑制,导致蛋白表达变少的。这个说法还是有道理的。
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问
心肌细胞分化试剂盒-赛默飞
土井挞克树
你看一下是不是一次放的细胞太多,减少点细胞用量
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