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构建细胞类型图谱是单细胞转录组数据分析的主体内容，但其仍然停留在“描述性研究”的范畴，难免让人感觉意犹未尽。想要在分子层面解释疾病发生的机制，就需要对数据进行更深入的探索。这当中，细胞通讯分析就是一个很好的方向。今天小编借助CellChat工具为大家介绍细胞通讯分析的使用方法、真实案例和注意事项。细胞通讯（cell communication）是指细胞接收、处理和传递与环境和自身的信号的能力，它是每个生物体（如细菌、 ...

在某一项研究中，我们可以通过测序或质谱获得实验组和对照组序列信息，进而获得基因表达量。但生物功能的执行往往涉及多个基因或蛋白的相互作用，实验者通常更希望在分子途径或其他功能相关的基因分组的层面上提出问题，仅对基因功能进行描述远无法满足人们的需求。在此需求的基础上，ORA、GSEA、ssGSEA应运而生，但这三者在应用范围(Table1)原理等方面有所不同，接下来，小编会对三者的原理和结果进行一个简单介绍。Tab ...

近年来，单细胞测序的快速发展极大推进了我们对生物系统的认知。这项技术的巨大潜力促使计算生物学家开发了一系列的分析工具，但大部分分析工具要求编程背景。今天，小编为大家介绍一款免费且几乎不需要编程背景，即可实现单细胞分析的工具，cellxgene。Cellxgene有两个产品，cellxgene data portal用于探索已发表的数据；cellxgene desktop用于探索个人单细胞数据。小编主要对cellxgene ...

新冠肺炎仍在肆虐，给全球的医疗和公共卫生系统带来沉重负担。新冠重症的病死率高，已累计夺走了数百万人的生命。事实上，导致病人死亡的直接因素，不是病毒本身，而是细胞因子风暴（cytokine storm）造成的多器官衰竭1。中性粒细胞被认为是细胞因子风暴的驱动因素之一，过度激活的中性粒细胞会导致高细胞因子血症（hypercytokinemia），以及肺部损伤2。临床上常常使用免疫抑制剂来控制细胞因子风暴。地塞米松（dex ...

提到单细胞测序，相信各位小伙伴们都很熟悉，真是又爱又恨的一个技术啊，爱它既能帮助我们解决很多科研问题，同时也是对它的价格暗暗咬牙；大家莫慌，今天小编就给大家一个神器——单细胞混样测序，让大家用小经费就能轻轻松松发表5分左右的文章。单细胞Mix（混样）测序产品是基于10x Genomics和BD Rhapsody平台，利用寡核苷酸偶联的抗体孵育不同的样本，为不同的样本标记上不同的标签，然后将多个样本混合在一起，按照单一样本 ...

虽然单细胞测序到现在已经应用到各个研究领域，但是实际的实验过程中依然会遇到很多问题，比如：1.很多样本根本没有办法制备单细胞悬液，比如已经在-80℃冻存的样本；2.有些样本制备成单细胞悬液以后现有的单细胞测序平台无法捕获，比如心肌细胞、骨骼肌细胞、成熟的脂肪细胞等，由于直径过大，超出了10x genomics和BD Rhapsody平台最大能捕获的细胞直径；3.再者有些细胞类型可能在单细胞悬液制备的过程中丢失，比如脑部的 ...

10x Visium空间转录组测序针对FFPE样本的实验已经开展有一段时间了，今天小编就来总结一下整个实验的详细流程。首先来一张实验流程导图：10xVisium FFPE的实验流程FFPE样本Visium空间转录组技术流程（图片引自10x官方）一、取材FFPE样本取材要求组织不要大于6.5mundefined6.5mm，因为10x visum的每张切片的捕获区域只能容纳6.undefined6.5的组织大小，≤6.5 x 6.5 mm的组织块可与Visium Spat ...

1、变性温度和时间：模板 DNA 和 PCR 产物的变性不充分是 PCR 失败的主要原因。适宜的变性条件是 95℃ 30s 或 97℃15s。变性不完全，DNA 双链会很快复性，因而减少产量。在变性中，温度太高或反应时间过长，会导致酶活性的损失。Taq DNA 聚合酶活性的半寿期：92.5℃为 2h 以上，95℃为 40min，97℃为 5min。2、复性温度和时间：复性温度决定 PCR 的特异性，而引物退火温度和所需时间长短取决于反应体系中的基本组成及扩增引物的长度和浓度，实际使用的退火温度要比扩增引物的 Tm 值低 5℃。增加退火温度会增加引物的识别，同时可降低引物 3 端核苷酸的错误延伸。因此，提高退火温度，特别是在前几个循环中，会增加扩增的特异性。而且为了在循环开始获得最高的特异性，应在第一次变性之后，引物退火之前加入 Taq DNA 聚合酶。复性时间一般为 30～60s。3、延伸温度和时间：引物延伸温度一般为 72℃，延伸的时间决定于扩增模板的长度，小于 1kb 的片段一般 1～2min，而 10kb 的片段可能需要 15min 或更长时间。不合适的延伸温度不仅会影响扩增产物

人CD3+T淋巴细胞阳性分选原理及注意事项一、细胞分选方法概述细胞学研究中一个很重要的课题就是细胞的分离纯化，尤其是需要对某种特定的细胞进行功能研究，如对细胞培养上清液通过ELISA分析检测细胞因子、细胞共培养检测细胞功能等，都需要得到高纯度的目的细胞。因此，高效地分离所需要的目的细胞是进行细胞功能研究的先决条件。细胞分选（cell sorting）是指根据细胞所具有的特性把某种特定的细胞亚群从混合的细胞样品中 ...

Western Blot 实验 通过SDS-PAGE胶将不同的分子量的蛋白分离开，将目标蛋白转移到PVDF膜上，再利用抗原抗体的特异性结合，用特异性的一抗结合目标蛋白，用HRP标记的二抗结合一抗，再加以ECL发光液显色，检测目的蛋白在不同处理的样本中表达量的高低变化服务优势及实验服务流程：1、利用高性能试剂配合高通量全自动western blot机，提供超高灵敏性的western blot实验服务。超高灵敏度最低至15飞克抗原。 ...

实验动物基础知识之实验常用大小鼠实验动物小课堂开课啦~~实验用小鼠01、C57BL/6小鼠来源： 1921年立特(Little)用艾比·拉特洛坡(Abby Lathrop)的小鼠株，雌鼠57号与雄鼠52号交配而得C57BL，将毛色呈黑色的进行固定，培育成的产物。1937年Little将维持的C57BL第六组亚系定名为C57BL/6，将第十组亚系定名为C57BL/10，继而分别维持至今。1985年从日本实验动物中央研究所引引 ...

心肌缺血再灌注模型： 心肌缺血是指心脏血液灌注减少，导致心脏供氧减少，心肌能量代谢不正常，不能支持心脏正常工作的一种病理状态。冠心病是临床常见的缺血性心脏病，是指冠状动脉发生粥样硬化引起管腔狭窄或闭塞，导致心肌缺血缺氧或坏死而引起的心脏病，临床以血运重建治疗为主。然而，目前大量研究结果显示，缺血心肌组织恢复血流供应后，心肌受损程度仍可能进一步加重，对心肌造成二次损害，缺血再灌注（I/R）损伤心肌可占全部梗死心肌面积的 ...

脑卒中是由于脑部血管突然破裂或因血管阻塞导致血液不能流入大脑而引起脑组织损伤的一组疾病。中医上称之为“中风”。由于其发病率高、死亡率高、致残率高、复发率高及并发症多的特点，使用医学界把它同冠心病、癌症并列为危害人类健康的三大疾病之一。为什么脑卒中被称之为“中风”? 因发病急骤，症见多端，病情变化迅速，与风之善行数变特点相似，故名中风、卒中。1.症状 脑卒中最常见症状为一侧脸部、手臂或腿部突然感到无力，猝然昏扑、不省人事，其他症状 ...

癌症已经成为影响人类健康的重要疾病，发病率呈现逐年上升趋势，癌症研究领域中公认的缺陷之一是缺乏能够研究癌变和癌症治疗的模型系统。在过去的几十年中，抗肿瘤治疗药物的研发呈现爆炸式的增长，但是绝大多数新疗法都不能顺利通过III期临床试验，其主要原因就是缺乏合适的体内模型。我们常用的人类肿瘤细胞系或患者源性肿瘤移植到免疫缺陷小鼠体内的肿瘤动物模型，使用人类肿瘤细胞系建立的动物模型称作肿瘤细胞系异种移植模型（Ca ...

恶性肿瘤的主要生物学特性之一是转移性，建立与临床表现相近的动物模型是研究的关键环节。人体肿瘤移植于裸小鼠建立人癌异种移植动物模型为深入研究提供了可能。原位移植可为人体肿瘤生长提供相似的微环境，更利于肿瘤恶性行为的表现，因此，大多采用原位移植的方法建立肿瘤转移动物模型。 根据我们多年的肿瘤模型构建经验，为大家介绍几种我们常遇到的几种肿瘤模型构建方法，以供参考。一、人肝癌原位移植模型 将人肝癌细胞株（如：HepG2等）传代 ...

制片前处理类别服务项目备注说明制片前处理石蜡包埋包埋1块固定后组织按客户要求取材，脱水，包埋成蜡块（进口石蜡）特殊包埋（细胞、材料、眼球等）包埋1块包埋要求难度较高(含特殊位置取材)石蜡组织芯片阵列点位包埋客户提供供体蜡块及标本信息软化（肝硬化、皮肤结痂、植物等）1块标本软化较为坚硬组织软化处理骨组织脱钙（小）1块标本脱钙最大面≤2cm²骨组织脱钙骨组织脱钙（大）1块标本脱钙最大面＞2cm²骨组织脱钙骨组织EDTA脱钙 ...

小鼠视网膜铺片及免疫荧光染色 在研究血管性视网膜疾病时，由于小鼠眼球较小，不便于进行眼底血管的直接观察。病理切片染色是诊断及评判的金标准，但该方法只能观察切面形态。视网膜铺片是研究血管性视网膜疾病的常用方法。下面介绍详细操作流程：第一步：心脏灌流固定小鼠麻醉后，仰卧位固定小鼠四肢, 剪开胸腔，充分暴露心脏，在心尖左旁2 mm处用输液针头刺入并剪开右心耳, 迅速灌注生理盐水100mL, 肝肠变白表明灌注成功, 旋转输液开关, 再灌入多聚甲醛溶 ...

根据我们多年来进行实验研究的体会，积累有关正常实验动物的各种生物学数据资料是很有实用价值的。现将我们实验室积累的资料和有关文献上的资料加以汇总，编制成表，按正常实验动物一般生物学数据、生理学数据、生化学数据和脏器重量、长度及其他数据等顺序排列。常见实验动物的生物血数据参考值--大小鼠小鼠大鼠成年体重♂20～40♂200～280（g）♀18～35♀180～250寿命（年）2～43～5染色体2n=402n=42体温（℃）37～37 ...

骨质疏松动物模型及卵巢切除术 骨质疏松是指全身性骨量减少及骨组织微结构改变，骨密度和骨质量降低，从而引起骨强度下降和骨脆性增加，导致极易发生骨折的一种常见的和全身性的骨代谢疾病。其症状表现为疼痛，主要，以腰背痛最为多见，其次是身长缩短、驼背，严重者可见骨折。 骨质疏松动物模型的制备方法较多，涉及的实验动物种类也很多，最常用的方法是雌性大鼠卵巢切除后诱发骨质疏松动物模型。其机理是模拟人类女性绝经后雌激素缺乏导致骨代谢紊 ...

发展现状 骨缺损是由于严重创伤、感染、骨肿瘤切除及各种先天性疾病等原因导致的骨结构完整性破坏，是目前骨科疾病领域一大挑战。兔构建骨缺损模型是目前骨组织工程学研究的常用方法。与大小鼠等啮齿类动物不同，兔具有与人类相似的骨骼哈弗氏系统，骨架大小适中，便于手术操作，且相对于犬、小型猪等大动物成本低。下面介绍骨缺损模型构建方法及要点：一、实验动物选择：实验兔年龄的选择是后期骨缺损愈合状况的一个重要因素。新西兰兔在18~20周 ...