相信很多朋友都经历过临床数据缺失,看着一个个空白的格子束手无策。其实在临床试验中,病例脱落导致数据缺失是十分常见且难以避免的。在尽量避免不必要的数据缺失的同时,还应掌握了相应的缺失数据处理方法。 一、为什么会产生「缺失数据」?临床试验中的缺失数据一般是由于受试对象在试验中因依从性差、不良事件或疗效不佳等原因提前退出试验造成的;也可能是因为采集标本或测量过程中因样本量不足或灵敏度不够所造成的疗效指标缺失;也可能是在数据记录或整理过程中造成的数据丢失等。 二、缺失数据有哪些类型? 1. 完全随机缺失(missing completely at random,MCAR)是指缺失数据的产生完全独立于可观察到和不可观察到的数据,其发生的比例不会依赖于受试者的特点,理论上不会给试验结果带来偏倚,数据分析时可仅分析现存数据。例:因受试者搬家或出差等所造成的失访脱落。2. 随机缺失(missing at random,MAR)是指缺失数据的产生独立于不可观察到的数据,但会与可观察的数据有关。受试者在试验中因不良事件或因疗效不佳而脱落,而不良事件发生和疗效不佳并不是完全随机发生,可能与其他因素相关,这些
读研究生的同学,无论是硕士生还是博士生,都离不开科研实验。我们通过千辛万苦,得到了数据,这时候可不要以为万事大吉了,重头戏在后面呢——整理实验数据。今天,笔者就来分享一下自己整理数据的一点经验吧~ 一、「完整全面」地记录数据实验数据必须完整全面地记录,实验时间、实验步骤、实验结果缺一不可。好记性不如烂笔头。不要对自己的记忆过度自信,觉得记在心里就好了,等到准备写论文的时候面对一堆数据一脸茫然,这是什么,这又是什么...实验时间一定要写实验往往不是一次就可以都得到理想的结果,很可能需要重复,重复,再重复,这时候日期就非常重要了。遥想当年,笔者刚开始做实验的时候,有一个实验重复了 5、6 次,原始数据是 Excle 。当时,笔者对自己的记忆过分自信,觉得心里记住了就可以了,所以没有记录日期。结果几个月后想要写论文的时候,发现记忆早已经模糊,根本不记得哪个数据是自己所需要的,所以只能哭着把数据又全部分析了一遍……实验步骤一定要写作为实验狗,笔者做实验前,尤其是新实验(哪怕是实验室师兄师姐已经做了 N 遍的实验)先尽可能的写清楚实验步骤(Protocol)。能写多细写多细,细到别人照着可以完全
亲爱的护理伙伴们,作为一名科研路上的新手,你是否经常望统计学而生畏,觉得统计是你科研路上最大的拦路虎?但笔者想说,统计学在咱们护理科研中并不是最难的部分,与研究设计相比,统计学还是属于比较简单的。接下来,笔者就将自己学习统计学的经验分享给大家,希望对为此发愁的你有所帮助! 一、在文献阅读中学习文献阅读是科研写作的基石,平常咱们阅读的文献主要分为三大类:综述、横断面研究以及试验性研究。对于后两类文献,统计部分必不可少。通过长期阅读的积累,常用统计学方法有哪些并如何加以选择,你会逐渐了然于胸。在日常的文献阅读中,我们可以这样做:1、阅读专业领域的顶级期刊 顶级期刊的文章无论是研究设计还是统计学部分的描述都比较严谨,有很多地方值得我们去学习。图片来源:作者笔记截图笔者选取了发表在《中华护理教育》期刊上的《音频指导居家盆底肌锻炼对压力性尿失禁孕产妇产后盆底康复的效果评价》文章,通过介绍该文章中涉及的统计学方法,来具体讲解如何在阅读中学习统计学。接下来,笔者将通过如下示例进行介绍:图片来源:作者笔记截图图片来源::作者笔记截图图片来源::作者笔记截图这篇文章中的统计学方法主要有 t 检验、c2
「丁香实验」致力于帮助科研人轻松科研,在丁香实验小程序上线后,已经汇集上万条实验 protocol、常见操作问答、科研方法文章、线上直播课程等。在2022年下半年,我们希望能够更加深入校园,让更多的校科研er们,知道我们丁香实验,同时也希望给在校的科研er们带来一份不错的额外收入,所以校园兼职计划来啦~校园兼职要做什么 校园兼职是丁香实验在校园的代理人,主要工作内容为:完成丁香实验小程序的校园推广工作~你将会获得一份不错的现金回报和一场还不错的实践经验;ps、校园推广还处于新生阶段,我们期待你除了基础的推广工作,还能参与校园推广的持续优化。我们希望你1、身为科研人或者熟悉学校实验室科研的小伙伴们;2、充足的时间及开放的态度;3、了解及认可丁香实验;兼职报名方式扫码添加主编微信,说明兼职即可丁香实验小程序10000+实验 protocol
一、导读大脑老化是痴呆和神经退行性疾病的根源,给家庭和社会带来巨大负担。前期对模式生物的系统性研究表明适当的外界干预能够逆转包括大脑在内的多种组织的生物学衰退。例如,年轻血浆的输注可使老年大脑恢复活力并恢复记忆功能。然而,大脑受到了脑屏障的保护,这在一定程度上可能会限制这些干预措施的获取,进而阻碍它们的功能效应。 脑脊液(Cerebrospinal fluid, CSF)与脑细胞密切相关,它携带信号,指导发育过程中神经元祖细胞的增殖和特异性。然而,脑脊液蛋白组成会随着人类年龄的增长而变化,表现为炎症蛋白的增加和脑源性神经营养因子等生长因子的减少。不过,脑脊液中的这些变化是否与年龄相关的认知能力下降有关尚不清楚。 2022 年 5 月 11 日,来自斯坦福大学医学院神经学与神经科学系的科研团队在国际顶级期刊 Nature 发表了题为 Young CSF restores oligodendrogenesis and memory in aged mice via Fgf17 的研究性文章,他们发现将年轻的脑脊液直接注入衰老的大脑可以明显改善记忆功能,其中少突胶质细胞对这种恢复最敏感,他们
南宋爱国诗人陆游曾言「我得宛丘平易法,只将食粥致神仙」,指出清淡饮食有助于延年益寿。早在一个世纪前,西方科学家发现通过降低卡路里的摄入能够显著地延长动物的寿命。延年益寿、青春永驻是人类对于生命的热爱的体现,是追求永生的美好愿望,引起无数科研工作者的研究兴趣。 2022 年 5 月 5 日,霍华德休斯医学研究所研究员 Joseph Takahashi 及其团队在 Science 杂志发表研究论文 Circadian alignment of early onset caloric restriction promotes longevity in male C57BL/6J mice。 这项最新的研究表明,在正常能量摄入基础上减少 30%~40% 的卡路里限制饮食可以让小鼠的寿命延长 10%。但如果将进食时间只限制在夜间(小鼠最活跃的时间),可大大延长低热量饮食小鼠的寿命,整体寿命延长了 35%。这一结果强调了身体的日常节律在「少吃可助于长寿」效应中起着重要的作用 ! 图 1. 来源 Science 一、限制热量摄入延长寿命取决于进食时间以往研究发现,在保证营养摄入且无饥饿情况,通过降低
2022 年 5 月 12 日,曹彬和王健伟教授团队在《柳叶刀-呼吸病学》(The Lancet Respiratory Medicine)发表一项关于新冠住院患者出院 2 年随访结果研究,关注新冠肺炎长期影响。 该研究纳入 2020 年 1 月 7 日至 5 月 29 日期间武汉金银潭医院的 1192 名新冠住院患者,并分别在出院后 6 个月、1 年和 2 年进行随访。 研究结果表明:无论最初的疾病严重程度如何,患者的身体和心理健康都会随着时间的推移而改善。随访 2 年时,出院康复者中至少出现 1 种新冠肺炎长期影响的比例为 55%(650/1190),相较于 6 个月时明显下降(68%,777/1149),其中疲劳或肌肉无力最常见的症状。随访 6 个月时,存在呼吸困难(mMRC 评分≥1)比例为 26%(288/1104),到 2 年时这一比例明显降低至 14%(168/1191);存在焦虑或抑郁症状比例从 6 个月时 23%(256/110)降低至 2 年时的 12%(143/1191)。与普通人群相比,新冠康复者在初次感染 2 年后的健康状况往往较差,这表明一些患者需要更多时
常言道,天将降大任于斯人也,必先苦其心志,劳其筋骨,饿其体肤,空乏其身,行拂乱其所为。适当的压力,能给个人的成长带来好处,最近的一项研究表明,细胞承受「压力」时可能也是如此…… 随着全球人口老龄化,越来越多的人被诊断为阿尔茨海默症,该疾病给无数家庭带来沉重的经济和心理负担,然而目前并未有疗效良好的药物。阿尔茨海默病的病理特征是错误折叠蛋白质的堆积,淀粉样蛋白和 tau 蛋白会形成聚集体,对大脑神经细胞造成不可逆的损伤。 2022 年 5 月 6 日,剑桥大学英国痴呆症研究所 Edward Avezov 博士领导的团队在 Nature Communications 杂志发表研究论文 Stress-induced protein disaggregation in the endoplasmic reticulum catalysed by BiP。该研究揭示,当细胞被要求生产大量的蛋白质时,它们会感到「压力」,这种「压力」通过拆开聚集体使其正确地折叠,有助于防止阿尔茨海默症中常见的蛋白质缠结的堆积。 若能寻找一种方法唤醒该机制,使细胞在压力状态下促使蛋白聚集体拆解并正确地折叠,则为攻克阿
细胞协调生物合成和分解代谢途径的活动,以及成分的吸收和分泌,以维持适当的分子组成。在持续增殖的细胞中,这些过程是协调的,使得所有细胞成分在每个细胞周期中翻倍,而分化细胞可能会改变其组成,以匹配其功能。 麻省理工学院(MIT)的研究人员注意到,细胞在进入细胞分裂时,会损失大约 4% 的质量,这意味着细胞在分裂前可能会进行一些清理,将似乎不再需要的分子排出体外。这一发现以 Single-cell monitoring of dry mass and dry mass density reveals exocytosis of cellular dry contents in mitosis 为题发表在近日的 Elife 上。 图 1 研究成果(图源:Elife) 研究内容为了更好地了解有丝分裂细胞的生长和成分变化,研究人员开发了一种监测单细胞干质量(即总质量 - 水质量)、干体积(即总体积 - 水体积)和干质量密度(即干质量 / 干体积)的新方法。 测量细胞的干质量,通常使用定量相显微镜完成,但它不会揭示有关干质量的生物分子组成的信息,并且很难用于悬浮生长的细胞。而 MIT 团队开发的新方
肌腱是人体运动和力学传递的关键组织,胶原纤维占比 95%,成熟胶原原纤维具备独特的直径大小不一的特点(平均直径 150nm),而损伤后由纤维化、直径均一的疤痕细纤维替代(平均直径 50nm),无法再恢复到粗纤维,导致肌腱无法再生,而胚胎肌腱胶原也由细纤维构成,结构与疤痕纤维类似,但可以成熟变成粗纤维(图 1)。 肌腱损伤和由此产生的肌腱病占运动系统疾病的 30%,对人们生活质量,社会生产力和医疗支出方面造成巨大损失。目前肌腱纤维成熟变粗的关键肌腱细胞亚群与机制并未有相关研究。因此,明确肌腱的细胞亚群和胶原纤维纳米水平构建机制,可望发现关键靶点和实现肌腱的亚显微结构再生。 在此背景下,浙江大学陈晓课题组于 2022 年 4 月 26 日在 Cell Reports 杂志上发表了题为 A Cd9+/Cd271+ stem/progenitor population and the SHP2 pathway contribute to neonatal-to-adult switching that regulates tendon maturation 的研究论文,首次明确了肌腱纤维成熟的
北京时间 5 月 7 日,中国科学院深圳先进技术研究院合成生物学研究所、深圳合成生物学创新研究院钟超课题组在 Science 子刊 Science Advances 上发表题为 Photocatalyst-mineralized biofilms as living bio-abiotic interfaces for single enzyme to whole-cell photocatalytic applications 的研究论文。 该研究利用工程改造的大肠杆菌生物被膜原位矿化作用,构建了一个全新的生物-半导体兼容界面,并基于此实现了从单酶到全细胞尺度上可循环光催化反应,为可持续半人工光合体系的构建提供了一种新的思路。钟超课题组副研究员王新宇和上海科技大学博士生张继聪为文章共同第一作者,钟超研究员为唯一通讯作者。 文章截图(文章链接:https://www.science.org/doi/10.1126/sciadv.abm7665) 随着全球能源和环境问题的不断加剧,可再生清洁能源的开发,特别是太阳能的转化利用吸引了全球研究人员的关注。半人工光合作用是近年来诞生的新兴研究领
1、引物最好在模板 cDNA 的保守区内设计DNA 序列的保守区是通过物种间相似序列的比较确定的。在 NCBI 上搜索不同物种的同一基因,通过序列分析软件(比如DNAman)比对(Alignment),各基因相同的序列就是该基因的保守区。2、引物长度一般在 15-30 碱基之间引物长度(primer length)常用的是 18-27bp,但不应大于 38bp,因为过长会导致其延伸温度大于74℃,不适于 Taq DNA 聚合酶进行反应。3、引物 GC 含量在 40%~60% 之间,Tm 值最好接近 72℃GC 含量(composition)过高或过低都不利于引发反应。上下游引物的 GC 含量不能相差太大。另外,上下游引物的 Tm 值(melting temperature)是寡核苷酸的解链温度,即在一定盐浓度条件下,50% 寡核苷酸双链解链的温度。有效启动温度,一般高于 Tm 值 5-10℃。若按公式 Tm=4(G+C+2(A+T)估计引物的 Tm 值,则有效引物的Tm为 55-80℃,其 Tm 值最好接近 72℃ 以使复性条件最佳。 4、引物 3' 端要避开密码子的第 3 位如扩增编
中暑是一种由热应激引起的危及生命的疾病,与循环衰竭和多器官功能障碍有关。如果全球变暖持续下去,中暑可能会成为世界范围内更突出的死亡原因,但其致病机制尚不清楚。 2022 年 5 月 5 日,中南大学吕奔团队在 Science 在线发表题为 Z-DNA binding protein 1 promotes heatstroke-induced cell death 的研究论文,该研究发现 Z-DNA 结合蛋白 1 (ZBP1),一种 Z-核酸受体,通过触发受体相互作用蛋白激酶 3 (RIPK3) 依赖性细胞死亡来介导中暑。 热应激通过热休克转录因子 1 (HSF1) 增加 ZBP1 的表达,并通过独立于核酸感应作用的机制激活 ZBP1。ZBP1、RIPK3 或混合谱系激酶域样 (MLKL) 和 caspase-8 的缺失降低了热应激诱导的循环衰竭、器官损伤和致死率。因此,ZBP1 似乎具有协调宿主对热应激反应的第二个功能。 临床上,中暑的特征是极度高热、全身炎症反应、循环衰竭、出血和凝血障碍,以及热相关细胞毒性、炎症和弥散性血管内凝血 (DIC) 之间复杂相互作用导致的多器官功能障碍。
日前,北京大学生命科学学院魏文胜课题组在 Cell 杂志上在线发表题为“Circular RNA Vaccines against SARS-CoV-2 and Emerging Variants”的研究论文。 魏文胜团队首先建立了体外高效制备高纯度环状 RNA 的技术平台,针对新型冠状病毒及其变异株,设计了编码新冠病毒刺突蛋白(Spike)受体结构域(RBD)的环状 RNA 疫苗。 该项研究中制备的针对新冠病毒德尔塔变异株的环状 RNA 疫苗(circRNARBD-Delta)对多种新冠病毒变异株具有广谱保护力。 新冠病毒 circRNA 疫苗研发示意图 一、首创环状RNA制备平台作为近几年兴起的突破性医学技术,mRNA 疫苗的基本原理是通过脂纳米颗粒(LNP)将 mRNA 导入体内来表达抗原蛋白,以刺激机体产生特异性免疫反应。2019年底新冠肺炎疫情(COVID-19)暴发后,针对性的 mRNA 疫苗(ModernamRNA-1273; Pfizer/BioNTechBNT162b2)在多种疫苗类型中脱颖而出。mRNA 疫苗的修饰及递送技术均产生于国外机构,制约了我国 mRNA
1953 年,沃森(James Dewey Watson)和克里克(Francis Harry Compton Crick)揭示了 DNA 双螺旋结构,自此开启现代分子生物学波澜壮阔的历史。1968 年,阿尔伯(Werner Arber)、内森斯(Daniel Nathans)和史密斯(Hamilton Othanel Smith)发现了如同精准的手术刀、切割特定 DNA 片段的限制性核酸内切酶,从此拉开了 DNA 编辑技术的序幕。1985 年,穆斯利(Kary Mullis)发明聚合酶链式反应,即体外特异性地大量扩增核酸序列的 PCR 技术。 上述三大了不起的发现均荣膺诺贝奖,随着科学技术车轮缓缓向前,基因编辑技术在此基础上应运而生! 自 20 世纪 90 年代以来,一系列基因编辑工具,如锌指核酸酶(ZFN)、转录激活因子样效应蛋白核酸酶(TALEN)、CRISPR 系统及单碱基编辑技术等基因编辑技术,被用以对基因组进行定点修饰。其中 CRISPR 系统及单碱基编辑技术更是在基因组编辑领域掀起了一场真正的革命! 然而,这些基因编辑工具在面对线粒体 DNA 的编辑时,却显得有心无力。2
癌症治疗中,有一类方法通过造成广泛的 DNA 损伤,可以使癌细胞失活并死亡,这类方法被称为基因毒性疗法。其中,放射治疗是标准肿瘤治疗中应用最广泛的基因毒性疗法。 放射治疗中的能量辐射会引发 DNA 广泛损伤,通常以双链断裂(double-strand breaks, DSBs)、单链断裂(single-stranded breaks,SSBs)和 DNA 链间交联的形式出现。这些损伤可能对细胞造成不可修复的损伤,触发细胞死亡或细胞周期退出。 然而,在临床上,癌症放疗的耐药性仍然是癌症治疗中相当大的障碍,因为癌细胞部署了一系列机制,以减轻放疗造成的损伤,但我们对这些机制尚不完全了解。 2022 年 4 月 28 日,丹麦哥本哈根大学生物技术研究与创新中心的 Claus Storgaard Sørensen 实验室在 Science 杂志发表研究论文 Cancer cells use self-inflicted DNA breaks to evade growth limits imposed by genotoxic stress,该研究为癌症放疗耐药性背后的机制提供了一种新的见解。
睡眠缺乏是全世界关注的公共健康问题。据世界卫生组织报道,全球约有27% 人口存在睡眠障碍。大量研究证明睡眠不足与糖尿病、高血压、心血管疾病以及肥胖等全身疾病相关,严重影响人类身心健康。在中国,成年人失眠的发病率高达 38.2 %。更令人震惊的是,有六成以上青少年存在睡眠不足。 4 月 28 日,厦门大学医学院眼科研究所、福建省眼科与视觉科学重点实验室刘祖国教授和李炜教授团队在 Cell 出版社旗下的 Stem Cell Reports 杂志在线发表其最新研究成果 Sleep Deprivation Induces Corneal Epithelial Progenitor Cell Over-Expansion through Disruption of Redox Homeostasis in the Tear Film,揭示睡眠不足对角膜上皮干细胞的危害。 图片来源:Stem Cell Reports 人们都说「眼睛是心灵的窗户」,而角膜则是眼睛的窗户。角膜表面的复层上皮细胞不断更新,维持角膜的高度透明和表面光滑,并防止外界微生物的入侵。人类角膜上皮细胞增生的源泉就是处于角膜缘的角
跨膜蛋白及药物研发跨膜蛋白作为细胞膜的重要组成部分, 在物质运输、信号转导和细胞间识别等多种细胞功能中发挥着重要作用。其功能异常往往会导致疾病的发生,这使它们成为理想的药物作用靶点。目前以跨膜蛋白为药物靶点占现阶段己知药物靶点的60%以上。而针对抗体药靶点,膜蛋白几乎占90%以上。跨膜蛋白在物质运输、信号转导和细胞间识别等多种细胞功能中发挥重要作用抗原制备尽管有着重大的意义,针对跨膜蛋白的药物开发仍然具有很大的挑 ...
做过病理实验的人都知道,实验看似容易,但真想把它做好,还是需要花上很长一段时间去积累和摸索经验。我从事病理实验已有 6 年多了,在这段时间里,我做过许许多多病理相关实验,刚开始啥也不懂,一味按照网上操作流程来做,但做的结果往往并不是十分理想,最终结果未能达到预期的效果。经过一段时间的浏览和学习,在论坛内学习、请教,并结合实践操作,我经历了初级——查找资料和摸索方法;中级——问题求助和不断总结;高级——难题解答和经验分享这三个阶段,也学到了不少知识,积累了很多宝贵经验,与大家一起分享。一、石蜡切片和冰冻切片的比较?1、要求做冰冻切片的不一定能做石蜡切片,这是我向一老师请教得出的结论。因为作石蜡切片时要高温烤片,可能会破坏组织的抗原性,如果组织的抗原性较稳定,则可作石蜡切片;但是要求做石蜡切片的,可作冰冻切片。2、冰冻切片的优点是能够较好的保存组织的抗原免疫活性,做免疫组化时不需抗原修复这一步。缺点是细胞内易形成冰晶而破坏细胞结构,可能会使抗原弥散;切片厚度较石蜡的厚,做的片子没石蜡的漂亮。当你买一抗时,目录上都写着做什么样的切片,如果它写着只能做冰冻,就不能做石蜡,如写着两者都可,那就都
1 血浆稳定性研究的意义1.1 血浆稳定性研究的重要性在药物发现过程中,先导化合物的代谢稳定性(包括肝代谢稳定性和血浆稳定性等)是影响其成药性的关键因素。在药物研发案例中,很多先导化合物都存在稳定性差的问题,而很多具有良好药理活性的化合物由于不够稳定最终导致研发失败而终止。因此,代谢稳定性研究是寻找候选药物过程中不可或缺的一项重要内容。尽管化合物的肝代谢稳定性被普遍认为是药物发现过程中所面临的最主要的挑战之一,但是 ...

