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基因芯片包含哪些基因序列

基因芯片目前最主要的有三种:表达谱芯片,SNP检测芯片和致病菌检测芯片。 表达谱芯片主要用于研究病变(或处理过的)组织与正常组织之间的基因差异表达。得到相关的差异表达基因,从而对差异表达基因进行进一步的研究。主要应用与疾病研究,药物筛选等。这类基因芯片将一个物种(主要有人,小鼠,大鼠,小麦等)的几千甚至上万个cDNA(或一段与cDNA互补的oligo片段)点在芯片上。这些基因的选择一般都是相对随机 ...

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在做基因芯片中,如何减少假阳性

1 PCR产物的污染。包括模板的污染和引物的污染。建议将实验室清洁分区。加荧光引物时要小心操作。 2 探针的设计。 确保探针的特异性。 3 探针之间的污染。 包括点样过程中探针的污染和装探针的板子各个孔之间探针的交叉污染。 4 杂交过程中的操作。 主意各个杂交block的杂交液和产物不要加错了。如果基片附了膜的话,膜要贴紧,不然,相临block的产物会相互渗透,导致假阳性情况发生。膜要足够厚,杂交 ...

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芯片待测样品的选择处理

1.单通道还是双通道。一般cDNA芯片多双通道,高密度芯片多单通道。双通道注意Cy3和Cy5换标(swap),另外要考虑试验的生物重复replicates(取消个体差异)和技术重复(取消仪器差异)。 2.样品的选择。一般使用单纯的样品,而不是将样品混合,这样将减少信息量。最后最好做一个将所有样品混合起来的样品(pooled sample),作为一个对照。 3.样品处理。一般mRNA的收率为1:10 ...

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大规模基因分类软件简介

1. MANATEE is a web-based gene evaluation and genome annotation tool. Manatee can store and view annotation for prokaryotic and eukaryotic genomes. The Manatee interface allows biologists to quickly i ...

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基因芯片细胞标本采集操作建议规程

细胞标本采集操作建议规程 1. 所有样品均应有样品标签(注明样品编号),同时有一张样品登记表,写明样品名称、种类、编号、取样日期、样品处理情况等。2. 一张芯片实验一般要求细胞数在1E+08,建议设计实验和收获细胞时可考虑多收集一些。 3. 贴壁与悬浮细胞培养诱导结束后,去除培养液,保留的细胞用PBS缓冲液洗一下,除去缓冲液,加溶液undefined充分溶解细胞,放入液氮运输。样品量以实际得到的 ...

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杂交、扫描、图像分解对基因芯片实验的影响

1. 基因芯片的杂交技术 基因芯片杂交要根据探针的类型、长度以及研究目的来选择优化杂交条件。当用于基因表达检测时,杂交需要高盐浓度、高样品浓度、低温和长时间(往往要求过夜),但严谨性要求则比较低,这有利于增加检测的特异性和低拷贝基因检测的灵敏度。目前对于基因芯片的杂交影响因素研究报道不多,主要有以下几方面:1)不同杂交时间的影响:如 Sarto等研究了不同水平的探针浓度和杂交时间对基 ...

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水分测定仪的选购

第一步:水份测定仪种类 市售的水分测定仪有很多,按测试方法分有以下几种: 1、红外法类仪器,体积小,测定范围比较宽,精确度差,适合水分含量5%~90%的木材、纸张等材料的测定,结构简单,价格低廉。 2、卡尔费休库仑法类仪器,主要原理:利用化学反应后电导率变化计算,结构复杂,体积较大,测定精确度最高,适合水分含量在100PPm以下的测定。它一般用于阴离子聚合等对水分有非常严格要求的化工、医药等行业产 ...

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浅谈对微阵列芯片认识的一些误区

目前在中国市场上的基因芯片主要有三种。cDNA芯片,Oligo芯片,和原位合成芯片。 cDNA芯片的原理是,通过克隆的方法把获得目标序列并将其作为探针,通过芯片点样仪喷到特定的基质上。由于探针要来源于获得的cDNA克隆,因此全部实验下来周期很长,工作量很大,费用很高。更由于探针的长短大小不一,杂交条件也不同,因此由于实验体系本身导致信号强弱的变化甚至已经超过了待检测的样品,可靠性和重复性很差,目前 ...

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基因芯片相关软件介绍

1、基因芯片综合分析软件ArrayVision 7.0 一种功能强大的商业版基因芯片分析软件,不仅可以进行图像分析,还可以进行数据处理,方便protocol的管理功能强大,商业版正式版:6900美元。 Arraypro 4.0 Media Cybernetics公司的产品,该公司的gelpro imagepro一直以精确成为同类产品中的佼佼者,相信arraypro也不会差。&nb ...

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生物芯片技术

一、生物芯片简介 生物芯片(biochip)是指采用光导原位合成或微量点样等方法,将大量生物大分子比如核酸片段、多肽分子甚至组织切片、细胞等等生物样品有序地固化于支持物(如玻片、硅片、聚丙烯酰胺凝胶、尼龙膜等载体)的表面,组成密集二维分子排列,然后与已标记的待测生物样品中靶分子杂交,通过特定的仪器比如激光共聚焦扫描或电荷偶联摄影像机(CCD)对杂交信号的强度进行快速、并行、高效地检测分析,从而判断 ...

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p19cl6细胞

Smads TAK1 and Their Common Target ATF-2 Play a Critical Role in Cardiomyocyte Differentiation We previously demonstrated that bone morphogenetic proteins (BMPs) induce cardiomyocyte differentiation ...

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芯片数据的标准化输出

基因芯片所产生的信息量非常大,其利用价值也远远超过单个实验本身,它也可以用于不同实验之间的比较。另外科研人员在用基因芯片来研究基因表达信息的时候往往也要和别人所做的实验结果进行比较,这样才能充分挖掘实验数据中所包含的生物信息。如研究酵母基因表达的科研人员可以将自己所得到的数据与别人的试验结果相对照,并进行比较分析,同时他也可以与别人共享他的芯片数据,以供别人研究。而要实现芯片数据的共享就必须有公用 ...

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THP1核酸代谢

THE PURINE NUCLEOTIDE CONTENT IN HUMAN LEUKEMIA CELL LINES Abstract: The HPLC method was used to determine the purine nucleotide (ATP ADP AMP GTP GDP GMP NAD+) contents and the values of the adenylate ...

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什么型号、品牌微量水分测定仪比较好

网友提问:什么型号、品牌微量水分测定仪比较好? 网友回答: MS/MX/MF/ML 快速水份测定仪 日本A&D以全新的设计理念、精湛的工艺技术制造出高精度快速水份测定仪,它操作简单,易于观察并以其卓越的性能充分应用于食品、烟草、制药、石油、造纸、饲料、化工、涂料、矿产、环保、地质等行业做物料含水率的快速测定,同时满足固体、颗粒、粉末、胶状体及液体含水率的测定要求。 特点:  ●具有创新SR ...

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水分测定仪的分类及其主要的应用

随着科学研究的发展和生产技术的进步水分的定量分析已被列为各类物质理化分析的基本项目之一,作为各类物质的一项重要的质量指标。根据不同形式试样中的不同水分含量提出了测定水分的不同要求。水分测定可以是工业生产的控制分析,也可是工农业产品的质量签定;可以从成吨计的产品中测定水分也可在实验室中仅用数微升试液进行水分分析;可以是含水量达百分之几至几十的常量水分分析,也可是含水量仅为百万分之一以下的痕量水分分析 ...

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SC69-02快速水分测定仪的常见故障及调修

快速水分测定仪以其能较快地测定被测物品所含水分的数值(即物品的含水率),已广泛运用于工矿企业、科研单位、制药及粮油食品加工等行业,用以测定物品的含水率。含水率作为一项重要的经济技术指标,它的测定能及时地分析结果,并指导生产,可见仪器在使用过程中正确与否将直接关系到测试结果的正确性,因此对仪器进行定期的检定与调修甚为重要。 该仪器主要由一定量天平、红外线可调压式烘干灯、光学系统、电器控温装置等组成。 ...

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实验动物饲养及保管基准(日本)

第一:一般原则 管理者等应爱护动物了解实验动物的生理、生态、习性,以对科学负责的态度去饲养和保管实验动物。同时应努力避免实验动物对人的生命、身体及财产的侵害,努力防止实验动物对生活环境的污染。 第二:定义 本文出现的用语其定义如下 ⑴实验动物 指为实验等为目的,在特定设施内饲养的哺乳类及鸟类动物。 ⑵实验等 利用动物进行教育,试验、研究及制作生物学制剂等科学利用为目的动物实验 ⑶设施 从事实验动物 ...

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实验动物和动物试验管理规程

一、总则 1、为保证生物制品生产、检定和科研的质量,必须加强对实验动物和动物试验的科学管理。 2、本规程所指的实验动物是指来源清楚或遗传背景明确,符合微生物控制指标要求,用于生物制品生产、检定及科研的动物。 3、本规程包括实验动物生产和动物试验两部分。实行国家有关实验动物的认证制度。各单位实验动物部门应根据本规程和具体条件,制定相应的实施细则执行。 二、实验动物设施 1、选址:应符合国家和地方对建 ...

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实验动物饲养-常用饲料原料的营养特点

1、玉米 玉米具有适口性好、价格低廉的特点,属于能量饲料,是饲料业的首选原料。黄色玉米籽实中还含有维生素A元的色素即隐黄素,数量虽然不多(约1PPm),但与其他籽实类饲料相比较,仍不失为优点。由于玉米含有较高的淀粉,故能值较高。玉米的蛋白质中赖氨酸和色氨酸等几种必需氨基酸含量较低,蛋白品质稍差,在实际使用当中应与其他含蛋白质较高的原料(如豆饼)相混合,而不能单独使用。 玉米含有较多脂肪,且其中不饱 ...

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实验动物饲养的辅助设施和设备

在动物房舍设施内使用于动物饲养的器具和材料,主要包括笼具、笼架、饮水装置和垫料等,并还有层流架、隔离罩和运输笼等。这些器具和物品与动物直接接触,产生的影响最直接,务必予以重视。其中,层流架和隔离罩等设备可在房舍设施中独立使用,隔离罩更是现今用于无菌动物饲育和实验的主要设备。 一、笼具和笼架 在笼外的环境符合质量控制标准的情况下,包围动物小环境的质量很大程度取决于笼具、笼架的情况。笼具要求能对动物提 ...

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