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Gel Shift (EMSA) Protocol

Mirmira Laboratory at the University of VirginiaThere are multiple variations to this protocol but we find that this one works well in all cases we tested. http://faculty.virginia.edu/mirmira/resource ...

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Simple Miniprep DNA Preparation

SNGENIMHNIH http://intramural.nimh.nih.gov/lcmr/snge/Protocols/Miniprep.html SOLUTIONS: •Resuspension buffer: 25mM Tris-HCl (ph8) 50mM Na2 EDTA 1% glucose Autoclave and store at 4℃. •NaOH/ ...

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植物总DNA的快速少量抽提(CTAB法)

DNA 分子是分子生物学研究的基本材料,依不同的实验目的可采取不同的抽提方法获取数量和质量不等的 DNA 。 实验目的:了解植物 DNA 抽提的主要方法,掌握 CTAB 法快速抽提水稻 DNA 。 实验材料及试剂: 水稻叶片,1.5 × CTAB ,氯仿 / 异戊醇 (24:1) ,95% 乙醇或无水乙醇等 实验原理:植物 DNA 的抽提常采用两种方法: (1)SDS 法: 离子去污剂 ...

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体外重组

载体与外源DNA分子体外重组时,如何选择优化连接条件以达到最高的重组率。因此有必要根据影响连接效率的因素综合考虑连接条件。影响连接效率的因素很多,如反应温度、插入片段和载体之间的摩尔比、DNA末端性质、反应时间、ATP浓度等。 1. 反应温度是比较重要的影响因素。因为连接酶的最适反应温度为37℃,但在此温度下仅含4-6bp的退火粘末端之间的氢键结合不稳定(Tm≤15℃),不足以抵抗拒热运动的 ...

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感受态细胞的制备实验技术

实验目的 为了获得大量的质粒作为克隆载体,我们需要将购买来的质粒通过转化的方法导入细菌的细胞内。 制备出感受态的细胞,我们就可以方便的将需克隆的质粒导入其中,使其繁殖,就能获得大量质粒。 本次实验的目的就是增加质粒的数量。 同时,我们能掌握大肠杆菌感受态细胞的制备及转化的基本原理和实验技术方法。 实验原理及过程 ...

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大肠杆菌感受态细胞的制备与重组质粒转化

一、目的 1.了解感受态细胞生理特性及制备条件,掌握大肠杆菌感受态细胞制备方法。 2.掌握质粒DNA 转化大肠杆菌的方法,了解转化的条件和利用半乳糖苷酶基因插入失活选择重组质粒DNA 的原理。 二、原理 (一)大肠杆菌感受态细胞制备的原理 所谓感受态,是指细菌生长过程中的某一阶段的培养物,只有某一生长阶段中的细菌才能作为转化的受体,能接受外源DNA而不将其降解的生理状态。感受态形成后,细胞生理状态 ...

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感受态细胞的制备[电转化法]

体外连接的DNA重组分子导入合适的受体细胞才能大量增殖。为了提高受体菌摄取外源DNA的能力,提高转化效率以获得更多的转化子,人们摸索出了不同的方法处理细菌,使其处于感受态。目前主要采用电转化法和CaCl2法将外源DNA导入受体细胞中,并需要相应地制备电转化感受态细胞和CaCl2感受态细胞。 实验目的:学习感受态细胞的制备过程 实验材料:大肠杆菌菌株DH5a或DH10B 实验原理:电转化法是利用瞬间 ...

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细菌总DNA的提取和鉴定

【目的和要求】 1.学会CTAB法提取细菌总DNA。 2.掌握DNA的琼脂糖凝胶电泳法。 【实验原理】 DNA在生物体内是与蛋白质形成复合物的形式存在的,因此提取出脱氧核糖核蛋白复合物后,必须将其中蛋白质去除。CTAB(溴代十六烷基三甲胺)是一种去污剂,它能与核酸形成复合物,在高盐溶液中可溶并且稳定存在,若降低盐浓度,CTAB与核酸的复合物会沉淀出来,而大部分蛋白和多糖仍溶于溶液中。 DNA的电泳 ...

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质粒提取简介及问题分析

一、导论 质粒提取的原理:转自复旦大学一位老师的帖子后面是方法介绍 碱裂解法从大肠杆菌制备质粒是从事分子生物学研究的实验室每天都要用的常规技术。可是我收研究生十几年了几乎毫无例外的是我那些给人感觉什么都知道的优秀学生却对碱法质粒抽提的原理知之甚少。追其原因我想大概是因为《分子克隆》里面只讲实验操作步骤而没有对原理进行详细的论述。这是导致我的学生误入歧途的主要原因。后来我发现其实是整个 ...

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重组质粒的筛选

重组DNA转化受体细胞后,须在不同水平上进行筛选,以区别转化子与非转化子、重组子与非重组子以及鉴定所需的特异性重组子。在转化过程中,并非每个受体细胞都被转化;即使获得转化细胞,也并非都含有目的基因,所以需采用有效方法进行筛选。筛选的方法包括根据遗传表型筛选、限制性内切酶分析筛选、核酸探针筛选、PCR筛选等。本实验采用遗传表型筛选中的抗生素平板筛选或α互补筛选的方法。 一、抗生素平板筛 ...

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基因与载体的重组(重组体的构建)

目的基因与载体的重组(重组体的构建)程序如下: (1)质粒DNA 的分离纯化。一般含有单个目的基因的DNA 片段,即使进入了宿主细胞也不能进行增殖。通常它需要同适当的能自我复制的DNA 分子(例如质粒、噬菌体DNA 等)结合后,才能在通过转化或其他途径导入宿主细胞,像正常质粒或病毒一样增殖和易于检测。分离质粒载体DNA 有许多方法,但其共同步骤是先用溶菌酶处理含有质粒载体的宿主菌培养物,以除去其细 ...

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植物基因克隆的策略与方法

基因的克隆就是利用体外重组技术,将特定的基因和其它DNA顺序插入到载体分子中。基因克隆的主要目标是识别、分离特异基因并获得基因的完整的全序列,确定染色体定位,阐明基因的生化功能,明确其对特定性状的遗传控制关系。通过几十年的努力由于植物发育,生理生化,分子遗传等学科的迅速发展,使人们掌握了大量有关植物优良性状基因的生物学和遗传学知识,再运用先进的酶学和生物学技术已经克隆出了与植物抗病、抗虫、抗除草剂 ...

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质粒DNA纯化

试验原理: 大量提取的质粒DNA一般需进一步纯化常用柱层析法和氯化铯梯度离心法。常使用的所有纯化方法都利用了质粒DNA 相对较小及共价闭合环状这样两个性质。例如用氯化铯-溴化乙锭梯度平衡离心分离质粒和染色体DNA 就取决于溴化乙锭与线状以及与闭环DNA分子的结合量有所不同。 溴化乙锭通过嵌入碱基之间而与DNA结合进而使双螺旋解旋。由此导致线状DNA的长度有所增加作为补偿将在闭环质粒DNA中引入超螺 ...

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连接酶简介

DNA连接酶是1967年在三个实验室同时发现的。它是一种封闭DNA链上缺口酶借助ATP或NAD水解提供的能量催化DNA链的5'-PO4与另一DNA链的3'-OH生成磷酸二酯键。但这两条链必须是与同一条互补链配对结合的(T4DNA连接酶除外)而且必须是两条紧邻DNA链才能被DNA连接酶催化成磷酸二酯键。 常用的DNA连接酶有两种:来自大肠杆菌的DNA连接酶和来自噬菌体的T4DNA连接 ...

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质粒提取常见问题

1.溶液I―溶菌液: 溶菌酶:它是糖苷水解酶能水解菌体细胞壁的主要化学成分肽聚糖中的β-14糖苷键因而具有溶菌的作用。当溶液中pH小于8时溶菌酶作用受到抑制。 葡萄糖:增加溶液的粘度维持渗透压防止DNA 受机械剪切力作用而降解。 EDTA:(1)螯合Mg2+、Ca2+等金属离子抑制脱氧核糖核酸酶对DNA 的降解作用(DNase作用时需要一定的金属离子作辅基);(2)EDTA的存在有利于溶 ...

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简单序列长度多态性(SSLP)和间简单序列重复(ISSR)

简单序列长度多态性(simple sequence length polymorphism,SSLP)是据串联重复排列微卫星基序两侧的单一序列设计引物,对微卫星序列(microsatellite DNA 或simple sequence repeats,SSR)进行扩增,由微卫星基序重复数目的变异而产生多态性。由于中某一特定的微卫星的侧翼序列通常都是保守性较强的单一序列,因而可以将微卫星侧翼的DN ...

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内切酶星号活性

在非理想的条件下,内切酶切割与识别位点相似但不完全相同的序列,这一现象称星号活性。有人提出,这种"星号"活性可能是内切酶的一种普遍特性(1),如果提供给相应反应条件,所有内切酶都会出现非特异性切割。NEB已证实下列酶存在星号活性:Apo I(2)、Ase I(2)、BamH I(3)、BssH II(2)、EcoR I(4)、EcoR V(5)、Hind III(1)、Hinf ...

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大肠杆菌感受态细胞制备及转化中的影响因素

1、 感受态细胞的概念 重组DNA分子体外构建完成后,必须导入特定的宿主(受体)细胞,使之无性繁殖并高效表达外源基因或直接改变其遗传性状,这个导入过程及操作统称为重组DNA分子的转化。 在原核生物中,转化是一个较普遍的现象,在细胞间转化是否发生,一方面取决于供体菌与受体菌两者在进化过程中的亲缘关系,另一方面还与受体菌是否处于一种感受状态有着很大的关系。 所谓的感受态,即指受体(或者 ...

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