以下是常用的microRNA靶标数据库和软件资源列表,希望对microRNA的研究者有所帮助。(1) miRbase:众所周知的microRNA基因注释数据库。目前miRBase只提供了microRNA的靶标的预测软件的链接(如:PicTar)。 网址:http://mirbase.org/index.shtml(2) starBase:一个高通量实验数据CLIP-Seq(或称为HITS-CLIP)和mRNA降解组测序数据支持的mi ...
被寄予很大希望的基因疗法最近因为一名美国病人的死亡而再度蒙上阴影。这已不是基因疗法的第一例死亡1990年,美国科学家安德森(William French Anderson)对一名患自身免疫疾病的4岁女孩进行了开创性的基因疗法,至今这一被寄予很大希望的新方法已经经受了17年的风风雨雨。尽管基因疗法取得了很多成果,但是近期一名美国病人的死亡又为这一技术蒙上阴影。这已不是基因疗法的第一例死亡。乔妮·莫尔之死36岁的乔妮· ...
号召大家参加2004年“中国BBS社区100强”评选,支持丁香园! 请点击http://it.icxo.com/100bbs投票作为医药生命科学的唯一代表,丁香园已经被设定为此次活动的投票选项,真诚希望大家支持我们,投上您庄严的一票!2004年“中国BBS社区100强”评选全球互联网第二次发展热潮已经降临,国内外风险投资家都在大规模搜寻投资对象,据世界权威的IT评测机构--世界IT实验室2004年10月研究报告显示:互联 ...
DNA是遗传信息的载体,是最重要的生物信息分子,是分子生物学研究的主要对象,因此DNA的提取也应是分子生物学实验技术中的最重要、最基本的操作,如不能有效的完成DNA提取方面的工作,那就根本谈不上进行分子生物学方面的实验。在DNA提取过程中应做到1,根据不同研究需要,保证结构的相应完整性;2,尽量排除其它大分子成分的污染(蛋白质、多糖及RNA等);3,保证提取样品中不含对酶有抑制作用的有机溶剂及高浓度的金属离子。下 ...
关于菌株的基因型符号http://www.takara.com.cn/product/2004/n/n-16fh11001.html野生的大肠杆菌(E.coli)的基因组DNA中有470万个碱基对(bp),内含4288个基因。E.coli基因组中还包含有许多插入序列,如λ-噬菌体片段和一些其他特殊组份的片段,这些插入的片段都是由基因的水平转移和基因重组而形成的,由此表明了基因组具有它的可塑造性。利用大肠杆菌基因组的这种特 ...
MIRNA(microRNA)检测实验流程(加polyA法)一:概述microRNA(miRNA)是一类有大约22个核苷酸组成的非编码小分子RNA,其广泛存在于真核生物中。miRNA在个体发育的不同时期及不同组织中有不同的表达模式,都表明了其在发育和分化中起有重大的调控作用。迄今为此,对miRNA的检测方法主要有Northern Blot 等基于分子杂交的方法,这些方法敏感度低、耗时长、RNA的用量较大。miRNA qPCR D ...
初来乍到,我刚查到的一篇文章。希望对大家有点帮助!怎样选出最合适的Taq酶随着分子生物学研究发展的不断广泛和深入,PCR已成为一门相当成熟的常规技术,而热聚合酶(即Taq酶)的合理选择是PCR成败与否的一个关键因素。目前市面上有多种Taq酶,能够满足多方面的实验需要。那么,如何选择最合适的Taq酶?根据用户经常考虑的指标,如特异性、保真性、耐热性、扩增速率、扩增片段长度、能否进行复杂模板扩增以及优化条件难易等等,我 ...
现状目前基于DNA的生物芯片主要应用在两个方面。一是作为某些疾病的特定基因突变诊断。这方面的主要例子是Affymetrix的GeneChip,它的P53基因芯片用于P53肿瘤抑制基因的多态性检测;HIV基因芯片用于检测HIV-1蛋白酶基因和病毒逆转录酶基因突变;P450基因芯片用于肝脏药物代谢酶的基因检测。Affymetrix还有许多此类基因芯片在开发中,如检测乳腺癌基因的BRAC1,以及用于细菌性病原体 ...
据美国每日科学网站7月22日(北京时间)报道,美国科学家在7月21日出版的《科学》杂志上撰文指出,他们找到了DNA的第7种、第8种碱基,并在人体胚胎干细胞和实验老鼠器官染色体组的DNA中发现了这两个碱基的踪迹。科学家们指出,最新发现对干细胞和癌症研究非常重要。几十年来,科学家们一直认为DNA中只包含有4种碱基:腺嘌呤、鸟嘌呤、胸腺嘧啶和胞嘧啶,这4种碱基已成为我们对基因代码如何形成生命的认识的基础。然而不久前,科学 ...
miRNA是一类小分子RNARecent discoveries of small regulatory RNA molecules have been keeping the research community abuzz. Thus far, two classes of tiny regulatory RNA molecules have been identified.siRNAsThe first class encompasses the small interfering RNAs (siRNAs), which have an ...
Cloningof miRNAs was performed as described (Elbashir et al., 2001; Llaveet al., 2002a). In brief, ;600 mg of RNA was resolved through two laneson a denaturing 15% polyacrylamide gel. Labeled DNA oligonucleotideswere used as size standards. A gel fragment spanning the size rangeof 15 to 26 nucleo ...
1.核酸序列数据库•BIOSINO 我国的核酸序列公共数据库•EMBL - EMBL Nucleotide sequence database (EBI) *•GenBank - GenBank Nucleotide Sequence database (NCBI) *•DDBJ - DNA Data Bank of Japan *•dbEST - Database of Expressed Sequence Tags (NCBI)•dbSTS - Database of Sequence Tagged Sites (NCBI) 2.基因组及相关数据库 Ge ...
Ethanol Precipitation of DNAEthanol precipitation is frequently used for concentration of DNA solutions and for removal of protein, salt, and unincorporated nucleotides. The two most common protocols use either 0.3 M sodium acetate (0.1 volume of 3 M) or 2.5 M ammonium acetate (0.5 volume of 7.5 M), ...
刚才在网上看到的,不知道是不是有人发过了。网址:http://www.csc.fi/oppaat/siru/下载地址:http://www.csc.fi/oppaat/siru/siruwww.pdf分部分下载地址:Part Ihttp://www.csc.fi/oppaat/siru/sirupartI.pdfPartIIhttp://www.csc.fi/oppaat/siru/sirupartII.pdfPartIIIhttp://www ...
RNAi GlossaryDicer - Dicer is a member of the RNase III family of nucleases that specifically cleave double-stranded RNAs. Dicer processes long dsRNA into siRNA of 21-23 nt.Interferon - A small and highly potent molecule that functions in an autocrine and paracrine manner, and that induces cel ...
复旦大学生化与分子生物学实验室黄伟达所率研究小组在Biochemical Journal的九月刊上报道了如题论文。哪位大侠能下载到全文,请在DXY里共享一下,以便大家交流学习。文摘如下:http://www.biochemj.org/bj/390/bj3900675.htmBiochem. J. (2005) 390 (675–679) (Printed in Great Britain)High doses of siRNAs induce eri-1 and adar-1 gene e ...
Nature Biotechnology 5年关于RNAi专题 :http://www.dxy.cn/bbs/post/view?bid=64&id=3130708&sty=1&tpg=1&age=01 Synthetic shRNAs as potent RNAi triggers2 Synthetic dsRNA Dicer substrates enhance RNAi potency and efficacy.◎3 Knockdown by RNAi-proceed with caution4 Rati ...
本人正在从事TILLING的研究,希望大家参与讨论.以下是几篇关于该技术的文献.大家可以自己到网上找,都能找到.找不到可以MAIL我,我可以传给大家.因为这里附件不能装那么多文献,所以大家可以直接找我要.1.McCallum C.M., Comai L., Greene E.A., Henikoff S. 2000 Targeted screening for ind-uced mutations. Nature Biotechnol. 18:455-72.McCallum C.M., Comai ...
看到一本权威的E文教科书关于gene knockout的过程,插图如下http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/bookres.fcgi/mcb/ch8f34.gifFigure 8-34. General procedure for producing gene-targeted knockout mice. Embryonic stem (ES) cells heterozygous for a knockout mutation in a gene of interest (X) a ...
1 RNAi实验原理、方法和应用http://www.dxy.cn/bbs/post/view?bid=64&id=1365323&sty=1&tpg=1&age=02 RNAi示意图http://www.dxy.cn/bbs/post/view?bid=38&id=1181258&sty=3&keywords=RNAi3 挺不错的RNAi的作用机制 ( FLASH )http://www.dxy.cn/bbs/post/view?bid=64&id=527666&s ...