染色质免疫共沉淀(Chromatin immunoprecipitation,ChIP)是一种用于研究目的蛋白在染色质上定位的技术。ChIP 的原理是通过甲醛处理细胞固定 DNA 和蛋白,然后提取染色质,使用超声或酶解将染色质剪切成小片段。之后使用结合在染色质的目的蛋白或组蛋白修饰特异性抗体富集 DNA 片段。富集的 DNA 片段可以通过 PCR,DNA 芯片或测序进行分析。虽然原理看起来很简单,但 ChIP 是一项非常具有挑战的技术,很多因素都可能导致实 ...
经季老师推荐,看到了下面这样的通知。作为一个从事这么多年正宗科研的人来说,其实对如何做好科研已经有自己的判断。但是这个王博士,是搞临床的,并且发了我们也梦寐以求的文章。我的心为之一动,那就去听听吧。听了一下这个王博士的简介,算起来应该和我差不多年龄,真要算,我的同学,年龄相仿的师兄师姐如今也是遍布国内外名校,几乎也都发过牛文。并且很多也回到国内重点院校担任教师。所以从我的角度看,他所讲的似乎和我已知的并无差异,也可 ...
文献综述是在对某研究领域近期公开发表的文献进行广泛阅读和理解的基础上,对该领域研究成果的提炼、综合和思考,阐明其研究进展,揭示其发展趋势。文献综述首先是对学术观点和理论方法的整理,其次是对现有的文献进行评价和分析,再次是对该研究的未来提出建议或展望。所以综述的写作是总结该方向前人已经做了的科研状况,了解目前的研究动态,分析存在问题及其原因,指出今后的研究问题和发展方向,列出该方向代表性的参考文献,为进行该领域 ...
一、亚硫酸氢钠修饰过程中可能出现的问题及应对措施亚硫酸氢钠修饰DNA的目的是将DNA序列中未甲基化的胞嘧啶完全转化为尿嘧啶,而甲基化的5一甲基胞嘧啶保持不变。影响此过程的主要因素有修饰试剂的浓度、反应温度、反应环境的pH值及反应时间。其中任何一个环节出现问题都将导致MSP扩增失败,体会如下:(1)亚硫酸氢钠的浓度最好控制在3.0~3.9 mol/L为好,其pH值必须用NaOH精确调整至5.0;(2)修饰时间应掌握在10~ ...
开始细胞传代前,仔细检查细胞传代所需的仪器和试剂是否齐全。细胞与试剂方面:1、细胞(单层细胞,镜检适合)2、培养液(MEM-0.2%LH 培养液或MEM 培养液或199 等适合细胞有要求的培养液)3、灭活小牛血清、庆大霉素溶液(1 万单位)4、7.5%NaHC03 溶液5、0.25%胰蛋白酶6、PBS 洗液。实验小用具方面:1、小方瓶(100m1)2、克氏瓶3、胶塞4、吸管(10ml、1m1)5、细胞吹打管(20 ml)(以上用具需经121℃至少15 分钟高压灭菌)6、 ...
随着免疫荧光技术的不断发展,荧光染料及其标记的抗体偶联物也被广泛的应用于生物学实验中。目前,市场上抗体及蛋白标记的荧光染料主要有CFTM系列(BIOTIUM, USA); Alexa Fluor®系列(Life technology, USA); DyLight系列; Cy系列; IR Dye系列等等。使用最多的为Alexa Fluor®系列和CFTM系列。一、CFTM系列染料的核心对比Alexa Fluor®系列具有以下几点优势:1、新型罗丹明核心罗丹明染料 ...
【嘉美生物】正常培养的细胞自噬活性很低,不适于观察,因此,必须对自噬进行人工干预和调节,经报道的工具药有:一、自噬诱导剂 (1) Bredeldin A / Thapsigargin / Tunicamycin :模拟内质网应激(2) Carbamazepine/ L-690,330/ Lithium Chloride(氯化锂):IMPase 抑制剂(即Inositol monophosphatase,肌醇单磷酸酶)(3) Earle's平衡盐溶液:制造饥饿(4) N-Acetyl-D- ...
我养细胞有 8 年历史了,现在我的细胞已成为大家参观和崇拜、学习的对象。好的经验要分享,这就将我这几年来养细胞的经历和感想跟大家交流一下。启蒙老师的重要性一般进实验室都有师兄师姐带着做,他们就是你做细胞的启蒙老师。他们的操作手法、细节、理论讲解就成了你操作的准则,如营养液、细胞瓶的摆放位置;灭菌处理程序;开盖手法;细胞吹打手法等等。要学会他们的正确操作,在第一次的时候就要重视。像养孩子一样养细胞细胞真的很脆弱,最好每天都去 ...
每次看到顶级期刊的封面文章的 Cover image 含有中国元素,就很兴奋,尤其是中国科学家本土做出并发表的,这些都能给予我们很大的激励和爱国情怀。所以我整理了以前看过的含有中国元素的发表在国际顶级期刊 Cell 、国际干细胞研究领域顶级期刊 Cell Stem Cell 及国际癌症研究领域顶级期刊 Cancer Cell 杂志上的封面文章,具体如下:1.Cell 封面之中国山水图2015 年 12 月 17 日,Cell 杂志以封面文章的形式报道了北京大学邓宏魁和赵扬研究组的 ...
明天就是 3.15 了,我掐指一算,届时我们又将发现更多诸如某某地沟油、毒大米等劣质品。果然还是吃货的力量更强大,科研狗再次被忽视了。你是不是很少发现有假试剂被大范围曝光呢?这样的假试剂,其实是不是很多呢?是不是害惨了我们呢?这是一个悲伤的故事为此我差点毕不了业刚进实验室的时候,那时还很单纯,总想着老板的钱也是守了 10 年发酵罐得来的,所以能省则省,虽然实验室不差钱。我做的是分子实验,其实对聚合酶的要求挺高的。实验室里的师兄师姐 ...
Nature 3 月 3 日这期文章中报道了一款动物实验研究设计校验工具(EDA, Experimental Design Assistant)。它能帮你干嘛呢?●创建实验流程图●准确算出样本量●发现你实验设计中的缺陷●给出实验设计优化建议软件的发明研究者 Nathalie Percie Du Sert 是一位实验设计专业人员,她指出,以往研究者们都是到了论文评审阶段,才被审稿人挑出实验设计方面的问题,然而这对研究人员来说,为时已晚。她发明这个工具,就是为了帮 ...
有人的地方就有江湖,有女人的地方就有麻烦。像实验室这样汇集全国各地高智商人群的地方,烦人的事更不会少。处理不好,类似林森浩那样的惨剧再发生也说不定。值此妇女节之际,给大家准备了几套话术,帮助大家搞定师姐师妹们,基本搞定了她们,实验室里会欢乐更多哦。我们一起来演练一下。你今天气色真好师姐:你今天怎么来这么晚啊?师兄:你今天气色真好。师妹:师兄,你怎么老盯着我看呢?师兄:师妹,你今天气色真好。实验室里来了小师妹,对小师妹来说 ...
在这里想和大家分享我作为某 SCI 杂志(影响因子 1.0 左右)的副主编的经验。在此不便把杂志的名字透露出来,请见谅。1. 通常来说,作者把稿件投到杂志社后,杂志社的编辑或执行编辑会对稿件进行初步的评估,来筛选出质量好的或适合的稿件。若你的文章很快被杂志社拒了,那就是没有被送出外审。若稿件通过了最初的评估, 就可以被送出外审了。建议:文章第一印象比较重要,比如需要使用合适的格式;必须过语言关,最好找 English native Speaker 或公司 ...
从第一篇 SCI(Molecular and cellular biology 6.188)到百篇 SCI 发表在数十个 SCI 杂志(包括 Pediatric neurology 1.513、 Journal of biological chemistry 5.328、J clinical endocrinologyand metabolism 6.495、Lancet 33.633、Blood 10.558 等等)。既有基础的 Original Papers,也有临床的 Case Reports。自己的身份也从 SCI 文章的 ...
2 月 27 日,募格编辑联合丁香园举办了一堂 SCI 论文写作微信公开课,资深母语编辑 Kristin 以论文的讨论部分写作为主题展开了在线讲解。课后,大家针对授课内容积极提问,我们现在将母语编辑的回答汇集整理,相信这 16 个问题的答案,一定能帮你帮您写好 Discussion。Q&A1.Whether we should use some important words such as 'the first time' in our paper?I think it helps. The clearer it is, the bett ...
大家好,我是王伯当,一只实验狗。平时除了做实验,就是愁实验。很少有时间专心读文献,虽然我也知道这样是不对的。其实刚刚接触科研的时候,我对文献是拒绝的。以为只要跟着师姐干,吃苦耐劳,加班加点,就能发文章了。其实科研的灵魂就藏在文献里。再牛的牛人也要经常读文献。只有文献读的溜,才能做的好科研。今后我会在这里和大家分享一些例子,帮助大家理顺文章思路,快速读通有些文章。其实读文章并没有那么痛苦,紧跟着我哈。今天和大家分享 Natu ...
上周的文章《课题不知道做哪个方向? 学会这个,妥妥的》中不少人提出,芯片数据哪里来?怎么找呢?那么今天就来给大家揭晓这个问题的答案。这里要提到全国最大的两个基因芯片公共数据,一个是 NCBI 的 Gene Expression Omnibus,简称 GEO,一个是 EBI(欧洲生物信息研究所)的 Array Expression 数据库。今天重点介绍 GEO。图一:GEO 数据库图二:Array ExpressGEO 使用流程具体的流程是:确定关键词、限定类型、物种选择、检测 ...
15 年底我们课题小组收获了第一篇 SCI。想起去年的这时候我们还在为校对稿子忙碌,自己该回顾一下通向 SCI 的这 3 年历程,为小组的同舟共济、为 X 老师的一路指导、也为憧憬科研的学弟学妹们留下些许帮助。文章发表的背景发表 SCI 的规划缘起于 12 年底,那年我们大二。生理与病生教研室给我们班提供了几项便于本科生参与的课题,带着对科研的新鲜感,同学们踊跃报名。我在 X 老师的推荐下选择了做文献计量,一来当时台湾学者何玉山掀起的文献计量的风潮方兴未艾,二来不 ...
当我还是一个学生的时候,我经常在想,如果我有一个自己的实验室那该多好。这样我就可以追随自己的好奇心,研究各种让我感兴趣的问题。我很幸运,实现了自己的梦想。过去的 20 年里,我在斯坦福大学有自己的实验室,研究神经胶质细胞。我简直难以形容这是多么幸运和有意思。作为学生做实验很有意思,没想到指导学生做实验的时候,我发现也很有意思,尤其是指导这么多有天分的研究生和博士后。基于这些,让我思考,我很幸运有一位好导师。那么好的导师是怎 ...
生物学霸要开实验讲堂啦,每周给大家讲解一种实验技术,还会邀请技术大牛来答疑哦,看大家的喜欢程度啦。今天的主题是——高通量测序。小师妹:霸霸,什么是高通量测序呀?霸霸:高通量测序也叫下一代测序哦,你是不是想问那上一代测序是啥呢?嘿嘿,还真有,传统的叫桑格测序-Sanger Sequencing。小师妹:这个我知道,以前基因都要送去测序的。那高通量测序是神马鬼呢?霸霸:哈哈,小师妹就是聪明。高通量测序就是一次运行能产生很多的基因 ...