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三句话读懂一篇 CNS:适度饮酒,与降低痴呆风险有关;衰老三标志,协同作用可抗癌

光阴似箭,日月如梭。转眼已到 2 月中旬,科研人奋斗的步伐不能停。 本周学术君继续带来 CNS 最新进展,助力大家勇攀科研高峰! 1. Nature:罕见遗传病中异常相分离和核仁功能障碍 无序蛋白质的突变可能会引起凝聚物的性质和功能的改变。 2023 年 2 月 8 日,德国马克斯普朗克分子遗传学研究所的 Denes Hnisz 团队在 Nature 杂志发表研究论文 Aberrant phase separation and nucleolar dysfunction in rare genetic diseases。 该研究表明无序区域中与疾病相关的大量遗传变异,可能使核仁和其他生物分子凝聚物失调,进而引起罕见复杂综合征(BPTAS,短指骨、多指和胫骨再生障碍/发育不全综合征),提示相分离的破坏可能经常发生在遗传疾病中。图 1:来源 Nature 2. Cell:DNA 甲基化在哺乳动物中能够跨代遗传 哺乳动物中表观修饰的跨代遗传是否存在及其机制不明。 2023 年 2 月 7 日,美国 Salk 研究所与 Altos Labs 的 Juan Carlos Izpisua Belm

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Science:性经验如何引起大脑内部状态改变?李莹课题组发现关键神经环路

大脑无疑是身体中最复杂的器官,它能够将各种感觉信息转换为不同的神经信号进而调控运动。这种感觉-运动转换与个体的内部状态密切相关,并受过往经验调节。已有研究表明,社会经验,尤其是性经验,可以引起社会行为相关神经回路的长期变化,并影响社会信息区分、交配、打斗和照顾幼崽等本能行为 [1-4]。然而,关于哪些神经环路编码性经验并影响本能行为抉择并不清楚。在小鼠中,雄性和雌性动物成功交配后通常会失去交配兴趣,即达到性饱足状态 [5]。这种内部状态的改变不仅可以避免寻找新伴侣而面临风险和精力浪费,对提高子代繁殖率也至关重要 [6]。然而关于两性大脑中是否存在特异的神经环路编码性饱足状态,以及该编码如何长期影响个体行为抉择并不清楚。2023 年 2 月 10 日,北京脑科学与类脑研究中心李莹实验室在 Science 发表题为 Hyperexcited limbic neurons represent sexual satiety and reduce mating motivation 的研究长文,系统研究了这些问题。该研究首次在小鼠大脑边缘系统的终纹床核中发现可以持续编码过往性经验的神经环路,阐明

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高福院士团队 Lancet 发文:北京 COVID-19 病例分析表明,疫情爆发期间未出现新变种

导读 COVID-19 大流行已经持续了近 3 年,目前仍然是一个全球关注的热点话题。鉴于新冠病毒的广泛传播和不断演变,全球出现了众多变种,比如 alpha (B.1.1.7)、beta (B.1.351)、gamma (P.1)、delta (B.1.617.2)、omicron (B.1.1.529) 等。其中,Omicron 最早在南非被发现,增加的高传播力使其迅速成为全球范围内的优势毒株。 2022 年 12 月之前,中国采取了与其他国家不同的应对策略,从 2020 年的武汉封城到动态清零政策,精准防控,阻止了新冠病毒的传播。随着 Omicron 亚变体致病性的减弱、疫苗接种的普及和防控经验的积累,2022 年 11 月中旬,中国调整和优化了预防和控制策略。 中国在调整防控政策后,疫情在中国的快速传播引起了世界的关注,并引发了人们对此次疫情是否会驱动新 SARS-CoV-2 变体出现的担忧。因此,对流行的 SARS-CoV-2 变体进行全面的时空研究,对于全球应对当前的 COVID-19 大流行至关重要。北京拥有常住人口 2100 万,在政策调整后初期成为中国病例数最多的城市之

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Science:减肥原来这么简单!只要控制在白天进食,连脂肪细胞都在帮你减肥……

导读随着生活水平的提高,肥胖在人群中越来越普遍,已成为威胁人类健康的全球性公共卫生问题。肥胖的根本原因是能量摄入和消耗之间的不平衡,而提起减肥,更无外乎是「管住嘴,迈开腿」。近年来在减肥圈中有一种备受关注的一种饮食模式——限制时间饮食(Time-restricted feeding, TRF),就是将进食时间限制在一天的特定时间段内。不久前,因为沈腾成功减肥而被推上微博热搜的「168 饮食法」也正是限时饮食的一种常见形式。此前,已有不少研究表明限制时间饮食对代谢健康有诸多好处,还可以帮助延缓衰老。近日,美国西北大学范伯格医学院的研究团队在 Science 发表的最新研究 Time-restricted feeding mitigates obesity through adipocyte thermogenesis,又一次揭示了限时饮食在控制体重和改善代谢健康中的作用。研究发现,在生物钟的活动阶段进食,脂肪组织会通过增强产热作用燃烧更多的卡路里,从而减缓肥胖的发展。图片来源:Science 主要研究内容 饮食的昼夜节律紊乱通过减少能量消耗促进肥胖 研究人员发现,仅在小鼠的非活动期间(白

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第一视角带你了解单细胞测序技术对植物领域模式生物的剖析

随着新一代测序技术的快速发展,更多生物学领域开始应用单细胞测序技术。单细胞转录组测序技术可以全面真实的揭示细胞的多样性和复杂性,尤其是在单细胞分辨率下对于样本的转录本信息进行研究,可以完美的解决细胞异质性问题。但在植物研究中由于细胞壁等因素的限制,相关研究稍显缓慢。2022 年 2 月 NEW PHYTOLOGIST 在线发表了一篇水稻花序单细胞文章,对水稻花序组织中细胞的分化发育进行了全面剖析,首次揭示了水稻花序组织发育过程中的细胞异质性和分化发育轨迹。该研究是以烈冰生物 CTO 宗杰博士为一作发表的文章,烈小冰将以第一视角为大家解析该文研究思路和分析结果。 1.文章介绍论著题目:A rice single cell transcriptomic atlas defines the developmental trajectories of rice floret and inflorescence meristems 发表期刊:NEW PHYTOLOGIST影响因子:10.323(2022 年最新数据) 2.实验基础信息实验分组: 采用水稻花序早期发育各生殖分生组织转换、花器官属性

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单细胞多组学联合怎么做,GUT 教你设计方案策略

胰腺癌,公认的最致命的恶性肿瘤之一,其 5 年生存率仅为 9%,是名副其实的「癌王」。而现阶段针对它的治疗手段---免疫检查点抑制剂和化学抗原体细胞受体,疗效甚微。且肿瘤内部微环境中存在的中性粒细胞(TANs)浸润也被认为是影响肿瘤的最不利的预后因素之一。科学家通过查阅大量文献得出针对先天免疫系统的治疗干预可能为目前 PDAC 免疫疗法的替代方案。因此摆在科学家面前的最大问题就是如何让中性粒细胞(TANs)成功被「策反」,协助免疫系统击败肿瘤的侵染呢? 1.文章介绍论著题目:Single-cell RNA-seq analysis reveals BHLHE40-driven pro-tumour neutrophils with hyperactivated glycolysis in pancreatic tumour microenvironment 发表期刊:GUT影响因子:31.793(2022 年最新数据) 2.实验基础信息样本信息:5 名 PDAC 患者的外周血和 PDAC 组织、2 名健康人(HC)的外周血、2 名胰腺炎患者(CP)外周血样本,分离血液 CD66b+ 中

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单细胞测序技术之肝细胞相关实验方案策略

肝细胞癌(HCC)是肝癌的主要组织学亚型,占原发性肝癌的 90%,是全世界癌症相关死亡率的第三大常见原因。肝癌的诱因诸多,譬如遗传、表观遗传改变、慢性乙型肝炎、肥胖和糖尿病等都是肝癌的主要危险因素,而且肝癌预后差,复发率和转移率高。因此本篇应用单细胞测序技术研究案例分享以孙倍成教授带领其研究团队发表在国际免疫学顶级期刊 Immunity 上的肝癌(HCC)炎癌转化调控新机制说起!1.文章介绍论著题目:The zinc finger protein Miz1 suppresses liver tumorigenesis by restricting hepatocyte-driven macrophage activation and inflammation 发表期刊:Immunity影响因子:43.474(2022 年最新数据) 2.实验基础信息样本信息:对照组:WT 小鼠实验组:除 WT(untreated)外,其它组小鼠(雄性)均出生后两周开始注射 DEN,后期每周注射 CCl4 以诱导肝癌的发生。单细胞捕获平台:10X Genomics单细胞实验分组:Miz1∆hep:Miz1

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Nature 正刊带你解锁单细胞测序对肿瘤免疫治疗的新思路

众所周知,肿瘤一直都是众多科学家难以攻关的难题,肿瘤军团和免疫军团的战争也从未停歇。人体本身的免疫军团时刻保持警惕,尤其是人体自身免疫系统,为了一举歼灭善于隐藏的肿瘤细胞,同时防止自己滥杀无辜,设下多种作战方式:① T 细胞重新找出肿瘤细胞(CAR-T 疗法);② 不受阻碍全力追击肿瘤细胞(免疫检查点抑制剂)。但仅靠免疫系统自身斗争还是有些困难,因此通过体外基因改造的嵌合抗原受体 T 细胞(CAR-T)疗法开始发挥作用,而叠加 CRISPR/Cas9 基因编辑技术 buff,形成的非病毒的定点整合 CAR-T 疗法就是最强武器。该治疗复发难治性非霍奇金淋巴瘤的临床试验结果表明:87.5%(7/8)的患者获得疾病完全缓解,5 例无癌生存已超过 1 年,首例接受治疗的患者已无癌生存 2 年! 1.文章介绍论著题目:Non-viral, specifically targeted CAR-T cells achieve high safety and efficacy in B-NHL发表期刊:Nature影响因子:69.504(2022 年最新数据) 2.实验基础信息单细胞捕获平台:烈冰生

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单细胞测序技术(scRNA-Seq)之 NCB 高分文章解析前列腺癌相关研究

前列腺癌是发病率非常高的恶性肿瘤,在世界范围内,高居男性恶性肿瘤发病率的第二位,仅次于肺癌。中国前列腺癌患者约 70% 在初诊时已是晚期,5 年生存率只有 53.8%,这为我国前列腺肿瘤的治疗带来了巨大的挑战。然而,随着新一代测序技术的发展,人们对于前列腺癌的认识取得了重大进展。1.文章介绍论著题目:Single-cell analysis reveals transcriptomic remodellings in distinct cell types that contribute to human prostate cancer progression 发表期刊:Nature Cell Biology影响因子:28.213(2022 年最新数据) 2.实验基础信息样本信息: 13 例前列腺肿瘤样本实验平台:BD RhapsodyTM、10X Genomics数据分析平台:NovelBrain® 生物信息分析云平台分析工具:聚类分析,marker gene 鉴定,GOPathway 分析,拟时序分析,Qusage 分析 3.研究结果展示:通过对 batch1 进行单细胞转录组测序

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单细胞免疫组库(TCR/BCR-seq)测序

免疫组库是哪位?能够称为“组库”,首先是功能相似的N多细胞的集合。而“免疫”是指免疫细胞,特指 T/B 淋巴细胞。“So~免疫组库”(Immune Repertoire,IR),指某个体,特定时间点下,所有功能多样性T/B淋巴细胞的总和。T/B细胞利用细胞表面受体(TCR/BCR)识别和结合抗原,介导机体产生针对性的免疫应答,发挥免疫功能并做好记录备案,如果该抗原再次入侵可迅速作出反应,作为健康卫士守护肌体城池。 “组库”从哪来?除了 n 多 T/B 细胞的集合,TCR/BCR 多样性也是把“蛋糕”做大的关键。首先 TCR/BCR 的本质是细胞膜表面蛋白受体,其生成过程都要走过 DNA 转录成 RNA 进而翻译生成蛋白质。在组成结构上,两种抗原识别受体均由两条不同链连接而成,TCR(1 条 α 链+1 条 β链),BCR(2 条重链+2 条轻链)。其中 α 链和轻链受基因片段 VJC 区域编码,组合形式相对简单,β 链和重链受基因片段 V(D)JC 区域编码。 基因片段 V(D)J (Variable-可变区; Diversity-多样区; joining-连接区;) 会发生随机重组,

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IF 44!哈佛最新研究:坚持 6 种健康生活方式,长新冠风险可降低一半

新冠感染往往会引起发烧、咳嗽、肌肉酸痛等症状,这些症状通常伴随着感染的结束而逐渐消失。但是,也有少部分治愈者会表现出轻度或重度的后遗症,常见的有脑雾、疲劳、嗅觉味觉失灵等问题。但是,新冠病毒感染者还面临着「长新冠」(Long COVID)的风险。根据世界卫生组织的定义,长新冠是指一般在新冠初次发作后三个月出现症状,持续 2 个月以上,而且无法通过其他诊断来解释的疾病,常见的包括脑雾、疲劳、焦虑失眠、胸闷胸痛等问题。尽管自新冠大流行开始以来,人们一直担心和讨论长新冠,但是如何预防或避免长新冠的发生仍然没有明确的策略。2023 年 2 月 6 日,哈佛大学陈曾熙公共卫生学院领导的团队在 JAMA Internal Medicine(IF = 44.409)杂志上线发表了一篇研究论文 Adherence to Healthy Lifestyle Prior to Infection and Risk of Post–COVID-19 Condition。研究结果表明,遵循健康生活方式大多数方面的女性,与没有任何健康生活方式的女性相比,患长期 COVID 的风险约为一半。即健康的生活方式与降低

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单细胞测序数据分析策略

全方位解读单细胞分析主要逻辑与分析内容,了解单细胞测序数据分析最新进展。

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如何进行细胞类型鉴定

手把手教你单细胞测序分析时如何运用多种数据库和参考文献定义每种类型的细胞群。

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单细胞技术原理及方法比较

详解百花齐放的单细胞测序技术,不同技术捕获原理和方法各有何优劣?

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揭露空间转录组测序的神秘面纱

结合细胞在组织中分布的位置信息和转录组基因表达信息,了解细胞在空间背景下的异质性。

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单细胞测序基础知识入门

重新定义疾病-细胞-基因间的关系,精确到单个细胞级别的测序从过去的天文数字变为可能。

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三句话读懂一篇 CNS:果糖促癌!中山团队揭示背后机制;孤独和社交隔离,增加心衰风险

火树银花合,星桥铁锁开,元宵节的结束意味着热热闹闹的年味告一段落。 本周学术君继续带来最新一周的 CNS 进展,助力大家勇攀科研高峰! 1. Neuron:发现五羟色胺调节关联学习记忆的时间窗口 条件刺激 (CS) 与非条件刺激 (US) 的重合是维持联想学习的必要条件,其机制不明。 2023 年 1 月 26 日,北京大学李毓龙团队在 Neuron 杂志发表研究论文 Local 5-HT signaling bi-directionally regulates the coincidence time window for associative learning。 该研究发现由 DPM 神经元释放的 5-羟色胺 (5-HT),能够双向调控果蝇嗅觉学习的一致性时间窗口,并影响蘑菇体 (MB) 凯尼恩细胞 (Kenyon cells, KCs) 的突触可塑性,刻画了一个感知时间巧合和确定环境事件之间因果关系的模型回路。图 1:来源 Neuron 2. eClinicalMedicine:超加工食品增加癌症风险 俗话说,病从口入,饮食习惯的好坏很大程度上影响人们的健康状况。 2023 年

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人类体温正在悄然变低,新研究发现可能与这些小东西有关……

研究背景1851 年,德国内科医生卡尔·温德利希(Carl Wunderlich)在德国莱比锡市收集了 2.5 万人的腋下体温数据,并首次计算出了 37 ℃ 这个平均正常值,将其确认为人体体温的标准数值。然而,近年来,越来越多的研究发现,人类的体温似乎正在下降。2019 年 1 月 7 日,美国斯坦福大学医学院教授朱莉· 帕森内特(Julie Parsonnet)团队在 elife 发表了一项研究成果,发现自 19 世纪以来,成年人的平均体温在持续下降,不到 200 年间下降了 0.4℃,从 37℃ 降到 36.6℃。但人类体温悄然变低这一现象背后的原因仍未可知。近日,一项发表在 American Journal of Respiratory and Critical Care Medicine(IF = 30.528)杂志上的研究指出,肠道微生物组是体温的潜在调节器,无论是在健康和危及生命的感染中。图片来源:American Journal of Respiratory and Critical Care Medicine 研究内容 肠道菌群会影响脓毒症患者的体温变化 这项研究由密

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补充维生素 D 真的有益吗?JAMA 子刊研究表明:效果可能取决于你的体重

研究背景 维生素 D 是参与许多生物过程的必需营养素,最显著的是帮助我们的身体吸收矿物质,如钙和镁。人体获得维生素 D 的方法主要有两种,一种是晒太阳,另一种是通过食物摄取,维生素 D 主要存在于海鱼、动物肝脏、蛋黄和瘦肉中。据估计,全球 30%~60% 的人存在维生素 D 缺乏或不足,但维生素 D 缺乏症通常可以通过补充剂来治疗。 来自实验室研究、流行病学研究和临床研究的多项证据也表明,维生素 D 可能在癌症和心血管疾病的发生和进展中发挥作用,维生素 D 也长期以来被用于预防和治疗骨骼相关疾病。然而,补充维生素 D 到底有无健康益处一直存在争议。 由此,便促使了最初的 VITAL 试验。这是一项随机、双盲、安慰剂对照试验,涉及 25871 名美国参与者,其中包括 50 岁以上的男性和 55 岁以上的女性,调查了服用维生素 D 或 omega-3 补充剂是否可以降低患癌症、心脏病、中风等多种疾病的风险。 VITAL 试验已发表的结果表明,虽然在整个队列中补充维生素 D 对预防癌症、心脏病发作或中风几乎没有益处,但 BMI 与癌症发病率、癌症死亡率和自身免疫性疾病发病率之间存在统计学相关

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