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近年来关于组蛋白的研究越来越多，组蛋白各种各样的修饰有各种各样的功能，想要做跟组蛋白相关的研究，组蛋白提取是一个必不可少的技能了。你还在为组蛋白如何简单方便的提取而烦恼么，来，让学霸君教你一招。组蛋白有四种类型：H2A、H2B、H3、H4，组蛋白是染色体基本结构蛋白，因富含碱性氨基酸 Arg 和 Lys 而呈碱性，可与酸性的 DNA 紧密结合。因为组蛋白是偏碱性的，因此我们可以使用酸法来提取。下面学霸君就仔细介绍一下实验操作步骤啦：1、将 3- ...

CpG 作为作为表观调控的重要组成部分，在基因调控方面起着重要作用。CpG 岛是什么，CpG 岛主要位于基因的启动子（promotor）和第一外显子区域，约有 60% 以上基因的启动子含有 CpG 岛。CpG 岛的 GC 含量大于 50%，长度超过 200bp。接下来介绍几个网站：EMBOSS、MethPrimer、Sequence Manipulation Suite。这三个网站的网址在对话框回复【0521】即可查询复制。这三个网站操作起来大同小异，EMBOSS 刚进入界 ...

有不少人询问如何查询基因序列、如何进行引物设计、如何使用 BLAST 进行序列比对......其实这些问题在 NCBI 上都可以方便的找到答案。

FlowJo 是美国斯坦福大学 Leonard Herzenberg 实验室研发的一款流式数据分析软件，它可以对所有流式细胞仪产生的数据进行分析，在多种电脑操作系统上兼容性良好。由于功能强大，简单易用，已经被生命科学领域内的科学家、实验室广泛使用；同时 FlowJo 也是各高影响力核心期刊最受欢迎的流式数据分析软件。本文主要针对流式分析中常用的平均荧光强度 (MFI)，五个小步骤带你快速分析出 MFI。01打开 FloJo，显示工作台。02找到 ...

经常看到很多大牛的 PPT 里面有很多极具视觉性的 Animation，自己平时也看到很多生物医学相关的国外的 Video，但是以上两种大多只能在线观看，不能下载（若知道下载方法的请忽略此文），经过探索及使用，现将相关下载方法推荐给各位，希望对需要的人有用。01推荐的国外生物学视频网站1. BioInteractiveBioInteractive2. PBS Learning Media PBS LearningMedia以上两个网站都包含了大量 ...

一般情况下，瞬时转染是将 DNA 导入真核细胞的方式之一。在瞬时转染中，重组 DNA 导入感染性强的细胞系以获得目的基因暂时但高水平的表达。转染的 DNA 不必整合到宿主染色体，可在比稳定转染较短时间内（最多一周左右）收获转染的细胞，并对溶解产物中目的基因的表达进行检测。如果过表达基因用质粒，如果敲降用的是 siRNA(在 microRNA 实验中，过表达用的是 mimics，敲降用的是 inhibitor)。通过瞬时转染，将目的基因敲降或者过表达（gain ...

科研中的示意图总是给我们很严肃的感觉。但实际上，有些实验中的示意图往往为了达到生动的效果，会使用一些手绘风格的图片。比如下面这篇文章中的萌萌哒的小白鼠，顿时为这篇文章增色不少，给了读者更大的阅读兴趣。就要比这种风格的实验示意图看起来更加吸引读者吧；那么这种手绘风格的实验示意图是如何进行绘制的，下面我来详细介绍一下：工具：配置有 PPT 的电脑一台第一步：插入一个圆，一个椭圆，两者的直径与椭圆的短轴长度相同；然后将两者结 ...

今天，小编为大家介绍一款资料搜索神器，帮助我们搜索这么多年想要却搜不到的资料。《百度云搜索器》是一款目前国内最稳定最大的百度网盘资料搜索软件，由凌风独立开发完成。它是基于搜百度盘的数据源，以上亿级的大数据为依托，为广大用户提供最全面的资料搜索。可以从其官网 soft.sobaidupan.com 上免费下载。下载后不用安装，直接点击应用程序就可以运行，如下图所示：下面给大家介绍一下该软件的具体操作步骤：第一步：打开该软件， ...

信息量巨大的 Heatmap（热图）在 CNS 中受到热捧，正如名字一样越来越热了。无论你是各种组学的结果还是常见的数据，文章中不出现个热图你都不好意思叫 SCI 了！Heatmap 最大优点就是信息量大却一目了然。你会惊奇地发现，本来看似杂乱无章高高低低变化的数据做成热图后竟然一下子就简单了。传说是因为人眼可以选择性忽略一些噪音而抓住重点。听着挺有道理哈，可谁知道是不是真的呢；但文章里如果放个热图，顿时逼格确实提升了不少！我对这样的 ...

作为一名资深的化学研究生，利用 chemdraw 软件来画化学结构式与反应式已经是得心应手，给原子编号和化学键上色等一些美化修饰手段是驾轻就熟，对于研究糖化学的工作者来说，画好的一连串的椅式构型的糖分子犹如一幅优美的画卷。但是也会看到有的文献图中糖的化学式中不同糖环的内部颜色还不同，相比于不同化学键的不同颜色来说显得更直观清晰，也显得更高大上，正如图中所示。本人第一次看到的时候也是惊叹不已，于是就在 chemdraw 软件 ...

蛋白质不是孤立存在与生物体中的，它们之间的相互作用往往发挥着重要的生物学功能，因此，功能蛋白质相互作用研究已经越来越受到研究者的重视。STRING 是集研究蛋白质相互作用组研究、基因组研究和蛋白质组研究于一体的非常强大的软件。现在我分析数据已经越来越离不开他了。我们可以进行在线数据分析。图 1可以通过输入蛋白质名称，多个蛋白名称，氨基酸序列等搜索 STRING。当我们不清楚物种是什么时也不用担心，因为网站有自动生成器，物 ...

探索蛋白质发挥功能部分氨基酸的序列规律在生物化学研究中是非常重要的。目前，序列标志（Sequence Logo）是最常用的可视化手段。其产生的结果是一个直方图样式，其中每个栏都用垂直的字母堆叠代替。堆叠的总高度以位表示，堆叠中每个字母的高度与其在该特定位置的频率成比例。但是，序列标志的不足是假设每个氨基酸发生的概率相同，为 0.05（5％），这显然是不合理的。而 Icelogo 则可以进行运算以校正用户定义的氨基酸频率，能够帮我们 ...

在生物领域中经常会遇到找化合物相关的生物文献和专利，甚至是检测一个结构为何物的时候，这对学生物的学生来说简直就是灾难。接下来的 pubchem 数据库会让大家的困扰迎刃而解，pubchem 隶属 NCBI 数据库的子数据库，是专门针对化学结构搜索的数据库，使用方便而且是免费数据库，让一种初学者走上生物信息检索的巅峰。打开网址：https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/1. 利用 bioassy 检测生物相关的文献在输入框中 ...

前段时间在某杂志上，看到这样一篇文献：「词频分析」、「词篇矩阵」和「共现矩阵」说得好高大上，有木有？出于好奇，到 CNKI 按照该文献方法，自己分析了一次。哇塞！真的是如获至宝，在此拿出来跟大家分享一下。01知网检索选择「高级搜索」，之后的界面由于本人研究「地中海贫血」，就以此为例。当然，你也可以使用诸如糖尿病、高血压，恶性肿瘤…… 大部分科研小犊儿，甚是关心期刊杂志发表情况，在此本人点选了「期刊」，当然，你也可以点选「文献」，根据个人需要吧。根 ...

基因功能富集分析已经成为生物信息学中几乎每篇文章的必备套路。差异表达得到的显著的基因做一个基因功能富集分析，看看是否富集在一些感兴趣的功能上；共表达分析得到的基因模块，做一个基因功能富集分析，看看这个模块主要跟哪些功能相关；相关分析得到的候选基因，做一个基因功能富集分析，看看这些与性状相关的基因的有一些什么功能。此外基因功能富集分析还可以用来帮助筛选基因，确定未知功能的基因簇的潜在功能等作用。 今天就给大家安利 ...

说起提取质粒，想必是做分子生物学的搬砖工们每天的常规工作。随着各大公司开发出各种质粒提取 kit，为苦逼的生物狗带来了福音—试剂再也不用自己配了，提取步骤再也不用那么繁琐了。但，你先别着急高兴，久而久之，很多刚进实验室的小白师弟师妹再也不懂得背后的原理：质粒提取出来掺杂有蛋白或者基因组 DNA 怎么办？待转染或酶切的质粒被有机溶剂污染了怎么办？且听我一一道来。质粒是独立于基因组外的小型环状 DNA 分子，能够自我复制，在分子克隆中 ...

做了一堆的实时定量 PCR，然后有一堆的数据，那不是要做一堆的柱状图，我想把这些结果都放在一起怎么办呢？那么我又不会高大上的 R 语言，那么咋整呢。今天我给大家介绍一个比较简单的热图制作软件 HEML。首先，把所有数据算好以后，在 excel 中排列好，如下：将 excel 保存成 2003 版， 这个很重要，只有 03 版才能够被识别, 将文件命名为 gene。然后打开 HEML 软件。打开 File——load (图中红色框框)，将要打开的文件类型选择为 word 2003，打开我们之前保存的 ge ...

我们写论文作图时，经常会碰到数据两极分化的情况（图 1），如果不做处理就做成柱形图，会出现类似图 2 的情况，后面两组数据几乎不可见，这种图形会给审稿人相当不好的印象，论文也会大打折扣。网上有利用同一个图形中插入散点图的方式来制作作 Y 轴截断图形，但比较繁琐。下面把我的制作过程讲解一下，最终得到图 3 效果的图形。第一步：给数据分组。在 Excel 里增加一列，将小数据分到另一列，注意一个原则，小数据列的最大值，一定要小于大数据列的最小值，不然数据会 ...

流式细胞仪检测细胞凋亡可以：鉴定细胞凋亡形态；可以准确的进行凋亡细胞的计数；可以进行特异的定性分析和定量分析。实验原理细胞凋亡时，在细胞、亚细胞和分子水平上会发生的特征性改变，这些改变包括细胞核的改变、细胞器的改变、细胞膜成分的改变和细胞形态的改变等，其中细胞核的改变最具特征性。通过流式细胞仪检测这些特征性的变化，进而判断细胞凋亡的情况。实验步骤一、收集细胞收集细胞｛数目约（1~ 5）×106 个 / mL｝，500～1 000 r/min 离心 5 m ...

很多人做信号通路研究时，费了九牛二虎之力，好不容易找到了下游底物。满心欢喜地以为守得云开月明，岂料怎么也找不到可用的泛磷酸化抗体，下游的实验也难以开展。制备一个特异性的抗体呗，耗时耗力不说，好不好用还不知道。有没有什么其他办法呢？其实市面上可供选择的泛磷酸化抗体很多很多，关键是你能不能找到其中适合你的那一款。大部分蛋白激酶都有偏好的底物蛋白序列，例如 AMPK 偏好的序列是 LXRXXundefined/undefined，AKT 偏好的序列是 RXRXXundefined/T ...