曼哈顿图,学名 Manhattan plot,是全基因组关联分析(Genome-Wide Association Study, GWAS)的标配,可以展示所有染色体上的不同位置的 SNP 的显著水平,因酷似曼哈顿的海边景色(高楼林立的)所以称为曼哈顿图。本质上,曼哈顿图是以 SNP 在基因组上的坐标/位置为 X 轴,以显著水平(通常是-log(P))为 Y 轴的散点图,所以理论上说所有能做散点图的工具都能画曼哈顿图。但是你想一想全基因组有多少 SNP,然后还要坐成能用来发表 ...
聚合酶链反应即 PCR 实验,是最基础最常用的实验之一,很多科研汪刚进入实验室的时候,经常被要求尽快掌握好 PCR 技术。但实验装备有限,经费又要节约,没有练习的机会,怎么提高技能呢?最好的办法当然是能自己解决实验装备,就可以随心所欲的练习啦。1 NEST PCR 八联管适用于普通 PCR 和 qPCR 反应,薄壁设计产生高热传导率,使管内反应液以最快速度达到目标温度。采用电子束灭菌,无人类 DNA 酶、无 RNA 酶、无 PCR 抑制物,可高温高压灭菌(121℃)。管盖密封性良好,开 ...
如题,或是没有差距?来小伙伴们探讨一下。@dts1014:不好说,就我看见的,国外重视对未知的研究,国内重视对已知的重复;国外重视技术的开发,国内重视机械的操作。这并不是说重复和操作不重要,而是很多核心的技术和操作比如 biological sample analysis,biomarker analysis,也许并不复杂,但是仍然掌握在别人手里。现在都在说生态,药物 R&D 也需要一个良好的生态圈,这个生态圈的建立不是 CFDA/CDE 发一两个 ...
小时候,老师问,你的理想是什么。开玩笑,必须是「医生」啊,白求恩是偶像,手术室是天堂,拿着刀救死扶伤,走路都自带光芒。毕业后,如愿以偿,做了一名临床医生,朋友问,做医生什么感觉。我用了一句话回答:有男杨某,安徽亳州人也,善手术,人送锦旗「华佗再世」。遇论文,卒,享年三十。关于临床医生,不得不吐槽的那些事儿:关于随机论文中写到「将 X 例患者随机分为两组」,未描述随机方法。各种方法找到科室电话,打电话咨询以补充信息。对方答复:「当然是看患者的 ...
今天的「实验时间」,我们要说的内容,大家应该都非常熟悉——PCR。之前一直在讲 PCR 的一些原理和基本方法,但都是些理论知识,在实验具体操作过程中,总会遇到这样那样的问题,大家肯定很想知道其他同学是否也会遇到类似情况。学霸君在这里告诉大家,是的,高手也都是从一步步摸索实践才逐渐成为高手的。今天,学霸君就 PCR 的常见问题以及这些高手经验解答作了汇总,让大家在实验中少走弯路。首先来回顾一下 PCR 的原理:PCR 技术的基本原理类似于 DNA 的天 ...
SPSS 全称为「社会科学统计软件包」,是 IBM 公司推出的一系列用于统计学分析运算、数据挖掘、预测分析和决策支持任务的软件产品及相关服务的总称。图中我们看到 SPSS 有 23 个方法模块,虽然我们不能每个模块都能用到,但作为一个科研工作者,其中的某些功能是必须要掌握的。图一:SPSS 的 23 个模块下面列出几个典型的例子供大家在做数据中作为参考:图二:医学中 SPSS 用到的模块一、描述性研究图三:SPSS描述性研究描述性分析主要是对数据进行基础性描述 ...
中兴 42 岁程序员跳楼自杀之后,2018 年首个职场焦虑,出现在大家都以为稳定又有保障的路桥单位。为了更好的发展,河北唐山市地方政府把当地各个路桥收费站取消了。这些收费站不仅收费、还造成道路拥堵,成为了出行者头疼不已的问题。但是,此举造成了收费站工作人员的不满。面临解聘的他们向相关部门抱怨,其中一位大姐说「我今年 36 岁了,除了收费啥也不会」。只有 36 岁,抱怨什么也学不会了——这不过是温水煮青蛙的一个职场悲剧案例。不仅仅是个人原因安于 ...
又到一年填报高考志愿的时候,不少人都在纠结要不要学医。作为过来人,在要不要报考医学专业的问题上,「劝人学医、天打雷劈」还是「悬壶济世、无悔杏林」成为了对立面。支持派说:@林*数:学医后悔一时,不学医后悔一世。反对派说:@梦*松:如临深渊,如履薄冰,劝人学医,天打雷劈。根据丁香人才相关调研数据,仅有 12% 的医生考虑过转行,绝大部分医生还是在往成为「名医」的路上奋斗着。精英医生意味着什么?业务熟练、博闻强识、手术精湛,同时深受同行与患者 ...
事实上,能做到临床科研两不误的医生都付出了常人难以想象的努力。越来越多临床小医生迫于晋级压力都得搞搞科研。一是时间紧迫,二是没有接受过正规系统的科研训练,虽然也想做实验发文章,但首先苦于不会做实验。如果没有基础研究,申请各种基金也比较困难。所以,很多人一提到科研就头疼:要怎么选择课题,优秀的临床科研/基础科研课题应该长什么样,实验中哪些小细节要注意,数据应该如何分析处理,如何投稿和选刊……各种尴尬的问题不知如何处理 ...
最近有站友吐槽:学硕一年有余,现在还没有写出第一篇自己看着顺眼的论文,自己写的东西拿出去都觉得丢人现眼,现在已经快要放弃治疗了。知道自己的问题很大,却不知如何改变,感觉自己真的不适合做科研。于是发出灵魂拷问:学硕到底是不是坑?大神们是这么说的:@savitarAT51: 读博的话,还是学硕比较好,发展前景大;专硕只看眼前,大医院注重科研,目光还是放长远些。别浪费青春,多学些东西。@法兰西的雄鸡: 规培是大势所趋,为什么要读学硕呢 ...
求助:大家在大学期间除了四六级之外还拿了什么证?有什么证书推荐去考的?谢谢各位了。@野百合 lily:最好来个结婚证@perfect0915:大二 四级 省计算机二级 Foxpro,大三 六级 国家计算机二级数据库,大四 国家计算机三级网络技术。顺便提句:研究生期间陪室友考了 1 次六级,200 多分……@zhangcardinal:驾照,必须的。@usui51:计算机二级,心理咨询师三级,公共营养师三级,普通话。@yangjlsdsg:准生证可以考虑一下啊。
身边的同学和同事纷纷投入到科研的怀抱,而你却还在彷徨。大学花去很多时间学习基础医学 、临床医学和临床实践,并没有系统地学习过科研思维和方法,所以科研迟迟未能上手。很多人习惯于抱怨说,学校没有教,我就不会做。其实,更多知识和经验是在学校之外学的。最近听到一个故事:一个离开学校在临床工作了好几年的医生,除了大学时候的实验课,几乎没有接触过科研和实验。他利用自己业余时间在丁香公开课自学,按照临床科研大牛的方法和套路,独立完 ...
@何小贝要加油是生物工程类的硕士,研究生时候做过分子生物学相关实验。毕业的时候海投了很多生物类的研发以及技术类的岗位,然而因为研究生实验和岗位要求不是很匹配,所以很多被拒。最后留下来两个机会,一个是某药企的微生物发酵研发岗,需要泡在发酵车间内,具体的就是调配各种发酵参数类的研发,厂区年后需要搬到很远的地方,交通不便;另一个机会是一家生物公司的分子产品项目专员,其实就是做分子新项目的孵育和前期临床转化,需要跑客户 ...
一年一度的国自然基金申请又进入最紧张的准备阶段,可能很多小伙伴们正在为标书埋头苦干浴血奋战;多少个不眠的夜晚,就为标书某一部分的构思;多少个郁闷纠结,就为技术路线的精益求精;经历过多少次反复修改,但是心里依然没底。希望得到专业人士的咨询建议,但却找不到门路。于是,学霸君特意为大家整理了国自然基金申请一系列的资料,包括基金申请技巧/标书撰写/预实验等,各种套路方法,全程为您的科研之旅保驾护航,让您的标书脱颖而出,大大 ...
做个生物实验也是够苦逼的啊,不止结果要好看光鲜,还要做定量……也是醉了。明明 western blot 结果做的那么漂亮,一眼就看出来差异了,还需要定量?!思量起来,这个也还算简单,忍了吧。。。but…辛辛苦苦做的免疫组化(或荧光)也需要定量——你当搬砖就可以随便使唤了吗?花花绿绿,斑斑驳驳,肿么分析 ?还好,我有这本秘籍,一定要看完哦。准备工作首先,你需要下载 imageJ,然后下载 IHC-Toolbox 插件,并放入 imageJ 的安装目录下的 plugi ...
我们大家都知道,OpenBUGS 是进行贝叶斯统计分析的得力工具,它不仅能做统计分析,详情请戳手把手教你用 OpenBUGS 做统计,还可以绘制疾病地图,下面告诉大家如何利用 OpenBUGS 绘制疾病地图。需要准备的材料1. 需要绘制的目标地区地图,一般从中国地理信息系统网站上可以下载到(.shp)格式的中国及各省份的地图。2. 数据,需要目标地区各个行政区域上某种疾病的发病率或患病率,并能计算出疾病的期望发病或者期望死亡数据。3. 需要在电 ...
在《如何查找核心文献(一):知网高级检索》、《如何查找核心文献(二):文献管理软件》中,我们已经详细了解了如何通过网站配合软件查找到核心文献。然而,对于外文的文献检索,仍有着不方便之处,正如我们想到检索中文文献就会想到 CNKI 一样,一想起外文文献检索,PubMed 肯定是首选。凭借着其庞大的文献量,对于写作医学类论文有着很大的便捷之处。然而,在检索界面,我们除了文献摘要外,并不能获得更多关于可以用于评价文献质量方面的提示(图 1)。图 1 ...
统计图,和科研领域里的大多数图像数据伴生,是一种大家喜闻乐见的,直观表现数据结果的形式。周围的 Lab 不管是做免疫,还是发育,或者肿瘤,都涉及到要做免疫荧光(Immunofluorescence, IF)或者免疫组化(Immunohistochemistry, IHC),而在拍完了图之后,直接给老板 show 漂亮的 images 时并不能让 TA 百分百满意,总是想要一个 bar 图,那就需要统计了。而手动点数细胞太费时,所以向大家介绍一个有用的软件 IMARIS ...
看到工资条的那一刻,老林摸着鼠标的手有些颤抖。去掉五险一金等,3 月份打进工资卡的不到五千块。想想一家三口的生活,他又忍不住叹了口气。老婆从刚结婚那会就在说相当全职太太,而等到儿子都上了小学,她还在过着每天加班的日子。唯一庆幸的是,房子买得早,房贷轻松点。于是,第 xxx 次想要离职的念头又出现了……丁香园于 2017 年 3 月~5 月进行了医生薪酬调研,了解了临床医生 2016 年的收入情况。数据显示 2016 年临床医生平均年薪为 8.5 万元(薪酬包括:工资、奖金、 ...
WB,又叫蛋白质免疫印迹,是很常见单很重要的一个分子生物学实验。然而,大家常常会遇到各种问题,特别是新手,有时候不知道如何下手,学霸君汇总了一下。欢迎大家来一起交流共同进步。问题chengxue727 :每次提蛋白后会将样品在短时间内重复 2-3 次 WB,但是每次跑出的条带趋势不一致,上样量和其他条件都没有变,内参基本是整齐稳定的,不知道为什么目的条带就是不一致?求解。回答dxymuchong:内参稳定说明上样量稳定(应该大致是 ...