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细胞培养注意事项(入门级)

按时间顺序整理1、 细胞房和生物安全柜(或超净工作台)先开紫外照射30min。作用:对环境灭菌(空气)。(备注:如果着急,至少也要开15分钟)在做实验之前考虑好需要哪些物品。开始照射之前,将所需要用到的物品都放到生物安全柜(或超净工作台)里面。常用移液枪或电动移液器等,需要在工作台上放置一套专用设备。细胞培养箱一般都已经调整好。定期留意一下二氧化碳是否足够。不够及时更换。2、 显微镜需要定期消毒酒精擦拭。注意:显微镜一般都放在细 ...

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献给初学者:一款超好用的 DNA 序列比对软件

对于每一个进入生物领域的人,基本都避免不了分子克隆(认知的同胞除外),当然就需要一个称手的 DNA 比对软件。今天给大家强烈推荐一款 DNA 比对软件,APE(a plasmid editor)。这款软件不仅能做 DNA 序列比对,DNA 序列翻译,还能够做引物设计,酶切位点设计,质粒图谱构建(这个还是 snapgene 更好用,不过人家是收费的),ORF 查找等非常多的实用功能,下面我来详细介绍一下这几个常用的功能。先发个软件的链接,需要的小伙伴可以去下载使用☟ ...

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想要快速掌握一个领域的发展与前沿?这里有项神技能......

老板给了一个课题,不知道如何下手啊。文献那么多,我该看哪一篇呢?世界那么大,挖掘机技术哪家强呢?应该找那个师傅比较好呢?生物医学发展日新月异,文献层出不穷,我该如何快速掌握呢?来来,走过路过,不要错过。老夫看你骨骼惊奇,实乃科研之奇才,老夫这有一个神技,传授于你,如何?先亮出我的神器 ——HistciteHistcite = history of cite,即引文历史,又叫引文图谱分析。该软件是 SCI 发明人加菲尔德开发创作的,用图示的方式展示 ...

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手把教你做临床 Meta 分析 —— 诊断试验性 Meta-Disc 分析

临床治疗的基础首先是需要准确的诊断,准确诊断性 Meta 分析是 Meta 分析的一个重要部分,本次想向大家推荐的是一款专用于诊断性试验的免费 Meta 分析软件,临床医学、临床检验、临床病理、临床科研人员、临床康复科及临床影像科等工作人员可用它写上一篇高大上的诊断准确性试验的 Meta 分析文章。安装软件Meta-DiSc 是一个免费的下载软件,登录 http://www.hrc.es/investigacion/metadisc_en.htm,下载安装 ...

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如何精读一篇文献

在开始这个主题之前,请大家明确你首先要有一个合理的理由来精读一篇文献,同时指定一篇文献,这个理由可能是你需要去回顾或者是和你的课题有关,总之得目的明确。精读一篇研究型文章,我们的主要目的是理解作者的科学成就,这并不容易。我们可能需要来回重复读好几遍。关于如何精读一篇文献,以下是我的个人建议。批判式阅读读研究型文章是一个批判的过程,千万不能认为作者说的都是对的,一定要保持质疑。批判式阅读很重要的一个环节是提出合适 ...

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德克萨斯州立大学教授给读博前学生的10个建议

以下这 10 点建议,师兄师姐可不会告诉你哦,这是德克萨斯州立大学一位教授给的建议。具体大家往下看。1. 沉浸在写作中,学习如何写资助方案也许你会说,这不是读完博士后该做的嘛,其实不是。写资助方案和你写论文或是典型的期刊文章差不多,但是各种资助方案会让你在读博期间就有经费支持。你找工作的时候,这个经历也是你简历上最好最吸引人的内容。2. 找一个强大的导师这点实在是太重要了,好的导师既要是一个好的科学家,也要是一个好的导师。他们能 ...

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论文投稿技巧汇总——教你如何避免拒稿

当你历经千辛万苦终于完成一篇论文的写作,以为大功告成的时候,殊不知后面仍长路漫漫,从投稿到刊出也是一个艰辛的过程。 以下是我拒稿 8 次后总结出的经验,希望对大家有帮助。一、投稿杂志选择投稿的第一步就是选杂志。一般老板会有几个推荐的杂志,如果中了当然很好;如果没中,老板可能让你自己选杂志,自己投(毕竟投稿是个持久战,老板也耗不起呀)。选杂志需要考虑以下因素:1. 和论文水平大致相匹配。投稿千万不能好高骛远,否则就是在浪费编辑和自己的 ...

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图文并茂 | 如何为甲基化特异 PCR 设计引物

作为一个刚入门的科研新手时, 做 PCR 都是师兄师姐把所需引物、试剂拿来,再甩出一个 Protocol,照着程序性加样、上机就行了,感觉也没什么技术含量。轮到做自己的课题时,还真是犯了点愁,四处请教,逛论坛看各种帖子,寻找一些设计原则,最后也算形成了自己的一套流程,可以给一些还在迷茫的初学者们一些参考。下面以 (SOD1) 为例,一步步演示。基因序列查找一般的 PCR 所需序列可以在 NCBI Gene 上,但是甲基化发挥作用主要在启动子区域,基因序列要包 ...

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如何制作多参数散点图

我们先看图 1,这张散点图上,红色圆圈为致敏组,蓝色为非致敏组;圆圈(圆心)垂直位置为发生率;圆圈面积为相对血液浓度;背景颜色分三种,从左到右依次为动物组,蔬菜组,吸入组。总共有四个不同的概念同时集中于一张图中,这张图内容丰富,却非常直观,同时也节省了版面,这种图形是比较受杂志社与编辑欢迎的(选自由我导师和同事完成的论文,这张图是主要成果,发表于 2016 年的 JACI 杂志,影响因子 12.485)。图形貌似非常复杂,有四个参数,但其实只需 ...

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看到这些论文评审意见,我哭笑不得......

2010 年 Environmental Microbiology 杂志刊登了一部分杂志的审稿意见,以下是我摘出的 10 个史上最狠的评审意见。让大家在学术研究严肃、认真的前提下,体会一下审稿人的幽默与诙谐,有的审稿意见甚至让人啼笑皆非。1. This paper is desperate. Please reject it completely and then block the author’s email ID so they can’t use the online system in future.这文章太不给力了… ...

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重磅| Cell:颠覆教科书的发现,原来 DNA 复制随机......

几乎地球上所有的生命都基于 DNA 复制或被复制。对 DNA 复制过程的了解带来生物和医学领域很多重大发现。现在科学家们首次看到单个 DNA 复制的全部步骤,有了一些惊人的发现 ——DNA 复制的随机性比我们想象得还要多。1. 惊人的发现加利福尼亚大学戴维斯分校和加州大学戴维斯分校综合癌症研究中心的微生物学和分子遗传学杰出教授 Stephen Kowalczykowski 说:换一种方式看 DNA 复制带来了新的发现。该作品于 6 月 15 日刊登在 Cell 上,题目为《Indepe ...

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仙人指路如何查询医院专科的学术水平

每年的 6 月份除了高考以外,对于科研狗们最重要的日子莫过于「路透社」揭榜新的 SCI 影响因子了。大部分同学可能也就看看自己发表的文章分数是升还是降,如果仅仅如此,未免太埋没 JCR 的作用了。发过 SCI 的同学往往还会选择继续深造,人往高处走,那么如何判断某某医院某某专业的学术水平高低呢?JCR 可以说就是这样的一盏指路明灯,通过 JCR 查询和判断医院专科的学术水平,选择自己下一站的深造地点,可以说是个不错的策略。好了,废话不多说,下面上干货:首先, ...

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为啥咱拼死拼活做研究写文章,没稿费还得贴钱?

「看通知!科研处规定了,发表费用报销封顶就是 4 000」「那我这发文章超的费用咋整?」「问老板去!老板没法报,就自己垫吧。」你拼了命地做实验,多次拒稿、重投、大修、小修,好不容易文章被接收了,最后你还得花钱……但你有没有想过为啥别的行业投稿要给作者稿费,而在科研领域你还得交钱?这是因为学术出版业独特的运营方法,由于历史原因,大部分作者已经习惯于不计酬劳地为出版社撰写文章(其实是求名不求利),当稿子发给出版社后,开始进行同行评议(注 ...

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百度、Google ,还可以这么用

本讲要介绍的两个高级搜索指令:【filetype:pdf】-- 限定搜索结果的格式为 pdf-- 也可选用其他格式,比如 doc,ppt 等-- 注意中间的冒号「:」是英文的【site:www.fda.gov】-- 限定在 www.fda.gov 网站内进行搜索-- 也可以换成其他网站--http:// 不要加,www. 可加可不加实例 1:搜索生理学的课件1. 如何搜索网上与生理学相关的 ppt 格式的文档?百度搜索:【生理学 filetype:ppt】2. 如何搜索百度文库中与生理学相关的 ppt 格式的文档?百 ...

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三个实例告诉你:不做实验,还可以挖掘数据库发表文章

今天小张就先介绍三篇最近很火的发文章的套路:不做实验,只挖掘数据库就发表文章。第一篇:影响因子 1.7 分第一篇是今年 5 月份刚发的文章,杂志是 Pathol Oncol Res,影响因子 1.7 分,研究团队是伊朗的科学家。文章主要通过 cBioportal 对 TCGA 数据中肝癌的数据进行挖掘,结果找到了一条 lncRNA SNHG6 作为肝癌的分子标志物。结果如下:感觉做了好多东西,其实就说了两件事:lncRNA SNHG6 等 3 条 lncRNA 在肝癌患者中基因组水平的改变和表达情况 ...

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如何快速筛选到想要的核心文献?

你知道一个数据库的文献量有多大么? 仅仅是万方中关于期刊的文献就有 36 000 000+ 篇,而 Pubmed 中则有 27 000 000+ 篇。每一个数据库的文献量都可以用「浩如烟海」形容。当然,你根据自己需要的主题进行检索所得的结果并没有这么多。即使如此,检索的文献量少则数十上百篇,多则上千篇,难不成你还要将所有的文献都浏览一遍,才知道哪些文章对你的研究是有帮助?即使是简单的浏览标题,也能让你两眼昏花,更何况进一步阅读摘要,甚至是全文。那么,接下来的关 ...

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献给初学者:巧做学术壁报

参加了多少次海内外大大小小的学术会议,没个展示自我科研成果的壁报可怎么行?那么,怎样制作出一份精致出彩的壁报呢,今天就带大家共同学习一番。1 明确会议要求查看会议方对壁报的要求,包括内容题材、壁报的尺寸、具体的格式要求等。2 简练撰写报告出众的观点,良好的表述,与出彩的展示均是不可或缺的。同样是对研究内容的简明扼要展示,如果还不会写结构式摘要,建议你先掌握好摘要的写法。然后,过渡性地转化为壁报内容,做到简明清晰易懂,有结构 ...

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免疫组化常见问题都在这里了

对于刚入门的科研小白,免疫组化步骤较为繁琐,而且一步错,步步错,有时候明明觉得自己都按照老师们提供的条件做,可惜就是没有得到预期结果,现我将自己的些许体会分享如下。关于免疫组化的定义,原理,分类,优势等不再一一介绍(丁香园等主流平台都有介绍),我只叙述我认为「比较小」的问题,但这些往往决定了成败,遗憾的是我检索了比较多的资料,都没有详细的提及这些问题。1 取材与制片① 一定要按照标本的标本留取要求留取,譬如某组织要求固定前要 ...

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你要相信:所谓论文,只要你敢写就有人敢收

写在前面的话本文是一篇脊柱领域系统评价,成文后自我评估不甚看好,理由有三:阴性结果一般不受待见中文文献偏多纳入文献质量偏低先后投稿以下七个期刊,最终被 AOTT 接受。European Spine Journal(2.132,投稿时 IF,下同)Clinnical Orthppaedics and Related Research(3.127)International Orthopaedics(2.387)Acta Orthopaedica Belgica(0 ...

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如何做出稳定可重复、背景干净的 western 条带?掌握这些,屡试不爽

我做 western 的时候,发现目前的资料都很老,网上的资料也大多互相传抄,说法各异,于是综合了目前网上所能找到的资料和个人实际经验,编辑了这份 western blot 操作步骤,内容包括主要操作步骤和所需要注意的有用的细节,并附上参考文献。我按下文的步骤操作已经做出来了稳定可重复的、背景干净的 western 条带了,屡试不爽,所以相信你也行。背景蛋白质印迹的发明者是斯坦福大学 George Stark。Neal Burnette 于 1981 年所著的 A ...

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