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今天向大家介绍一个无需翻墙，且集多种实用功能于一体的国产插件 Scholarscope。该插件是国内某位具有奉献精神的爱心人士于 2017 年下半年开发出来的。进入网站后页面是这样的：然后点下载选项，从本网站直接下载（我觉得只要是谷歌内核的浏览器应该都可以，本人使用的是猎豹浏览器），安装成功后进行设置。设置好后我们进入 PubMed 看看效果：点击感兴趣的文章去看摘要。右侧有两排实用小工具，可分别按类别（已读，想读，喜欢）进行收藏。而 ...

进化工程师已经培育出一种新的酿酒酵母菌菌株，它可以从农业和木材废料的原料木质纤维素中发酵乙醇。罗莎·加西亚·桑切斯(Rosa Garcia Sanchez)和同事们通过在连续培养中施加选择压力，加速了酵母的进化，最终形成了一种能够将戊糖、木糖和阿拉伯糖完全转化为乙醇的生物体。定向进化的过程似乎并不是转基因技术的显著进步，而且很容易与古代的人工选择方法进行比较。进化工程学的一个警告是，新的有益突变不太可能发生。野生型酵母 ...

这篇文章最初发表在BioMed Central的杂志Biome上。为了创造真正可持续的生物燃料，研究人员正在研究从废弃的植物干物质(如木头和稻草)中生产生物乙醇的方法，这些物质被称为木质纤维素原料。工业酵母(S. cerevisiae)已经被用于从富含葡萄糖的作物(如玉米和甘蔗)中生产生物乙醇，但在发酵废弃木质纤维素原料中发现的戊糖(d -木糖和l -阿拉伯糖)时效率不高。植物的木质部分也具有抗酶降解性，需要热化学预处理来释放可 ...

① 上交复旦Science 子刊揭示靶向 YY1 有望治疗糖尿病肾病转化生长因子β1（TGFβ1，由基因 TGFB1 编码）已被确定为糖尿病肾病产生的主要致病因子。然而，当前的拮抗 TGFβ1 的策略未能在临床试验中表现出有益的治疗结果。在一项新的研究中，来自中国上海交通大学和复旦大学等研究机构的研究人员为了鉴定出一种不同的治疗方法，设计出一种基于质谱的 DNA-蛋白相互作用筛选方法，以便发现与 TGFβ1 启动子结合的转录阻遏物。他们鉴定出一种称为 ...

长久以来，马因其美丽、精神、力量和速度而受到赞赏。狗可能是人类最好的朋友，而马在人类历史的旅途中几乎是必不可少的伙伴。如今，作为唯一交通工具的马越来越少，但它们仍然是我们生活的重要组成部分，尤其是在跑道上，成千上万的人仍然聚集在那里观看它们比赛。然而，也许不那么为人所知的是，马也作为再生医学的一个模型脱颖而出。尽管对干细胞在体内的作用了解有限，但干细胞在兽医学中被广泛应用，尤其是在赛马中。成功的赛马价值不菲——英国 ...

肌肉疾病的遗传多样性是广泛的，需要新的工具来研究疾病的机制和测试新的治疗干预措施。从病人身上分离出来的细胞作为特定模型的来源，这些模型允许在病人自身遗传背景下研究疾病，而这些细胞模型正变得越来越重要。尿液是人类原始细胞的来源开发特定于患者的细胞模型依赖于拥有容易获得的细胞源，如果这些细胞不是来自感兴趣的组织类型，则需要一个健壮的重新编程过程。肌肉活检是侵入性的，有时对肌肉质量受限的病人来说是有问题的。另外， ...

① Nature：母体维生素 C 调节 DNA 甲基化重编程和生殖细胞产生哺乳动物生殖系经历广泛的 DNA 去甲基化，这在很大程度上通过连续细胞分裂对甲基化进行被动稀释而发生，并且伴随着 TET 酶对活性 DNA 的去甲基化。人们已发现 TET 酶活性受到诸如维生素 C 之类的营养物和代谢物的调节。在一项新的研究中，来自美国加州大学旧金山分校等研究机构的研究人员发现母体维生素 C 是小鼠模型中的正确 DNA 去甲基化和雌性胎儿生殖细胞产生所必需的。母体维生素 C 缺乏并不影响整体胚胎发育 ...

我们知道 CRISPR 技术可以在基因组水平对目标基因进行激活上调、转录抑制以及缺失。那使用 CRISPR-Cas9 技术需要考虑哪些问题？今天在这里给出几点建议供大家参考。一、 选择合适的基因功能研究技术Activation，repression 或者 deletion 到底该选择哪个？以 lncRNAs 为例，如果研究的 lncRNAs 在选择的细胞模型中是有表达的，那 CRISPR-del 和 CRISPRi 两种基因功能缺失 (LOF) 策略是不错的选择。但是通常情况下没 ...

客座作者凯瑟琳·穆勒教授和艾米丽·克莱门特解释了脂肪细胞是如何帮助病人抵抗乳腺癌药物的。在发表于《乳腺癌研究》(Breast Cancer Research)的一篇文章中，来自里昂癌症研究中心(Cancer Research Center)的查尔斯•杜蒙特(Charles Dumontet)的团队表明，乳腺癌周围的脂肪组织增强了对曲妥珠单抗(trastuzumab，或赫赛汀)的耐药性。曲妥珠单抗是一种靶向癌基因HER-2的单克隆治疗抗体 ...

发表在《分子脑》杂志上的一项新研究报告了利用诱导多能干细胞(iPSC)对人无脑畸形的发病机制进行了表征。在这篇博客中，庆应义塾大学医学院院长兼生理学教授冈野秀之博士向我们介绍了更多关于基于ipsc的无脑畸形模型的知识。无脑畸形是一种先天性的大脑畸形。十年前，山中伸弥(Shinya Yamanaka)博士报道了获得诺贝尔奖的诱导多能干细胞(iPSCs)技术。除了它在体细胞重编程以成为多能性方面的意义之外，人们对ips ...

① Nature：揭示组蛋白标记 H3K36me2 招募 DNMT3A 并影响基因间 DNA 甲基化塔顿布朗拉赫曼综合征（Tatton–Brown–Rahman syndrome, TBRS）是一种儿童过度生长障碍，是由生殖系 DNMT3A 突变导致的。儿童期巨脑畸形综合征（Sotos syndrome）是由 NSD1 的单倍剂量不足引起的，其中 NSD1 是组蛋白甲基转移酶，催化组蛋白 H3 在 K36 位点发生二甲基化（H3K36me2）。在一项新的研究中，来自美国哥伦比亚大学欧文医学中 ...

最近融合基因大火，目前获批的药物有很大一部分也是针对基因融合的，比如前一阶段大火的 NTRK 融合以及肺癌中经常被提起的 ALK 融合等。融合基因检测方法较多，小编整理了 7 种融合基因的检测方法：一、qRT-PCR理论上可检测融合 partner 和融合亚型，但是只能检测已知融合形式或者已知亚型，无法检测未知融合 partner 和亚型。PMID：19136943，IF：41.577，Nature 2009 Mar 05;458(7234)①TICdb：肿瘤相关染色 ...

今天教大家如何用 MEGA 构建进化树！一、序列比对常见算法:Muscle、ClustalW1、打开 MEGA 软件，这里以 7.0 版为例，依次按照箭头方向进行选择2、序列比对经以上步骤后弹出新的对话框：M7:Alignment Explorer若没有显示我们的目标 fasta 文件，请注意修改这里的文件后缀名称3、打开后的 species.fasta 文件注意：重点来啦！4、然后呢？然后就比对好了，查看一下首位是否比对齐，没有比齐的碱基就删除掉5、最后，将比 ...

祝贺生物医学中心的John Gurdon爵士和Shinya Yamanaka，他们共同获得了2012年诺贝尔生理学或医学奖，因为他们“发现成熟细胞可以被重新编程成为多能细胞”。“干细胞再一次成为热门话题!在1962年约翰·古尔表明成年细胞保留所有必要的重建生物体遗传信息的细胞核替换一只青蛙卵细胞的细胞核成熟细胞从蝌蚪的肠道,从而表明（尽管不一定专业）成年细胞不可逆转地致力于一个命运。40多年后，山中伸弥(Shinya Ya ...

寄生虫很吸引人。当我们惊叹于它们错综复杂的生命周期时，我们永远不会厌倦在吃寿司、乌冬面或蓝眼睛时向我们所爱的人讲述他们病态的病理细节(当然，我们没有意识到，在这个过程中表现出的迟钝……)，我们不能忘记故事的另一个同样迷人的方面:宿主对感染的反应。有人认为，脊椎动物的整个免疫系统进化几乎完全是为了应对寄生虫的感染。这种“2型”免疫与通常控制抗病毒或细菌免疫的反应(“1型”免疫系统)有很大不同，它利用了许多独特的成分，包括 ...

① 华中科技大学 Cell 发现全新感受冷的受体蛋白家族来自华中科技大学生命学院，教育部分子生物重点实验室的研究人员发现了谷氨酸受体基因编码感受冷的受体，这是进化上非常保守的全新感受冷的受体蛋白家族。研究人员首先以秀丽隐杆线虫为模型，通过无差别正向遗传学筛选的方法，筛选出一个谷氨酸受体蛋白 GLR- 3 能够直接感受低温，并能激活其表达的神经元，介导线虫的逃避反应。更重要的是，该谷氨酸受体蛋白 GLR- 3 所相对应的脊椎动物，如斑马鱼、小鼠和 ...

一、用 IPTG 诱导启动子在大肠杆菌中表达克隆化基因所需特殊试剂：1M IPTG1. 将目的基因与 IPTG 诱导表达载体连接，构成重组质粒并转化相应的表达用的大肠杆菌。将转化体铺于含相应抗生素的 LB 平板，37℃ 培养过夜。通过酶切序列分析等筛选带有插入片段的转化体。2. 分别挑取对照菌和重组菌 1 个菌落，接种于 1 ml 含有相应抗生素的 LB 培养液中，37℃ 通气培养过夜。3. 取 100 微升过夜培养物接种于 5 ml 含有相应抗生素的 LB 培养液中（各 10 份），适当的温度（20－37℃）震荡培养 4 小时，至对数 ...

参考文献的插入是写文章时必不可少的环节，也是一件让很多初入科研界的同学头疼的事情。Endnote 是一款非常好用的工具，但在使用过程中经常遇到各种问题。今天，笔者就为大家系统详细的介绍 Endnote 的文献格式插入方法，让你写文章的时候没有「后顾之忧」。一、软件使用前事项Endonote 软件安装后，会发现：Endnote 没有出现在 word 或者 WPS 的菜单栏中。解决方法很简单：找到 word 的加载项，转到 COM 加载项，在此勾选 Endonote 选项即可 ...

今天给大家介绍强大的 graphpad prism 8.0 是如何进行多因素方差分析的，我们以双（多）分析中的析因分析为例来介绍。首先我们要明确，析因分析所关心的问题主要有两个：两个或两个以上处理因素的各处理水平间均数有无差异？及主效应有无统计学意义两个或两个以上处理因素之间有无交互作用话不多说，我们直接开始：1. 为了方便仍然以 sample data 来介绍，如下图。当然也可以按照第二种选择，设定平行样本数，即可得到数据表。2. 点击 analyze ...

我们都知道，小提琴图能显示数据的集中与离散程度，数据越集中图形越胖。另外，其箱线图可用来展示中位数和四分位数。一般来说呢，R 语言绘制小提琴图更佳，但是 R 语言学习代价太高，科研小白难以掌握，所以我们该如何绘制小提琴图呢？具体的操作步骤：先说明一下哈，本次教程使用的是 graphpad prism 8.0 ，界面美观系统，功能强大。1. 进入软件→ New table&graph → Column → Data table → Enter or import data a new table → Options → E ...