干细胞龛的概念——作为多能干细胞的微环境——是一个古老的概念,但随着识别干细胞和可视化生态位的工具的进步,这一概念也在不断发展。在为BMC生物学的一篇新论坛文章中,来自不同领域的八名专家讨论了干细胞生态位的定义以及他们正在研究的生态位的重要意义。讨论的领域包括完善线虫生殖系细胞利基(Judith金布尔),皮肤越“古典”领域(Elaine Fuchs)和肠道(Hans聪明),壁龛的肌肉(迪迪埃Montarras和玛格丽特• ...
这篇最新的《基因组医学》社论由客座编辑Stuart Orkin (Dana-Farber癌症研究所)撰写,这是该杂志自2009年创刊以来发表的第250篇文章。这篇发表在6月号上的社论为一系列关于干细胞基因组学的新主题文章奠定了基础。本系列旨在通过特别委托的评论和评论文章,突出这一不断发展的领域中基础和翻译研究的关键进展。Stuart Orkin通过讨论干细胞基因组学和细胞重编程的最新进展来介绍本系列,并预测未来可能出现 ...
BMC医学正在寻求提供干细胞治疗的新转化和临床见解的原始研究报告,作为正在进行的干细胞系列的一部分。这个主题系列将有自己专门的网页,我们的目标是突出一些最重要和最热门的问题——包括干细胞研究的最新进展、争议和挑战,当然还有它们的临床意义。为了开始这个系列,三篇特别委托的BMC医学文章强调了临床干细胞研究中一些最重要和最热门的问题。Hans Snoeck在给转化研究人员的“战斗召唤”中描述了将人类多能干细胞分化为胸 ...
Adobe illustrator是一种应用于出版、多媒体和在线图像的工业标准矢量插画的软件,是一款非常好的图片处理工具,简称AI。作为一只实验狗,总要想办法展示自己的数据结果,漂亮的配图则会给你的文章锦上添花。AI都是可以处理科研用图的神器,不管是示意图模式图、信号转导通路图、通过R或者数据处理软件得到的生图,还是需要后期排版的图表,用AI都可以分分钟搞定。而且对于科研绘图而言,AI中复杂的功能也用不到,掌握最基 ...
讲讲如何用Graphpad Prism5制作生存曲线,摆脱用EXCEL和PPT做图的习惯。 觉得好的话回个帖或者投个票!生存曲线图我们经常能在文献中看到,如下图是一篇在新英格兰杂志中的一个生存图,好像是EXCEL是无能为力了吧。也许你会说,SPSS也能做,但我觉得没Graphpad Prism做起来的图好看。好,废话不多说,进入正题。1. 打开Graphpad Prism5,点击FILENEWNEW PROJECT FILE,或者如下图,都 ...
如果你已经开始使用OneNote,一定会对它的自由排版和云端同步印象深刻。既能随手记录日常待办事项,也可以拼贴各类素材完成一次项目方案,OneNote的好处真的不少。
输入公式需要下载MathType,绘制流程图则要使用Coredraw或者Visio等绘图软件,绘制思维导图又需要Xmind或者Blumind;总是要安装无数个软件在电脑,实在是内存不够啊!而且操作都不简单哦!今天推荐一个可以在线鼠标手写公式和画流程图的神站:webdemowebdemo网址:https://webdemo.myscript.com/webdemo可以完美解决公式输入和流程图的绘制。只需要鼠标轻松 ...
关于OneNote笔记,估计大多数都不陌生,如果你的电脑是微软系统,只要安装了office软件,系统会自带OneNote。如果你的电脑里还没有OneNote,可以到官网进行下载。下载网址:https://products.office.com/zh-CN/onenote1.最像笔记本的笔记软件OneNote 简直就是一本普通笔记本或三孔活页夹,可以在页面的任一角落进行输入,文字、图像、手写,全部包括。2. 树形目录OneNote ...
想知道如何让 Pubmed 自动加载出期刊的影响因子、领域排名吗?想将文献生成二维码方便手机查看或分享吗?今天给大家介绍一个 Pubmed 的小插件 scholarscope。我们以火狐浏览器为例进行介绍:1. 打开浏览器,点击右上角菜单选项,在下拉菜单中选择「附加组件」。2. 进入下一级对话框,输入 scholarscope 进行搜索:3. 得到搜索结果:4. 选中后点击安装,后重启浏览器就可以看到浏览器右上角多了这个小显微镜图标。让我们来使用一下看看效果。 ...
先确定目标基因CRISPR/Cas9 基因敲除实验全记录 1 -- 确定目标基因然后对目的基因进行背景调查CRISPR/Cas9 基因敲除实验全记录 2 -- 目标基因背景调查设计 sgRNA 及引物CRISPR/Cas9 基因敲除实验全记录 3 -- sgRNA 及引物设计CRISPR/Cas9 基因敲除实验全记录 4 -- 构建 sgRNA+Cas9 载体golden gate 构建好载体,酶切验证成功293FT 细胞转染验证(1)sgRNA+pSpCas9 载体用 lipofectamine 3000 转染至 293 ...
前期记录1. 先确定目标基因CRISPR/Cas9 基因敲除实验全记录 12. 然后对目的基因进行背景调查CRISPR/Cas9 基因敲除实验全记录 23. 设计 sgRNA 及引物CRISPR/Cas9 基因敲除实验全记录 3 -- sgRNA 及引物设计读者补充上次推文我针对 sgRNA 设计方面增加了一部分内容,有一位特别棒的读者(简书名:chuxinxzz)在下方给我留言说可以使用 Cas9 +sgRNA 切割效率试剂盒验证切割效率,并且经实践得知,验证结果和实际编辑结果相差 ...
前期记录先确定目标基因CRISPR/Cas9基因敲除实验全记录1然后对目的基因进行背景调查CRISPR/Cas9基因敲除实验全记录2设计sgRNA及引物CRISPR-Cas9基因敲除sgRNA设计CRISPR-Cas9基因敲除sgRNA设计好之后对前期文章的补充:设计sgRNA之后,需要对结果进行判断:但为什么0.7044分数的哪一个没有选,我也不知道为什么,总感觉他们的顺序不是随意的排的。或许有人能解答一 ...
设计了 sgRNA 之后怎么办呢?还是这篇文章先讲一下这里的框架首先是实验设计Experimental design1. Target selection for sgRNA--选择靶点详情见:CRISPR-Cas9 基因敲除 sgRNA 设计 https://www.jianshu.com/p/ 8222f449cb442. Approaches for sgRNA construction and delivery.sgRNA 的合成和投递有两种方式:A)PCR;B)单独的 sgRNA 的表达 ...
以最火热的p53为例Step 1 先找p53基因序列1. NCBI--输入p53并选择物种human:tumor protein p53 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geneimage.png2. Ctrl+F,输入sequence,快速定位(当然其实拉下去就是了),点击Genebankimage.png3. 下载p53基因序列4. 用SnapGene软件打开序列,并简单了解每个元件最好是可以学一下SnapGene这个软件的使 ...
① Nature:揭示蛋白 BORIS 是耐药性癌症产生的罪魁祸首在一项新的研究中,美国研究人员发现一种称为 BORIS 的蛋白是某些儿童癌症的罪魁祸首。这种蛋白能够破解神经母细胞瘤基因组,导致在某些类型的治疗后处于休眠状态的癌细胞苏醒过来,从而引起癌症复发。儿童癌症可能特别容易受到 BORIS 作用的影响。与成人癌症不同的是,它们很少是由 DNA 突变引起的。相反,它们通常是由于表观遗传影响而产生的,包括改变染色质环状结构并对重要基因的表达 ...
今天主要的内容是准备工作1. preparationclear objectives 明确目标--敲除抑癌基因首先,登录 Catalogue Of Somatic Mutations In cancer (COSMIC) Databasehttps://cancer.sanger.ac.uk/cosmic其次,根据癌症类型查看肿瘤体细胞突变统计,并下载体细胞突变 list。find and download接着,找到tumor suppressor gene databaseht ...
PCR过程中免不了遇到各种问题,如扩不出目的条带、有非特异性条带、空白对照出现扩增产物、扩增产物跑胶弥散或拖尾、高保真PCR出现突变等等。今天师兄就带大家来聊一聊PCR的常见问题应该如何解决。PCR实验包括反应体系的配置和反应程序,反应体系中有模板、引物、dNTP、酶、buffer、Mg2+,反应程序又包括预变性、变性、退火、延伸和彻底延伸。那么在PCR出现问题时主要是从反应体系的各个组分和反应程序上来进行调节优化。 ...
很多小伙伴对信号通路都是知其然而不知其所以然,看了那么多信号通路,你知道信号通路到底有什么用吗?先一起了解下信号通路到底是什么,再对常见信号通路的进行总结!信号通路的意义看文献:更好的了解文献中分子的调控机制;区别主变量与因变量解开文章逻辑上的难点。定题:了解热门通路;分子和疾病之间的桥梁。实验设计:了解通路的机制,设计实验内容。信号通路的概念信号通路,信号转导,signal pathway狭义能够把胞外的分子信号经 ...
1. CHO-K1 细胞CHO-K1 细胞是实验中非常常用的一个细胞株,在生物制药中使用也非常广泛。该细胞株培养条件简单,贴壁强度适中,比较容易转染,很适合用它来研究一般哺乳动物基因的功能。来源:Cricetulus griseus (中国仓鼠) 卵巢形态:表皮细胞生长特性:贴壁注释:CHO-K1 由 CHO 衍生而来,CHO 是 T. T. Puck 在 1957 年从一只成年中国仓鼠卵巢获得的。培养液:Ham's F12K(含 2 mM L - 谷氨酰胺,1.5 g/L NaHCO3), 10% 胎牛血清。传代:吸去培养液。 用 0. ...
相信经常与大鼠、小鼠打交道的老师都碰到过这样的情况:大鼠、小鼠不配合,导致我们无法进行相应的操作,比如注射,采血等;又比如被大鼠、小鼠咬住了,等到回过神来,发现大鼠或者小鼠已经重重的掉到地上或者实验台上…… 诸如此类的情况相信还有很多。这些都是我们自己和大鼠、小鼠的本能反应,那如何操作能让我们顺利完成相应的实验,同时小鼠也能相对舒服呢?今天,我们就说说大鼠与小鼠的固定方法。首先引入两个术语: Handling (处理) 和 Restra ...