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        丁香实验推荐阅读
        HNADOCK - 一个研究 RNA 与 DNA/RNA 互作的平台

        核酸(RNA/DNA)之间的相互作用在许多基本的细胞活动中起着重要作用,例如转录调控,RNA加工和蛋白质合成。因此,确定RNA/DNA之间的复杂结构对于理解相关核酸相互作用的分子机制至关重要。因为结构往往决定了分子的功能,这种核酸-核酸相互作用的结构建模和预测对于理解原子级相关生物过程的分子机制,进而开发针对相互作用的干预性治疗药物或措施也是至关重要的。因为采用实验技术来探究RNA/DNA之间相互作用通常是复杂 ...

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        如何顺利发表一篇 SCI ?

        SCI 的发表对于硕士,尤其博士,是必须的一种技能,也是一道难关。所谓大道无形,小道可走。下面给出一些博士期间的撰写心得,希望能有所裨益。文章可以有三个境界: 毕业、科研、贡献。现在只说第一个,为了毕业。这里的文章,可以指 EI 文章、SCI 文章。我把文章分成三个阶段: 阅读、写、改。一、阅读 SCI 论文即: 阅读哪些文章 (对象),阅读文章的目的是什么 (目标),怎么阅读 (方法)1. 阅读什么文章。阅读文章,需要阅读经典的专业基础文章、survey(概述) 文章,及 5 - 10 篇左右阅读新 ...

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        如何用 R 语言绘制嵌套条形图

        多嵌套图拼接的 R 语言实现1. 原文研究设计及图片还原思路首先来看一下文献的原图吧~原文作者在对不同年龄(幼鼠和成年鼠),不同性别(雌/雄)进行某种刺激后,在 7 个时间点(1 为刺激前,6 为最后 1 次刺激,7 为刺激后一段时间)分别对 3 个效应指标进行了测量。在进行结果展示时,作者放弃了常规的统计表格,选择了上图的形式,按照年龄,性别分为 4 层,每层 3 个子图,分别反映 3 个不同的指标。不难看出,原图由 12 个嵌套图组成,每个嵌套图又由 1 个主图和 1 个子图拼接而成。其中,主图采用散点与误差棒 ...

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        如何用 R 语言绘制散点图?

        R 语言绘图-散点图散点图是展示两个或多个数值型变量相关性特征的常用工具,通常包括简单散点图、三维散点图、矩阵散点图等。简单散点图简单散点图是将观测数据绘制在一个二维平面中,以此观察数值型变量之间的相关性。我们以 R 中 ggplot2 包中的 mtcars 数据集来讲述一下 R 如何绘制简单散点图。ggplot2 包的安装及调用install.packages("ggplot2")#安装 ggplot2 包#library(ggplot2)#ggplot2 包#1 ...

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        10.12 Science 揭示 RNA-Seq 数据有助于发现罕见的遗传变异;轮状病毒感染或可引起 1 型糖尿病

        ① Science 揭示 RNA-Seq 数据有助于发现罕见的遗传变异纽约基因组中心、哥伦比亚大学等机构的研究人员近日在《Science》杂志上发文,称 RNA 测序数据有助于发现罕见的遗传变异。他们开发出一种新颖方法,能够通过了解两个等位基因的表达失衡来诊断罕见疾病。文章的第一作者、斯克里普斯转化科学研究所的 Pejman Mohammadi 博士表示,出现罕见疾病时,罕见的遗传变异通常会出现在一个拷贝上。查看一群人的每个基因就能了解亲本拷贝 ...

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        零基础菜鸟:如何快速写出高质量的 SCI 论文题目和摘要

        一、如何翻译出好标题?1、拆分关键成纤维细胞源性外泌体-miR-520b作为潜在的胰腺癌治疗手段2、理清关键词成纤维细胞源性外泌体-miR-520b作为潜在的胰腺癌治疗手段纤维细胞能够释放外泌体,外泌体中的miR-520b能够影响胰腺癌细胞。3、百度学术模仿➤ 提取核心关键词➤ 核心关键词搜索➤ 影响因子查询网站http://www.letpub.com.cn/index.php?page=journalapp&view=search1 ...

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        DISCOVER-Seq——Science 检测CRISPR脱靶效应的新方法

        自从 CRISPR 基因组编辑技术问世以来,它已经显示出了治疗许多棘手疾病的巨大希望。然而,科学家们一直在努力确定与治疗有关的细胞类型的潜在非靶向效应,这仍然是临床转化的主要障碍。现在,Gladstone 研究所和创新基因组学研究所(IGI)的一组科学家与 AstraZeneca 合作开发了一种可靠的方法来实现这一点。CRISPR 通过在特定位置切割 DNA 来编辑一个人的基因组。挑战在于确保该工具不会在 DNA 上的其他地方进行切割,即所谓的「脱 ...

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        10.11 PNAS 揭示生长素调控细胞分裂模式新机制;外泌体 HIV- 1 Tat 对人细胞蛋白表达的影响

        ① PNAS 揭示生长素调控细胞分裂模式新机制细胞分裂模式在器官的形成过程中发挥着至关重要的作用。在植物中,生长素作为最重要的激素之一已经被报道在器官发育过程中调控细胞的分裂模式,然而细胞分裂模式如何在时空上被生长素精确调控仍然知之甚少。福建农林大学海峡联合研究院徐通达课题组报道了非经典的植物生长素信号通过类受体蛋白激酶 Transmembrane kinases (TMKs) 调控侧根发育过程中细胞分裂模式的分子机制。研究发 ...

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        干细胞的个体性、随机行为和药物发现

        为什么考虑干细胞的个体性很重要?数学方程能预测什么时候干细胞突变会导致潜在的致命疾病吗?多能干细胞会成为未来的疾病模型、推动药物发现和预测副作用吗?这是生物医学中心的三家旗舰期刊(BMC生物学、BMC医学和基因组医学)最近在《BMC生物学》杂志上发表的干细胞专题系列文章中讨论的一些问题。作为开场白,《BMC生物学》系列丛书的咨询编辑Arthur Lander评论说,目前干细胞生物学的概念可能没有考虑到“干细胞的个体性 ...

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        剑桥大学神经干细胞研究中心

        BioMed Central上周参加了剑桥神经干细胞研讨会。这次会议是由剑桥干细胞计划联合主办的,旨在集中关注神经干细胞生物学领域的最新进展,并鼓励近300名代表之间的进一步合作和互动。这次会议收集暴露了在神经发生领域发现的加速步伐,特别是在正常成年人中,以及在疾病中生长和分化缺陷的作用。生物医学中心的旗舰期刊《BMC生物学》、《BMC医学》和《基因组医学》最近出版了干细胞主题系列,与会者对此非常感兴趣。格尔德•克佩 ...

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        亚太干细胞研究——需要论文

        干细胞研究与治疗邀请提交原始研究手稿,已纳入一个关于亚太地区干细胞研究的特别系列,于2012年出版。该系列丛书由台湾阳明大学的Oscar Lee、美国南加州大学的Shi Songtao、中国卫生科学研究所的Shi Yufang和Ying Jin编辑,旨在展示在该领域开展的广泛和创新的工作。开放获取的研究文章将与一系列由该领域的领导人撰写的评论和观点文章一起发表,这些领导人包括康庆新(Kyung-Sun Kang)、郭泓志(Hung ...

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        10.10 Nature 子刊揭示控制自身免疫反应的分子机制

        ① Nature 子刊揭示控制自身免疫反应的分子机制近日,一项刊登在国际杂志 Nature Immunology 上的研究报告中,来自维也纳生物中心的科学家们通过研究分析了沉默或唤醒自体反应 B 细胞的两种拮抗机制,这两种机制受到了 Ikaros 蛋白的控制,因此其能够控制自身免疫力。当小鼠成熟的 B 细胞中缺少 Ikaros 时,研究者就能观察到较高级别的自身免疫力,这就促使他们开始研究两种开启或关闭 B 细胞的特殊机制,B 细胞抗原受体(BCR)的无效应性是一种特殊 ...

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        手把手教你用 Imaris 统计动画里的细胞数据

        如果给你一张静态的染色图,你可能觉得 so easy,老板再也不用担心我没有统计结果了。如果给你一个动画,你会不会傻眼了呢?看着攀爬的细胞,你脑子里闪过高中物理知识,这个细胞迁移长度,位移,速率,轨迹都是重要的参数啊,可是怎么统计呢?定性的说明不再被买账,而定量的统计结果成为刚需。今天向大家介绍一个有用的软件「Imaris」,可以自动统计细胞动态迁移图中细胞迁移的各种参数。具体操作如下1. 在 Imaris 中点击「open」,点击一下( ...

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        Sci-hub 又打不开?Kopernio助你分分钟下载好文献

        作为一个爱看文献的科研狗,不能下到想看的文献一直是一件很头疼的事情,好在我们一直有 Sci-hub 这个神器,导师再也不用担心我们看不到文献了。但是…...Sci-hub 经常会打不开,打不开,打不开~那我们应该如何是好呢?这不,实验菌今天又给大家寻觅了一个神器~科睿唯安大家想必都很了解,就一个字,牛!科睿唯安(ClarivateAnalytics)是全球专业信息提供与分析服务领域的领导者。科睿唯安旗下拥有诸多业界知名品牌,包括 Web ...

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        科研热点还不会找?感觉自己做了「假」科研…

        「科研汪」每天除了吃饭睡觉做实验外,干的最多的活莫过于阅读文献了,还经常幻想下一刻实验现象就按照自己预想的呈现,再发个大 paper,走上人生巅峰。好了,少年该醒醒了。回到现实,首先你需要一个好的方案,而方案来源就是跟踪研究热潮。每一个方向都只会热一段时间,研究后期想要发好文章相对较难,所以追踪科研潮流,抢占先机的重要性不言而喻。我把自己常用的几种追踪前沿文献的方法总结如下,大家可以结合自身情况选择。根据习惯大致可分 ...

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        多篇 SCI 经验教你如何识别假抗体!

        在Western blot、IHC/ICC/IF、ELISA/FACS(表位)/Co-IP、ChIP等这些实验中,都需要用到抗体,但是抗体市场的庞杂带来了质量的参差不齐,抗体的不可靠性也会给科研带来巨大损失,包括时间和资源上的浪费。2006年耶鲁大学病理学家David Rimm研究了一项有效治疗黑色素瘤皮肤癌的指导方法,这项技术的基础是抗体——可以结合成为特殊生物学分子的Y形大蛋白,而且可以在样本中标志它们的存在。而当他准备 ...

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        如何从顶级 SCI 论文中快速获取基金标书撰写套路 ?

        正在准备国自然的朋友都知道,申请国自然课题过程中困难重重,最让人头疼的就是标书应该怎么写?小编今天要与大家分享如何从顶级SCI论文中获取基金标书撰写思路的方法,正在写标书或者是准备要写标书的小伙伴都可以看一看~

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        安利科研汪们 4 个免费医学视频学习网站,无需注册!

        今天给大家介绍几个免费的国内外医学视频学习网站,视频比较多,还有最新的治疗方案、视频或者图谱、会议、病例讨论等,对医学方面的学习十分有帮助~一、国外网站MedlinePlus 美国国家医学图书馆http://www.nlm.nih.gov/medlineplus/其收藏包括:七百多万本医学和相关学科的书籍,期刊,技术报告,手稿,缩微胶卷,照片和影像,其中包括一些世界上最古老,最稀有作品。这是一个面向公众的健康网站,公英益性质的 ...

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        让你 Chrome 浏览器开挂的插件,这 8 个绝对要装!

        很多人都在使用 Chrome 浏览器,其流畅的浏览体验得到了不少用户的偏爱,但流畅只是一方面,Chrome 最大的优势还是其支持众多强大好用的扩展程序。最近整理了以下 8 款 Chrome 浏览器插件,可以大幅度提升我的们的科研工作效率,在此分享给大家。(以下插件有些也支持别的浏览器,本文主要是介绍将插件安装在 Chrome 浏览器并使用)1、谷歌访问助手让 Chrome 浏览器轻松访问谷歌商店下载地址:http://www.downza.cn/soft/ 26 ...

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        Solid Converter v9 免费的 pdf 转换器,多格式,功能无限制!

        经过多个转换器综合测评后终于发现了一个免费的、功能强悍且稳定的 PDF 转换工具--Solid Converter v9,墙裂推荐给大家。一、Solid Converter v9 软件安装① 下载完成后,双击安装;② 安装过程很简单,这里就不详细说明了;③ 安装完成后,打开软件,将会提示你是试用还是购买软件,这时候选择「我已有解码密码」④选择「解锁密码」后,直接复制以下信息填写以下账号信息即可。名称:SolidConverterPDFv9电子邮件:Solid@C ...

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