全部

RT-qPCR、转录组或者蛋白质组是实验室常用的表征基因的表达水平的方法，然而你知不知道其实不做实验也可以预测目标基因的表达水平呢？测序技术的高速发展使数据库中可获得的 DNA 序列大量增长，基于这些海量的数据，科学家们进行了一些与 DNA 组成相关的统计分析，如密码子的使用情况。很快科学家就发现物种的基因之间存在相当大的密码子使用异质性，并且密码子偏好性的程度与基因的表达量成正相关。基因在物种之间存在的密码子使用偏好差异 ...

在上期的教程中，我们初步了解了 CiteSpace 的一些基本功能以及如何安装 CiteSpace。在本期的教程中，我们就利用真实数据，教大家如何使用 CiteSpace 快速锁定领域内最新研究热点。首先，打开 CiteSpace 之后，出现的就是下图的界面，我们点击「date」中的功能链接，我们就可以看到该软件能够分析的数据库名称：一、前期数据准备今天，我们就从我们最熟悉的数据库-CNKI（中国知网）开始！我们就先以《中国细胞生物学学报》近五 ...

卡方检验是一种常用的假设检验方法，属于非参数检验，主要是比较两个及两个以上样本率（构成比）以及两个分类变量的关联性分析。它包括两个率或两个构成比比较的卡方检验；多个率或多个构成比比较的卡方检验以及分类资料的相关分析等。今天继续给大家介绍 graphpad 统计分析系列教程中的卡方检验。同样还是以 sample data 来给大家介绍。1. 打开软件，在 contingency 模块下，如下图进行选择注：如果期望频数有其中之一小于 5，那么就应该使用 ...

① Nature：在人类癌症基因组非编码区域中鉴别出关键的致癌突变近年来，癌症驱动基因引起了广泛的关注。不过，人们过去发现的驱动突变主要集中在蛋白质编码区，而广大的非编码区仍被称为癌症基因组中的「暗物质」。人们有意探索 RNA 剪接在癌症中的作用，但由于 snRNA 重复性等挑战，从剪接体（spliceosome）的非编码成分中发现与癌症相关的改变也并非易事。加拿大研究人员近日在人类癌症基因组的非编码区域中发现了一种新的癌症驱动 ...

在众多文献管理工具里面，Endnote 被广泛用于学术领域。很多新手对于 Endnote 的基础功能使用都存在问题，尤其是如何使用 Endnote 插入文献以及如何使用 Endnote 调整参考文献格式这两点，本文以 Endnote X9 版本为示范，详细讲解一下这两个最常用的操作。Endnote X9 下载：公众号回复关键词 “破解版” 即可获取 Endnote X9 破解版安装包。一、使用 Endnote X9 插入文献用 Endnote X9 插入文献有以下三种方式：1. 用 PMID 插入文献2. 直接导入 E ...

今日跟大家分享的关于 WB 实验的要点及背后的原理。开场时，先 bia 个概念～蛋白质印迹法（免疫印迹试验）即 Western Blot：它是通过特异性抗体对凝胶电泳处理过的细胞或生物组织样品进行着色，通过分析着色的位置、深度获得特定蛋白质在所分析的细胞或组织中表达情况的信息。虽然此定义言简意赅，但总觉其好生硬费解，而对于得花近 2 天时间才能搞定的实验，我们如果没有较充分地理解它，就会很容易出现各种各样的 bug，最后结果也呵呵，对此自己确实深 ...

毕业论文的重要性，相信大家都知道。所以我们在撰写毕业论文前，还要设计一个好看封面。一个好看的毕业论文封面能让人眼前一亮，甚至成为我们的加分项。那么如何制作好看的论文封面呢？如果你不会制作论文封面的话，别急，可以参考下面的方法来制作。只要跟着下面的步骤来，就能快速生成好看的论文封面。具体的操作步骤如下：（1）点击菜单栏中的【插入】，点击【文本框】，选择【横向】，然后绘制出一个方框就行。（2）在绘制好的方框中输入文字，主要输入学 ...

本文源自知乎一文，作者 Tsing软件名称：HistCiteHistCite 是一款非常强大的引文分析工具，1、可以快速绘制出某个研究领域的发展脉络，2、快速锁定某个研究方向的重要文献和学术大牛，3、可以找到某些具有开创性成果的无指定关键词的论文。普通检索方式以文章的被引量判定文章的重要程度，但是并非所有的引用都是有效的，只有相同领域文章的引用才能真正体现文章在这个领域中的实力。因此在 Web of Science（以下简称 WOS） ...

谷歌学术是个神器，但要是用不好没准适得其反。本文介绍的这些技巧，很有可能让你事半功倍。一、利用被引用信息做反向搜索谷歌学术的搜索列表会显示文章被引用的情况。你可以从搜索结果页顺藤摸瓜，点进其他引用了这篇文章的论文。这样能对别人怎么看这篇文章有个了解，还能看出引用者的研究方向和目的是否和你的一样。反向搜索有两个好处，除了能找到新的信息源，你还能根据被引用信息判断某篇文章是否适合出现在你的研究里。二、隐身模式的搜索 ...

一、CRISPR-Cas 系统简介图1 CRISPR-Cas9 系统介绍CRISPR-Cas9 系统是一种被广泛运用的基因组编辑工具，它来源于细菌的适应性免疫系统。CRISPR-Cas9 系统包括：Cas9 酶和一个向导 RNA。 向导 RNA 作用是引导 cas9 到基因组的特异性位点上切割。如图 1 所示。目前为止，CRISPR-Cas9 系统主要有两方面应用: 基因敲除和基因敲入。基因敲除时, 一旦 DNA 的双链断裂反应（DSB）被 Cas9 切割诱导发生, 细胞会启动 NHEJ DNA 修复方式，这会造成 D ...

基本原理CRISPR-Cas9 是一种细菌获得性免疫，用于降解入侵的外源 DNA。CRISPR RNA (crRNA) 与转录激活 crRNA (Trans-activating crRNA， tracrRNA) 退火形成的复合物能特异性识别与其互补的基因组序列，引导 Cas9 核酸内切酶在目的片段生成 DNA 双链断裂，如下图所示。通过基因工程手段对 crRNA 和 tracrRNA 进行改造，将其连接在一起得到 sgRNA (single guide RNA)。通过将表达 sgRNA 的原件与表达 Ca ...

非编码 RNA 可火了，miRNA 大火烧了十几年，现在慢慢地把 lncRNA 的领域也给点着了。现在可能连实验室的插枪头阿姨都知道绝大多数的 RNA 分子并不翻译，这非编码 RNA(noncoding RNA)，包括 miRNA、lncRNA 等。目前主要研究方向集中在非编码 RNA 及其相互结合的 DNA、RNA、蛋白质等科学问题，而科学问题的解答依赖于实验技术的创新使用和革命。ncRNA 可以海陆空全面调控细胞功能，厉害了，其实主要指 lncRNA，而 miRNA、siRNA ...

造血是造血干细胞发育和分化的最佳模型之一。造血是造血干细胞从多功能造血干细胞中分化出具有表型特征的成熟细胞的过程。在他们最近发表在《干细胞研究与治疗》上的综述中，剑桥大学的Bertie Gottgen的小组讨论了造血转录因子的转录调控。转录因子直接调控基因表达，在干细胞维持、谱系承诺和分化中起关键作用;它们是正常发育的强大调节因子，它们的错误表达曾被发现导致白血病。作者回顾了最近的一些研究，这些研究在基因组的多个 ...

干细胞领域是一个非常令人兴奋的领域，无论是基础研究还是转化研究。有鉴于此，《基因组医学》与特约编辑斯图尔特·奥金(Stuart Orkin)将发表一系列评论文章，重点介绍干细胞研究中最重要、最热门的话题——最近的突破、争议、挑战和医学意义。基因组医学关于干细胞基因组学的主题系列将与来自我们两个姊妹期刊的相关的、特别委托的内容一起发表。干细胞生物学的更基本的生物学方面将由BMC生物学涵盖，而BMC医学的重点是目前正在进行 ...

BMC麻醉学:现代器官移植为了纪念BMC麻醉学中新的实体器官移植麻醉和围手术期护理的推出，该科的编辑们写了一篇社论，描述了麻醉学在器官移植中的历史和作用。他们讨论了麻醉方面的许多进展，这些进展有助于器官移植的成功，以及目前在进行特定器官移植时存在的挑战。作为本节的编辑。Saner和Bezinover注意到，移植麻醉领域在主要的麻醉会议和期刊中被低估了。通过这个新的部分，他们希望吸引高质量的研究，继续阐明麻醉研 ...

学任何一个软件，首先当然是了解如何读取、呈现和保存软件处理对象，就像学编程，总要先来一句「Hello，world」一样。对于图像处理软件就是打开图片、获取图片基本信息、对图片进行简单操作，然后保存成所需格式。有了这个基础之后，再去正式学习软件的功能，会事半功倍。Image J 和传统软件不太一样，它把标题栏、菜单栏、工具栏和状态栏集中放在一起，并没有把工作区框起来，而是打开图片之后，以图片悬浮的方式作为各自的工作区。一、打开图 ...

基本概念WGCNA其译为加权基因共表达网络分析。该分析方法旨在寻找协同表达的基因模块(module)，并探索基因网络与关注的表型之间的关联关系，以及网络中的核心基因。适用于复杂的数据模式，推荐5组(或者15个样品)以上的数据。一般可应用的研究方向有：不同器官或组织类型发育调控、同一组织不同发育调控、非生物胁迫不同时间点应答、病原菌侵染后不同时间点应答。基本原理从方法上来讲，WGCNA分为表达量聚类分析和表型关联两 ...

之前看帖子说 histcite 可以用来先筛选文献，（这么晚才知道，智商捉急啊）自己就下了，从下载到安装花了很长时间，中间弯了好几道弯路才成功，所以想说几点失败的小经验给大家，不知道会不会有用，因为自己是新手，估摸也回答不了什么问题。哈哈！1. 软件下载可以在帖子里找找，有好心人贴出来了，我也在那下的，装上就好；2. 装后开始的时候怎么都分析不了，出现如下图片解决方法是在 c 盘建立一个 fakepath 文件夹，然后把从 wos 导出的文件放在文件夹内就 ...

前几天，有朋友问到小编：我正在进行一项 Meta 分析的检索，发现 PubMed 和 EMBASE 在主题词、自由词使用完全一致的情况下，而结果却是极大的不同，前者文献量远远小于后者文献量，究竟这是怎么回事呢？因此小编就 PubMed 和 EMBASE 在检索使用中存在的异同点展开了探索。在制定文献检索策略时，总体的要求就是查全和查准。医药类的数据库常用的有：PubMed、MEDLINE、the Cochrane library、OVID、EMBASE、ISI W ...

有很多朋友询问做系统评价/Meta分析的时候需要用Embase、ClinicalKey数据库去检索文献，但是问题是这2个数据库是付费的，不给Money搜索网页都进不去，由于很少有学校购买这2个数据库，所以对于很多朋友来说完成Meta分析就比较麻烦。那么怎么去获得这2个数据库的检索权限呢？1.如有你的学校或者单位有购买权限，那么请忽略这篇文章！（很少会有学校或者单位购买，如果有，那么本人表示十分羡慕！因为我这没有！ ...