【求助】求进化树构建软件
丁香园论坛
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本人最近需要对一批测序克隆进行进化树分析，但是看文献好像有多种不同的进化树构建方式，不知道哪个软件比较合适？我想构建的是细菌的进化树，哪位高人如有能否发我一个啊？xumin101977@163.com 不胜感激！
参考文献啊，有很多的，例如mega。
用mega吧，这个软件是最专业的！
中低端：MEGA(free)
http://www.megasoftware.net
中端：phylip(free)
http://cmgm.stanford.edu/phylip
高端: paup(commercial)
http://paup.csit.fsu.edu/downl.html
最适合生物学研究者使用的是MEGA，易学易用。
http://www.megasoftware.net
中端：phylip(free)
http://cmgm.stanford.edu/phylip
高端: paup(commercial)
http://paup.csit.fsu.edu/downl.html
最适合生物学研究者使用的是MEGA，易学易用。
gel compare
还有这个公司出的bionumberics
如果有 DiversiLab最好，比较适合细菌基因分型，常用于院内细菌感染研究中。
但是以上软件没有free的，都需要花钱，而且不少。
~undefined*的好像没有，因为这几个商业软件都用了加密狗，很难crack。
还有这个公司出的bionumberics
如果有 DiversiLab最好，比较适合细菌基因分型，常用于院内细菌感染研究中。
但是以上软件没有free的，都需要花钱，而且不少。
~undefined*的好像没有，因为这几个商业软件都用了加密狗，很难crack。
paup，本论坛上的**版的了。MrBayes也可以偿试下。
DNAman,DNASTAR, RNAst
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