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        系统进化树问题,如何确定相关序列?

        相关实验:蛋白定量技术

        user-title

        哇哈哈哈321

        想请问1000条以上的氨基酸序列,同源性较差用什么软件建树比较好,MEGA不行,大概是序列太多,总显示内存不足,求前辈帮帮忙吧!

        wx-share
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        3 个回答

        user-title

        dxy_gwrp7ndq

        有帮助

        NCBI 、DNAMAN 、DNAStar 、Bio edit 均可构建进化树

        user-title

        府宅

        有帮助

        FastTree可计算上千条,还给出了每个节点的可信度

        user-title

        洛噜啦噜啦嘞

        有帮助

        可以用MUSCLE 先再比对下, http://www.ebi.ac.uk/Tools/msa/muscle/

        再MEGA试, 过短和过长的序列都不要, 选 pairwise deletion 参数

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