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        PCR引物设计及相关软件使用(二)

        互联网

        3693

        引物编辑

        PCR引物设计及相关软件使用(二)
        PCR引物设计及相关软件使用(二)

        Some other useful function of PP5

        Enzyme

        PCR引物设计及相关软件使用(二)


        Melting temperature graph

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        GC% graph

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        Stability

        PCR引物设计及相关软件使用(二)


        (五)Oligo 6.44 使用说明

        主要功能:专门的引物设计软件

        Oligo 6.44 启动界面

        PCR引物设计及相关软件使用(二)

        3个弹出窗口

        PCR引物设计及相关软件使用(二)



        PCR引物设计及相关软件使用(二)
        PCR引物设计及相关软件使用(二)

        用Oligo 设计引物时的3个标准

        Tm 值曲线以选取5‘到3’的下降形状有利于引物引发聚合反应。

        Frq 曲线宜选用3‘端Frq 值相对较低的片段。

        ΔG 值在5’端和中间值比较高,而在3‘端相对低

        PCR引物设计及相关软件使用(二)


        选中引物

        PCR引物设计及相关软件使用(二)

        引物分析

        首先检查引物二聚体尤其是3’端二聚体形成的可能性。

        二项检查是发夹结构(hairpin);与二聚体相同,发夹结构的能值越低越好。

        第三项检查为GC 含量,以45-55%为宜。

        第四False priming 检查

        Final PCR information

        PCR引物设计及相关软件使用(二)

        Search for primer using Oligo 6.44

        PCR引物设计及相关软件使用(二)

        Online primer3 service

        http://frodo.wi.mit.edu/

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