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        【求助】NCBI protein中各个条目的含义

        丁香园论坛

        7327
        LOCUS DAA06302 180 aa linear ROD 26-SEP-2008
        DEFINITION TPA_inf: major urinary protein 6 [Mus musculus].
        ACCESSION DAA06302
        VERSION DAA06302.1 GI:206725620
        DBSOURCE accession BK006646.1
        KEYWORDS Third Party Annotation; TPA; TPA:inferential.
        SOURCE Mus musculus (house mouse)
        ORGANISM Mus musculus
        Eukaryota; Metazoa; Chordata; Craniata; Vertebrata; Euteleostomi;
        Mammalia; Eutheria; Euarchontoglires; Glires; Rodentia;
        Sciurognathi; Muroidea; Muridae; Murinae; Mus.
        REFERENCE 1 (residues 1 to 180)
        AUTHORS Chamero,P., Marton,T.F., Logan,D.W., Flanagan,K., Cruz,J.R.,
        Saghatelian,A., Cravatt,B.F. and Stowers,L.
        TITLE Identification of protein pheromones that promote aggressive
        behaviour
        JOURNAL Nature 450 (7171), 899-902 (2007)
        PUBMED 18064011
        REFERENCE 2 (residues 1 to 180)
        AUTHORS Logan,D.W., Marton,T.F. and Stowers,L.
        TITLE Species specificity in major urinary proteins by parallel evolution
        JOURNAL PLoS ONE 3 (9), E3280 (2008)
        PUBMED 18815613
        REMARK Publication Status: Online-Only
        REFERENCE 3 (residues 1 to 180)
        AUTHORS Logan,D.W., Marton,T.F. and Stowers,L.
        TITLE Direct Submission
        JOURNAL Submitted (13-JUN-2008) Cell Biology, The Scripps Research
        Institute, La Jolla, CA 92030, USA
        COMMENT Method: conceptual translation supplied by author.
        FEATURES Location/Qualifiers
        source 1..180
        /organism="Mus musculus"
        /db_xref="taxon:10090"
        Protein 1..180
        /product="major urinary protein 6"
        /note="Mup6"
        Region 34..170
        /region_name="Lipocalin"
        /note="Lipocalin / cytosolic fatty-acid binding protein
        family; cl01150"
        /db_xref="CDD:141125"
        CDS 1..180
        /gene="Mup6"
        /coded_by="join(BK006646.1:1..96,BK006646.1:435..568,
        BK006646.1:1327..1400,BK006646.1:2038..2148,
        BK006646.1:2489..2590,BK006646.1:2754..2779)"
        ORIGIN
        1 mkmllllclg ltlvcvhaee asstgrnfnv ekingewhti ilasdkreki edngnfrlfl
        61 eqihvlensl vlkfhtvrde ecselsmvad ktekageysv tydgfntfti pktdydnflm
        121 ahlinekdge tfqlmglygr epdlssdike rfaqlceehg ilreniidls nanrclqare
        请问:region 34..170的内容是什么;region中region name、note、family和db_xref各代表什么意思呢?谢谢!
        你找的这个蛋白一共有180个氨基酸,所以:
        region 34..170是指:第34-170个氨基酸;

        region name:是指第34-170个氨基酸形成的结构域是“Lipocalin”

        note:解释了这个结构域的全称;

        family:应该是这个蛋白属于哪个家族蛋白吧。不是很清楚。

        db_xref:这个不是很清楚。
        /db_xref="CDD:141125" 应该是指和其他数据库的关联,CDD就是编码序列数据库。谢谢楼上2位
        太感谢了!提供了一个很好的链接!
        链接怎么打不开啊

        本文由丁香园论坛提供,想了解更多有用的、有意思的前沿资讯以及酷炫的实验方法的你,都可以成为师兄的好伙伴

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