自由组合定律 law of independent assortment
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也称孟德尔第二定律：在配子形成时各对等位基因彼此分离后，独立自由地组合到配子中。
该定律意义：
(1)自由组合定律也同样具有广泛适用性，不仅植物，动物中也同样存在，如一个很有趣的昆虫行为遗传的例子，那是蜜蜂的卫生品系，它可识别患了腐臭病（foul brood）的幼虫，将蜂房的盖子打开，拖出患病的幼蜂再扔掉，使整个蜂巢保持清洁。但还有另一种不卫生品系，不具有以上行为。将这两种蜜蜂杂交，产生的后代（F1）全部是卫生品系，F1互交产生的F2代有四种类型，一种是卫生品系，另一种是只会揭开蜂房的盖子，而不会拖出病蜂，还有一种类型是不会揭开盖子，如果人们帮它将盖子打开，这些蜜蜂会将病蜂拖出，第四种类型是不卫生品系，既不会揭开盖子，也不会将病蜂拖出。这四种类型的比例为9:3:3:1，符合自由组合定律。
(2)由于自由组合的存在使各种生物群体中存在着多样性，使世界变得丰富多彩，使得生物得以生存和进化。
(3)人们将自由组合的理论可以应用于育种，将那些具有不同优良性状的动物或植物，通过杂交使多种优良性状集中于杂种后代中，以满足人类的需求。
规律来历的介绍：
孟德尔在实验中不仅观察一对性状的遗传，而且还仔细观察分析了两对性状的遗传，也就是双杂种的杂交情况。孟德尔将黄色圆型的豌豆和绿色皱缩的豌豆杂交，黄色对绿色为显性，圆型对皱缩为显性，杂交一代的表型全部为黄色圆型。F1代自交后产生了四种不同表型的籽粒（F2）代，黄色圆型籽粒为315个，黄色皱缩的101粒，绿色圆型的108粒，绿色皱缩的32粒，它们之间的比例近似于9:3:3:1。其中和亲本性状组合相同的后代，黄色圆型和绿色皱缩的称亲组合（parental combination），而不同于亲本形状组合的后代，黄色皱缩和绿色圆型的称重组合（recombination）。为什么会产生这样的比例呢？孟德尔进行了富有逻辑性的分析，首先只看其中的一对性状，如亲本为黄色绿色籽粒的遗传，F1代全为黄色，F2代416粒为黄色，140粒为绿色。两者之比正好符合3：1。再看另一对性状圆型和皱缩，F1代全部呈现为显性性状圆型，F2代423粒为圆型，133粒为皱缩，两者之比为3：18，也符合3：1。看来各种情况并不混合，而是独立遗传的。在F2代中除了亲组合以外，又出现了重组合，而且各种表型籽粒的比例为9:3:3:1，正是（3 1）的二次方展开式，孟德尔推测这是两对性状自由组合的结果。
与分离定律相同，黄色圆型亲本为显性性状，基因型为RRYY；只能产生一种基因型的配子RY，绿色皱缩的亲本为隐性性状，基因型为rryy，也只能产生一种配子，基因型为ry。杂交后F1代是杂合体，两种配子结合，基因型为RrYy。当F2产生配子时等位基因Rr彼此分离，等位基因Yy也同样如此，彼此自由组合，形成四种不同基因型的配子:RY、Ry、rY和ry。四种不同配子又随机结合受精，在F1上结四种不同的豆粒，它们的基因型应为9种，表型为4种，比例为9:3:3:1。
