• 我要登录|
  • 免费注册
    |
  • 我的丁香通
    • 企业机构:
    • 成为企业机构
    • 个人用户:
    • 个人中心
  • 移动端
    移动端
丁香通 logo丁香实验_LOGO
搜实验

    大家都在搜

      大家都在搜

        0 人通过求购买到了急需的产品
        免费发布求购
        发布求购
        点赞
        收藏
        wx-share
        分享

        WB实战指南(十一)之 Quantity One高斯建模与分析

        丁香园

        4622

        Quantity One

        高斯建模与结果分析:

        a.高斯建模,即用数学方法(微积分)对正态分布曲线进行统计分析。理论上每道band的光密度都呈正态分布的平滑曲线(每个band中间位置蛋白压缩最紧浓度最高,向上向下因扩散而减弱);然而实际操作过程中,如果荧光过强,往往出现类似方波的曲线(曲线无peak峰,上方为平滑直线,超识别的最高阈值);荧光较弱宜出现波浪样(多)波峰,或难与背景区分。

        首先电脑会统计band中每个点的光密度值,并对这些值按正态分布进行归类,当读值不符合正态分布的原理时,电脑会自动做出选择以对偏离正态分布的数据进行统计学取舍(置信区间),从而最终优化光密度曲线呈正态分布。

        如何进行高斯建模呢?很简单,只要执行“Band-Gauss Model Bands...”命令就可以了,执行后Quantity One回弹出一个对话框问您要对那条泳道进行高斯建模。请钩选“One”,然后再输入需要建模的泳道代码就可以了;如果选择了“All”则对所有泳道进行高斯建模,当然建模这么多泳道会费一点时间了。

        b.观察结果:执行完高斯建模以后使用“Band-Band Information”命令来观察结果。

        方法是将变成蓝色惊叹号的鼠标移到刚才已经识别的Band的部位,一个详细的“Band Information”信息框就会立刻弹出来。在这幅图中我们必须注意的是“Trace”和/或“Gauss Model Trace”,因为我们刚才辛苦了半天就是为了得到这个数据。这个数据表示的就是Band光密度分布曲线下面积,也就是Quantity One用来表达Band内分子总量的方式。

        最后,我们计算、记录的值,应该是“Gauss Model Trace”这一栏的读值。

        目前看来,基本算是改完了;当然仍然可能有疏漏或遗忘的地方,我会不定期做细节的修改、补充,但至多只是局部修修补补。感谢大家能够耐心阅读完这么长的东西

        感谢丁香园论坛铁杆站友 jacqueslm2001

        ad image
        提问
        扫一扫
        丁香实验小程序二维码
        实验小助手
        丁香实验公众号二维码
        扫码领资料
        反馈
        TOP
        打开小程序