2013年11月12日，来自加利福尼亚州圣克拉拉的消息——Affymetrix公司（纳斯达克代码：AFFX）宣布推出一款多基因组的病原体芯片。此款芯片是由美国FDA的食品安全和应用营养中心（CFSAN）设计、Affymetrix制造，可在食源性疾病爆发期间检测和鉴定致病大肠杆菌。
这一DNA芯片分析适用于Affymetrix GeneAtlas®个人型芯片系统，能够在疫情爆发情况时实时检测、区分并独特地鉴定出食品、临床样品以及环境样品中的大肠杆菌菌株。
此款定制设计的芯片包含数万个生物标记，来自超过250个大肠杆菌全基因组序列，使其真实再现了大肠杆菌泛基因组（PanGenome）。除了包含每个已知的大肠杆菌基因（>40,000），设计还包含了超过10,000个高信息量的单核苷酸多态性（SNP）标志物。
因此，这款混合芯片是高度区分性的，并带有生物和进化的信息。此外，采用Affymetrix的芯片条技术(Array Strip)，芯片分析速度快（<24小时）、通量高、半自动化，且经济实惠。
Minimal Signature E. coli Array（FDA-ECID）集FDA分子生物学部门7年研发之大成。病原体鉴定芯片上目标的选择是作为理性设计策略的一部分，在很大程度上基于之前的爆发疫情研究所获得的数据，这些研究也采用了之前一些Affymetrix定制芯片设计；包括GeneChip® E. coli Genome 2.0 Array和FDA-E. coli-Shigella (ECSG) Array。
在实时疫情爆发研究中，FDA的比较基因组研究证明了临床上、时间上和地理位置上不同事件的快速鉴定和清晰区分。
此芯片是一个在基因组规模对食源性病原体进行分子分型的完整方案。与FDA的Microbial ArrayTrack™ 软件共同使用，用户将拥有一个齐全、定制的芯片数据存储、分析和可视化解决方案。
Microbial ArrayTrack是由FDA国家毒理学研究中心（NCTR）的生物信息学家开发的，作为一个高端的芯片数据存储、分析和可视化软件包。因此，Microbial ArrayTrack如今包含ECID特定的注释，配合定制和经过验证的数据分析和可视化方案。
“Affymetrix很高兴看到我们与FDA的长期合作关系催生了一款食源性病原体的监控工具。预防大规模疫情爆发的关键在于尽量快速、准确且轻松地检测和鉴定污染物及食源性疾病。
基因组学/生物信息学的综合解决方案是食品安全应用中不可或缺的工具，快速回答了严重问题”Affymetrix表达业务部门的高级副总裁Kevin Cannon博士谈道。
目前Affymetrix可以对外出售该芯片。
请注意：Affymetrix、Affymetrix的徽标、GeneAtlas和GeneChip商标均为Affymetrix公司所有。其他所有商标均为其各自所有者所有。
来源：Affymetrix公司
前瞻性声明
本新闻稿中所有非历史性声明均为符合不时修订的《证券交易法》第21E节所述含义的“前瞻性声明”，包括关于Affymetrix的“期望”、“信念”、“预期”、“打算”、“战略”等事项的声明。
这些声明均受各种风险和不确定因素的影响，实际结果可能与Affymetrix所预测的情形有很大出入。Affymetrix在截至2012年12月31日的Form 10-K年报中以及其他SEC报告中说明了这些风险因素和其他因素。
关于Affymetrix
Affymetrix技术在细胞、蛋白和基因水平实现了生物学系统的多重和同时分析，有助于实验室中的研究快速转化到关系人类健康和福祉的临床和日常使用。
我们努力提供领先和支持，并与制药、诊断和生物技术公司，以及领先的科研、政府和非营利研究所合作，寻求利用生物学让世界更美好的答案。
目前已有2,300多个芯片系统销往世界各地，并利用此技术发表了48,000多篇同行评审的论文。Affymetrix的总部位于美国加利福尼亚州的圣克拉拉，并在克里夫兰、俄亥俄、圣地亚哥、维也纳和新加坡拥有生产基地。该公司在全球拥有约1,100名员工，其销售和分销业务覆盖欧洲、亚洲和拉丁美洲。
