一种新型的生物信号通路的图形建模方案

学科：生物信息学

2018年3月15日，发表在《nature protocals》上的一篇文章，提出了对生物学家友好的图形建模方案，该方案有助于构建详细的信号网络图，总结生物通路的组成部分（如蛋白质和生物化学物质），并说明它们是怎么相互作用的。这些图表能模仿信号通路的活动流，从而将其动态行为模型化。

亮点：与建模路径的许多数学方法不同，它不需要为模型参数化构建一系列方程或速率常数。根据模型的复杂性和信息可用性，其构建可能需要几天到几个月的时间，也可能需要几年才能完善。但是，一旦进行组装和参数化，模拟运行即使在大型模型上也只需几秒钟。

未来运用：使用这种方法构建的模型为生物信息学的知识管理、信息交换提供了一种手段。这种方法通过对其动态活动进行计算模拟，提出假设和测试，以及扰动时进行系统行为预测。