• 我要登录|
  • 免费注册
    |
  • 我的丁香通
    • 企业机构:
    • 成为企业机构
    • 个人用户:
    • 个人中心
  • 移动端
    移动端
丁香通 logo丁香实验_LOGO
搜实验

    大家都在搜

      大家都在搜

        0 人通过求购买到了急需的产品
        免费发布求购
        发布求购
        点赞
        收藏
        wx-share
        分享

        恢复类型

        741

        人类白细胞抗原(HLA)是基因组中最具多态性的区域,在免疫应答中起着关键作用。在人类中,HLA基因包含在主要组织相容性复合体(MHC)位点中,由位于6号染色体上的200多个基因组成。确定个人HLA类型在医学的许多方面都是至关重要的,包括移植,为了避免排斥反应,供体和受体的组织类型必须匹配。

        该区域巨大的遗传异质性对HLA分型提出了重大挑战。传统上,HLA分型是通过血清学检测(使用白细胞)或DNA检测(从白细胞中提取DNA)来进行的,并依赖于要研究的特定区域的扩增。

        最近发表在《基因组医学》(Genome Medicine)杂志上的两篇论文描述了使用下一代序列(Next Generation Sequence, NGS) reads获取个人HLA类型的计算方法。Rene Warren和他的同事提出了一种从散弹枪序列数据集直接识别HLA等位基因的计算方法HLAminer。Sebastian Boegel及其同事提出了seq2HLA,这是一种从RNA-Seq序列中确定HLA等位基因的软件工具。两种方法的优点是显而易见的;可以直接从序列读取进行HLA调用,从而减少了生成HLA特定数据的需要,并且可以用于现有和未来的数据集,而不需要额外的实验室协议。随着这些方法的特异性和分辨率的增加,这些技术可以节省宝贵的时间和金钱在诊所,以及解锁有价值的信息从数据集没有额外的实验。

        ad image
        提问
        扫一扫
        丁香实验小程序二维码
        实验小助手
        丁香实验公众号二维码
        扫码领资料
        反馈
        TOP
        打开小程序