染色体免疫共沉淀（chip）

很多老师关心自己研究的某些关键基因上是否有目的蛋白结合或者是否有组蛋白修饰，别着急，小编今天有备而来，就给大家讲这个。 reads在Peak关联基因上的分布图，是选取筛选到Peak的基因，进行作图，展示比对到该基因的reads的覆盖深度分布，通俗的说，就是该基因上目的蛋白的结合分布，横坐标显示基因位置，纵坐标表示reads数（reads count）。这是项目KC2018-CXX，植物某转录因子ChIP测序的一张read ...

ChIP测序结果图怎么用来发文章ChIP测序中关键的结果图，这些结果即体现了ChIP实验和测序的成功，可以帮助我们了解目的蛋白的结合甚至调控特征，都是撰写文章可以利用的极佳素材。说了这么多好像还是不太会用，没关系，我们结合发表的文章，让它们一较高下。1. Peak在TSS上下游的分布图这张图实际包括两部分，上部整体展示了基因转录起始位点（TSS）及上下游的input和IP的reads的覆盖深度分布，可以看出结合峰 ...

Peak在TSS上下游的分布图是ChIP测序中非常关键的一张图。有这张图，我们就能知道目的蛋白（组蛋白或转录因子）在转录起始位点（TSS）及上下游附近的整体分布/结合情况。图中横坐标为基因位置，纵坐标为reads的覆盖深度，它可以反映目的蛋白分布情况。input由于没有富集，其reads通常分布较低，而IP对目的蛋白及其结合序列的富集作用则会使reads覆盖深度提高，产生相应的结合峰。TSS上下游通常是组蛋白和 ...

ChIP测序小编分享对于ChIP-seq的测序小问题如下： 1、ChIP-Seq 有什么样品要求？1） 请供给浓度≥10 ng/ul、总量≥20 ng、OD260/280 为1.8~2.2 的DNA 样品；若单次ChIP 后DNA 量不够，主张将2~3 次ChIP 的DNA 兼并在一起。2）请供给DNA 打断时检测胶图，要求打断后DNA 电泳主带在100-500bp 规模内；请对于ChIP 获得 DNA 规划引物进行QPCR 验证和定量，能够供给检测位点的检测报告，附阳性和阴性对照。3）样品请置于1.5 ml ...

CST TECH TIPS 系列课程，欢迎关注「CST博士互助平台」ChIP实验中，交联或固定是实验的第一步。您知道合适的交联时间是多长吗？快点击观看 Cell Signaling Technology（CST） ChIP 团队Fang Chen 博士的讲解。点击看视频交联是防止 DNA在 3 天的 ChIP 实验中从蛋白上脱落。否则，抗体只能让靶蛋白沉淀，而不能让 DNA 沉淀。交联对转录因子和辅因子尤为重要，因为与组蛋白相比，它们的丰度更低，与 DNA 的结合更弱。此外，与培养的细胞相 ...

ChIP（染色质免疫共沉淀，Chromatin Immunoprecipitation）技术是现代分子生物学研究，特别是表观遗传学的机制研究中一种非常重要的研究手段。ChIP 技术的主要目的是研究目的蛋白（包括： 修饰组蛋白， 转录因子， 辅因子及其他染色质蛋白）在染色质上的定位及丰度分析。ChIP 技术可以帮我们解答特异性修饰组蛋白或转录因子在染色质上是如何分布的，通过分析它们的染色质定位可以为解码目的蛋白的功能提供帮助。以组蛋白 ...

上一篇分享了做好 ChIP 实验需要注意的一些细节。但是注意了这些细节，按照流程完成了实验就结束了吗？当然没有，接下来的问题又来了。得到了目的片段 DNA，但是怎么判断得到的片段是不是自己想要的呢？换句话说，怎么判断 ChIP 是不是成功呢？IP 之后的染色质经过洗脱，解交联，RNase A 和 Protease K 处理，抽提或 DNA 纯化柱回收（这些步骤类似于前面的检测超声效果）就可以获得目的蛋白结合的 DNA。后续的这些步骤对于有分子生物学基础的人来说并不会 ...

开始细胞传代前，仔细检查细胞传代所需的仪器和试剂是否齐全。细胞与试剂方面：1、细胞(单层细胞，镜检适合)2、培养液(MEM-0.2%LH 培养液或MEM 培养液或199 等适合细胞有要求的培养液)3、灭活小牛血清、庆大霉素溶液（1 万单位）4、7.5％NaHC03 溶液5、0.25％胰蛋白酶6、PBS 洗液。实验小用具方面：1、小方瓶(100m1)2、克氏瓶3、胶塞4、吸管(10ml、1m1）5、细胞吹打管（20 ml）(以上用具需经121℃至少15 分钟高压灭菌)6、 ...

培养基因其营养物质丰富，极易染菌，给培养过程及后续试验带来困扰，目前，判断染菌的主要方法是培养检测，最后通过观察颜色变化给出结论，此过程历时较长，且打瓶过程中也伴随着染菌的风险。若有一种快检方法，能即时给出结论，将对培养基质量控制（特别在染菌早期）带来很大益处。JIMBIO CC 流式库尔特计数仪，检测粒径范围广（3-30μm），能对菌团有良好的判断，30s 内快速给出检测数据。1. 材料与方法1.1 材料培养基：Hyclone MEM 未开封培 ...

一步步教你BL_420F/S 生物信号采集与分析系统驱动程序的安装方法，附图说，让你轻松理解、简易安装。

为最大程度的保证实验结果，我们推荐客户严格遵循 CST 的实验操作方法，这些实验方法经过 CST 科学家的反复验证，能够保证实验结果的精确性和可重复性。

染色质免疫沉淀 (ChIP) 用于检测细胞核中天然染色质内的蛋白质与 DNA 之间的相互作用。ChIP 实验首先需要将细胞固定，即将蛋白质与 DNA 相互作用交联固定到位。然后将染色质打断为片段，使用抗体对目的蛋白质以及与其结合的所有 DNA 进行免疫沉淀。最后，解交联，对沉淀 DNA 进行纯化。纯化的 DNA 可进行进一步的分析，如标准或实时 PCR、芯片或测序分析。这些实验对染色质的完整性、蛋白质表位的质量以及免疫沉淀抗体的特异性非常敏感。尤其当目标蛋白质与 DNA 相 ...

我们提供了关于蛋白质组学数据的多元分析背景，并且还提供了不同数据包数据转换的方法。这项技术可以用来解决包含大量数据的生物学及生物化学方面的问题。多元分析包括 2D 胶的数字化、图像处理软件分析、数据的转换、多元数据分析、结果的解释，根据这些多元分析，最终解决生物学的问题。

陆陆续续地回到实验室，该重操旧业啦。生物学霸今年会给大家呈上更多最新技术及解读，带你装逼带你飞。今天带给大家的是冷泉港二月期刊推出的最新实验技术，一共有 五个，学起来。CRISPR–Cas9 技术构建转基因鼠Editing the Mouse Genome Using the CRISPR–Cas9 System先用细菌举例给你解释一下啥叫基因编辑，比如我想让细菌给我产一个蛋白，但是他不听话，所以我只好人工地敲掉一些基因，然后再额外给他一些基因， ...

色谱仪平衡塔板理论指出，色谱柱内样品各个组分的区带宽度与柱长和理论塔板高度乘积的平方根成正比，与组分性质、流动相性质、分离条件和温度无关。也就是说，在平衡塔板理论的理想条件下，被色谱柱分离的各个组分在流出柱末端前，其色谱区带都具有相同的峰形和峰宽，不同的区带宽度不是在柱内的分离过程中造成的，由于各个组分流出色谱柱出口时流速不同而造成峰宽不同。

高效液相吸附色谱仪分类有多种。1、按分离目的可分：实验室高效液相吸附色谱仪和工业高效液相吸附色谱仪。2、按功能可分：高效液相吸附分析色谱仪和高效液相吸附制备色谱仪。3、按分离规模可分：小型高效液相吸附色谱仪和大型高效液相吸附色谱仪。4、按产地可分：国产高效液相吸附色谱仪和进口高效液相吸附色谱仪。5、按作用可分：高效液相吸附定量色谱仪和高效液相吸附定性色谱仪。6、按进样自动性可分：自动进样高效液相吸附色谱仪和手动进样 ...

高效离子色谱仪流动相一般是盐类的缓冲水溶液，有一定的 PH 值。一、流动相主要影响组分离子和交换基团形成离子对的过程。二、流动相 PH 值对弱酸、弱碱的影响：影响组分形成离子的程度。不同离子交换剂的 PH 值适用范围：1、强酸型：较宽2、强碱型：PH＜113、弱酸型：PH＞64、弱碱型：pH＜8三、离子强度的影响：离子强度大，溶剂强度大，洗脱能力强。四、平衡离子的影响：1、浓度相同时，高电荷离子与交换基团亲和力大。2、离子的分子量增大，亲和力增大。3、离 ...

高效离子生物色谱仪种类有多种。1、按分离目的可分：高效离子生物化验室色谱仪和高效离子生物工业色谱仪。2、按灵敏性可分：微量高效离子生物色谱仪和痕量高效离子生物色谱仪。3、按作用可分：高效离子生物定量色谱仪和高效离子生物定性色谱仪。4、按产地可分：国产高效离子生物色谱仪和进口高效离子生物色谱仪。5、按进样自动性可分：自动进样高效离子生物色谱仪和手动进样高效离子生物色谱仪。6、按洗脱方式可分：等度洗脱高效离子生物色谱仪 ...

电子俘获检测器（ECD）是灵敏度最高的高效气相色谱仪检测器，同时又是最早出现的选择性检测器，其应用面仅次于 TCD 和 FID，一直稳居第三位。ECD 信号不同于 FID 等电离检测器，FID 等信号是基流的增加，而 ECD 信号是基流的减小。一、工作原理：由高效气相色谱仪色谱柱流出的载气和吹扫气进入 ECD 池，在放射源放出的β－射线的轰击下被电离，产生大量电子。在电场作用下，这些电子流向阳极，得到 10ˉ9～10ˉ8A 的基流。当电负性组分从柱后进入检测器时，即俘 ...

凝胶渗透色谱仪分类有多种。1、按分离目的可分：实验室凝胶渗透色谱仪和工业凝胶渗透色谱仪。2、按功能可分：分析型凝胶渗透色谱仪和制备型凝胶渗透色谱仪。3、按作用可分：凝胶渗透定量色谱仪和凝胶渗透定性色谱仪。4、按产地可分：国产凝胶渗透色谱仪和进口凝胶渗透色谱仪。5、按进样自动性可分：自动进样凝胶渗透色谱仪和手动进样凝胶渗透色谱仪。6、按分离规模可分：微型凝胶渗透色谱仪、小型凝胶渗透色谱仪和大型凝胶渗透色谱仪。7、按用途 ...