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蛋白组学

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蛋白功能验证的方法

1。根据序列比对,相似性分析,初步估计蛋白质可能的功能2。查阅文献,看有否相关研究3。如果用血清,在未知功能情况下,很难有所作为,建议等初步知道功能后,用血清是验证抉具体作用的4。比较常用的未知基因分析方法,是从基因水平入手:将该基因敲除(现在可以考虑RNAi),看看在功能组、蛋白组、转录组等等有何改变?形态等宏观水平有否改变?将该基因过表达(转入表达载体,或用小分子特异上调该基因?),看看是否有 ...

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蛋白的裂解与提取方法

10ml 三去污裂解液配方如下:50 mmol/L Tris-cl (pH 8.0): 0.07882g 150 mmol/L NaCl: 0.08775g0.2 g/L叠氮钠: 0.002g 1 g/LSDS 0.01g100 mg/L Aprotin 0.001g10 g/L NP-40 0.1g 5 g/L去氧胆酸钠 0.05g100 mg/L 苯甲基磺酰氟(PMSF) 0.001g总蛋白抽 ...

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蛋白的裂解与提取方法

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蛋白的浓缩方法

丙酮沉淀法;免疫沉淀法;三氯醋酸沉淀法;硫酸铵沉淀法;(低温)有机溶剂沉淀法;聚乙二醇沉淀法;超滤法;透析法;离子交换层析和冷冻干燥法……1,丙酮沉淀法;三氯醋酸沉淀法 试验要求的仪器简单,但是常常导致蛋白质变性。2,免疫沉淀法:得有特异性抗体!3,硫酸铵沉淀法:利用高浓度盐将蛋白质析出(盐析)选择硫酸按是因为:盐析有效性,pH范围广,溶解度高,溶液散热少,经济!4,(低温)有机溶剂沉淀法:强调低 ...

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蛋白的浓缩方法

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Western转膜步骤

下面的步骤适用于通过Xcell Ⅱ转印系统进行蛋白印记的大部分应用。为达到最佳效果,用户的优化是必要的。I. 所需材料: •Xcell SureLock™或Xcell Ⅱ™ Mini-Cell以及Blot Module(Cat. Nos. EI10001 EI9001及EI9051)•电泳后的迷你胶(mini-gel)(最大的尺寸9cundefined9cm)•预先切割好的印记膜:硝酸纤维素(Cat. no. ...

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电泳和Western转印的常见问题

表1 Common problems for electrophoresis and western bloting 问 题可能原因建议解决方法推荐电压条件下电泳时间过长。电泳缓冲液过稀。配制新鲜缓冲液,使用1X稀释液。推荐电压条件下电流过高,热量过大。电泳缓冲液过稀。配制新鲜缓冲液,使用1X稀释液。推荐电压条件下电流过低或无电流。接触不良。在电泳前移除胶盒底部的封条;确认缓冲液没过加样孔;检查b ...

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使用胶做western blot的方法

在经典的Western Blot的世界里,蛋白电泳―转膜―封闭―抗体―显色这个五步骤环环相扣,构成WB完整过程,就象砌积木一样,少了前面一步的基础后面的就砌不上去。但是亲爱的朋友,告诉我,你们在一次又一次重复这个貌似简单又颇为费时的实验时,有没有设想过能省略掉其中的某个费时的非必需步骤,更直接更快得到结果呢?那该有多么省事啊!真的有这样一种产品,抽掉了WB中费时的非必需步骤――转膜和封闭,直接在P ...

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western blot失败经验总结1

我做了很久的WB,最大的一个难点感觉在于样品制备上!蛋白的降解有些时候是你想象不到的,可能出奇的糟糕,也可能完全没事~~如果单独做WB的话,感觉以“快速彻底裂解,先变性后保存”的原则比较有效,尽量选择足够强的裂解液,甚至直接给loading buffer裂解,然后取出部分蛋白定量,其余加入loading buffer100度充分变性,再分装保存。有些时候比蛋白酶抑制剂更有效。另一个感觉就是样品中目 ...

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使用胶做western blot的方法

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western blot失败经验总结2

我就跑胶和转膜谈一点儿自己的体会1、跑胶 电泳Buffer重复利用的时候要注意,不能混浊,有时候能用个3-4次,有时候第二次都不行了,事先前预电泳一下,看看气泡的均匀度;Buffer一定要淹过梳子孔,否则就会发现今天的蛋白不会跑;跑的时候先用低电压跑过浓缩胶,再换高电压跑分离胶,不要追求速度,慢慢跑条带会分离的更好,特别是对于高分子量的目的蛋白;2、转膜 我用的是湿转,Buffer一定要预冷,最好 ...

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关于细菌超声破碎的小总结

细菌工程菌胞内表达主要分为两种形式,一种是在强启动子条件下的高效表达,由于蛋白的过度表达,使蛋白不能及时有效折叠而发生无规则卷曲,以固体颗粒的形式堆积于胞间质中,这就是所说的包涵体,另外一种是间质内的可溶性表达,即可以发生正常折叠,具有生物活性。一般情况下,细菌只要被正常破壁就可以通过离心的形式将包涵体和可溶性表达的蛋白分离开。 超声破碎的条件一般是300w,10s/10s,20分钟,具体条件可根 ...

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Western 不同转膜方法的取舍

转膜:小分子量的蛋白半干转效果比较好,大分子量(100KD)以上建议湿转。具体转膜条件需要多摸一下。30-80KD半干转恒流1mA/cm2,1-1.5h 都可以,大分子湿转100V,2.5h以上应该可以,转完膜丽春红染出的条带比较清楚的话,一般都能有结果。湿转,Buffer一定要预冷,最好提前一天配好放4度;滤纸不要大过PVDF膜,防止短路;胶在负极,膜靠近正极,放入Tank前检查一遍会使你免以体 ...

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WESTERN BLOTTING心得

蛋白提取:1.总蛋白提取(胞膜,胞浆,胞核): 组织匀浆后15000g 4度 20分钟后取上清.Buffer:NP40 750ul 脱氧胆酸钠0.5克 SDS 0.1克 加undefinedPBS 至100ml. 再加入PMSF(7.4mg/ml) 0.1ml. (现用现加)7.4mg/ml PMSP异丙醇溶液: 取A mg PMSF 加 A/7.4 ml 异丙醇.工厂-20度储存2.组织膜蛋白提取:所在操 ...

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蛋白质的蛋白质的提取技术

选择材料及预处理   以蛋白质和结构与功能为基础,从分子水平上认识生命现象,已经成为现代生物学发展的主要方向,研究蛋白质,首先要得到高度纯化并具有生物活性的目的物质。蛋白质的制备工作涉及物理、化学和生物等各方面知识,但基本原理不外乎两方面。一是得用混合物中几个组分分配率的差别,把它们分配到可用机械方法分离的两个或几个物相中,如盐析,有机溶剂提取,层析和结晶等;二是将混合物置于单一物相中,通过物理力 ...

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