蛋白质修饰

组蛋白的翻译后修饰过程对 DNA 转录，染色体功能以及维护细胞信号传导通路的正常运行具有重要的作用，瓜氨酸化是由称为蛋白质精氨酸脱亚胺酶（Protein Arginine Deiminases，PADs）的酶家族催化的许多关键组蛋白修饰手段之一。PADs 催化肽基精氨酸水解，在组蛋白上形成肽基瓜氨酸，调节与染色质结构相关的许多生化过程。PAD 家族由钙依赖性同工酶 PAD1, 2, 3, 4 和 6 的五个成员组成。组蛋白瓜氨酸化是通过在组蛋白上转化精氨酸而影 ...

各位大大， 最近小妹接到老板的任务， 要对SPITC法修饰研究进行实验， 在参考了大量的文献（15篇左右）， 总结出了如下的流程， 并且进行了实验，我会把我的实验过程和结果贴出来， 希望大家能够共同分析并且提供小妹建议， 谢谢！！以下是我试验的一个protocol，希望各位前辈能指点一下，谢谢！我用BSA（国产）1mg 做样品，大致的流程是：先溶液酶解，然后C18 ZipTip固相SPITC衍生，洗脱冻干后打MALDI。具体步骤如下：（一）溶液酶解：8 M Urea 3 ...

随着蛋白质组学和生物医药等领域发展，多肽和蛋白质的修饰引起了人们的广泛关注，成为当前一个非常重要的研究方向。通过对多肽和蛋白的修饰，可以研究蛋白质分子结构与功能之间的关系以及蛋白质-蛋白质相互作用，利用标记分子进行追踪定位，另外还可以对一些活性多肽和蛋白质进行改性。

蛋白质磷酸化对于许多生物现象的引发是很必要的，包括细胞生长、增殖、泛素（ubiquitin）介导的蛋白降解等过程。特别是酪氨酸磷酸化，作为细胞信号转导和酶活性调控的一种主要方式，通常通过引发蛋白质之间的相互作用，进而介导生长因子、荷尔蒙和细胞因子等对细胞膜上受体的信号调控。 然而，酪氨酸磷酸化在细胞的所有磷酸化修饰中所占的比例却非常低。大概10%的细胞蛋白会受到磷酸化共价修饰，但每100次蛋白的 ...

3月2日，清华大学生命科学院施一公教授领导的研究组与王佳伟副教授合作在《自然》在线发表论文，报道原核细胞蛋白酶体调节亚基MecA-ClpC异六聚体结构与功能的研究。

药用纳米粒的制备 20世纪80～90年代，人们对药物缓释系统的研究主要着眼于增加药物利用率和降低材料的毒副作用。早期的纳米、微米粒子主要由聚烷基氰基丙烯酸盐合成。微米粒子因其体积过大，不能从肠腔进入体内淋巴循环系统而不适用于口服药物。另一方面，纳米载药粒子因噬菌作用导致其降解速率过快，影响其在静脉内的吸收和利用。近年来，人们通过对纳米粒子的表面修饰而解决了上述问题。纳米粒由于其特有的优点， ...

纳米材料与新型药物制剂 纳米(nm)是英文namometer的译音，是一个物理学上的度量单位，1nm是1m的十亿分之一，相当于45个原子排列起来的长度。当物质达到纳米尺度以后，即在1～100nm这个范围空间，物质的性能就会发生突变，出现特殊性能。这种既具不同于原来组成的原子、分子，也不同于宏观物质的特殊性能构成的材料，即为纳米材料。如果仅仅是尺度达到纳米，而没有特殊性能的材料，也不能叫纳米 ...

制备纳米粒的常用的聚合物 1．聚乳酸(PLA) PLA是由乳酸脱水聚合成丙交酯，再由丙交酯开环聚合而成。PLA是一种无毒，有较好生物兼容性的可生物降解材料，能在体内先降解成人体代谢的产物――乳酸，然后进一步分解成二氧化碳和水。PLA的亲水性和结晶度都比较低。因乳酸是手性分子，导致PLA有4种形态，即L―PLA、D―PLA、D，I―PLA以及Illeso―PLA。L―PLA、D―PLA ...

聚乙二醇等聚合物纳米粒表面改性 PEG是亲水、非离子性的高聚物，具有良好的生物兼容性。在现阶段中，它们是避免MPS清除作用和延长脂质体在血液中驻留时间的最常用试剂。Veronese等指出，PEG嫁接在蛋白质、肽以及非肽类分子上，具有无毒、无免疫性、不产抗原和水中稳定等优点，并已通过FDA认证。修饰后的药物具有长滞留时间、减小降解酶的降解作用、削弱免疫可能性等优点。正是因为PEG修饰方法的存 ...

泊洛沙姆和泊洛沙敏聚合物纳米粒表面改性 泊洛沙姆和1白洛沙敏系列具有相似的A―B―A嵌段结构，它们通过中心疏水的B嵌段(聚丙氧基或聚丙氧基乙二胺，PO)连接在胶质纳米粒的表面，而亲水嵌段(乙氧基，EO)伸展开来。泊洛沙姆和泊洛沙敏的结构示意图 早期对泊洛沙姆用于避免MPS清除作用的研究集中在泊洛沙姆―188和泊洛沙姆―338。Illum和Davis曾报道，当这两种泊洛沙姆材料被吸附 ...

纳米粒的表面改性 表面改性赋予纳米粒表面以亲水性，以减少肝脏巨噬细胞吞噬，延长体循环的时间，增加对细胞膜的黏附能力等。 在很多注射型载药系统中存在一个很大的问题，即这类药物能被人体的单核吞噬细胞系统(mononuclear phagocyte system，MPS)很快地从血液中清除。微粒的大小和表面特征是决定清除速度的关键性因素。由于有充足的血液供应、特殊化的血管结构和丰富的MP ...

PriCells: 藻红蛋白标记抗体的方法﹠PE-标记蛋白A方法 藻红蛋白标记抗体的方法：1. 巯基化藻红蛋白（PE）的制备；（1） 将600μl浓度为15.5mg/ml的盐酸巯醇亚胺加到1.2ml浓度为3.6mg/ml的PE中；（2） 将以上混合液和1.2ml pH6.8的PB混合，而后装入透析袋置入50mmol/L pH6.8的P ...

N-连接的糖基化是一种具有重要生物学意义的翻译后修饰过程，但是现在已经发现的糖基化蛋白并不多。作者在这里采取了一种“滤纸收集样品（filter aided sample preparation,FASP）”的方法，籍此糖基化多肽可以富集于载有凝集素的滤纸上，然后用高精确度的质谱技术从小鼠的四种组织和血浆的2352种蛋白质上发现6367个糖基化位点。

使用一种不被自然利用的稀有金属，莱斯大学的化学家们发明了一种合成酶，有助于解开难以研究的数千种蛋白质的身份，其中包括许多在癌症和其他疾病发挥关键角色的蛋白质。这项研究最近在线发表在《美国化学学会杂志》上。

蛋白质折叠软件

由于用X光晶体衍射和NMR核磁共振技术测定蛋白质的三维结构，以及用生化方法研究蛋白质的功能效率不高，无法适应蛋白质序列数量飞速增长的需要，因此近几十年来许多科学家致力于研究用理论计算的方法预测蛋白质的三维结构和功能，经过多年努力取得了一定的成果。 蛋白质三维结构的预测方法通常包括：同源性建模和从头开始的预测方法。对数据库中已知结构的序列的比对是预测未知序列三级结构的主要方法，也即同源建模的方法。 ...

蛋白质二级结构的预测通常被认为是蛋白结构预测的第一步，二级结构是指α螺旋和β折叠等规则的蛋白质局部结构元件。不同的氨基酸残基对于形成不同的二级结构元件具有不同的倾向性。按蛋白质中二级结构的成分可以把球形蛋白分为全α蛋白、全β蛋白、α＋β蛋白和α/β蛋白等四个折叠类型。预测蛋白质二级结构的算法大多以已知三维结构和 ...

ExPASy工具包包涵的程序 ComputepI/MW：是ExPASy工具包中的程序，计算输入序列等电点和分子量的工具。对pI的确定基于早期研究中将蛋白质从由中性到酸性变性条件下迁移过程中所获得的pK值（Bjellqvist等，1993）。分子量的计算是把序列中每个氨基酸的同位素平均分子量加在一起，再加上一个水分子的分子量。 用户可以把序列整理为FASTA格式，或提供SWISS-PROT标识，或者 ...

根据组成蛋白质的20种氨基酸的物理和化学性质可以辨析电泳等实验中的未知蛋白质，也可以分析已知蛋白质的物化性质。 ExPASy工具包包涵的程序：http://www.expasy.ch/tools/ AACompIdent：与把氨基酸序列在SWISS-PROT库中搜索不同，AACompIdent工具利用未知蛋白的氨基酸组成去确认具有相同组成的已知蛋白。该程序分析时需提交的相关信息包括：蛋白质的氨基酸 ...

对各种方法所得到的蛋白质结构预测结果需要进行验证，以确定预测方法是否可行，确定其适应面。验证的一种方法是取已知结构的蛋白质，对这些蛋白质进行模拟结构预测，并将预测结构与真实结构进行比较，分析两者之间的差距。为了客观地评价各种预测方法，需要建立权威的评判机构，建立公共认可的蛋白质结构测试数据集。设立在马里兰生物技术研究中心的CASP就是这样一个系统（http://predictioncenter.l ...