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PCR扩增

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PCR反应条件如何选择?

PCR反应条件为温度、时间和循环次数。 温度与时间的设置:基于PCR原理三步骤而设置变性-退火-延伸三个温度点。在标准反应中采用三温度点法,双链DNA在90~95℃变性,再迅速冷却至40~60℃,引物退火并结合到靶序列上,然后快速升温至70~75℃,在TaqDNA聚合酶的作用下,使引物链沿模板延伸。对于较短靶基因(长度为100~300bp时)可采用二温度点法,除变性温度外、退火与延伸温度可合二为一 ...

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引物溶解稀释的方法

◆干粉引物溶解稀释方法: 收到引物后,在开启离心管盖前在3000-4000转/分钟的转速下离心1分钟,以防开盖时引物干粉散失。引物保存在高浓度的状况下比较稳定。如果对实验的重复性要求较高,合成的OD数较大,建议分装,避免反复冻融。引物一般配制成10-100pmol/ul(umol/l)。三博远志的引物在出厂时都标有1OD 相当于多少umol 的计算结果,进行稀释时的引物加水量可以按以下公式 ...

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Taq Plus 和Taq Plus I 有没有什么区别?

DNA聚合酶Taq Plus和 Taq Plus I 有什么区别吗?对PCR结果有影响吗?Taq Plus集扩增效率高和保真度好于一体。能有效地扩增10 kb以下的片段,扩增效率比Pfu高,保真度 Taq Plus 比Taq好。对于有些结构复杂的模板,如GC含量高、有二级结构等可选用Taq Plus扩增。 Taq plus ITaq plus I是 Taq DNA 聚合酶和pfu DNA聚合酶的混 ...

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何谓正义引物和反义引物?

我不是高手,但是试着回答一下。上游引物和下游引物是按照位置来分的。与mRNA相同的引物为正义引物,而与其互补的是反义引物。所以上游引物对应的是正义引物,下游引物对应的是反义引物。 (责任编辑:大汉昆仑王) ...

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请教引物的稀释与使用的原则、步骤和注意事项

1. Oligo DNA是以OD260单位来计算的,这是指在1ml体积1cm光程标准比色皿中,260nm波长下吸光度为1A260的Oligo溶液定义为1 OD260单位,根据此定义,1 OD260单位相当于33μg的Oligo DNA,您可以根据此数据和您的Oligo DNA分子量,计算得到摩尔数以计算不同摩尔浓度的溶液。2. 引物序列的分子量计算公式如下:MW=(A碱基数×312)+(C碱 ...

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PCR一般步骤

(一)总RNA提取取液氮冻存脑组织置于玻璃匀浆器中,按100g:3ml的比例加入Trizol试剂,严格按照TrizolRNA提取试剂盒说明书的流程进行。(1)加Trizol(按3ml/100mg组织,宁多勿少)置于玻璃匀浆器中匀浆后,冰浴10-15min。(2)移入1.5mlEP管中,4ºC 13000g离心10min。(3)上清液移至另一EP管中,室温放置10-15min。(4)加入0.2ml氯 ...

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RT中Olig(dT)15引物与随机引物?

RT实验Olig(dT)15引物合成的条带明显优于随机引物,不是随机引物的效果较好吗?怎样解释这种现象网友一回答:Olig(dT)适合于长链甚至全长mRNA的RT,要求RNA必须有Poly A,所以真核生物的mRNA都适用,对RNA样品的质量要求较高,最好不要有明显的DNA污染、RNA降解和RNA断裂。随机引物 适合各种RNA的RT,尤其适合短链mRNA和模板丰度很低的情况(比如某个gene表达量 ...

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11条PCR引物设计原则

  1、引物最好在模板cDNA的保守区内设计。   DNA序列的保守区是通过物种间相似序列的比较确定的。在NCBI上搜索不同物种的同一基因,通过序列分析软件(比如DNAman)比对(Alignment),各基因相同的序列就是该基因的保守区。   2、引物长度一般在15-30碱基之间。   引物长度(primer length)常用的是18-27bp,但不应大于38bp,因为过长会导致其延伸温度大于 ...

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Real time PCR 实验注意事项

实验中的一些好习惯加入试剂之前把它混匀一下以免放置时间长了浓度不均移液枪用完之后要归到最大计量的位置,防止久而久之弹簧失去弹性一定要记着关水浴箱,切记切记多和大家讨论,同时多关注别人讨论的经验,这几乎是最快提高的捷径了所有的试剂都自己配,出了问题才好找原因防止RNA酶污染的措施1. 所有的玻璃器皿均应在使用前于180℃的高温下干烤6hr或更长时间。2. 塑料器皿可用0.1% DEPC水浸泡或用氯仿 ...

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Overlap PCR(重叠PCR)的基本原理

Overlap PCR(重叠PCR)重叠PCR的应用是非常广泛的,他的原理其实很简单:比如说有两个基因或者说一个启动子和一个基因,你要将他们连接到一 起,我们首先想到的方法当然是借助于酶切的方法,但有时我们并不一定能构找到合适的酶切位点,或者说我们找到了酶切位点,但这种酶非常特殊或者又很贵,我 们可能只用一次,这样购买酶就变成了一种浪费,难道没有别的办法了吗?当然有,那就是重组PCR技术。举个例子 ...

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PCR之引物详解

1. 引物是如何合成的?   目前引物合成基本采用固相亚磷酰胺三酯法。 DNA 合成仪有很多种 主要都是由 ABI/PE 公司生产,无论采用什么机器合成,合成的原理都相同,主要差别在于合成产率的高低,试剂消耗量的不同和单个循环用时的多少。  亚磷酰胺三酯法合成 DNA 片段,具有高效、快速的偶联以及起始反应物比较稳定的特点。亚磷酰胺三酯法是将 DNA 固定在固相载体上完成 DNA 链的合成的,合 ...

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菌液PCR的经验

此方法可能很多师兄师姐们都在用,只是当时的确没有找到相关的详细说明,学弟再次把自己摸索出来的一点心得写出来,高手就多多指正,没做过的就相互学习下,见笑)由于课题组所需,我需要构建数量可观的真核表达载体和融合载体起初我也查到相关菌落PCR的文献,和导师商量,导师一口回绝了他的理由和我所搜集到的理由一样:假阳性我们实验室一博士师姐需要做一个真核表达载体挑选了60个菌落,运用目的基因的上下游引物做PCR ...

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Folin-酚(福林酚)试剂配方

在2升磨口回流瓶中,加入100克钨酸钠(Na2WO4•2H2O)25克钼酸钠(Na2MoO4•2H2O)及700毫升蒸馏水,再加50毫升85%磷酸,100毫升浓盐酸,充分混合,接上回流管,以小火回流10小时,回流结束时,加入150克硫酸锂(Li2SO4),50毫升蒸馏水及数滴液体溴,开口继续沸腾15分钟,以便驱除过量的溴。冷却后溶液呈黄色(如仍呈绿色,须再重复滴加液体溴的步骤) ...

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PCR技术详解

PCR技术概论  聚合酶链反应(Polymerase Chain Reaction PCR)是80年代中期发展起来的体外核酸扩增技术。 它具有特异、敏感、产率高、快速、简便、重复性好、易自动化等突出优点;能在一个试管内将所要研究的目的基因或某一Dundefined*段于数小时内扩增至十万乃至百万倍使肉眼能直接观察和判断;可从一根毛发、一滴血、甚至一个细胞中扩增出足量的DNA供分析研究和检测鉴定。过去几天几星期 ...

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简并引物设计方法

一 利用ncbi搜索不同物种中同一目的基因的蛋白或cDNA编码的氨基酸序列因为密码子的关系,不同的核酸序列可能表达的氨基酸序列是相同的,所以氨基酸序列才是真正保守的。首先利用NCBI的Entrez检索系统,查找到一条相关序列即可。随后利用这一序列使用BLASTp(通过蛋白查蛋白),在整个Nr数据库中中查找与之相似的氨基酸序列。二、对所找到的序列进行多序列比对将搜索到的同一基因的不同氨基酸序列进行多 ...

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实时荧光定量PCR原理和实验

  无论是对遗传病(如地中海贫血和血友病)、传染病(如肝炎和艾滋病)或肿瘤进行基因诊断,还是研究药物对基因表达水平的影响,或者监控药物和疗法的治疗效果,定量PCR技术都可以发挥很大作用。定量PCR技术的最新进展是实时荧光定量。该技术借助于荧光信号来检测PCR产物,一方面提高了灵敏度,另一方面还可以做到PCR每循环一次就收集一个数据,建立实时扩增曲线,准确地确定CT值,从而根据CT值确定起始DNA拷 ...

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PCR引物设计知识与技巧分析

自从1985年Mullis等发明了具有划时代意义的聚合酶链式反应(PCP) 以来,PCR已经成为了分子生物学领域最基本也是最重要的技术手段之一。然而能否找到一对合适的核苷酸片段作为引物,使其有效地扩增模板DNA序列,无疑决定着PCR的成败。现在动物遗传育种早已进入了分子时代,在基因水平寻求影响动物遗传表型的新基因突显重要,因此引物设计无疑又成为了寻找新基因的重中之重。1 引物的设计以及初步筛选引物 ...

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详细介绍引物设计原则

引物设计原则一:1. 引物的长度一般为15-30 bp,常用的是18-27 bp,但不应大于38,因为过长会导致其延伸温度大于74℃,不适于Taq DNA聚合酶进行反应。2. 引物序列在模板内应当没有相似性较高,尤其是3’端相似性较高的序列,否则容易导致错配。引物3’端出现3个以上的连续碱基,如GGG或CCC,也会使错误引发机率增加。3. 引物3’端的末位碱基对Taq酶的DNA合成效率有较大的影响 ...

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PCR技术应用九:HIV感染

八十年代以来由人类免疫缺陷病毒(HIV)感染而引起的艾滋病(AIDS)因其严重的危害性而受到人们高度重视,力争早期诊断和寻求有效治疗是防止其广泛传播的关键所在.聚合酶链反应(PCR)具有敏感、特异和快速的特点,是检测病毒、评价病情进展和探讨发病机理的有效工具.一、HIV的基因结构  HIV的基因结构与其它逆转录病毒基本相同,为RNA双分子,其单链RNA分子由9749个核苷酸组成,有3组共9个基因。 ...

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Taqman-LNA探针的合成

什么是LNALNA 是新型的核酸类似物,它包含了2'-氧4' 碳亚甲基连接,这个连接限制了呋喃核糖环的灵活性,因而将其结构锁定成一个刚性的双环模式,因此而提高杂交效率和优越的稳定性。LNA 荧光探针优点:1.增强热稳定性和杂交的特异性对实时定量PCR探针提出LNA化学产品增强双链体的热稳定性,同时加强对目标序列杂交的特异性。因此,由非所需激活的荧光背景将大量减少,从而使信号对背景噪音的比例增大。L ...

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