RNAi target selection rules:Targeted regions on the cDNA sequence of a targeted gene should be located 50-100 nt downstream of the start codon (ATG). Search for sequence motif AA(N19)TT or NA(N21) or ...
Argonaute - A family of proteins containing multiple domains and involved in RNA interference (RNAi). Argonatue is the main component of RNAi effector complex the so called siRNA induced silencing com ...
提取RNA器械:离心管2支,吸管4个,酒精灯,打火机,记号笔,200ul1000UL枪,DEPC泡过的枪头EP管,紫外照过的手套。滤纸,DEPC纯水(750ml无水乙醇+150mlDEPC水剧烈振荡,使劲的摇晃,直至混匀),氯仿,75%酒精,异丙醇,Trizol,预冷的离心机(两种),EP管架(洗液擦洗)过程:1. 取细胞悬液,室温下离心,1000rmp/min6min弃上清(此时可预冷另一个离心 ...
提取RNA器械:离心管2支,吸管4个,酒精灯,打火机,记号笔,200ul1000UL枪,DEPC泡过的枪头EP管,紫外照过的手套。滤纸,DEPC纯水(750ml无水乙醇+150mlDEPC水剧烈振荡,使劲的摇晃,直至混匀),氯仿,75%酒精,异丙醇,Trizol,预冷的离心机(两种),EP管架(洗液擦洗)过程:1. 取细胞悬液,室温下离心,1000rmp/min6min弃上清(此时可预冷另一个离心 ...
RNA抽提指南(TRIZOL法)注意事项:_全程佩戴一次性手套。皮肤经常带有细菌和霉菌,可能污染RNA的抽提并成为RNA酶的来源。培养良好的微生物实验操作习惯预防微生物污染。_使用灭菌的,一次性的塑料器皿和自动吸管抽提RNA,避免使用公共仪器所导致的RNA酶交叉污染。例如,使用RNA探针的实验室可能用RNA酶A 或T1来降低滤纸上的背景,因而某些非一次性的物品(如自动吸管)可能富含RNA酶。_...
一、用异硫氰酸胍提取提禽流感病毒的详细步骤,可参考(我提过N次做定量PCR都没问题):1.取200ul样品数+阴性对照+阳性对照个1.5ml灭菌eppendorf管2.加600ul异硫氰酸胍,然后加入对照和样品,再加200ul氯仿,颠倒混匀3.13000rpm离心15min4.在第3步离心快结束时,另取同样多eppendorf管,加入400ul -20度预冷的异丙醇5.取第3步离心的上清(一定不要 ...
1.TotalRNAisolation: 测定OD260,OD280及两者比值,换算出RNA的浓度。并电泳鉴定。 2.Gel: 以80ml的1.5%甲醛琼脂糖凝胶为例: agrose:1.2g ddH2O:57.6ml 10×RNundefined(RNAbuffer):8ml(RNB具体配方见后,用表示,下同) 甲醛溶液:14.4ml 3.Electrophoresis: (1)加样:(以取20μ ...
一、用异硫氰酸胍提取提禽流感病毒的详细步骤,可参考(我提过N次做定量PCR都没问题):1.取200ul样品数+阴性对照+阳性对照个1.5ml灭菌eppendorf管2.加600ul异硫氰酸胍,然后加入对照和样品,再加200ul氯仿,颠倒混匀3.13000rpm离心15min4.在第3步离心快结束时,另取同样多eppendorf管,加入400ul -20度预冷的异丙醇5.取第3步离心的上清(一定不要 ...
RNA酶保护试验((RNase Protection AssayRPA)是通过液相杂交的方式用反义RNA探针与样品杂交,以检测RNA表达的技术。1。原理:双链RNA(杂交的)能够抵抗RNA酶的降解。2。应用:检测RNA表达3。与Northern杂交和RT-PCR比较,RPA有以下几个优点:1. 检测灵敏度比Northern杂交高。由于Northern杂交步骤中转膜和洗膜都将造成样品和探针的损失,使 ...
RNA酶保护试验((RNase Protection AssayRPA)是通过液相杂交的方式用反义RNA探针与样品杂交,以检测RNA表达的技术。1。原理:双链RNA(杂交的)能够抵抗RNA酶的降解。2。应用:检测RNA表达3。与Northern杂交和RT-PCR比较,RPA有以下几个优点:1. 检测灵敏度比Northern杂交高。由于Northern杂交步骤中转膜和洗膜都将造成样品和探针的损失,使 ...
一、试剂准备1. GACU POOL:取100mM ATP、CTP、GTP各2.78μl、100mM UTP 0.06μl,加DEPC H2O至100μl。2. 杂交缓冲液IPES 0.134g、0.5M EDTA(pH8.0)20μl、5M NaCl 0.8ml、甲酰胺8ml,加DEPC H2O至10ml。3. RNase消化液:5M NaCl 120μl、1M Tris-HCl(pH7.4) ...
一、试剂准备1. GACU POOL:取100mM ATP、CTP、GTP各2.78μl、100mM UTP 0.06μl,加DEPC H2O至100μl。2. 杂交缓冲液IPES 0.134g、0.5M EDTA(pH8.0)20μl、5M NaCl 0.8ml、甲酰胺8ml,加DEPC H2O至10ml。3. RNase消化液:5M NaCl 120μl、1M Tris-HCl(pH7.4) ...
看了离心机的配平讨论帖,才决定发起该帖的。该帖的问题也比较简单,但人人都会遇到,所以帖之。实验者,5 成用心,3+ 成用脑,2- 成用手是也。假定你抽提 RNA 时使用到的有机试剂 - 氯仿、异丙醇、无水乙醇 - 都是国产的 (这是完全可以使用的)。我的问题是:你采取了什么措施来降低或者杜绝 RNase 的污染?具体地:你是如何选择、预处理、使用和保存氯仿和异丙醇?你是如何配制和保存 75% 乙醇 ...
看了离心机的配平讨论帖,才决定发起该帖的。该帖的问题也比较简单,但人人都会遇到,所以帖之。实验者,5 成用心,3+ 成用脑,2- 成用手是也。假定你抽提 RNA 时使用到的有机试剂 - 氯仿、异丙醇、无水乙醇 - 都是国产的 (这是完全可以使用的)。我的问题是:你采取了什么措施来降低或者杜绝 RNase 的污染?具体地:你是如何选择、预处理、使用和保存氯仿和异丙醇?你是如何配制和保存 75% 乙醇 ...
转录后基因沉默(PTGS, post- transcriptional gene silencing)-最初被认为仅限于矮牵牛花和其它一些植物中的奇异现象,是目前分子生物学研究中一个最热门的话题。过去几年中,科研工作者已明确转录后基因沉默现象普遍存在于动、植物中,在机体防御病毒入侵和转座子沉默效应中起着重要作用。但是最激动人心的是转录后基因沉默现象的技术应用,即在多种有机体中应用核糖核酸干扰(RN ...
前言Lipofectamine™ 2000试剂是一项专利配方,用于高效转染Stealth™ RNA或者短的干扰RNA(siRNA)到哺乳动物细胞,以进行RNAi分析(1,2)。该说明书提供了一般的指导以及使用Lipofectamine™ 2000转染Stealth™ RNA或者siRNAj进入哺乳动物细胞的步骤。提供推荐的起始使用试剂剂量。为了获得最佳的RNAi实验结果,需要针对哺乳动物细胞系和目 ...
方法一、改良异硫氰酸胍提取法试剂及其配制异硫氰酸胍变性液:贮存液-在含484ml 水(经DEPC处理) 17.6ml 0.75mol/L柠檬酸钠(pH7.0)和26.4ml10%Sarkosyl的溶液中加入250g异硫氰酸胍,加热至60~65℃并持续搅拌使之充分溶解。贮存液室温保存备用(不超过3个月)。工作液-在每50ml贮存液中加入0.35ml2-ME即配制成工作液。工作液于室温下保存不超过1个 ...
方法一、改良异硫氰酸胍提取法试剂及其配制异硫氰酸胍变性液:贮存液-在含484ml 水(经DEPC处理) 17.6ml 0.75mol/L柠檬酸钠(pH7.0)和26.4ml10%Sarkosyl的溶液中加入250g异硫氰酸胍,加热至60~65℃并持续搅拌使之充分溶解。贮存液室温保存备用(不超过3个月)。工作液-在每50ml贮存液中加入0.35ml2-ME即配制成工作液。工作液于室温下保存不超过1个 ...
二、RNA质量检测提取的RNA需要对其质量和数量进行检测。实验室常用的方法有紫外吸收值检测和电泳检测两种。方法一、紫外吸收检测试剂:TE ( 10mmol/L Tris 1mmol/LEDTA)。dH2O试验程序1.预热紫外分光光度计10~20min.。2.取两个1ml的狭缝石英杯,一个装入1mlTE溶液作为空白校正液,用来校正分光度计零点及调整透光度至100。3.取4μl RNA待测样品加入另一 ...
二、RNA质量检测提取的RNA需要对其质量和数量进行检测。实验室常用的方法有紫外吸收值检测和电泳检测两种。方法一、紫外吸收检测试剂:TE ( 10mmol/L Tris 1mmol/LEDTA)。dH2O试验程序1.预热紫外分光光度计10~20min.。2.取两个1ml的狭缝石英杯,一个装入1mlTE溶液作为空白校正液,用来校正分光度计零点及调整透光度至100。3.取4μl RNA待测样品加入另一 ...