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PCR技术原理

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PCR常见问题总汇

1、PCR产物的电泳检测时间 一般为48h以内,有些最好于当日电泳检测,大于48h后带型不规则甚致消失。 2、假阴性,不出现扩增条带 PCR反应的关键环节有①模板核酸的制备,②引物的质量与特异性,③酶的质量及, ④PCR循环条件。寻找原因亦应针对上述环节进行分析研究。 模板:①模板中含有杂蛋白质,②模板中含有Taq酶抑制剂,③模板中蛋白质没有消 化除净,特别是染色体中的组蛋白,④在提取制备模板时 ...

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PCR简介及污染的处理

PCR技术简介 前言 一滴残留在裙子上的精液使得美国总统Bill Clinton不得不坦承他与白宫实习生有不正当的关系。因为他知道现在的生物科技就连一个精子也能被用来做为证据。这种将极微量的生物标本化为可供鉴定的现代技术正是PCR(Polymerase chain reaction)--聚合酶链式反应具有的特色之一。这也是分子生物医学令人震撼的一例。 何谓PCR 简单的说,PCR就是利用DNA聚合 ...

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PCR检测的质量控制

随着兽医防疫工作重要性的逐步提高,PCR检测技术已被兽医工作者比较广泛认可,已经从实验室研究走进了临床应用阶段。如何提高PCR检测质量,已成为实验室技术人员不可回避的一个问题,它直接影响实验室检测结果的可信度和兽医防疫工作质量。 PCR检测质量的控制是一个系统工程,总体上涉及三个方面:一是试验仪器;二是试验试剂与耗材;三是人员操作。任何一个方面出现问题,都会影响PCR检测质量。 一、试验仪器 PC ...

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PCR假阴性问题总结

PCR的假阳性问题深受重视,但PCR假阴性问题相对于临床检测更为严重。其实PCR假阳性的问题是比较单纯的,一般仅涉及污染和引物的非特异性问题。而污染可以通过严格的实验室管理,合理的环境设置,以及加入UNG酶抗污染基本可以解决,而引物的非特异性问题基本属于厂家试剂质量问题。而PCR的假阴性却不同,它涉及了与PCR实验的几乎所有人员和技术环节,十分复杂。就临床而言,大三阳检出率低、甚至于GC镜下都很多 ...

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PCR假阴性的原因分析

PCR的假阳性问题是在PCR诞生之初就被深刻认识到了,同时由于造成假阳性的因素相对单一,因此假阳性并不是困惑检验工作的主要原因。如果一个项目只是阳性率高敏感性好的话,那么可以认为其阴性结果具备很高的可排除性,仍然有相当的临床适用价值。但PCR的假阴性在检验工作中仍很严重,并且用些因素经常被人忽略,严重的影响了PCR的使用。可以想象一种假阳性和假阴性都很高的项目,有什么样的诊断价值。 造成PCR假阴 ...

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PCR技术总结

PCR的最早设想 核酸研究已有100多年的历史,本世纪60年代末、70年代初人们致力于研究基因的体外分离技术,Korana于1971年最早提出核酸体外扩增的设想:“经过DNA变性,与合适的引物杂交,用DNA聚合酶延伸引物,并不断重复该过程便可克隆tRNA基因”。 PCR的实现 1985年美国PE-Cetus公司人类遗传研究室的Mullis 等发明了具有划时代意义的聚合酶链反 ...

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PCR相关技术

早在1958年科学家分离出DNA聚合酶( polymerase)后,就曾设想利用DNA聚合酶扩增大量DNA片段。但当时由于DNA测序较难,没有核苷酸合成技术及耐热性的DNA聚合酶没有得到分离等原因而没有发展起来。直到1985年,美国的Cetus人类 遗传实验室的年轻科学家Mullis在偶然灵感的启迪下发明了划时代的聚合酶链式反应(polymerase chain reaction)简称PCR技术- ...

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PCR的故事

末代沙皇尼古拉二世、1918年的流行性感冒病毒、电影《侏罗纪公园》,以及辛普森杀妻案,这四件事情到底有什么相关?答案是没有。只不过近十几年来生物技术的一项新发明,把它们给连在一块了。这项技术就是“聚合酶链反应”(polymerase chain reaction,PCR)。 PCR的最大特点,是能将微量的DNA大幅增加。因此,无论是化石中的古生物、历史人物的残骸,还是几十年 ...

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判断PCR阳性的标准

一、条带宽不超过1mm,边缘整齐; 二、条带在期望的碱基大小之内; 三、背景上无smears也无引物二聚体的出现则是PCR扩增失败,而非阴性反应; 四、如果出现期望的碱基大小之外的其它条带,不管是否有期望大小的条带,均应作为人工假像看待; 五、在临床标本检测时,尤其对于肿瘤标本,除预期条带外,经常有以外条带或smear现象,但只要其亮度明显低于目的条带,也应视为阳性; 六、对于某些情况,尤其在自 ...

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PCR产物克隆方法

平端连接 通常情况下,PCR产物可直接与平端载体DNA进行连接,但其连接效率效低。因为TaqDNA聚合酶具有非模板依赖性末端转移酶活性,能在两6条DNA链的3'末端加上一个多余的碱基,使合成的PCR产物成为3'突出一个碱基的DNA分子。这种DNA分子的连接效率很低。由于PCR产物的效率通过较高,。在采用大量T4DNA连接酶并配以5-10u T4 RNA连接酶时,可显著提高其连接效率。对于较短PC ...

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聚合酶链反应单链构象多态性技术

PCR-SSCP分析的基本程序为:首先PCR扩增特定靶序列,然后将扩增产物变性为单链,进行非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳。在不含变性剂的中性聚丙烯酰胺凝胶中电泳时,DNA单链的迁移率除与DNA链的长短有关外,更主要的是取决于DNA单链所形成的构象。在非变性条件下,DNA单链可自身折叠形成具有一定空间结构的构象。这种构象由DNA单链碱基决定,其稳定性靠分子内局部顺序的相互作用(主要为氢键)来维持。相同长度 ...

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用PCR、GC发夹及变性梯度凝胶电泳检测突变

变性梯度胶凝电泳(DGGE)能够将具有单个碱基差别的DNA分子分离开来。分离以 DNA在溶液中的解链特性为基础。以温度或变性剂浓增高时,DNA分子在不同的区域相 对应的解链温度称为基础。解链区域的长度从25个碱基对到数百个碱基对不等,与每 一个解链区域相对应的解链温度称为解链温度(Tm)。由于一个DNA链上相邻碱基间的 堆积作用在DNA双螺旋的稳定上起着相当重要的作用,因此解链区域的Tm值主要取决 ...

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PCR问题的总结

PCR产物的电泳检测时间 一般为48h以内,有些最好于当日电泳检测,大于48h后带型不规则甚致消失。假阴性,不出现扩增条带。 PCR反应的关键环节有 ①、模板核酸的制备 ②、引物的质量与特异性 ③、酶的质量 ④、PCR循环条件。 寻找原因亦应针对上述环节进行分析研究。 模板:①、模板中含有杂蛋白质;②、模板中含有Taq酶抑制剂;③、模板中蛋白质没有消化除净,特别是染色体中的组蛋白;④、在提取制备模 ...

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Preparation of G+A Marker

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PCR(聚合酶链式反应)扩增和扩增产物克隆

第一节 概 述 PCR (Polymerase Chain Reaction,聚合酶链反应)是一种选择性体外扩增DNA 或RNA的方法。它包括三个基本步骤: (1) 变性(Denature):目的双链DNA 片段在94℃下解链; (2) 退火(Anneal):两种寡核苷酸引物在适当温度(50℃左右)下与模板上的目的序列通过氢键配对;(3) 延伸(Extension):在Taq DNA 聚合酶合成D ...

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PCR污染与对策

PCR反应的最大特点是具有较大扩增能力与极高的灵敏性,但令人头痛的问题是易污 染,极其微量的污染即可造成假阳性的产生。 一、污染原因 (一)、标本间交叉污染:标本污染主要有收集标本的容器被污染,或标本放置时,由于 密封不严溢于容器外,或容器外粘有标本而造成相互间交叉污染;标本核酸模板在提 取过程中,由于吸样枪污染导致标本间污染;有些微生物标本尤其是病毒可随气溶胶 或形成气溶胶而扩散,导致彼此间的污 ...

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PCR污染及解决对策

聚合酶链反应(polymerase chain reaction PCR)是一种选择性体外扩增DNA或RNA片段的方法,在微生物感染的诊断中具有重要的价值。在PCR扩增过程中,扩增的DNA产量是呈指数上升的,经过n个循环的扩增,一个DNA分子的产量便达到2n个拷贝。PCR产物一般为1013拷贝/ml,取0.1ml即为109拷贝,而1mg人基因组DNA才含1.4´106拷贝的单拷贝基因片 ...

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PCR实用大全

PCR引物设计的11条黄金法则 一、引物最好在模板cDNA的保守区内设计。 DNA序列的保守区是通过物种间相似序列的比较确定的。在NCBI上搜索不同物种的同一基因,通过序列分析软件(比如DNAman)比对(Alignment),各基因相同的序列就是该基因的保守区。 二、引物长度一般在15~30碱基之间。 引物长度(primer length)常用的是18-27 bp,但不应大于38,因为过长会导致 ...

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PCR专题

PCR的问题,无疑是绝大多数学生物的人都关心的问题。今天我们把相关内容整理出来,与大家共同讨论,希望对大家能有所帮助。 引物设计 所谓“工欲善其事,必先利其器”,这年头手工设计引物的人似乎不多,还是用软件方便些,防止你一不小心看走眼,丢一个碱基,同时计算起来也方便。设计软件有很多,既可以在线设计(如Primer3 http://frodo.wi.mit.edu/cgi-bi ...

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