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PCR技术原理

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反向PCR(reverse PCR)相关知识

反向PCR(reverse PCR)是用反向的互补引物来扩增两引物以外的未知序列的片段,而常规PCR扩增的是已知序列的两引物之间DNA片段.实验时选择已知序列内部没有切点的限制性内切酶对该段DNA进行酶切,然后用连接酶使带有粘性末端的靶序列环化连接,再用一对反向的引物进行PCR,其扩增产物将含有两引物外未知序列,从而对未知序进行分析研究. 反向PCR的目的在于扩增一段已知 ...

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对PCR扩增产物分析

1、凝胶电泳分析 PCR产物电泳,EB溴乙锭染色紫外仪下观察,初步判断产物的特异性。PCR产物片段的大小应与预计的一致,特别是多重PCR,应用多对引物,其产物片断都应符合预讦的大小,这是起码条件。琼脂糖凝胶电泳通常应用1~2%的琼脂糖凝胶,供检测用;聚丙烯酰胺凝胶电泳时,6~10%聚丙烯酰胺凝胶电泳分离效果比琼脂糖好,条带比较集中,可用于科研及检测分 ...

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定量PCR常见问题解答

1.定量PCR仪的开关机顺序是怎样的? 按照正确的开关机顺序操作,有助于延长仪器的使用寿命,减少仪器出故障的频率。开机顺序:先开电脑,待电脑完全启动后再开启定量PCR仪主机,等主机面板上的绿灯亮后即可打开定量PCR的收集软件,进行实验。关机顺序:确认实验已经结束后,首先关闭信号收集软件,然后关掉定量PCR仪主机的电源,最后关闭电脑。 ...

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定量PCR(Polymerase Chain Reaction)技术

定量PCR(Polymerase Chain Reaction)技术有广义概念和狭义概念。广义概念的定量PCR技术是指以外参或内参为标准,通过对PCR终产物的分析或PCR过程的监测,进行PCR起始模板量的定量。 广义概念下的定量PCR技术可以分为五种类型: (1)外参法+终产物分析。所谓“外参法”是指样本与阳性参照在两个反应容器内反应。这种类型没有对样本进行质控监测,易出现 ...

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原位PCR的详细介绍

The In Situ PCR: Amplification and Detection in a Cellular Context Ernest F. Retzel Katherine A. Staskus Janet E. Embretson and Ashley T. Haase Department of Microbiology University of Minnesota Minne ...

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实时PCR原理探针翻译

1.实时PCR原理 对扩增产物进行可重复性的定量长期以来一直是科学家和研究者的目标。传统的方法需要对终产物进行凝胶电泳分析。这种方法可以确定目的产物和竞争产物的大小,估算纯度,计算条带强度。然而,所用扩增试剂和体系的变动会造成扩增的终产物的重复性有较大的变动,成为这种方法的主要弊端。 扩增过程的指数期提供给我们最有用的,可重复的数据。在起始的目的DNA量与循环过程的指数期的扩增产物量之间存在着定量 ...

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提高PCR特异性的方法

1、引物设计 细心地进行引物设计是PCR中最重要的一步。理想的引物对只同目的序列两侧的单一序列而非其他序列退火。设计糟糕的引物可能会同扩增其他的非目的序列。下面的指导描述了一个可以增加特异性的引物所具有的令人满意的特点: 1.典型的引物18到24个核苷长。引物需要足够长,保证序列独特性,并降低序列存在于非目的序列位点的可能性。但是长度大于24核苷的引物并不意味着更高的特异性。较长的序列可能会与错 ...

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引物

一 设计引物应遵循以下原则 1 、引物长度: 15-30bp,常用为20bp左右。 2 、引物扩增跨度: 以200-500bp为宜,特定条件下可扩增长至10kb的片段。 3 、引物碱基:G+C含量以40-60%为宜,G+C太少扩增效果不佳,G+C过多易出现非特异条带。ATGC最好随机分布,避免5个以上的嘌呤或嘧啶核苷酸的成串排列。上下游引物的GC含量不能相差太大。附加序列(RT site P ...

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如何建立一个PCR实验室

为了对以个特定序列进行PCR做重复检测需要三个不同的区域,每一个区域的具体技术操作和试剂在下面详细列出。 一、样品准备区 这个区域专门用作样品的准备,在制备和操作用于核酸提取的试剂时应该采取预防措施: (1)PCR产物和带有要扩增序列的DNA克隆不能在这个房间操作。 (2)组织培养物、组织标本和血清样品都带进样品准备间处理,以根据应用的需要提取DNA或RNA。 (3)用于样品处理的工具不能被用作普 ...

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禽流感实验室检测技术方案

一、实验室网络设置 实验室网络由中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所国家流感中心和省级流感实验室两级组成。 二、实验室条件及生物安全操作的要求 1.省级流感实验室实验条件及生物安全的操作要求 (1)实验生物安全要求:安全Ⅱ级+(BSL-2 级+)或安全Ⅲ级(BSL-3 级)。 (2)特异性H5 的 RT-PCR 病毒核酸检测、血清学检测中用到的血凝抑制实验(HI)可以在安全Ⅱ级+(BSL-2 级+ ...

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浅谈PCR方法中常见的污染问题及对策

反转录-聚合酶链反应(RT-PCR)是一种体外核酸扩增技术,它具有特异、敏感、快速、简便、重复性好、易自动化等突出优点,能在几个小时内完成从一根毛发、一滴血、甚至一个细胞中扩增出足量的目的产物供分析研究和检测鉴定,所以近年来RT-PCR技术被广泛应用于人和动物的多种传染病早期诊断。 笔者一直从事实验室动物疫病检测工作,现就应用RT-PCR实验方法过程中出现的一些常见污染问题做如下论述,仅共同行参考 ...

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启动子克隆方法研究进展

随着基因工程的发展,常常需要构建一种能高水平表达异源蛋白质的表达载体。启动子对外源基因的表达水平影响很大,是基因工程表达载体的重要元件。因此研究启动子的克隆方法,对研究基因表达调控和构建表达载体至关重要。 迄今为止,国外尚未见到有关启动子克隆方法的综述性报道,国内仅孙晓红等曾就启动子的结构、分类、克隆方法和食用菌中已经分离到的启动子作过综述。而近年来又有许多改进的克隆启动子的方法获得了多方面的成功 ...

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其它链扩增技术及应用范围

一、免疫PCR 所谓免疫(Immune PCR)就是利用抗体与DNA特异结合来检测抗原,把抗原抗体反应与PCR联合应用而建立的一种抗原检测系统。 在免疫PCR中,一个中介分子同时具有与DNA、抗体分子特异结合的能力。其一端连接DNA(标记物),另一端连接抗原-抗体复合物,形成一个特殊的抗原-抗体-DNA连接物。作为标记物的DNA分子可用PCR的扩增,存在特异的PCR产物应证明作为标记物的DNA分子 ...

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耐热DNA聚合酶的选择指南

一、耐热DNA聚合酶特点 合理选择耐热DNA聚合酶是PCR成败与否的一个关键因素,如何选择最合适的耐热聚合酶,是进行PCR实验首先要考虑的问题。目前市面上有许多耐热DNA聚合酶,虽然名称各不相同,但主要区别在于特异性、保真性、耐热性、扩增速率、扩增片段长度等几个指标。 TIANGEN公司生产的耐热DNA聚合酶全部采用标准化生产工艺和质量检测标准,是经过多次分子筛、离子交换层析柱纯化的超纯型产品,去 ...

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PCR的污染与对策

PCR反应的最大特点是具有较大扩增能力与极高的灵敏性,但令人头痛的问题是易污染,极其微量的污染即可造成假阳性的产生。 污染原因 (一)标本间交叉污染:标本污染主要有收集标本的容器被污染,或标本放置时,由于密封不严溢于容器外,或容器外粘有标本而造成相互间交叉污染;标本核酸模板在提取过程中,由于吸样枪污染导致标本间污染;有些微生物标本尤其是病毒可随气溶胶或形成气溶胶而扩散,导致彼此间的污染。 (二)P ...

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PCR基础知识[PCR basics]

The polymerase chain reaction PCR using a heat-stable polymerase and suitable primers to direct the amplification of the desired region of DNA. is a rapid inexpensive and simple way ofcopying specific ...

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PCR技术:样品处理与注意事项

一、样品处理 DNA是染色体的主要组成部分,是PCR的扩增模板。要进行PCR,研究DNA结构与功能或者用于诊断目的,首先必须从生物体内提取DNA。DNA往往以核蛋白形式存在,其分子量大(人的染色体DNA平均大小为3.0×109bp),提取DNA应尽量保持DNA完整性和纯度,即在提取中尽量避免机械张力引起的DNA分子降解,又要注意杂质及蛋白的去除,防止胞内酶解DNA。因此,提取DNA的基 ...

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PCR技术操作程序与优化方法

典型的PCR操作 在此处仅列出—般PCR操作过程,具体影响因素的优化将在本章第二节讨论,每一个具体操作前都需进行必要的优化。 一、 试剂 (1)引物根据待扩增DNA不同,引物亦不同,引物的设计见本章第三节。 (2)耐热DNA聚合酶:此酶是从耐热细菌中分离出来的,能耐受高温(93—100c),不同耐热DNA聚合酶的特性详见本章第4节。 Perkin—E1mer&m ...

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PCR技术的拓展知识

1、逆转录PCR(RT-PCR)用来扩增RNA的方法。 2、竞争逆转录PCR(competitive reverse transcription-polymerase chain rection C-RT-PCR)低丰度RNA定量的好方法。 3、多重PCR(multiples PCR)在同一PCR体系中加入多对引物可用于基天长度很长,发生多处缺失的检测。扩增同一模板的几个区域。 4、多种PCR可同 ...

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PCR技术的原理

PCR是体外酶促合成特异DNA片段的新方法,主要由高温变性、低温退火和适温延伸三个步骤反复的热循环构成:即在高温(95℃)下,待扩增的靶DNA双链受热变性成为两条单链DNA模板;而后在低温(37~55℃)情况下,两条人工合成的寡核苷酸引物与互补的单链DNA模板结合,形成部分双链;在Taq酶的最适温度(72℃)下,以引物3’端为合成的起点,以单核苷酸为原料,沿模板以5’&ra ...

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