体外转录相关技术

在哺乳动物细胞中进行RNA干扰:设计，实验和分析siRNA效应转录后基因沉默，也称为RNA干扰，是指双链RNA分子阻断或者降低同源基因的表达的现象。这种现象可能是作为一种抑制病毒感染和转座子跳跃的细胞防御机制(Ketting et. al., 1999; Tabara et. al., 1999; Jensenet. al., 1999; Ratcliff et. al., 1999)。在体内，双链RNA被内源的核糖核酸酶降解为21-23个碱基大小的小分子干扰RNA（small i ...

shRNA 资源库及其构建方法shRNA资源库：以下资源库的构建及其详细的protocol都可以在网站下载1.NCBI　shRNA资源库http://cgap.nci.nih.gov/RNAiAbout RNAi on CGAPThe NCI is part of the consortium supporting the preparation of human and mouse libraries containing RNAi constructs that target cancer-relev ...

一．实验材料及其仪器1．实验仪器iQ5 Real Time PCR Detection System： Bio-Rad2．实验材料及试剂All-in-OneTM miRNA Q-PCR Detection Kit： GeneCopoeia (Cat. No. R0101S )验证模板：人源十个不同的组织所制备的cDNA测试引物：共5 对（具体引物序列等详细信息附在产品说明书处，此处略）Catalog# Primer ID Mature_Acc Mature_ID PCR SIZE1 miRQP0227 hsmq ...

浏览核酸研究2006年数据库专刊的时候，发现了两个miRNA的序列数据库。miRNAmap:http://nar.oxfordjournals.org/content/vol34/suppl_1/index.dtlwhat is miRNmapWe establish genomic maps for microRNA precursors and their mapping to targets in vertebrate genomes, namely miRNAMap. In this s ...

1 Founding Members： Lin-4/let-7Ambros, V., and Moss, E. (1994) The heterochronic genes and developmental timing in C. elegans. Trends in Genetics 10, 123-127.Basyuk E, Suavet F, Doglio A, Bordonne R, Bertrand E. (2003) Human let-7 stem-loop precursors harbor features of RNase III cleavage products. ...

RNA干扰介绍 （2006年诺贝尔医学奖）据诺贝尔奖官方网站消息，10月2日当地时间上午11时30分(北京时间17时30分),瑞典皇家科学院诺贝尔奖委员会宣布将2006年度诺贝尔生理学或医学奖授予两名美国科学家安德鲁-费里和克拉格-米洛，以表彰他们发现了RNA干扰现象。费里和米洛将分享奖金。因此，搜集了一点相关资料与大家共同学习。请斑竹酌情加分。RNA干扰技术研究进展及其应用作者单位：云南农业大学动物科学技术学院， ...

MicroRNAs（miRNAs）是一种小的内源性RNA分子，大约由21－25个核苷酸组成。这些小的miRNA通常靶向一个或者多个mRNA，通过翻译水平的抑制或者断裂靶标mRNAs而调节基因的表达。Discovery（发现）：1993年，Lee，Feinbaum和Ambros等人发现在线虫体内存在一种RNA（lin-4），是一种不编码蛋白但却可以生成一对小的RNA转录本，每一个转录本能在翻译水平通过抑制一种核蛋白 ...

本人新手，刚接触到microRNA这一领域时，不知道如何下手。通过查阅相关文献，虽然对其有所了解，但也存在诸多困惑！且不说对各种miRNA的功能及作用机制知之甚少，单从最基本的miRNA的命名上看就很是费解，比如：hsa-miR-4720-3p 等应该如何理解呢？我想大多数刚接触到这方面的朋友们估计也跟我有一样的困惑吧？！通过收集各方面的资源，总算有了些收获，为以后在该领域的进一步研究打下了基础。在此分享给大家，希望对 ...

相约8月 microRNAs完整解决方案暨生物美学技术培训班——姚开泰院士亲自讲解表观遗传学与肿瘤学前沿不容错过的理由：专业的品质，丰富的经验，莱德尔带您步入小分子的殿堂，与您分享microRNAs研究最完整的解决方案群雄逐鹿的战场上一块仅存的处女地，microRNAs研究最后一次不容错过的良机：microRNAs启动子的表观遗传学研究与分子生物学明星技术培训最抽象的分子机制可以绘制出最华丽的插图，投稿Nat ...

miRNA Northern Blot实验步骤1975年，英国科学家埃德温·迈勒·萨瑟恩（Edwin Mellor Southern）创建了Southern Blot技术用于检测DNA。基于同样的原理，1977年由斯坦福大学的James Alwine、David Kemp和George Stark开发出了用于检测RNA的Northern Blot技术，至今仍然是一种经典的RNA检测技术。miRNA在不同组织中丰度变化大，例如，miR-133在骨 ...

MicroRNA Interference TechnologiesBy Zhiguo WangPublisher: SpringerNumber Of Pages: 193Publication Date: 2009-08-01ISBN-10 / ASIN: 3642004881ISBN-13 / EAN: 9783642004889Description:MicroRNAs (miRNAs), endogenous noncoding regulatory mRNAs of around 22-nu ...

采用Arraystar lncRNA芯片发现病毒型肝癌的新靶点【字体：大 中 小】　　www.ebiotrade.com　　时间：2011年8月4日　　　　来源：康成生物------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------摘要： 第二军医大学孙树汉教授课题组长期致力于肝癌研究，许多实验成果已经发表在国际顶级期刊上。此次研究利用Arraystar lncRNA芯片（长链非 ...

　　原来上学的时候，我们知道mRNA，tRNA和rRNA，当时只知道除了mRNA估计都不会考的，于是也就这么过来了。但做了科研才知道，原来还有MiRNA、SiRNA、LncRNA、PiwiRNA、CeRNA……当我看到看到这些的时候，我感觉整个人都不好了，感受到了科研所带来的深深的恶意……脑海里只有两个念头：“这TM是啥？”&“这TM又是啥？”　　MicroRNA这几年挺火的，所以必须要知道一些相关的知识。　　MicroRNA (miRNA) 是 ...

RNA干扰(RNA interference，RNAi)是正常生物体内抑制特定基因表达的一种现象，它是指当细胞中导入与内源性mRNA编码区同源的双链RNA(double stranded RNA，dsRNA)时，该mRNA发生降解而导致基因表达沉默的现象，这种现象发生在转录后水平，又称为转录后基因沉默(post-transcriptional gene silencing，PTGS)。外源dsRNA 进入细胞后产生的小分子干扰RNA（s ...

最近开始自己包装慢病毒shRNA，用的是之前组里师姐的protocol，基本上是基于TRONOLAB的protocol。之前师姐包装的病毒，效率很高，基本上能KD八成到九成。最近我自己包装了两次，浓缩后根据之前师姐包装的病毒用量感染肝癌细胞，细胞生长速度明显延缓，形态改变也跟之前的相似。但是做western却只能看到很marginal的蛋白水平降低，在有的细胞株甚至完全看不到KD。我用GFP质粒转染HEK29 ...

尽管当前有多种方法可用于全面研究蛋白质编码基因的细胞内作用，然而用于系统研究与多种生物学信号通路有关的长链非编码RNAs (lncRNAs)的技术却十分有限。在这篇文章中，来自德国德累斯顿工业大学的研究人员开发了一种结合非编码RNAs敲除和定位分析的技术，称之为c-KLAN。利用这一技术对lncRNAs进行了功能鉴定和定位，并鉴别出了调控小鼠胚胎干细胞类型的转录物。在真核生物基因组中大量的蛋白质编码和非编码转 ...

A resource for large-scaleRNA-interference-based screens in mammalsPATRICK J. PADDISON1~undefined, JOSE M. SILVA1~undefined, DOUGLAS S. CONKLIN1~undefined,?, MIKE SCHLABACH2,?, MAMIE LI2, SHOLA ARULEBA1, VIVEKANAND BALIJA1, ANDY O'SHAUGHNESSY1, LIDIA GNOJ1, KIM SCOBIE1, KENNETH CHANG1, THOMAS WESTBROO ...

Do Your Experiments Require Total RNA or mRNA?看看就会有收获Selecting a Purification Strategy . . . . . . . . . . . . . . . .. . . . . . . . . 198Do Your Experiments Require Total RNA or mRNA? . . . . . 198Is It Possible to Predict the Total RNA Yield froma Certain Mass of Tissue or Number of Cells? . . . . . . . . 201Is There Protein in Your RNA Preparation, andIf So, Shou ...

如果有人告诉你有一种不用去NCBI、UCSC、DBTSS等数据库，也不用众多的启动子分析软件去苦苦倒腾，就能准确、快速、高效、直接、简洁、明了的获取目的基因的启动子以及cDNA、shRNA、miRNA等重要信息，道友们一定不会相信，而在今天之前我也不相信，而事实是下面我要分享的这个东东介于牛A和牛C之间，很牛B啊！道友们不信？ 去这个网站吧http://www.genecopoeia.com/product/search/i ...

1. The MicroRNA: Overview of the RNA Gene That Modulates Gene Functions2. Structure Analysis of MicroRNA Precursors3. MicroRNA Biogenesis: Isolation and Characterization of the Microprocessor Complex4. Recognition and Cleavage of Primary MicroRNA Transcripts5. Mouse Embr ...