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【转贴】小常识:大肠杆菌的基因型

大肠杆菌的基因型野生的大肠杆菌具有大约4,700 kbp的DNA分子,上面有约2,800个基因。当这些基因中有突然变异发生时,基因产物随之变化,并且有可能给大肠杆菌带来可以观察到的变化。这种能够观察到的特征叫做大肠杆菌的表现型 (Phenotype),而把基因的构成叫做大肠杆菌的基因型 (Genotype)。通常情况下,基因工程中使用的大肠杆菌的基因型只有在基因发生变异、表现型发生变化时才被表示。但是需要特别指出时, 则在野生 ...

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【交流】亚基因组的定义

亚基因组的定义一,这是别人问我的两个问题的回答词:1.什么是亚基因组?我查到一些资料:披膜病毒科(Togavride)病毒,其下4个属,其中一个属是甲病毒属(Alphavirus),其Genome是单链(+)RNA,其单独即可引起完整的复制周期。而其Genome 3’末端后1/3编码数种病毒结构Propeins,含4100个核苷,这一区域也称为亚基因组mRNA(subenomic RNA),或称为26S mRNA,此区域编码病毒结构 ...

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【共享】分子生物基因工程教科书汇总

molecular biology of the gene第五版及英文原版配套光盘下载开放中!:http://www.helixnet.cn/bbs/thread-9081-1-1.html基因8完全中文PDF版(纳米盘连接):http://www.helixnet.cn/bbs/thread-9071-1-1.html基因8英文原版http://www.helixnet.cn/bbs/thread-1327-1-2.html最新分子生物学实验技术( ...

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【资源】一些与基因组学学习相关的资料

基因组学相关软件列表1、基因组组装分析:phred, phd2fasta, phrap, consed, arachne, RePS  2、功能注释:glimmer, genewise, genscan, fgenesh, BGF, tRNAscan-SE, MicroRNA, sim4, InterproScan, GO, WEGO, Promoter 2.0, Disembl  3、重复序列:Repeatmasker, ReAS  4、比较基因组:cross_match, blastall, blastz, blat, Fasta, CA ...

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【共享】[文献] 功能基因组学中的功能缺失研究策略

感谢参与!给出链接即可!如果可能,楼主可以给一个comment。0 引言在功能基因组学(functional genomics)研究中,阐明各种蛋白的结构和生物学功能是其核心任务,不仅是生物学的主要研究方向,而且也是医学研究的主要内容,毕竟细胞的功能和表型是由细胞中的蛋白来主导的,许多疾病都是蛋白结构与功能、表达水平与调节的异常引起的. 研究蛋白的功能,常常通过改变蛋白的表达水平,观察细胞的生物学特性的变化,来研究蛋白相应的 ...

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【共享】“常见重大疾病全基因组关联分析和药物基因组学研究”重点项目课题申报指南

“常见重大疾病全基因组关联分析和药物基因组学研究”重点项目课题申报指南科技部 日期: 2009-03-10关于发布“十一五”国家高技术研究发展计划(863计划)生物和医药技术领域“常见重大疾病全基因组关联分析和药物基因组学研究”重点项目课题申报指南的通知各有关单位:全基因组关联分析和药物基因组学已经成为国际上新的研究热点,对于预防、治疗常见重大疾病具有重要战略意义。根据863 计划“十一五”发展纲要,国家决定实施“常见重大疾病 ...

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【进展】 我国科学家发现解读基因“神奇工具”

如果愿意,可以将某些人的身高调控成姚明那样的大高个、也可以把人类衰老的时钟往后再拨一拨……而这些可能不再是遥远得要苦苦等上几百年的事情了。复旦大学的科研人员最近找到了一种更为高效、快速地**“基因天书”的“密码”,这意味着人类大规模、逐一了解3万个基因中每个基因的功能、并找到基因疾病的根源将不再那么遥不可及。  据悉,该项轰动世界、被称为“里程碑式发现”的科研成果已由国际顶尖生命科学杂志《细胞》在线刊登,并将刊登在8月12日 ...

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最新基因组学术语表New Genome Glossary

最新基因组学术语表New Genome GlossaryGenome GlossaryAAdenine (A): A nitrogenous base, one member of the base pair AT(adeninethymine).Allele: Alternative form of a genetic locus; a single allele for each locus isinherited separately from each parent (e.g., at a locus for eye color the allelemig ...

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菌株的基因型符号

关于菌株的基因型符号http://www.takara.com.cn/product/2004/n/n-16fh11001.html野生的大肠杆菌(E.coli)的基因组DNA中有470万个碱基对(bp),内含4288个基因。E.coli基因组中还包含有许多插入序列,如λ-噬菌体片段和一些其他特殊组份的片段,这些插入的片段都是由基因的水平转移和基因重组而形成的,由此表明了基因组具有它的可塑造性。利用大肠杆菌基因组的这种特 ...

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【共享】如何找到一个感兴趣的基因并确定其结构(转自基因治疗讨论版)

From:http://www.dxy.cn/bbs/post/view?bid=75&id=5304778&sty=1&tpg=1&age=01.国立生物技术信息中心(NCBI)图谱浏览器(Map Viewer)可以通过NCBI主页进入NCBI的人类图谱浏览器,网址为http://www.ncbi.nlm.nih.gov/。点击右栏标有“Human map viewer”的超级链接即可进入图谱浏览器的主页。页面上端的符号标明此为Build 29,或 ...

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功能分类基因芯片应用案例

功能分类基因芯片应用案例介绍:功能分类基因芯片作为芯片业的后起之秀已在国际学术界的受到广泛关注。美国SuperArray公司自1998年以来专业生产功能分类基因芯片,品种最为齐全,已有大量论文发表。为了让研究人员对这一研究工具有更直观的认识,我们现将国外近年来使用SuperArray功能分类基因芯片发表的文章摘要汇编如下,以供大家参考。如需原版全文或更多文章,请与我们联系,免费电话:800-820-5058C ...

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【交流】宏基因组学及基因X (美)(英文版)

宏基因组学Metagenomics Methods and Protocols基因X (美)(英文版)Metagenomics has proven to be a powerful tool for exploring the ecology, metabolic profiling, and comparison of complex microbial communities as well as its important applications in the mining of metagenomes for genes encodi ...

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【交流】走出基因论的误区

走出基因论的误区本文刊于《生物科学进展》1997;(6):16-21。周慕瀛山东肥城矿务局中心医院271608摘要基因只是蛋白质分子的规格信息,它远不是物质本身.性状却必然意味着性状物质以及它的四维分布。从规格到实际物质的分布欠缺着有时、空坐标的物质制造活动.可见,基因根本决定不了性状的全过程。基因论的失误起始于孟德尔,延续到摩尔根并直至如今.生命的最大特色是主动性.牢记这一事实既易于走出基因论的误区,也易于找到生 ...

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NCBI使用方法之二:如何查找连续的mRNA、cDNA、蛋白序列

1、进入NCBI主页:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/在search后面选择Gene,在for后面填写需要查找的基因的名字。如图所示:点击“Go”,出现以下界面:出现了很多基因序列,在每个序列的右边还有“Order cDNA clone” 的链接,这些序列中有些序列是跟你的目的基因同名的,有些是别名(Other Aliases)与你的目的基因一致,根据每个序列的介绍认真选择你的目的基因。上图中我需要的IL6是标号为 ...

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NCBI使用方法之一:Map viewer查找基因序列,RNA,启动子

下面以人的IL6(白细胞介素6)为例讲述一下具体的操作步骤一、打开Map viewer页面,网址为:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/mapview/index.html在search的下拉菜单里选择物种,for后面填写你的目的基因。操作完毕如图所示:二、点击“GO”出现如下页面:.三、在步骤二图示的右下角有一个Quick Filter,下面是让你选择的几个复选框,在Gene前面的小方框里打勾,然后点击Fil ...

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水稻功能基因芯片之开发

一、引言 水稻是世界上重要的粮食作物之一,负担近35 亿人口的粮食需求,是全球二分之一人口的主食。根据估计到了公元2050年全球的人口总数预计会大幅成长7.5-10.5亿,而这些新增人口主要集中在以稻米为主食的地区。根据2009年联合国世界粮农组织(FAO)的报告推估,到了公元2050年全世界的粮食生产,和现在相比,可能要产出额外70%的粮食,来喂饱这些新增的人口,可以想见,稻米的生产在不久的未来,是维持粮食安全的重要指标。 ...

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千元基因组时代来临

苹果前掌门人乔帮主离世两年多了,这位活着就为改变世界的天才在去世之前仍做了一件与他性格极其相符的事情:花费10万美元进行了一次全基因组测序。并对该技术抱有巨大期望:“我相信我会成为这家公司治愈的首批癌症患者之一,抑或是最后一批因为癌症而死亡的患者之一。”但由于治疗上的耽搁,该技术并未使得乔布斯从鬼门关返回。据乔布斯传记的作者艾萨克森透露,乔布斯当时是世界上仅有的20个完成个人基因组测序的人之一。技术的不确定性 ...

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新一代细胞转染方法-磁性转染

细胞转染是将外源性分子如DNA,RNA等导入真核细胞内的专门技术,是研究基因表达调控,突变分析,基因沉默,蛋白质等的工具,目前已成为生物和医学等研究实验室广泛使用的基本技术。理想的转染方法具有转染效率高,对细胞毒性小,使用简便,适用范围广等特点。阳离子脂质体法是目前普遍应用的细胞转染方法,转染效率较高,对细胞有一定毒性,转染效果随细胞类型变化大。对于难以转染的细胞及原代细胞,病毒介导法是可供选择的方法之一,它通过 ...

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神奇的荧光素酶

在细胞和基因的微观世界中研究探索,遗传报告基因是非常有用的"可视化和量化"工具,具有广泛的应用。荧光素酶(萤光素酶)以出色的灵敏度、使用方便、可以定量检测而成为理想的报告基因。 荧光素酶不是特定的分子,是一类中能催化产生生物发光的酶的统称,不同来源的荧光素酶各有特点,可催化底物发出不同颜色的光,有的还可以配合进行双色发光检测。这种酶最早的来源,也是最有代表性一种 ...

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酵母染色体沉淀分析方法Yeast Chromatin Immunoprecipitation (ChIP) Assay

ABSTRACTThis protocol describes a method for the detection of proteins bound to specific regions of chromatin in yeast. There are many variations of this assay.MATERIALS ReagentsAntibody of choice ...

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