DNA测序

虽然单细胞测序到现在已经应用到各个研究领域，但是实际的实验过程中依然会遇到很多问题，比如：1.很多样本根本没有办法制备单细胞悬液，比如已经在-80℃冻存的样本；2.有些样本制备成单细胞悬液以后现有的单细胞测序平台无法捕获，比如心肌细胞、骨骼肌细胞、成熟的脂肪细胞等，由于直径过大，超出了10x genomics和BD Rhapsody平台最大能捕获的细胞直径；3.再者有些细胞类型可能在单细胞悬液制备的过程中丢失，比如脑部的 ...

急性红细胞白血病（AEL）是白血病（AML）亚型中的一种，在老年人白血病中的占比较高。相对于其他类型的AML，AEL病人有更加poor-risk的细胞遗传学异常和不良的预后。虽然针对AEL的外显子突变位点发现已有一些报道。但是，针对AEL的完整突变谱发现还没有相关报道。研究人员运用外显子组测序技术，发现了AML相关的高频突变基因GATA2和CEBPA等突变，为理解急性红细胞白血病的发生发展过程提供了新的证据。研 ...

lixingliang1987 本人近日构建克隆，送公司测序。得到序列结果进行DNAMAN分析，发现和目的基因相比多出两个碱基，我随后查看测序峰图，发现峰图上并没有相应的碱基，询问过公司后，他们建议按照峰图来分析结果。像这种拼接序列和峰图序列不同的现象，不知大家平时经常遇到吗？shylook 1.峰图有的 才能有 请确认是否真的没有多出俩碱基确认后打电话给公司 两边都打开峰图 确认一下如果确实没有 即声讨不负责任 不付款 找另外的公司再测2.真 ...

cssc 如题，一个肿瘤患者，用他的肿瘤组织DNA和血液样本DNA测序时，两者所得的序列是否应该一致的？谢谢！bigbang_0_0 不是完全一致的，肿瘤细胞存在基因组不稳定的特点，易积累体细胞突变。而血液细胞多由造血干细胞分化得来，除非造血干细胞本身发生癌变，其基因组应该与胚胎时期的基因组是一致的。cssc 谢谢啊，感谢帮助！华因康基因公司 有些基因是是存在体细胞突变的，这些体细胞突变一般发生在肿瘤细胞中，所以肿瘤组织中突变比 ...

xuquan897 求教一个关于测序的问题：我的大概1000bp左右的质粒拿去测序公司做正反向测序，结果正向测的很好，而反向给的报告是双峰，结果见下图，不知道是什么原因呢？请教各位高手。多谢多谢！file:///C:\Documents and Settings\yuanyuan.xu\Application Data\Tencent\Users\183410312\QQ\WinTemp\RichOle\%`GN))OT@@(C005`91(Y` ...

lilyfisher 为什么叫做反向重复序列，我反着读没有读出什么规律，能不能指点一二？如铅笔所指。请问N指的是什么核苷酸，谢谢biolinkphilic 就是说双链DNA，从5‘端开始读序列是一样的。N指的是ATCG四者之一，不确定。lilyfisher 请问从5‘端开始读序列是一样的吗，我做出互补的另一条链AATANGTNT，不管是正着读还是反着读也是不一样啊，我哪里理解还不对。请指点下下，谢谢。lmnsmu 是4个反向重复 ...

qisanni05 请教各位大侠，为什么我在MiRbase上找不到hsa-mir-150 基因上下游序列呢，请各位高手帮忙找一下，十分感谢！qisanni05 这是什么意思啊，由于刚涉及这方面还不太懂，还请高手多指教，非常感谢！lide658 你是要找编码hsa-mir-150的序列吗？如果是想构建hsa-mir-150表达载体，在MiRbase上是找不到的，你只能找到hsa-mir-150的成熟序列或者是前体序列。但是你可以直接在 ...

xxzjcg 求助人的twist基因的全序列，谢谢slytjiaofei 按你的实际需要选择相应选项，结果见下面的链接！！！http://genome.ucsc.edu/cgi-bin/hgNear?hgsid=191200469&org=Human&db=hg19&near_search=uc003sum.2&near_order=expGnfAtlas2&near_count=50&near.do.getSeqPage=sequen ...

wymderek 本人目前在做肺癌基因检测，靶标方面的研究，手上的标本均为05---08年肺穿刺、气管镜的组织标本，既往曾经过福尔马林固定，石蜡包埋等处理，切片后行LCM（显微切割）选出肿瘤区域。小片组织细胞数约为50个细胞，我们的后续方法为从这样的标本组织中提取DNA（应用蛋白酶水解过夜，在蛋白酶失活方法，经过验证新近标本，均可成功），然后巢式PCR扩增，最后测序比对可能出现的突变或者缺失。我们检测的基因为EGFR及K ...

qiangshou2010 我想问个这几天一直想不明白的事情。现在人类基因组测序早就完成了，也开始了其它物种的测序，包括猴子---恒河猴，rhesus,这几天我查了猴子的几个基因，发现在它的序列里包括了一部分的N。这些N表示什么意思呢？是当时没有测出来？还是不能找到合适的样本，才测不出来的？在哪里可以查到序列完全测出来的物种呢？就拿猴子来说，哪种猴子的序列是测全了的呢？zhujoker N表示的意思就是Nucleosid ...

kaoyanbaihe M13mp18的全基因图谱在哪里才能查到呢，我只查到了多克隆位点的序列，另外需要它的全基因图谱。大家帮帮忙啊baby_susan 你找的是这个网址吗http://www.fermentas.com/en/support/technical-reference/phage-plasmid-dna/m13mp18-m13mp19woxingwosu http://www.cardiff.ac.uk/biosi/st ...

borderland 搞临床的，不看基础很多年。书上说，微卫星DNA重复次数10-60，为啥么属于高度重复序列，高度重复序列不是重复次数达数百万次么？应该是中度重复序列才对。请专家拍砖borderland ?????borderland ????georgeli 晕:)freecell 参考此文： http://d.wanfangdata.com.cn/Periodical_shxmsytx200404001.aspx本文由丁香园论坛提供，想了解更 ...

hbglmn 本人进行某个基因启动子的DNA测序，发现一个突变点，但是不知道怎么查是否已经有人发现，恳请各位高手帮忙！非常感谢，因为本人刚从临床过来开始试验，很多东西不明白，请能够详细点说明！woxingwosu 呵呵，那你只能是看paper了，没有其他办法。不过基因的启动子突变研究，除非发现了这个突变真的具有很强的调节蛋白表达的效果，不然我觉得没有必要做下去的。默默默默默 同意楼上的建议！hbglmn 谢谢各位，我问了我们实验 ...

yuyue2010 我要RORγt的基因序列号，可是在NCBI上检索出来的只有RORC，请问是一回事吗？谢谢！版主zhujoker留言:我想问一下朋友，你能不能把你描述的基因的物种以及NM号给出来，你请人家帮忙也得给一点好的提示吧，老是暗语！yuyue2010 对不起，老师。我要用Real-time PCR检测人血的RORγt mRNA水平，在NCBI上检索不到RORγt 的基因序列号，只有RORC的基因，请问老师我可以用RORC ...

悠悠妈 如何从整个基因中判断表位序列？请高人指点。。。版主freecell留言:以后求助问题，请尽量在标题把问题表述清楚freecell This link may be helpful for u:http://www.embraceregistry.net/service/netctl-prediction-ctl-epitopes-protein-sequencesdnazyme 我是外行，也想参加讨论。线性表位的预测作了很多工作，就像“沙发”位置的 ...

hujuncas 最近合成回来一批PNA(DNA的类似物,只是骨架不同),因为不能对PNA测序,所以无法判断PNA的序列是否正确.今想到可以用测定PNA/DNA 双链Tm值的方法来验证,因为如果PNA序列有误,则其与互补DNA的Tm值肯定下降.有无大牛给指条明道,哪怕是 DNA/DNA的Tm值是如何测的(包括仪器和操作,以及所需核酸量),也好有个借鉴.另外,可否使用Realtime PCR仪器呢?先谢谢了!:Dsong333 TM for ol ...

折翼的老鼠 达人，你好，我是一个新手，想问下，我在NCBI上查的基因序列包不包括该基因的启动子？？阿呆硕士 没有。。一般都只有ORF序列即ATG开始TAA(..)结束。。。启动子序列要根据你的基因上下游序列去分析或是自己去验证某基因的上游序列是否具有启动功能。。。但一般对与目的基因的克隆表达研究，用的外源的高效启动子比较多。。。折翼的老鼠 那该怎样查一个基因的外源启动子序列呢？？michaelmichael 折翼的老鼠 wrote:那该怎样 ...

fangxiang2008 有高手能指点一下图片6个外显子的序列码？或指点一下在什么地方能查到？图来源的文献在附件。fangxiang2008 文献来源，刚才没有贴上去zhujoker 你直接将基因说出来不就搞定了吗？NCBI你查相应的东西都有的。bigbang_0_0 ucscfangxiang2008 基因是二氢叶酸还原酶，缩写DHFR；NCBI查不到外显子。另外请教楼上，ucsc怎么查，不太清楚fangxiang2008 NC ...

baolingbaby 各位前辈，鄙人现NCBI菜鸟一个，现急需胰岛素基因序列以及它各个内含子和外显子的序列，如果能帮我附上图文解说的查询方法更感激不尽，我也尝试从头开始学NCBI但时间太紧了，我还得分析其他数据，各位拜托了，谢谢。我的邮箱是baolingbaby@163.com,结果太大的话可以发到我邮箱里。再次谢谢了yuandong 或许对你有用http://liucheng.name/1048/另外，摸索一下UCSC G ...

JaneyJuan 请教各位大侠：我现在手上有一个真菌的ITS序列，请问怎样标示其中的ITS1、5.8S rDNA、ITS2和18S rDNA区域？急~~~请高手帮忙！非常感谢~~freecell 你是不知道用什么软件在已知的ITS上去标示这些区域，还是不知道“ITS1、5.8S rDNA、ITS2和18S rDNA区域”在你手头ITS上的具体位置，想知道怎么样找到这些区域在ITS上的位置？JaneyJuan freecell wrote:你是不知 ...