DNA基础知识

yehuanlr 本人是新手，所以说得不专业的地方，敬请谅解！别人建立了cDNA文库，通过对文库的分析，分析了一些新的基因，在数据库中没有发现其同源序列，他只通过RT-PCR确定了这几个新基因在某些组织中转录，就此推断了该基因具有的可能功能。这些功能正好是我所想研究的，所以想研究这些基因。但是我所研究的鱼繁殖周期很长，全人工繁殖几乎还没有实现，而且没有卵子或精子给我做。请问各位前辈，具体我该怎么研究啊！！！敬请指导，十分 ...

biophysics hsa-mir-941-4MI0005766 在miRbase上没有相应的染色体位置什么原因？LBN chromosome: 20; Location: 20q13.33 See MIR941-4 in MapViewerbiophysics 谢谢，我已经得到了位置了，hsa-mir-941-4MI0005766206255084562550935+没想到miRbase也会犯这样的错误啊，呵呵本文由丁香园论坛提供，想了解更多有用的、有意 ...

jing1209 HR includes gene conversion of the XhoI site without an associated crossover or deletion of one GFP copy by crossover or single-strand annealing.非常感谢！！！LoftyMan HR是不包括主动交换的相关基因交换或单GFP拷贝缺失，也是不包括单链变换的相关基因交换或单GFP拷贝缺失的XhoI区域基因变换jing1209 谢谢LoftyMan， ...

ariel_l 我想问下大家，有没有在做研究启动子活性的时候，在已报道的启动子比如CMV，SV40的下游加入自己的已被先前试验证明可有效启动外源基因转录的一个调控元件片段，结果反而外源基因的表达效率降低了的情况？（这个表达效率降低是和只有强启动子CMV/SV40，而没有自己的调控元件片段的情况对比的结果。）slytjiaofei 【标题】HRE／CMV启动子的克隆和缺氧调控活性的测定【作者】杨洁 杜德伟 李占亭 贾林涛 赵晶 许彦鸣 杨安钢 孙脊峰 ...

xhrg 大家有谁用过pIVEX2.3d或2.4d等用于体外表达的质粒呀，有什么心得freecell 你想知道哪些方面的心得呢？xhrg 还可用什么质粒呢？本文由丁香园论坛提供，想了解更多有用的、有意思的前沿资讯以及酷炫的实验方法的你，都可以成为师兄的好伙伴师兄微信号：shixiongcoming

西点6688 请教一下各位大虾：质粒pACYC184和pBRM-Wt的具体结构是怎样的呢，谢谢！slytjiaofei http://genome-www.stanford.edu/vectordb/vector.html自己查查吧！！！lastone9853 这两个质粒pACYC184和pBRM-Wt的图谱，序列等可以在网上查到，我这有这两个载体，可以快递给你。本文由丁香园论坛提供，想了解更多有用的、有意思的前沿资讯以及酷炫的实 ...

starwink 求助对基因芯片结果进行染色体富集和组织表达富集分析的软件，GOTM目前已不能进行以上两方面的分析starwink Gene Ontology Tree Machine在线分析数据库以前可以对多个基因进行组织表达和染色体分布的富集分析，现在不能用了，有其他的相关在线数据分析软件或平台吗？请指教，谢谢！！freecell Try...http://www.geneontology.org/GO.tools.microarra ...

liuwenbinahslyy 基因芯片数据分析时，比值大于2.0或者小于0.5被认为是有表达差异，为什么要相差两倍呢？这个比值与PCR或Western blot验证时的基因或蛋白表达差异是否是一致的(即是否也是相差两倍以上)？按理说PCR或Western blot检测表达差异根本不需要相差两倍以上，这还取决于重复实验的次数及数据的分布情况。zjubell liuwenbinahslyy wrote:基因芯片数据分析时，比值大于 ...

duanshengyu0223 请问大家一下stk15这个基因一般都是做的那些位点啊侠骨仁医 stk15应该就是Aurora Kinase，目前做的比较多的多态性是T91A F31I Phe31Ile，但是在不同肿瘤和STK15多态性的关联是不一样的，关键看你的研究目的。建议楼主自己好好复习文献，应该可以得到不少启发，附上两篇相关我文献。duanshengyu0223 嗯，谢谢了啊，因为最近在做这个基因关于结直肠癌方面的论文，所以 ...

zenth197 请问有做early polyadenylation的前辈或者熟悉这方面工作的前辈吗？可以否介绍下相关的研究方法？我现在对于设计特异的扩增目的基因early polyadenylation产物的引物感到很困惑，希望能得到大家的帮助。感激不尽！freecell http://scholar.google.com/scholar?as_q=%22early+polyadenylation%22&num=100&btnG= ...

biophysics 网上有无数多的转录因子结合位点预测工具，我想问的是这些预测的位点全部是基于染色体的正链吗？因为数据库是以正链为序列的。那如果一个基因转录的模板链如果是负链的话，那转录因子结合位点的预测不是错了？freecell 一般是根据mRNA序列来预测的。biophysics 谢谢，文献报道的全基因组转录因子位点预测如何做的呢？是要从细胞中提总mRNA，反转录测序再预测还是怎么做？全基因组的mRNA序列好象不 ...

galaxyzj 我有一个真核表达载体，包含一个Iba1启动子，来源于巨噬细胞的特异性基因Iba1，因此是个组织特异性的启动子，用来控制GFP的表达。启动子的结构见图1，其中加框部分是外显子序列。载体的结构见图2。载体的构建人说，这个载体的开放阅读框起始是Iba1基因自身的ATG，也就是图1里面Exon1内部加了下划红线ATG，GFP的起始密码ATG也是在一个读码框内。因此，这个载体最后表达GFP蛋白，并且N端融合 ...

ybcz1974 本人刚刚涉及分子生物学领域，可能说得很不转业，请勿见笑！最近想做一种非整数倍染色体病的研究，有几个问题想请教大家：1、如果这种疾病是由于某一条染色体多一条引起，除了基因（DNA）数量上的改变，会不会出现基因组的差异，例如出现新的基因？或者基因突变？2、通过患者与对照血清基因筛选是否有意义？有没有可能发现基因表达差异？如何进行基因筛选？3、每条染色体都表达数百种基因，通过何种方法可以找到某条染色体特异性 ...

coco0663 P53NM_000546.4Transcript Variant: This variant (1) is a dominant transcript and encodes isoform a.麻烦高手看下，这是野生型P53还是突变型P53？Transcript Variant是否突变型的意思，那么NM_000546.4 所转录的是否就是突变型的P53？谢谢侠骨仁医 Transcript Variant的意思是变异体的意思，应该不是突变的意思，看了一下，人类 ...

mnidr 我想做拟南芥基因和烟草基因的NORTHERN，想选择β-actin作为内参，请问，在拟南芥和烟草中β-actin的序列是一样的吗？如果在更远的物种里呢，比如动物？？？？freecell 脊椎动物中不同物种的β-actin基因氨基酸之间的序列同源性超过98%。其它种属不清楚，你可以在NCBI里面blast一下。sherwing2009 可以在NCBI中，blast一下，相似性应该很高detector350 有一定相似度， ...

dnazyme 每个领域都有独特的研究方法，理解其方法的优缺点特别关键，大家是否对甲基化组（甲基化谱）感兴趣？列举了一些能够通过PubMed搜到的代表性论文。Profiling DNA methylomes from microarray to genome-scale sequencing.生物芯片的方法。DNA methylome of familial breast cancer identifies distinct profiles defined by mutation ...

longyu2728 请问DNA单链的长度，eg,含30个碱基的DNA链的长度，是纳米级，还是埃级，如何计算，每个碱基大约多长呢？不胜感激！freecell one bp corresponds to circa 3.4 Å of length along the strand.longyu2728 freecell wrote:one bp corresponds to circa 3.4 Å of length along the strand.Thank you!本文由丁香园论坛提供，想了解更多有用的、有意思的前 ...

gtwyx 慢病毒包装质粒SIN18-pRLL-hEFIap-EGFP-WRPE，求图谱。gtwyx-fd@163.com希望得到各位战友的帮助！freecell Write to author for it.http://www.nature.com/mt/journal/v3/n1/abs/mt200115a.htmlgtwyx 谢谢楼上的战友。我想知道国内有没有用这种三质粒系统的~~~本文由丁香园论坛提供，想了解更多有用的、有意思的前沿资讯以及酷 ...

lim1896 现在基因敲除技术里好多用的都是同源重组的方法！！！但是，为什么同源就会重组呢？看了好多书还没悟出来原因，而且，基因敲除过程中会有二次重组，这又是为什么呢？？？求解！！！bigbang_0_0 二次重组是Cre-依赖的条件性基因敲出范畴George2 下面的材料对理解同源重组很有帮助，供你参考1、概念基因敲除（geneknockout），是指对一个结构已知但功能未知的基因，从分子水平上设计实验，将该基因去除，或用其它顺 ...

mnidr 我现在在做基因敲除，用的是red重组系统，pKD46质粒上携带有敲除所需的蛋白。pKD46质粒上有两个复制起始点Origin of Replication：repA101ts & oriR101 ；repA101ts是温度敏感型复制起始点。有几个问题请教：1.大家有用过这个pKD46的吗？oriR101是温度敏感型复制子还是条件诱导型复制子啊，我在网上查到它是温度敏感型复制起始点，我很不理解，为什么已经有一个温度敏感性 ...