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DNA片段的Fill-in标记

This protocol was designed to generate directionally end-labeled probes for DNaseI footprinting but it can be used for any application that requires end-labeled DNA probes.Solutions10 mM dNTP StocksTh ...

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32PATP标记寡核苷酸

Labeling oligonucleotides with 32P ATPSteve HahnLast modified 8/13/01Wear gloves throughout and work in radiation area. Monitor area before and after use.Mix the following in an eppendorf tube:1. 0.5 ...

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如何在DNA序列中找到序列标签位点(ESTs)

NCBI的“electronic PCR(e-PCR)”工具是UniSTS资源库的一部分,可以用来寻找一段目的DNA片段中的STS标记物。UniSTS (http://www.ncbi.nih.gov/genome/sts/ ) 能提供所有有关STS标记物的资料,包括引物序列、产物大小、作图信息和别名。与之相链接的其他NCBI资源如Entrez、LocusLink 和MapViewer 也同样提供 ...

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基因诊断技术方法的分类

(1)诊断技术分类 1)根据目的基因是否被放大分类可分为杂交法和扩增法。前者被检测的目的基因不被放大,如分支链DNA技术,但用杂交法可以进一步检测经过放大了的基因片段,如PCR产物杂交分析;后者包括PCR及连接酶链反应,Qβ复制酶系统等。 2)根据被测基因的核酸类型分类①在杂交法中,Southern印迹用于检测DNA;Northern印迹用于检测RNA;斑点印迹或称 ...

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DNA并非唯一遗传物质

来自加拿大多伦多大学,多伦多成瘾与心理卫生研究中心,以及瑞士,澳大利亚的研究者在最新一期的Nature Genetics发表研究成果,该研究文章在遗传学方面提出了新的问题,质疑DNA作为唯一遗传物质的学说。一直以来,经典的遗传学说认为DNA是遗传信息的载体,人类所有的信息都存在于这个小小的染色体上。从父母亲那遗传来的形状取决于DNA序列。文章作者Art Petronis教授否定了这一论断,他认为D ...

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碱裂解法提取质粒DNA

实验目的 1、掌握最常用的提取质粒DNA的方法和检测方法;2、了解制备原理及各种试剂的作用。实验原理 碱裂解法是基于DNA的变性与复性差异而达到分离目的的。碱性使质粒DNA变性,再将pH值调至中性使其复性,复性的为质粒DNA,而染色体DNA不会复性,缠结成网状物质,通过离心除去。 细菌质粒是一类双链、闭环的DNA,大小范围从1kb至200kb以上不等。各种质粒都是存在于细胞质中、独立于细胞染 ...

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从动物肝脏中提取DNA

一、原理:在浓氯化钠(1―2mol/L)溶液中,脱氧核糖核蛋白的溶解度很大,核糖核蛋白的溶解度很小,在稀氯化钠(0.14 mol/L)溶液中,脱氧核糖核蛋白的溶解度很小,核糖核蛋白的溶解度很大。因此,可利用不同浓度的氯化钠溶液,将脱氧核糖核蛋白和核糖核蛋白从样品中分别抽提出来。将抽提得的核蛋白用SDS(十二烷基硫酸钠)处理,DNA或(RNA)即与蛋白质分开,可用氯仿―异戊醇将蛋白质沉淀除去,而DN ...

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真核细胞基因组提取

真核细胞基因组提取 一. 实验目的及背景 高等动物,高等植物的基因组相当宠大, 如人类细胞基因组由30亿个碱基对组成,果蝇基因组有1.4×108个碱基对,水稻基因组有1.4×109个碱基对。真核细胞基因组中,约1万-1.5万个可表达的结构基因,其它大量存在的是调控序列和内含子序列。可以说某特定物种的基因组,包含了该物种生长,发育,繁殖等各项生理活动的几乎全部信息量,因而对真核细胞基因组的结构,组成 ...

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植物基因组DNA提取、酶切及电泳分析

一、目的 掌握植物基因组DNA提取的一般方法及注意事项。大分子量DNA分子的酶切分析。二、原理十六烷基三乙基溴化胺是一种去污剂,可溶解细胞膜,它能与核酸形成复合物,在高盐溶液中(0.7mol/L NaCl)是可溶的,当降低溶液盐浓度到一定程度(0.3 mol/L NaCl)时,从溶液中沉淀,通过离心就可将CTAB与核酸的复合物同蛋白质、多糖类物质分开,然后将CTAB与核酸的复合物沉淀溶解于高盐溶液 ...

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MinElute

作分子生物学实验,核酸纯化、酶切、克隆算是最基本的步骤了。因为要做定向克隆,通常要作双酶切。为了省时省事儿,我们常常想方设法把两个酶放在一起切。可是事情并非总那么称心如意――两个酶经常在一起闹别扭,不是反应温度不同啦,就是Buffer不同,有时候两个酶切位点连在一起,必须先切一个再切另一个,否则就切不动――因为有的酶除了识别位点之外还需要旁边留有几个碱基,如果正好被切掉了就出问题。于是有人就到处找 ...

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Purification

This is a modification of the procedure in Short Protocols (1-411-45)1. Prepare a 50 ml liquid lysate:A. mix 2xlO8 E. coli cells with 100 ul phage (from one picked plaque in 500 ul SM) and100 ul lOmM ...

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Oligo-StorageandHandling

Use of oligonucleotides in various research applications requires certain basic storage and handling techniques in order to ensure trouble-free experiments. Proper storage of your oligonucleotide will ...

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Rapid Method for Preparation of Genomic DNA from P.aeruginos

Inoculate 1 ml of L-broth or other rich media with cells of the strain from which genomic DNA is to be isolated. Grow this culture at 37℃ overnight on a roller.Transfer this overnight culture to a 1.7 ...

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DNA-Methyltransferase Assay

This protocol was written by Jean-Pierre Issabased on Adams et al.* Kam-Wing Jair has made some useful shortcuts that work well if you are careful.Here is .This assay can be used to measure activity i ...

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DNA methylation

DNA methylation is an epigenetic event that affects cell function by altering gene expression and refers to the covalent addition of a methyl group catalyzed by DNA methyltransferase (DNMT) to the 5-c ...

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Foot printing

FootprintingFootprinting is a method for determining the exact DNA sequence to which a particular DNA-binding protein binds. Examples: hormone-receptor complexes that bind to their hormone response el ...

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Singel Nucleotide Primer Extension(SNuPE)

Contributed by Dr. A. GratchevSingle Nucleotide Primer Extension is a powerful method which can be used for the precise analysis of methylation in a certain position. The procedure is shown on the fig ...

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DpnI mediated site-directed Mutagenesis

1. DNA DNA template plasmid 5-20 ng   10x pfu DNA polymerase buffer 5.0 µl   25uM oligo 1 0.5 µl   25uM oligo 2 0.5 µl   10mM dNTP 1.0 µl   Pfu DNA polymerase (2.5 units) 1.0 µl   fill w/ddH2O to 50 µ ...

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Nick Translation for CGH

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Erase-a-Base System

The Erase-a-Base® System is designed for the rapid construction of plasmid or M13 subclones containing progressive unidirectional deletions of any inserted DNA . The system is based on the procedure d ...

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