生物信息学技术

突触是神经细胞间信息传递的关键部位，信号从一个神经元传递到另一个神经元需要通过突触这一“关卡”。神经元的膜电位和兴奋性对于调节其功能起十分重要的作用。神经元消耗能量，通过钠‐钾泵（Na+，K+‐ATPase，NKA）在细胞浆中浓集钾离子并排出细胞内的钠离子，从而维持细胞膜内外的钠、钾离子浓度梯度，调控神经元的膜电位和兴奋性。既往研究证实ATP、钠和钾离子可以调节钠‐钾泵的 ...

FunDO是一个可以利用功能疾病本体注释发现基因相互作用的网站。FunDO网站可以通过http://fundo.nubic.northwestern.edu 或 http://django.nubic.northwestern.edu/fundo两个网址免费使用。

视频介绍了用于生物系统氧气测量的树突状磷光纳米传感器，并对探针关键性的光物理学特性以及现有的精细校准方法作了描述。

近日来自美国埃默里大学医学院的研究人员通过基因芯片微阵列技术和一种他们称之“散弹糖组学”（ shotgun glycomics）的方法为对聚糖展开了研究。埃默里研究小组开发了一种新的化学方法可将一种荧光染料粘附到纯化的聚糖上，再将个别的聚糖分成多个小点固定到在玻片上进行检测。这种方法详细描述在本周的《自然-方法学》（Nature Methods）期刊上。

“生物芯片”实际上是一种微型多参数生物传感器。它通过在一个微小的基片表面固定大量的分子识别探针，或构建微分析单元和系统，实现对化合物、蛋白质、核酸、细胞或其他生物组分准确、快速、大信息量的筛选或检测。 基因芯片，又称DNA微探针阵列(microanav)，是一种最重要的生物芯片。它集成了大量的密集排列的基因探针，通过与被检测的核酸序列互补匹配，进行序列测定 ...

生物信息学以核酸蛋白质数据为主要对象 生物信息学是20世纪80年代末随着基因组测序数据迅猛增加而逐渐形成的一门交叉学科。伴随着生物学和医学的迅速发展，特别是人类基因组计划的顺利推进，产生了大量的生物学数据，特别是生物分子数据的积累速度的快速增加。 这些数据具有丰富的内涵，其中隐藏着丰富的生物学知识。充分利用这些数据，通过数据分析、处理，揭示这些数据的内涵，得到对人类有用的信息，这将 ...

生物芯片技术的基本概念 生物芯片是一种生物检测技术，其目的是用于检测生物大分子，它的概念源自于计算机芯片。我们知道，计算机芯片是指将不同功能单元集成在一块微型器件上，生物芯片借用了计算机芯片的集成化特点，把生物活性大分子(目前主要是核酸和蛋白质)或细胞、组织等密集有序地排列固定在固相载体上，形成微型的检测器件，固相载体通常是硅片、玻片、聚丙烯或尼龙膜等。狭义的生物芯片也称微阵列芯片(mic ...

原位合成的基因芯片制备技术 生物芯片制备中材料的固定方式主要包括原位合成法和点样法两种，点样法又分为接触式点样法和非接触式点样法。原位合成法主要用于基因芯片的制备，点样法可用于基因芯片和蛋白质芯片的制备。细胞芯片主要是通过细胞本身的贴壁生长来完成固定。组织芯片通过一些黏性溶剂(如石蜡)使组织切片固定在载体上。某些微流体芯片不需要材料的固定，只是通过硅材料上大量的微通道来完成检测，另外一些微 ...

直接点样的芯片制备技术 直接点样法最早由Stanford大学Brown实验室发展而来，是将微量的寡聚核苷酸片段、cDNA或蛋白质等通过特定的高速点样机器人直接排列到玻片等介质上，生物大分子探针通过共价键或离子键与特殊处理的玻片相连，从而制备成芯片。直接点样法主要包括3个重要的环节：探针的准备，载体的表面修饰和点样。 1．探针的准备 根据实验的目的，选择相应的探针及种类，基因芯片 ...

生物芯片实验样本选择和设计 基因芯片对样本的选择非常重要，选用有效的样本可以使实验结果可靠。但是基因芯片对样本要求非常高，理想的样本往往得不到。因此，在可选择的范围内，样本的选择和设计非常重要。 (1)待测样本的选择：基因芯片需要的样本来源非常广泛，可以是组织来源的或血液来源的，也可以是培养的细胞或病人的体外分泌物等等，可以根据不同的检测目标选用不同的样本。一般来讲，组织标本比较宝 ...

KegArray是一个Java应用程序，可在Mac和Windows上运行，该软件可为转录组数据（基因的表达谱）和代谢组数据提供一个分析环境。KegArray软件通过集成KEGG数据库信息，可将转录组数据和代谢组数据映射到KEGG数据库，从而将研究的基因或代谢物用特殊颜色定位到pathway中，方便您直观的看出研究目标的上下游基因以及处于重要调控环节的基因，为并您提供信号传导通路和基因组图谱等信息。

KegArray是一个Java应用程序，可在Mac和Windows上运行，该软件可为转录组数据（基因的表达谱）和代谢组数据提供一个分析环境。KegArray软件通过集成KEGG数据库信息，可将转录组数据和代谢组数据映射到KEGG数据库，从而将研究的基因或代谢物用特殊颜色定位到pathway中，方便您直观的看出研究目标的上下游基因以及处于重要调控环节的基因，为并您提供信号传导通路和基因组图谱等信息。

《每日科学》2010年8月21日报道 —— 由华盛顿大学的一名物理学家所率领的一个研究小组设计了一种方法，可在极小尺度上对DNA进行测序，并且测序速度更快、相对更加便宜。他们的实验表明，这一方法具有对卫生保健产生广泛影响的潜力。

英国科学家最近正在研发一种芯片，它只有一厘米宽，当人类想要做出某个动作时芯片上的电极会迅速接收神经冲动信号，通过数据处理技术来分析大脑神经运动，破译人们的想法，最终无线发射器会将信息从大脑里传出，发送给与芯片匹配的假肢。

加拿大多伦多大学教授布雷登·费雷率领的研究团队发现，在DNA中一个隐藏的“剪接密码”可用来解释为什么有限数目的人体基因能够产生出如此巨大数量的遗传信息。相关文章将发表在5月6日出版的《自然》杂志上。

4月21日，英国研究人员报告说，他们研发出一种新型溶剂，可用它来提取回收那些比金子还珍贵的纳米微粒。英国布里斯托尔大学在发布的公报中说，该校研究人员和同行研发出了这种微乳溶剂，它是一种液体以微小液珠形式分散在另一种液体中得到的混合物。通俗来讲，这种微乳溶剂就是一种特殊的油和水的混合物。实验中，将镉和锌的纳米微粒放入这种溶剂后，只要加热，液体就会分为两层，其中一层会含有全部纳米微粒，可供回收使用

据《科学日报》4月16日报道，以色列魏兹曼研究所（WeizmannInstitute）的科学家已经“训练出”一种能够像人类一样预测陌生气味的愉悦性的电子系统，这彻底颠覆了气味的愉悦性完全因人而异并且具有文化特性这个普遍的观点。在发表在《公共科学图书馆开放获取杂志-计算生物学》（PLoS Computational Biology）上的研究中，科学家证明了对一种气味的愉悦性的知觉与其分子结构具有内在的刚性联系，同时这种联系仅在某些特定背景下，因个人差异与文化差异才会有一些表面上的变化。

美国研究人员说，他们开发出一种非侵入式且无痛的诊断口腔癌的新方法。美国新一期《癌症预防研究》（Cancer Prevention Research）杂志上报告说，这种新型检测工具形状和大小与牙刷类似，内置一个芯片。它不仅具有非侵入性和无痛的优点，而且检测只需15分钟。普通的活体组织检查一般需要数天时间才能得出结果。

RNA的质量对于芯片实验的成败至关重要。现在大多数的生物芯片服务供应商除了接收客户提供的RNA样品之外，也提供帮客户从样本中提取RNA，从而进行芯片实验的服务。

R&D Systems Proteme Profiler 96 蛋白芯片96包含一块96微孔板检测板，每个微孔都预先点有一系列捕获抗体构成的抗体芯片列。向微孔内加入实验样本后，样本中的目标蛋白与固定于微孔板上的捕获抗体结合。随后为检测被捕获的蛋白，使用生物素标记的混合检测抗体与HRP偶联的亲和素，或者是HRP偶联的泛抗磷酸酪氨酸抗体进行检测（夹心法）。化学发光底物被用来产生可检测的信号，最好使用化学发光检测成像系统检测微孔中芯片上每个斑点的光强度，每个斑点的光强度大小反应一种相关蛋白表达水平的高低。