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如何确定基因的内含子和外显子序列及基因结构

问题如下:我想在NCBI上找猪KIT(FJ938289)基因的结构图以及其内含子和外显子的序列?基因的内含子和外显子的序列在NCBI找到基因序列之后,要确定其内含子和外显子的序列是比较简单的。如果是RefSeq序列的话,那就更加容易了。简单的思路就是跟基因组序列比对就行了。% 用NCBI的Splign工具,详见:图解:如何在NCBI上找到HNF-4基因第4个外显子的序列 。% 但由于猪KIT(FJ ...

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适合新手练习的实验:核酸序列分析

此文章来源于网络。讲解了核酸序列分析一些基本的步骤和常用到的网站。适合刚接触生物信息学或是刚接触核序列分析的朋友。---------------【实验目的】◦掌握已知或未知序列接受号的核酸序列检索的基本步骤;◦掌握使用BioEdit软件进行核酸序列的基本分析;◦熟悉基于核酸序列比对分析的真核基因结构分析(内含子/外显子分析);◦了解基因的电子表达谱分析。【实验原理】针对核酸序列的分析就是在核酸序列 ...

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FASTA序列格式详细说明

fasta序列格式是blast组织数据的基本格式,无论是数据库还是查询序列,大多数情况都使用fasta序列格式,所以首先对fasta格式在做详细说明。下面是一个来源于NCBI的fasta格式序列:gi|187608668|ref|NM_001043364.2| Bombyx mori moricin (Mor) mRNAAAACCGCGCAGTTATTTAAAATATGAATATTTTAAAACT ...

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windows下构建基于web的Blast服务

本篇文章主要介绍windows如何使用PHP建立PHP服务。首先讨论一下设计思路 web界面,可以参考NCBI, 使用Javascript增加对用户输入的校验, 然后将用户输入传给PHP脚本,PHP脚本检验用户输入, 并将这些输入拼成执行Blast的命令, 然后传给后台执行命令, 拦截Blast程序的输出,判断是否执行成功, 将结果返回给用户。代码示例 ...

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凝血因子异常所致出血性疾病的实验诊断详解

1.血友病   (1)概述:血友病是一组遗传性因子Ⅷ和Ⅸ基因缺陷、基因突变、基因缺失、基因插入等导致内源凝血途径激活凝血酶原酶的功能发生障碍所引起的出血性疾病。包括血友病A或称血友病甲、因子Ⅷ缺乏症或AHG缺乏症;血友病B或称血友病乙。血友病A、B均为性连锁隐性遗传病,基因分别位于Xq28、Xq27.   (2)临床特点:患者表现为自发性或轻微外伤后出血难止。出血常发生于负重的大关节腔内(膝、踝、 ...

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新药含量测定的方法学研究

药品的含量是评定药品的主要指标之一,设计其测定方法时,应根据药品特性、剂型、处方、鉴别试验和纯度检查综合考虑,当鉴别试验和纯度检查保证了专属性和纯度的情况下,含量测定方法的选择要着眼于准确性、稳定性和可重复性。此次线上讲座以中药含量测定为主要出发点,对新药含量测定的方法学进行介绍与分享,同时也希望就此方面话题与各位同仁作一次较深层次的探讨。文中鲁莽不当之处,恳请指正。1.一种新药的含量侧在HPLC ...

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大孔树脂在中药成分分离中的应用

大孔树脂是一种不溶于酸、碱及各种有机溶剂的有机高分子聚合物应用大孔树脂进行分离的技术是20世纪60年代末发展起来的继离子交换树脂后的分离新技术之一。大孔树脂的孔径与比表面积都比较大在树脂内部具有三维空间立体孔结构由于具有物理化学稳定性高、比表面积大、吸附容量大、选择性好、吸附速度快、解吸条件温和、再生处理方便、使用周期长、宜于构成闭路循环、节省费用等诸多优点本文从大孔树脂的性质、分离原理、影响吸附 ...

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利巴韦林含量测定方法

利巴韦林(Ribavirin) 又名三氮唑核苷、病毒唑、三唑核苷。为广谱抗病毒核苷类化合物 能抑制病毒合成核酸 对多种RNA、DNA 病毒有抑制作用。现将有关含量测定方法做一简单介绍。一、高效液相色谱法①色谱条件: 色谱柱: ShimpackC18色谱柱(4.6mm×15cm);流动相:重蒸馏水(超声波振荡脱气);流速:1ml/min;紫外检测波长207nm;检测仪灵敏度0.01AUFS。②色谱条 ...

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二甲基亚砜(DMSO)在涂料中的应用

二甲基亚砜分子式:(CH3)2SO(简写DMSO)分子量:78.13沸点:189(760mmHg) 结晶点:18.45 比重:1.1014(20)闪点:95 燃点:304规格:优级品、医药级、光谱级、食品级、电子级。性质:一种透明、无色、无臭、呈微苦味的液体,毒性极低。它是一种水溶性的化合物,能溶解绝大多数有机化合物,甚至对无机盐也能溶解。液态的二甲基亚砜能高度缔合。属极性溶剂具有很强的吸水性和对 ...

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二甲基亚砜(DMSO)的应用

1, 二甲基亚砜(DMSO)在石油加工中的应用DMSO在芳烃抽提中作为萃取溶剂,最早是法国 的 IFP法,曾在华沙三十五国化工会议上发表。它的优点是:(1)对芳径的先择性高;(2)常温下对芳径的无限制混溶;(3)萃取温度低,且不与烷烃、烯烃、水反应;(4)无腐蚀、无毒;(5)萃取工艺简单、设备少、节能;(6)不溶烯烃适合含烯高的油料;(7)溶济回收可用反萃取。比壳牌公司的Sulfinol法和环球公 ...

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二甲基亚砜的研究

二甲基亚砜(DMSO)是一种含硫有机化合物,分子式为(CH3)2SO,常温下为无色无臭的透明液体,具有吸湿性的可燃液体,既有高极性,高沸点,非质子,于水混溶的特性,毒性极低,热稳定性好,能溶于乙醇,丙醇,苯和氯仿等大多、数有机物,被誉为“万能溶剂”。二甲基亚砜广泛用作溶剂和反应试剂,特别是丙烯腈聚合反应中作加工溶剂和抽丝溶剂,作聚氨酯合成及抽丝溶剂,作聚酰胺,聚酰亚胺和聚砜树脂的合成溶剂,以及芳烃 ...

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植物提取大孔吸附树脂的选购参考

专用树脂 型号用 途 HPD-100A栀子黄色素、紫甘薯色素等提取 HPD-100B维生素B12、头孢等抗生素的提取 HPD-100C越橘原花青素类提取 HPD-80黑米色素专用提取 HPD-910去除酒类高级脂肪酸酯,降浊,去除杂味等 HPD-D骨碎补有效成份提取 HPD-200L用于浓缩苹果汁、梨汁的生产;使果汁保持原有新鲜的滋味和香气 HPD-300L用于浓缩脱色、脱酸苹果汁、梨汁的生产;使 ...

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甲醛的一些概述与用途

(一)甲醛  甲醛(化学分子式HCHO,分子量:30.03)是一种无色有强烈刺激性气味的气体。易溶于水、醇和醚。甲醛在常温下是气态,通常以水溶液形式出现。其40%的水溶液称为福尔马林,此溶液沸点为19 ℃。故在室温时极易挥发,随着温度的上升挥发速度加快。 ...

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空气中臭氧检验方法

1 原理(GB/T 18204.27-2000)空气中的臭氧使吸收液中蓝色的靛蓝二磺酸钠褪色,生成靛红二磺酸钠。根据颜色减弱的程度比色定量。2 试剂本法中所用试剂除特别说明外均为分析纯,实验用水为重蒸水。重蒸水的制备方法:在第一次蒸馏水中加高锰酸钾至淡红色,再用氢氧化钡碱化后,进行重蒸馏。2.1吸收液 靛蓝二磺酸钠溶液量取25ml靛蓝二磺酸钠贮备液用磷酸盐缓冲液稀释至1L棕色容量瓶中冰箱内贮放可使 ...

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实验动物标本采集方法

一、血液的采集常用的采血方法有割(剪)尾采血、眼眶静脉丛采血、断头采血、心脏采血、颈静脉(动脉)采血、股动脉(静脉)采血、耳静脉采血、前肢头静脉才学、后肢小静脉采血等。二、尿液的采集实验动物的尿液常用代谢笼采集,也可通过其他装置来采集。(一)用代谢笼采集尿液代谢笼用于收集实验动物自然排出的尿液,是一种特别设计的为采集实验动物各种排泄物的密封式饲养笼,有的代谢笼除可收集尿液外,又可收集粪便和动物呼出 ...

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Stober法合成均匀硅球的一点经验

在小木虫上逛久了,经常发现有人问硅球合成和包覆的问题。我也做过两年的硅球,主要是利用合成的硅球做一点表征和应用。在这里想给大家说一说我的一点经验和教训,希望能给新入门的学弟学妹们一点帮助,少走一点弯路。谬误之处,还请指正。我做的最拿手的一个配方,是利用Stober方法合成直径360 nm左右的硅球。配方如下:1. 配制溶液A:9 mL 浓氨水 + 16.25 mL 乙醇 + 24.75 mL水, ...

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豚鼠的取血法及血清和血浆的制备方法

一、豚鼠的取血法(1)足背中静脉取血:助手固定动物,将其后肢膝关节伸直捉到实验者面前,实验者将动物脚背面用酒精消毒,找出背中足静脉后,以左手的拇指和食指拉住豚鼠的趾端,右手拿注射器针刺入静脉。拔针后立即出血,呈半球状的隆起。采血后,用纱布或脱脂棉压迫止血。反复取血时,两后肢交替使用。(2)心脏取血:豚鼠的心脏取血法与兔的采血方法相似。二、血清和血浆的制备方法血清和血浆均是不含细胞(包括血小板)等有 ...

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生物制药产业化及膜分离技术,下游纯化解决方

swordhearter wrote:最近做增强完整性测试有时候泡点合格但是扩散流不合格有时候是扩散流流合格但是泡点又不合格.不知道这两种情况是什么原因造成的该如何解决呢?谢谢先!!!要看您的测试对象是什么。对于大面积的滤芯,用扩散流(Forward flow)更准确。而对于小面积的Disc膜片,用泡点法(Bulb point)更可取。888老师我用的是10'' PVDF滤芯 采用完整性测试仪有时 ...

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小鼠总抗氧化能力的测定

小鼠总抗氧化能力的测定刘小美 宋菊敏(2006-10-24)一、原理机体中有许多抗氧化物质,能使Fe3+还原成Fe2+,后者可与菲啉类物质形成稳固的络合物,通过比色可测出其抗氧化能力的高低。二、目的1.掌握总抗氧化能力的测定方法。2.观察血虚小鼠模型总抗氧化能力的变化。3.观察中药对血虚小鼠模型总抗氧化能力的影响。三、材料和方法1.试剂:总抗氧化能力测定试剂盒(南京建成生物工程研究所)2.材料: ...

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检验经验大总汇

第一部分 化验中应该注意的问题一、 溶剂处理方面的潜在危险。 A、溶剂无水处理前,一定要预处理 对于低沸点的溶剂,如乙醚,正戊烷等一定要先用干燥剂预先干燥,然后再加入钠丝进行回流,并且加热不能过快过高。因为,一旦溶剂里面的含水量过大,那么生成氢气很剧烈的话,溶剂极易冲出体系,然后遇见明火或正在加热的电阻丝,发生爆炸。这一点在有机所是有先例的,当时的惨状是,爆炸的冲击波从三楼冲到顶楼,把通风装置炸的 ...

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