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生物芯片与基因发现

生物芯片是目前生物技术中主要的技术之一。研究人员从计算机技术中借用了微型化、整合、平行化处理的技术来发展在芯片上的实验室装置和处理过程。一般地,在芯片上的靶标是有序排列的样本,如cDNA,寡核苷酸或者蛋白质等。宏观矩阵(Macroarraying)也可称之为画格子,把样本点到比较大的尼龙膜上,通过杂交来分析它们。然而,微矩阵(Microarraying)的点直径小于200微米,并需要显微分析。把那 ...

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生物芯片应用领域介绍

1、基因表达水平的检测 也是目前应用较多的领域,用基因芯片进行的表达水平检测可自动、快速地检测出成千上万个基因的表达情况,通过分析那些有表达差异的基因来达到研究目的。2、基因诊断 从正常人的基因组中分离出DNA与DNA芯片杂交就可以得出标准图谱。从病人的基因组中分离出DNA与DNA芯片杂交就可以得出病变图谱。通过比较、分析这两种图谱,就可以得出病变的DNA信息。这种基因芯片 ...

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基因芯片基础教程

一、什么是基因芯片?  基因芯片(Gene Chip)准确的讲(或者说是狭义的基因芯片)是指DNA芯片(DNA Chip),其原理是指利用现代探针固相原位合成技术、照相平板印刷技术、高分子合成技术等微电子技术把大量分子生物学技术(包括南北印迹技术、探针杂交技术、PCR等)具体而微的固定在一定狭小的空间内,以实现高速度、高通量、集约化和低成本的分析技术。基因芯片的概念现已泛化到生物芯片(biochi ...

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生物芯片-蛋白芯片

蛋白芯片技术是根据蛋白质-蛋白质相互作用规律而设计的高通量蛋白检测技术平台。其主要特点是将已知蛋白阵列固定在支撑物表面,用来检测相配对的未知蛋白,这种新技术使得研究人员可以在一次实验中比较生物样品中成百上千的蛋白质的相对丰度,相对于传统技术而言,效率大为提高。固定在支撑物上的蛋白质可以是抗体、抗原、受体、配体、酶、底物以及蛋白结合因子等。在实际应用中,抗体芯片研究得最多,其次是酵母双杂交技术。后者 ...

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生物芯片及其应用简介

一、简介  生物芯片(biochip)是指采用光导原位合成或微量点样等方法,将大量生物大分子比如核酸片段、多肽分子甚至组织切片、细胞等等生物样品有序地固化于支持物(如玻片、硅片、聚丙烯酰胺凝胶、尼龙膜等载体)的表面,组成密集二维分子排列,然后与已标记的待测生物样品中靶分子杂交,通过特定的仪器比如激光共聚焦扫描或电荷偶联摄影像机(CCD)对杂交信号的强度进行快速、并行、高效地检测分析,从而判断样品中 ...

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生物芯片-寡核苷酸芯片

寡核苷酸芯片的主要原理与cDNA芯片类似,主要通过碱基互补配对原则进行杂交,来检测对应片段是否存在、存在量的多少。它与cDNA芯片的本质差别在于寡聚核苷酸芯片固定的探针为特定的DNA寡聚核苷酸片段(探针),而后者为cDNA。基因表达芯片的两个重要参数是检测的灵敏度和特异性。cDNA芯片由于基因长短不同以至Tm值各异,众多的基因在同一张芯片上杂交,使得杂交条件很难同一,使得传统的cDNA芯片的分辨能 ...

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生物芯片-cDNA芯片

cDNA芯片与Oligo芯片、DNA芯片一样归属于基因芯片,它是指对各种生物随机克隆和随机测序所得的cDNA片段进行归类,并把每一类cDNA片段的代表克隆(代表一个独立基因 )经过体外扩增,得到大小和序列不同的片段分别经过纯化后,利用机械手高速将它们高密度有序地点样固定在玻片硅晶片或尼龙膜上,从而制备成cDNA微阵列,以此对各基因的表达情况进行同步分析。 cDNA芯片可以检测待测样品中是否有 ...

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生物质谱技术原理及其应用与展望

生命科学被誉为21世纪的最前沿科学之一,随着人类第一张基因序列草图的完成和发展,生命科学的研究也将进入一个崭新的后基因组学,即蛋白质组学时代。正如基因草图的提前绘制得益于大规模全自动毛细管测序技术一样,后基因组研究也将会借助于现代生物质谱技术等得到迅猛发展。本文拟简述生物质谱技术及其在生命科学领域研究中的应用。 1 质谱技术 质谱( Mass SPectrometry)是带电原子、分 ...

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分子生物学软件集

下列软件大部分目前都已经有新的版本,软件介绍仅供参考。 1. DNASIS 2.5 DNASIS for Windows 2.5版是日立软件公司(Hitachi Sofeware Engineering Co.Ltd.)97年推出的一个功能强大的序列分析软件。包含有大部分分子生物学软件的常用功能,可进行DNA,RNA,蛋白质序列的编辑和分析,甚至还能进行质粒作图、数据库查询等功能,足可满足一般实验 ...

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分子生物学一线实验人员软件解决方案

在互联网上,有很多软件可以解决分子生物实验人员从立项到最后写论文的实际问题。本文提供了对相同作用的很多软件进行比较后推荐给一线实验人员使用的Windows软件。 一、资料收集整理阶段。本阶段需要查找某个专题的文章,并写出对该专题的综述,以便对自己所要做课题的现状有一个基本的了解。 推荐软件:Reference Manager 9.0 优点:可以在线通过查找关键词搜索PubM ...

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Affymetrix生物芯片介绍

美国Affymetrix公司是目前全球基因芯片行业的领头羊,以其专利的寡聚核苷酸原位光刻合成技术,年产各类寡聚核苷酸基因芯片达到几十万张,占据了表达谱基因芯片科研市场的一半以上,经过了将近十年的研究和开发,已经在国际上赢得了很高的盛誉,同时也成为为数极少的已经盈利的生物芯片公司。Affymetrix公司的基因芯片为寡核苷酸芯片(Oligo芯片),这种类型的芯片具有极高的特异性和灵敏度,重复性好,假 ...

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分子生物学实验人员软件解决方案

在互联网上,有很多软件可以解决对单个基因进行研究的分子生物学实验人员从立项到最后写论文的实际问题。本文提供了对相同作用的很多软件进行比较后推荐给一线实验人员使用的Windows应用软件。  一、资料收集整理阶段。本阶段需要查找某个项目专题的文章并写出对该专题的综述以便对自己所要做的课题的现状有一个基本的了解。推荐软件:Reference Manager 9.0 同类参考软件:Endnote 3.1 ...

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高压电泳技术

(一)原理同普通电泳。普通电泳的电压一般为2V/cm~20V/cm,电泳时间需1小时至数小时。电泳时间越长,扩散越严重。对于一些小分子的物质如核苷酸、氨基酸、多肽等,在常压电泳中,往往达不到分离的目的。高压电泳则能使分子量相近的物质充分地进行分离。在高压电泳中,电压可达到50V/cm~200V/cm,高压电源达1 500V~1 0000V,电流可达50mA~400mA.电压越高,分离时间越短,所以 ...

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层析技术(Layer-analise technique)

离子交换层析技术是以离子交换纤维素或以离子交换葡聚糖凝胶为固定相,以蛋白质等样品为移动相,分离和提纯蛋白质、核酸、酶、激素和多糖等的一项技术。(一)原理 在纤维素与葡聚糖分子上结合有一定的离子基团,当结合阳离子基团时,可换出阴离子,则称为阴离子交换剂。如二乙氨乙基(Dicthylaminoethyl,DEAE)纤维素。在纤维素上结合了DEAE,含有带正电荷的阳离子纤维素—O—C6 H14N H,它 ...

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凝胶层析技术

凝胶层析又称为分子筛层析或凝胶过滤。具有分子筛作用的物质很多,如浮石、琼脂、琼脂糖、聚乙烯醇、聚丙烯酰胺、葡聚糖凝胶等。以葡聚糖凝胶应用最广,商品名是sephadex型号很多,从G10到G200,它的主要应用范围是:①分级分离各种抗原与抗体;②去掉复合物中的小分子物质。如除盐、荧光素和游离的放射性同位素以及水解的蛋白质碎片;③分析血清中的免疫复合物;④分子量的测定。 (一)原理 凝胶是 ...

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RT-PCR技术概述

RT-PCR简介 RT-PCR是将RNA的反转录(RT)和cDNA的聚合酶链式扩增(PCR)相结合的技术。首先经反转录酶的作用从RNA合成 cDNA,再以cDNA为模板,扩增合成目的片段。RT-PCR技术灵敏而且用途广泛,可用于检测细胞中基因表达水平,细胞中RNA病毒的含量和直接克隆特定基因的cDNA序列。作为模板的RNA可以是总RNA、mRNA或体外转录的RNA产物。无论使用何种RNA,关 ...

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甲醇酵母表达系统

甲醇酵母基因表达系统是一种最近发展迅速的外源蛋白质生产系统。甲醇酵母是可利用甲醇作为唯一碳源的酵母,主要有H.Polymorpha、Candida Bodinii、Pichia Pastoris三种,其中Pichia Pastoris作为基因表达系统使用得最多、最广泛[1]。与以往的基因表达系统相比,它具有无可匹敌的高表达特性,已被认为是最具有发展前景的生产蛋白质的工具之一。 1. 外源蛋白质的基 ...

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蛋白质定量技术

(一)双缩脲测定法1.原理 蛋白质中的肽键有双缩脲反应,在碱性溶液中与二价铜离子形成蓝紫色的络合物,在一定的范围内,颜色的深浅与蛋白质的含量成正比。此法特异性强,游离的氨基酸、小肽和核酸均不产生这种反应,但此法不够敏感,仅能测出毫克水平。 2.试剂配制 硫酸铜(CuSO4·5H2O) 1.50g酒石酸钾钠 ...

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色谱分析法基本原理

色谱法,又称层析法。根据其分离原理,有吸附色谱、分配色谱、离子交换色谱与排阻色谱等方法。   吸附色谱是利用吸附剂对被分离物质的吸附能力不同,用溶剂或气体洗脱,以使组分分离。常用的吸附剂有氧化铝、硅胶、聚酰胺等有吸附活性的物质。   分配色谱是利用溶液中被分离物质在两相中分配系数不同,以使组分分离。其中一相为液体,涂布或使之键合在固体载体上,称固定相;另一相为液体或气体,称流动相。 ...

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液相色谱法简介

气相色谱不能由色谱图直接给出未知物的定性结果,而必须由已知标准作对照定性。当无纯物质对照时,定性鉴定就很困难,这时需借助质谱、红外和化学法等配合。另外大多数金属盐类和热稳定性差的物质还不能分析。此缺点可高效液相色谱法来克服。在经典液相色谱的基础上,引入了气相色谱的理论与技术,在70年代初建立了高效液相色谱分析法(以HPLC表示)。在常压下操作的液相色谱,分离一个样品往往长达几小时至几十小时,因此工 ...

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