(一)原 理 由于聚丙烯酰胺凝胶的浓度可以按要求配制,因此可以形成“连续系统”和“不连续系统”两种电泳系统。“不连续系统”最大的特点在于大大提高了样品分离的分辨率。这种电泳的主要特点是:(1)使用两种不同浓度的凝胶系统;(2)配制两种凝胶的缓冲溶液成分及pH不同,并且与电泳槽中电泳缓冲液的成分、pH也不相同。在实验中,电泳凝 ...
目的要求 (1)了解克隆基因表达的方法和意义。 (2)了解重组蛋白亲和层析分离纯化的方法。 实验原理 克隆基因在细胞中表达对理论研究和实验应用都具有重要的意义。通过表达能探索和研究基因的功能以及基因表达调控的机理,同时克隆基因表达出所编码的蛋白质可供作结构与功能的研究。大肠杆菌是目前应用最广泛的蛋白质表达系统,其表达外源基因产物的水平远高于其它基因表达系统,表达的目的蛋白量甚至能超过细菌总蛋白量 ...
蛋白测定是在生命科学研究中最广泛应用的方法之一。在蛋白提纯,电泳,免疫分析,细胞生物,分子生物和其他研究应用时评估蛋白浓度是必需的。虽然目前有各种不同的蛋白测定方法,但仍然还没有一种测定方法被认为是广泛适合于所有的应用要求。每种方法都有它的优点和限制。一般来说,研究中经常需要用到一种以上的蛋白测定方法以排除一些未知的物质的干扰。 大多数蛋白样品可通过比色测定法定量。在典型的蛋白测定中,化学试剂加 ...
1. 蛋白沉淀 蛋白能溶于水是因为其表面有亲水性氨基酸,在蛋白质的等电点处若溶液的离子强度特别高或者特别低,蛋白则倾向于从溶液中析出。硫酸铵是沉淀蛋白最常用的盐,因为它在冷的缓冲液中溶解性好,冷的缓冲液有利于保持目的蛋白的活性。硫酸铵分馏常用作试验室蛋白纯化的第一步,它可以初步粗提蛋白质,去除非蛋白成分。蛋白质在硫酸铵沉淀中较稳定,可以短期在这种状态下保存中间产物,当前蛋白质纯化多采用这种办法进 ...
一、各种蛋白染色方法的灵敏度比较 染色方法 灵敏度 与质谱的兼容性 Silver 1- 10ng - Silver (MS compatible) 10ng + Comassie G -250 or R-250 ...
1. 用 PDQuest软件或肉眼比对,找出感兴趣的蛋白点,并做好标记和记录。 2. 用 MilliQ水冲洗胶 2 次。 3. 用色谱纯甲醇和 MilliQ水冲洗 Ep 管 4. 将枪头(200μl)下端剪去,使其内径略小于蛋白斑点的直径,用色谱纯甲醇和MilliQ水冲洗枪头。 5. 对准斑点中央小心将蛋白切割下来,放入Ep 管,MilliQ水漂洗 2 次,如胶块 太大,将其切成 1 x ...
水化上样( 被动上样) 1. 从冰箱中取出 IPG 胶条,室温放置 10min。 2. 沿水化盘槽的边缘从左向右线性加入样品,槽两端各 1cm 左右不加样,中间的样品液一定要连贯。注意:不要产生气泡,否则会影响胶条中蛋白质的分布。 3. 用镊子轻轻撕去 IPG 胶条上的保护层。注意:碱性端较脆弱,应小心操作。 4. 将IPG胶条胶面朝下轻轻置于水化盘中样品溶液上.注意:不要将样品溶液弄到胶条背面 ...
主要包括以下 4 个基本步骤:样品制备;电泳分离;蛋白的膜转移;免疫杂交与显色――蛋白检测。 溶液和试剂 1. 1X 磷酸盐缓冲液(PBS) 2. ModifiedRIPAbuffer:Tris-HCl:50 mM pH 7.4 ; NP-40: 1% ;Na-deoxycholate: 0.25% ;NaCl: 150 mM ;EDTA:1 mM ;PMSF: 1 mM;Aprotininle ...
样品制备原则 样品制备是双向电泳中最关键的一步,将直接影响 2-DE 结果好坏。目前并 没有一个通用的样品制备方法,尽管处理方法多种多样,但都遵循几个基本的原 则:1)尽可能的提高样品蛋白的溶解度,抽提最大量的总蛋白,减少蛋白质的 损失;2)减少对蛋白质的人为修饰;3)破坏蛋白质与其他生物大分子的相互作 用,并使蛋白质处于完全变性状态。 根据这一原则,样品制备需要四种主要的试剂:离液剂(chao ...
一、重组蛋白质的诱导表达 1. 挑取转化有质粒的单菌落, 接种于3ml 选择性 LB 液体培养基中,37℃,250rpm/min振摇培养过夜。 2. 次日将培养过夜的菌液 500 μl 再接种于 10 ml(1: 20)选择性LB 液体培养基中,37 ℃,250 rpm/min振摇培养至光密度(OD600=0.6)时,取 1 ml 样本作 为诱导前标本,10000g 离心 1 min 收集 ...
定量蛋白质组学是蛋白质研究的前沿学科。目前常用的定量蛋白质组学研究技术有荧光差异凝胶电泳(DIGE)、同位素亲和标记(ICAT)等。同位素标记相对和绝对定量(iTRAQ)技术是近年来最新开发的一种新的蛋白质组学定量研究技术。结合非凝胶串联质谱技术,该技术可对复杂样本、细胞器、细胞裂解液等样本进行相对和绝对定量研究,具有较好的定量效果、较高的重复性,并可对多达8种不同样本同时进行定量分析。 蛋白 ...
DIGE荧光差异蛋白表达分析系统在传统双向电泳技术的基础上,结合了多重荧光分析的方法,在同一块胶上共同分离多个分别由不同荧光标记的样品,并第一次引入了内标的概念,极大地提高了结果的准确性,可靠性和重复性。在DIGE技术中,每个蛋白点都有它自己的内标,并且软件全自动根据每个蛋白点的内标对其表达量进行校准,保证所检测到的蛋白丰度变化是真实的。DIGE技术可检测到样品间小于10%的蛋白表达差异,统计学 ...
一、培养细胞(culture cell)样品处理方法: 培养动物组织细胞由于没有细胞壁,因此可以将细胞收集下来,直接加入裂解缓冲液(Lysis buffer)抽提总蛋白。裂解缓冲液有多种配方,本实验室主要采用如下成份: 1. 7M Urea,2M Thiourea,4%(w/v)CHAPS,40mM Tris-Base,40mM DTT,2% Pharmalyte pH 3-10. 其他常用的裂 ...
银染的方法种类很多,目前有文献报道的就有 100 多种。但是其准确的染色机制还不是特别的清楚。大致的原理是银离子在碱性 pH 环境下被还原成金属银,沉淀在蛋白质的表面上而显色。 由于银染的灵敏度很高,可染出胶上低于 1 ng/蛋白质点,故广泛的用在 2D 凝胶分析上。待找到自己感兴趣的蛋白质点后,再通过考染富集该目的点,然后做进一步的肽段指纹图谱分析(PMF)或序列测定。随着质谱技术的不断完善和 ...
1. 总的策略 ① 化学试剂纯度要高,至少是分析级,目前国产试剂达不到纯度要求 ② 使用去离子水(电导<2uS) ③ 尿素和丙烯酰胺/甲叉丙烯酰胺需新鲜配制 ④ Deionize urea pri ...
一、试剂 1. 试剂甲:碱性铜试剂溶液中,含0.5n NaOH、10%Na2CO3、0.1%酒石酸钾和0.05%硫酸铜,配制时注意硫酸铜用少量蒸馏水溶解后,最后加入。 2. 试剂乙:与前面的基本法相同。临用时加蒸馏水稀释8倍。 3. 标准蛋白质溶液:同基本法。 二、操作步骤 测定标准曲线与样品溶液的操作方法与基本法相同。只是试剂甲改为1毫升,室温放置10分钟后,试剂乙改为4毫升。在55℃恒温水浴 ...
A. 裂解液 (lysis solution) (8M Urea 4%CHAPS 2% Pharmalyte3-10 40 ml) Final concentration Amount Urea(Fw 60.06) 8M ...
一、试剂 1. 试剂甲:碱性铜试剂溶液中,含0.5n NaOH、10%Na2CO3、0.1%酒石酸钾和0.05%硫酸铜,配制时注意硫酸铜用少量蒸馏水溶解后,最后加入。 2. 试剂乙:与前面的基本法相同。临用时加蒸馏水稀释8倍。 3. 标准蛋白质溶液:同基本法。 二、操作步骤 测定标准曲线与样品溶液的操作方法与基本法相同。只是试剂甲改为1毫升,室温放置10分钟后,试剂乙改为4毫升。在55℃恒温水浴 ...
Western免疫印迹(Western Blot)是将蛋白质转移到膜上,然后利用抗体进行检测。对已知表达蛋白,可用相应抗体作为一抗进行检测,对新基因的表达产物,可通过融合部分的抗体检测。 一、原理 与Southern或Northern杂交方法类似,但Western Blot采用的是聚丙烯酰胺凝胶电泳,被检测物是蛋白质,“探针”是抗体,“显色”用标记 ...
蛋白质印迹的发明者是斯坦福大学George Stark。Neal Burnette于1981年所著的AnalyticalBiochemistry中首次被称为Western Blot。最开始做印迹的是一个叫Southern的科学家,但印迹的对象是DNA链,他把这种技术称为Southern blot,后来出现了两个过程相似,但是对象不同的印迹方法,一个针对RNA,一个对蛋白质,人们分别把这两种技术的称为Northern和Western,与这两个技术的发明人没有关系了。