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PCR 引物设计及软件使用技巧

1自从1985 年Karny Mullis 发明了聚合酶链式反应以来,PCR 技术已成为分子生物学研究中使用最多、最广泛的手段之一,而引物设计是PCR 技术中至关重要的一环。使用不合适的PCR 引物容易导致实验失败:表现为扩增出目的带之外的多条带(如形成引物二聚体带),不出带或出带很弱,等等。现在PCR 引物设计大都通过计算机软件进行。可以直接提交模板序列到特定网页,得到设计好的引物,也可以在本地计算机上运行引物设计专业软件。一般来说,专 ...

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【公告】丁香园真诚邀请各行业专家开展“网上专家讲座”活动

丁香园是一个非营利的学术科技网站,其今后发展定位是公益性学术科技类型网站,我们在“独立,非营利,纯学术”的思想指导下来建立和发展丁香园,主要目的是希望继传统知识交流平台(报纸,杂志,期刊等)之后,利用现在成熟和发达的互联网,使之成为一个承载和传播先进科技思想的新平台。这个平台与传统知识交流平台相比,具有如下特点:获取信息速度快,范围广,信息量大,互动性强,成本低。这几个特性是传统知识交流平台所不具备的。目前由于对互联网 ...

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各位大侠,帮我设计一个引物

我作RT-PCR, 这个引物实在是设计不好,是TOPO II ALPHA其mRNA如下:1 aggttcaagt ggagctctcc taaccgacgc gcgtctgtgg agaagcggct tggtcggggg61 tggtctcgtg gggtcctgcc tgtttagtcg ctttcagggt tcttgagccc cttcacgacc121 gtcaccatgg aagtgtcacc attgcagcct gtaaatgaaa atatgcaagt caacaa ...

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请教关于怎样通过定量PCR检测点突变!!!

老板给定了一课题,希望能通过定量PCR来检测一病原真菌对药剂的抗药性。该病原真菌的抗药性由其β-维管蛋白基因的881位的点突变引起。该菌抗药性β-维管蛋白基因序列为:ATGCGTGAGATTGTGAGTGTTTTCCTCTGACCTCTAACTTCAAGCTGTTGCATGCGTTGAGCTTGTGTTTTGTGCCCTTGATTGTACCCCGCCGGGCGGTGGCAGCTCAACAACAATGCA ...

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请教关于RT-PCR实验的问题

刚刚接触RT-PCR实验,现在遇到一些问题.特向各位高人请教.我做的是关于大鼠erg,mink,KvLQT的基因表达,引物是老板按照文献给的,源自于Circulation(2000;101:2007-2014),作者是日本人.非常困惑的是没有GENEBANK的NO,对于这些引物我非常想核对,但是无从谈起.硬着头皮做了,可是发现跑出的条带不对头,与Marker比较都大了许多,erg大约是900左右,这是不是就是所谓的基因 ...

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PCR技术的原始论文是哪一篇?

因工作需要,想查一下最原始的有关PCR论文,在PubMed上,用(“Polymerase chain reaction”)搜索了1984-1987年的论文,结果有11篇,其中最早的在1986年发表,共3篇,具体如下:9: Saiki RK, Bugawan TL, Horn GT, Mullis KB, Erlich HA. Related Articles, LinksAnalysis of enzymatically amplified beta-globin and HLA-DQ alpha DNA with ...

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PCR技术详解

PCR技术概论聚合酶链反应(Polymerase Chain Reaction ,PCR)是80年代中期发展起来的体外核酸扩增技术。它具有特异、敏感、产率高、快速、简便、重复性好、易自动化等突出优点;能在一个试管内将所要研究的目的基因或某一DNA片段于数小时内扩增至十万乃至百万倍,使肉眼能直接观察和判断;可从一根毛发、一滴血、甚至一个细胞中扩增出足量的DNA供分析研究和检测鉴定。过去几天几星期才能做到的事情,用PCR几小时便 ...

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【分享】世界著名生物技术公司特色简介(转贴)

一、 分子生物学Promega: Promega 公司是分子生物学研究工具的经典品牌,已有接近30年的历史,是生命科学这个朝阳产业中的“老字号”。该公司所特有的萤光素酶生物发光技术,灵敏度高,信号/背景比率低,在基础研究和药物筛选领域内得到广泛的应用和认可。应用范围涉及报告基因检测;细胞学活力、细胞毒作用、细胞凋亡检测;蛋白酶、蛋白激酶、核受体检测,以及描述药物先导物的吸收、分布、代谢、排泄等特征性参数的一系列检测方法。Prome ...

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【原创】深圳市生科源技术(MABSKY)问题手册(载录)

深圳市生科源技术有限公司PCR项目客户问题手册(载录)1.何谓PCR?PCR是多聚酶链式反应(Polymerase ChainReaction) 缩写,是80年代中期发展起来的体外核酸扩增技术。是一种选择性体外扩增DNA或Rundefined*段的方法,能使极少量的基因组DNA或RNA样品中的特定基因片段,在短短几小时内扩增上百万倍。2.实时荧光PCR和普通PCR的区别?普通PCR技术:对反应的终产物进行半定量分析或定性分析。实时荧光 ...

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【旧贴整理】PCR

荧光PCR原理http://www.dxy.cn:8080/bbs/upload/2005/10/21/32745781.docPCR技术http://www.dxy.cn/bbs/post/view?bid=64&id=1372243&sty=3&keywords=pcrPCR动画http://www.dxy.cn/bbs/actions/archive/post/3318653_1.htmlRT-PCR 实验步骤http://www.dxy. ...

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【版务】PCR引物设计的11条黄金法则

PCR引物设计的11条黄金法则1.引物最好在模板cDNA的保守区内设计。DNA序列的保守区是通过物种间相似序列的比较确定的。在NCBI上搜索不同物种的同一基因,通过序列分析软件(比如DNAman)比对(Alignment),各基因相同的序列就是该基因的保守区。2.引物长度一般在15~30碱基之间。引物长度(primer length)常用的是18-27 bp,但不应大于38,因为过长会导致其延伸温度大于74℃,不适于Taq DNA ...

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帮帮忙吧!刚刚自己设计了一对引物,很兴奋。帮我看看怎么样,在线等!!

前一段时间贴出一段基因想请大家帮忙设计引物,可惜大家都太忙。我自力更生,学着设计了一下,不知怎么样,希望各位赐教!!!基因序列:1 gtattaaagg gaccggagcg gggcagttcc cgacgccgca gcgctcgctt tcccttccct61 cctctctggc cctccctcct cccacccact ggctccctcc cccagcgctc tccagtttct121 gtgccccagg agctacgcga cagtcttcca ...

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请大家分析一下我这引物是否可行----急!

我要对大鼠的IL-18RβmRNA进行RT-PCR现设计了如下两条引物:引物对1:扩增区域 1~522 退火温度59℃。F1ATGCTTAAATCCAGATGTGGCGR1CCCATAAAACAGGGCTACCTCC引物对2:扩增区域600~1113 退火温度58℃F2AGGCTTGTACGTGTGCGATTACR2TTCAATCCAGTGCCAGTAGAGC请各位高手帮我分析分析这两对引物怎样,替我指点指点!谢谢!以下 ...

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HELP:如何设计该基因的引物

我想用RT-PCR扩增出某种纤毛虫的制动抗原基因的全长cds通过ncbi查到它的全长cds为(1329bp):ATGAAATATAATATTTTATTAATTTTAATTATTTCTTTATTTATTAATGA ATTAAGAGCTGTTCCATGTCCTGAT GGTACTTAGACTCAAGCTGGATTGA CTGATGTAGGTGCTGCTGATCTTGGTACTTGTGTTAATTG CAGACCTAAT TT ...

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闲聊PCR

--------------------------------------------------------------------------------虽然长了些, 但耐心看完,应该对你的问题有所帮助各位战友 我们来聊聊PCR :)PCR可以说是目前分子生物学实验中应用最为广泛的一种技术。从最初的在几个水浴锅里把试管放来放去,到现在各种先进的PCR仪, 到REAL TIME PCR。 设备是越来越先进,方法是越来越多,但基本的原理还是那套。然而实际操作中,仍然有很多的问题让人头疼。正好看到有人建议来个PC ...

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【分享】Thermo Scientific 直接PCR(植物、动物、人源组织)

直接PCR方法使PCR可以直接从样本开始,为DNA扩增带来前所未有的便捷。未经DNA纯化而直接使用微量原始样本做模板,为PCR实验节省大量的时间和成本。优势:无需进行昂贵又费时的DNA抽提;样品需求量小;实验方案简便,手动操作步骤少;实验时间极短;已对多种样本类型进行测试;强劲的热启动DNA聚合酶保证特异性和高产量。适用于各类植物样本的高效PCR测试样本:叶片(拟南芥、玉米、水稻、棉花、烟草、葡萄藤)种子(苹果、胡萝卜 ...

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PCR技术总结

PCR技术简史  PCR的最早设想 核酸研究已有100多年的历史,本世纪60年代末、70年代初人们致力于研究基因的体外分离技术,Korana于1971年最早提出核酸体外扩增的设想:"经过DNA变性,与合适的引物杂交,用DNA聚合酶延伸引物,并不断重复该过程便可克隆tRNA基因"。  PCR的实现 1985年美国PE-Cetus公司人类遗传研究室的Mullis 等发明了具有划时代意义的聚合酶链反应。其原理类似于DNA的体内复制,只是在 ...

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【原创】超高通量PCR-一次上万个qPCR

大家好,Fluidigm BioMark 系统通过集成流体通路(Integrated Fluidic Circuit, IFC),将上万个微小管道、控制阀门集成到微板上,形成纳升(nL)量级的反应仓,不需特别移液器,就可以同时进行多达近万个常规qPCR (传统Taqman 或其他) 实验。操作简单,既有传统qPCR可定量之好处,又有基因芯片高通量耗材少之优点,能大幅提高实验效率及准确度。· 单个细胞基因表达( Single Cell Gene Expression): ...

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求救引物设计

1: AF075241. Sus scrofa prepro... LinksLOCUS AF075241 451 bp mRNA linear MAM 17-MAY-2000DEFINITION Sus scrofa prepro-orexin mRNA, complete cds.ACCESSION AF075241VERSION AF075241.1 GI:3328338KEYWORDS .SOURCE Sus scrofa (pig)ORGANISM Sus scrofaEukaryota; Metazoa; Cho ...

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请帮看一下blast结果

这是我设计的P53基因引物blast结果,请教高手这引物可用吗?Distribution of 104 Blast Hits on the Query Sequence--------------------------------------------------------------------------------Score ESequences producing significant alignments: (bits) Valuegi|51475426|ref|XM_496493.1| PREDICTED: Homo sapiens s ...

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