RNA实验技术

1. RNA interference-mediated knockdown of DNA methyltransferase 1 leads to promoter demethylation and gene re-expression in human lung and breast cancer cells.Cancer Res. 2004 May 1;64(9):3137-43.PMID: 15126351 2. A plasmid-based system for expressing small interfering RNA libra ...

1. The MicroRNA: Overview of the RNA Gene That Modulates Gene Functions2. Structure Analysis of MicroRNA Precursors3. MicroRNA Biogenesis: Isolation and Characterization of the Microprocessor Complex4. Recognition and Cleavage of Primary MicroRNA Transcripts5. Mouse Embr ...

很好的常用关于RNAi的网站大全，也许对你有用。Comprehensive List of RNAi Publications (updated daily)RNA info on the WebRNA World Websitehttp://www.imb-jena.de/RNA.htmlRNA interference (RNAi) PDF files on the WebThe Knowledge Foundation: RNA in drug developmenthttp://www.knowledg ...

microRNA 原位杂交 protocol这个我是以exiqon的protocol为蓝本翻译过来的，有些小步骤上有修改。1脱蜡水合 RT二甲苯undefined3min----二甲苯2x3min——无水乙醇undefined3min——无水乙醇undefined3min——96%乙醇浸入5min——70%乙醇5min——PBS 2-5min2蛋白酶k 2ug/ml(临用前配置) 200ul 10min 37度40ug/ml 蛋白酶k 1:20稀释于蛋白酶k buffer3含0.2%甘氨酸PBS * 2 5min RT（暂时省 ...

试验整体方案1.Scrambled (Negative) siRNA Control2.Positive siRNA Control3.Multiple siRNAs to a Single Target4.Monitor Both Target mRNA and Protein Levels5.Use the Lowest Possible siRNA Concentration6.Validation Via Array Analysis and Rescue ExperimentsTo better under ...

以下是美国冷泉港(CSHL)Hannon领导的研究小组报道的29bp shRNA可以在哺乳动物中起RNAi效应：Paddison PJ, et al. Short hairpin RNAs (shRNAs) induce sequence-specific silencing in mammalian cells. Genes Dev. 2002 Apr 15;16(8):948-58. 免费全文网址：http://www.genesdev.org/cgi/content/full/16/8/948该 ...

1 前言RNA是生物体内最重要的物质基础之一，它与DNA和蛋白质一起构成生命的框架。但长久以来，RNA分子一直被认为是小角色。它从DNA那儿获得自己的顺序，然后将遗传信息转化成蛋白质。然而，一系列发现表明——这些小分子RNA事实上操纵着许多细胞功能。它可通过互补序列的结合反作用于DNA，从而关闭或调节基因的表达。甚至某些小分子RNA可以通过指导基因的开关来调控细胞的发育时钟。2 综述2.1 研究历史与发展前景2.1.1 定义双链 ...

原文见：http://www.ebiotrade.com/newsf/2003-12/B20031219174450.htmRNA一度被认为仅仅是DNA和蛋白质之间的“过渡”，但越来越多的证据清楚的表明，RNA在生命的进程中扮演的角色远比我们早前设想的更为重要。RNA干扰（RNA interference）的发现使得人们对RNA调控基因表达的功能有了全新的认识，更因为可以简化/替代基因敲除而成为研究基因功能的有力工具，因 ...

无论您的研究内容是遗传发育、干细胞、调控，还是疾病……无论您的研究物种是人、大鼠、小鼠，还是植物……无论您的样本类型是组织、细胞、血液，还是石蜡切片……您都可以很简单、很轻松地研究miRNA！什么是miRNA？MicroRNA（miRNA）是真核生物中一类长度为22nt左右的非编码单链RNA分子，在生物进化过程中高度保守。miRNA分子可与靶mRNA3’UTR区或编码区通过碱基互补配对原则特异性结合，诱导靶mRNA降解或 ...

这个是RNAi对照最权威的文献了,看了以后对对照产品没有疑惑!Whither RNAi? Nature Cell Biology, 5, 489-490 (2003).Whither RNAi?The generally rapid progress of molecular biology methodologies is punctuated on occasion by discoveries that do nothing less than revolutionise the field. Historical exa ...

http://www.uniklinikum-giessen.de/bio/rnai.html这一页提供了许多RNAi公司的链接，值得加分呀！RNAi Drug Discovery CompaniesAlnylam Pharmaceuticals RNAi drug developmentBenitec RNAi stable gene silencing in transgenic miceCenix BioScience RNAi for genome-wide screening ...

在siRNA序列设计时，将潜在的序列用BLAST进行同源序列搜索时，出来的结果好象总是存在和其它编码序列同源的序列，郁闷！是不是可以只看E值？还是只看score？这个问题好菜！ 我的目的序列是Human P-glycoprotein (MDR1）中的一个片断，请问出现以下的结果如何判断这个目的序列与其它编码序列不是同源的序列？下面是BLAST的结果： Score ESequences producing significant alignm ...

Version 1.5 of siRNA DNA Designer has been released. The following features have been added.1) BLAST Engine:A BLAST Engine is now included with siRNA DNA Designer 1.5 which permits desktop analysis for potential off-target hits.The Blast engine performs a search for off-target hits using the s ...

我前一段时间看了一些有关“RNA介导的基因调控系统”方面的文章，对该系统的分类有一点体会，本想写综述发表，但感觉有和各位探讨的必要，故拿出其中一部分，希望你们发表不同的意见：小双链RNA（short double-stranded RNA, dsRNA）触发的RNA干扰是近年来生物界的研究热点。随着对RNA干扰(RNA interference, RNAi)研究地深入，人们逐渐认清了RNA系统在细胞内的基因表达调控作用,它不但能关闭生 ...

以下是整理的microRNA靶标数据库和软件资源列表，希望对microRNA的研究者有所帮助。（1）miRbase：众所周知的microRNA基因注释数据库。目前miRBase只提供了microRNA的靶标的预测软件的链接（如：PicTar）。最新版本发布时间：2010年9月。网址：http://mirbase.org/index.shtml（2）starBase：一个高通量实验数据CLIP-Seq（或称为HITS-CL ...

miRNA Northern Blot实验技术应用MicroRNA（miRNA）是真核生物中一类长度约为20-25nt（核苷酸）的非编码单链RNA分子，在生物进化过程中高度保守，约占整个基因组基因总数2%。大量研究表明，miRNA在多种生物过程中起关键作用，包括细胞的发育、分化、增殖和凋亡等；并且功能研究已证实多种miRNA分子与肿瘤发生、发展过程相关，miRNA具有类似于致癌基因或抑癌基因的作用。最早被发现的两个miR ...

（1）取3 g样品，加入10% 样品重的多聚聚乙烯吡咯烷酮（PVPP），用液氮研磨成细粉状，将细粉分为每份约3 g，并贮藏于-80℃下。（2）在5O ml falcon管中加入2O ml提取缓冲液。提取液的组成为0.2 mol/L 脱水四硼酸钠（sodium tetriborate decahydrate）、30 mmol/L 乙二胺四乙酸（EDTA）、1% （W/V）十二烷基硫酸钠（SDS）、1%脱氧胆酸钠盐。再加入0.0309 g二硫苏糖（DTT）、200 ul乙基苯基聚乙二醇（NP-40 ...

Andrew Z. Fire 生于1959年,1983年于美国麻省理工学院获生物学博士学位,现任美国斯坦福大学医学院病理与遗传学教授。Craig C. Mello 生于1960年,1990年于美国哈佛大学获生物学博士学位,现任美国马萨诸塞大学医学院分子医学教授。2006年10月2日,瑞典卡罗琳斯卡研究院颁发了本年度诺贝尔生理学或医学奖,美国斯坦福大学医学院的Andrew Z. Fire和马萨诸塞大学医学院的Craig C. Mello因发现一种全新 ...

RNAi原理及演示1 RNAi的机制RNAi的机制可能是细胞内双链RNA在Dicer酶的作用下，可形成-22 bp大小的小干扰RNA(small interfering RNAs，siRNAs)，siRNAs可进一步掺入多部分核酸酶(multicomponent nuclease，RISC)并使其激活，从而精确降解与siRNAs序列相同的mRNA，完全抑制了该基因在细胞内的翻译和表达.RNA酶Ⅲ是一种能切割双链RNA的酶，参与RN ...

【经验】如何确认RNA的质量各位都知道，提取到质量良好的RNA（包括总RNA和mRNA，以下同）是非常困难，关于RNA的提取技术，我就不说了，为什么呢？或许各位非常关心呢，我是这样想的，我可以看到的资料或者是厂家的说明书，各位也同样可以看到的，内容当然都是一样的了，所以实验做的好不好，主要是心的投入多少的问题，所以希望大家自己多多思考啊！提取技术虽然不说了，但是我可以告诉各位如何准确确认RNA质量的有效方法（可能是 ...