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【science】华大基因最新文章介绍高通量测序技术

来源:生物通第二代测序技术, 又称新一代测序技术, 是相应于以Sanger 测序法为代表的第一代测序技术而得名。第二代测序中3种主流测序技术分别为依次出现的 Roche/454 焦磷酸测序(2005 年)、Illumina/Solexa 聚合酶合成测序(2006 年)和 ABI/SOLiD 连接酶测序(2007 年)技术。与 Sanger测序相比, 3种新一代测序技术共有的突出特征是, 单次运行(run)产出序列数据量大, 故而又被通称为高通量测序技术。  深圳华大基因研究院是国内 ...

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【共享】chip

1. 染色质免疫沉淀Input对照:在进行免疫沉淀前,需要取一部分断裂后的染色质做Input对照。Input是断裂后的基因组DNA,需要与沉淀后的样品DNA一起经过逆转交联,DNA纯化,以及最后的PCR或其他方法检测。Input对照不仅可以验证染色质断裂的效果,还可以根据Input中的靶序列的含量以及染色质沉淀中的靶序列的含量,按照取样比例换算出ChIP的效率,所以Input对照是ChIP实验必不可少的步骤。Be ...

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【旧帖整理】本版精彩幻灯集锦!

本版精彩幻灯集锦中所有链接均来自DXY和网上,朋友各取所需吧!同贺DXY四岁生日!由于本人还不知怎样使用超连接,所以有点浪费版面!1 基因敲除幻灯(219.5k)http://www.dxy.cn/bbs/user/download/401898/last%20result.ppt2 一些RNAi的幻灯片a http://www.genesil.com/docs/index.asp?toPage=1&mySort=8b 因只是单个都超过了粘贴上 ...

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丁香医学期刊征集《因特网医学信息应用》讲座专刊

丁香医学期刊征集《因特网医学信息应用》讲座专刊丁香园满3岁了。在过去的岁月里,许多战友通过学习检索知识,对于因特网的专业资源有了新的认识。论坛在专业知识交流的同时,仍希望在检索和医学信息的寻找和利用方面,继续保持特色。丁香医学期刊(电子版),是丁香园即将推出的专业在线杂志。在登载专业战友的研究成果以外,为了增强知识性和可读性,结合期刊的内容,准备不定期地开设专业医学信息应用方面的讲座。开设讲座的目的:1. 总结丁香园论 ...

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【公告】肿瘤转化研究杂志TCR“DNA断裂与修复”特刊翻译工作全面启动

肿瘤转化研究杂志TCR“DNA断裂与修复”翻译工作全面启动目前,TCR杂志“DNA断裂与修复”特刊翻译人员招募工作已顺利完成,自在丁香园发帖招募翻译人员后,深受广大战友们的欢迎,大家踊跃报名,共有近20位报名人员。经组织专家讨论,确认由南京大学医学院附属鼓楼医院顾劲扬担任本特刊的主译。一叮等10位站友担任译者(见表1),其他报名人员拟按排TCR杂志其他特刊的翻译工作,感谢大家的积极参与!现将具体任务安排公布于下。表 ...

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【共享】分子生物基因工程教科书汇总

molecular biology of the gene第五版及英文原版配套光盘下载开放中!:http://www.helixnet.cn/bbs/thread-9081-1-1.html基因8完全中文PDF版(纳米盘连接):http://www.helixnet.cn/bbs/thread-9071-1-1.html基因8英文原版http://www.helixnet.cn/bbs/thread-1327-1-2.html最新分子生物学实验技术( ...

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【共享】细菌基因组提取方法!

细菌基因组DNA的提取方法综述1 快速微量提取法A.取1.5ml菌体培养物于一灭菌Ep管中,12000rpm离心1min, 丢去上清夜,收集菌体。B.加入400ul裂解液(40mMTris-醋酸,20mM醋酸钠,1mMEDTA,1%SDS,pH7.8)混匀,置于37oC水浴1hr。C.然后加入200ul5mol/L的氯化钠溶液,混匀后于13000rpm离心15min。D.取上清液,用苯酚抽提2次,氯仿抽提1次。E.加两倍体积无水乙醇 ...

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师兄精选:核酸实验版块 牛帖汇总

师兄精选:核酸实验板块 牛贴汇总,标题: 【交流】有求必应----DNA克隆URL: http://www.dxy.cn/bbs/post/view?bid=64&id=13864679点击: 4175作者: dnaworm发帖时间: 2009-02-09 15:07:49标题: 【原创】RNA抽提细节系列之四: 解读OD值与RNA纯度的关系URL: http://www.dxy.cn/bbs/post/view?bid=64&id=15495042 ...

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请教blast的一个问题

这是我的引物在ncbi上blast的部分结果,我看不懂。是不是说我的引物和以下的都是同源的?这些都不是同一个基因?也就是说我的这个引物不能用了?:(为什么会有这么多的同源片段那?我想找到全长的基因,这个引物是前面的和后面的一段,我想我都的要,怎么办那?1,Homo sapiens protein translocase, JM26 protein, UDP-galactosetranslocator, pim-2 protooncogene homo ...

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七嘴八舌说二甲双胍

减肥促排卵的作用我只知道用于肥胖型糖尿病,其他还真不知道,学习一下在妇科,我知道了可用于不孕患者,特别是肥胖的多囊卵巢综合征患者,除了改善胰岛素抵抗,还有促排卵的作用作为胰岛素增敏剂的降糖药物二甲双胍具有抗肿瘤的多种生物活性,它能够抑制肿瘤细胞的增殖、促进凋亡、增强肿瘤对化疗药物的敏感性、并且能逆转部分肿瘤细胞对化疗药物的耐药性、甚至还能抑制肿瘤新生血管的生成对二甲双胍在AD-T2DM中的作用感兴趣 老年人使用二 ...

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【共享】大量质粒抽提 给像我一样在穷实验室工作的新手

质粒DNA的大量提取和纯化  在制作酶谱、测定序列、制备探针等实验中需要高纯度、高浓度的质粒DNA,为此需要大量提取质粒DNA。大量提取的质粒DNA一般需进一步纯化,常用柱层析法和氯化绝梯度离心法。(一)、碱法  1、取培养至对数生长后期的含质粒的细菌培养液400ml,4℃下5000转离心15分钟,弃上清,将离心管倒置使上清液全部流尽。2、称重一般为3-4g.  2、将细菌沉淀物重新悬浮于4ml/1g溶液I中,充分悬浮菌体细胞。(该步骤很 ...

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【资源】DNA 纯化的问题及解决(很不错的)

DNA PurificationSibylle Herzer内容:What Criteria Could You Consider When Selecting aPurification Strategy? . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 168How Much Purity Does Your Application Require?. . . . . . . . 168How Much Nucleic Acid Can Be Produced from a GivenAmount of Starting Material? . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 168Do You Require High Molecular Wei ...

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【公告】国庆7天乐,积分多多,奖励多多,在本版参与过讨论并得分的战友请进

国庆七天乐,积分多多,奖励多多【公告/领奖】在本版参与过讨论并得分的战友请进为感谢各位战友长期以来对核酸版的支持,将给予额外的积分奖励,以表心意,祝大家国庆快乐。条件:在任意连续的30天、60天、90天...内在本版得分≧5、10、15...的战友请跟帖领取 “奖金”(加1、2、3、4、5分,最多5分),此外,如果国庆期间(2008.10.01开始-2008.10.08上午截止)在本版得分超过3分的(本次活动奖金除外),可以再跟帖加1分。如某 ...

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转染步骤

Procedure for Transfection of Mammalian CellsMaterials:LipofectamineIMDM containing 10% fetal bovine serum, 1% glutamine, 1% aaIMDM containing 1% glutamineIMDM containing 20% fetal bovine serum, 1% glutamine, 1% aa(1)In a six-well or 35 mm tissue culture plate, seed ~2x 105 cells per well ...

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【共享】提供实验录像链接

虽然是老东东了,虽然too old,但是我加上了我自己的整理:)http://www.postharvest.net.cn/films/UploadPhotos/molecular/在膜上杂交.rm http://www.postharvest.net.cn/films/UploadPhotos/molecular/用磁珠法从总RNA中分离mRNA的原理.rm http://www.postharvest.net.cn/films/Uploa ...

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染色质结构与基因表达调控

主题:染色质结构与基因表达调控胡建广 杨金水Chromatin Structure and Gene ExpressionHU Jian-Guang YANG Jin-Shui(Institute of Genetics, Fudan University, Shanghai 200433)  真核细胞中DNA与蛋白质结合形成染色质和染色体是生物进化的必然结果〔1〕。  核小体(Nucleosome)是染色质的基本结构单位,其为长度约160bp的DNA绕由H2A, H2B, H3和H4 ...

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【专题讨论】外源DNA和质粒载体的连接反应

a.将0.1μl载体DNA转移到无菌微量离心管中,加等摩尔量的外源DNA。b.加水至7.5μl,于45℃加温5分钟以使重新退炎的粘端解链,将混合物冷却到0℃。c.加入:10xT4噬菌体DNA连接酶缓冲液 1μlT4噬菌体NDA连接酶 0.1Weiss单位5mmol/L ATP 1μl于16℃温育1-4小时10xT4噬菌体DNA连接酶缓冲液200mmol/L同Tris.Cl(pH7.6)50mmol/K MgCl250mmol/L二硫苏糖醇5 ...

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玻璃奶制作方法

想提取芽孢核酸,用玻璃粉法。sigma的玻璃珠(425-600nm的)我买了,但是在溶液中总是很快沉淀,很难悬浮在液体中用来吸附核酸。因此我觉得文中所述玻璃粉应该是更微小的玻璃颗粒,配成的“玻璃悬液”或者有人称做的“玻璃奶”,但是不知道哪儿有卖的,请大家帮帮忙,非常感谢。从土壤中提取细菌和芽孢核酸用于PCR的研究王津 宋亚军 等军事医学科学院徽生物流行病研究所,北京100071 国家生物医学分析中心分析微生物实验室,北京100 ...

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【转帖】质粒提取的原理

质粒提取的原理http://www.bioon.com 生 物 谷 网 站碱裂解法从大肠杆菌制备质粒,是从事分子生物学研究的实验室每天都要用的常规技术。可是我收研究生十几年了,几乎毫无例外的是我那些给人感觉什么都知道的优秀学生却对碱法质粒抽提的原理知之甚少。追其原因,我想大概是因为《分子克隆》里面只讲实验操作步骤,而没有对原理进行详细的论述。这是导致我的学生误入歧途的主要原因。后来我发现其实是整个中国的相关领域的研究生水平都差不多, ...

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