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反向聚合酶链反应技术

    我们描述一种大聚合酶链反应(PCR)应用的方法,使在已知序列的核心区边侧的未知 DNA成几何级数扩增。用适当的限制性内切裂解含核心区的DNA,以产生适合于PCR扩 增大小的片段,然后片段的末端再连接形成环状分子。PCR的引物同源于环上核心区 的末端序列,但其方向性,使链的延长经过环上的未知区而不是分开引物的核心区。 这种反向PCR方法可用于扩增本来就在核心区旁边的序列,还可应用于制备未知 ...

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固相杂交反应的特点、问题及解决办法

   杂交反应的条件类似于传统的Southern或Northern杂交。具体的选择视研究目的而定,例如,进行多态性分析或杂交测序时,要求能够区分单个碱基的变异,所以需要较高的杂交严谨性;而用于表达谱检测的芯片为了提高检测的特异性、保证较高的灵敏度,需要较长的杂交时间,高的严谨性、高的样品浓度、较低的杂交温度等。同时,杂交反应还必需考虑反应液中的盐浓度、探针序列的G+C含量、探针所带电荷情况、探针与 ...

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RNA实验方法

Solublization of RNA in Formamidecontributed by James McCaughern-Carucci Yale University Resuspending RNA in Formamide (as reported by Chomczynski et al. Nucleic Acids Research) has several benefits o ...

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细菌培养基

Preparation of LB Plate (Dr. Chastain)prepare LB plate with or without antibiotics Bacterial Culture Media Recipes (WUGSC) M9 Plate Supplement (Gottschling Lab) Bacterial Media Solutions and Stock ...

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细菌的核酸抽提

DNA Extraction・ DNA Extraction from Bacteria (Julie B. WolfUMBC)Phenol/chloroform method ・ DNA Extraction From Bacteria (Triton Method) (NWFSC)Isolation of Chromosomal DNA from Bacteri ...

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细菌人工染色体

The Construction of Bacterial Artificial Chromosome (BAC) Libraries (complete manuscript) (Clemson University Genomics Institute) Construction of BAC Library (Caltech)Guideline for BAC library prepa ...

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噬粒(phagemid)

Phagemid Related Protocol (Erik)provides procedures for phagemid lysate preparation titering phagemid determining uracil incorperation and SS DNA preparation Preparation of Single-stranded DNA (OGM ...

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M13噬菌体

・ M13 Phage (Michael Blaber)Very useful background information about M13: its infection replication packing cloning. If you are new to phage culture it will be great beneficial to read this.・ ...

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蛋白质制备

Preparation of HeLa Nuclear Extract (John Garland) ・ Extract Preparation (Brent Graveley)Preparation of nuclear extract and cytoplasmic extract ...

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EMSA实验问题与解答

以下问题是以Promega公司试剂盒为例。凝胶迁移实验1)什么是凝胶迁移或电泳迁移率实验?凝胶迁移或电泳迁移率实验(EMSA)是一种研究DNA结合蛋白和其相关的DNA结合序列相互作用的技术,可用于定性和定量分析。这一技术最初用于研究DNA结合蛋白,目前已用于研究RNA结合蛋白和特定的RNA序列的相互作用。通常将纯化的蛋白和细胞粗提液和32P同位素标记的DNA或RNA探针一同保温,在非变性的聚丙烯凝 ...

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引物延伸实验问题与解答

1)什么是引物延伸实验?引物延伸实验用于定量mRNA的量,测定低丰度的mRNA的种类。另外引物延伸实验可标定转录产物的5`-端, 确定转录的精确起始。特异的末端标记的引物退火到RNA链的互补区域, 随后用RNA作为模板,用反转录酶延伸引物得到cDNA,用变性聚丙烯酰胺凝胶电泳分析cDNA。cDNA的长度为引物的标记的核苷酸到RNA-5`末端间的碱基数,所得cDNA的量和目的RNA的起始量成正比。理 ...

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TNT偶联网织红细胞裂解物系统问题与解答

1)什么是TNT偶联网织红细胞裂解物系统?TNT偶联网织红细胞裂解物系统为研究人员提供了一种可供选择的真核体外翻译系统,一种单管、偶联转录/翻译系统。将转录产物掺入到翻译混合物中,TNT偶联网织红细胞裂解物系统简化了体外翻译的过程,缩短了翻译所需的时间。标准兔网织红细胞裂解物翻译系统所用的RNA来源于用SP6、T3、T7RNA聚合酶启动子在体外合成的转录产物,需要3次分开的反应,每1个反应间需要多 ...

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质粒提取实验方法

导论质粒DNA的小量制备质粒DNA的大量制备质粒DNA的纯化一、导论   已经提出过许多方法用于从细菌中提纯质粒DNA, 这些方法都含有以下3个步骤:细菌培养物的生长。细菌的收获和裂解质粒DNA的纯化。 (一)细菌培养物的生长   从琼脂平板上挑取一个单菌落,接种到培养物中(有含有行当抗生素的液体培养基中生长),然后从中纯化质粒,质粒的提纯几乎总是如此。现在使用的许多质粒载体(如pUC系列)都 ...

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石蜡包埋组织DNA提取的基本方法

石蜡包埋组织的DNA提取蜡包埋组织DNA提取的基本方法影响DNA提取质量的因素提高DNA提取质量的方法  近10年来,现代分子生物学技术越来越广泛地被用于人类疾病研究的诸领域,为了解病理状态下基因组DNA的变化积累了新资料。目前认为,人类基因组并非人们想像的那样稳定,诸如基因重排、扩增、缺失,突瘘和DNA甲基化类型改变等时有发生,这些改变对于基因表过和调控,以及疾病过程的发展与转归等方面均具有重要 ...

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质粒载体连接反应

连接反应(一)外源DNA和质粒载体的连接反应  外源DNA片段和线状质粒载体的连接,也就是在双链DNA5'磷酸和相邻的3'羟基之间 形成的新的共价链。如质粒载体的两条链都带5'磷酸,可生成4个新的磷酸二酯链。但如果质粒DNA已去磷酸化,则吸能形成2个新的磷酸二酯链。在这种情况下产生的两个杂交体分子带有2个单链切口,当杂本导入感受态细胞后可被修复。相邻的5'磷酸和3'羟基间磷酸二酯键的形成可在体外由 ...

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包涵体表达的蛋白的复性

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组织和细胞RNA的制备

一、 组织和细胞总RNA提取:异硫氰酸胍法(一)试剂准备 1.CSB缓冲液:42mM柠檬酸钠;0.83% N-lauryl sarcosine(十二烷基,N甲基甘氨酸钠);0.2 mM β-巯基乙醇。 2.变性液:异硫氰酸胍(终浓度 4 M)25g、CSB缓冲液 33ml,混合直至完全溶解,可在65℃助溶。4℃保存备用。 3.2 M乙酸钠:pH 4.0。 4.异丙醇 5.无水乙醇、70%乙醇 6. ...

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Western免疫印迹

Western免疫印迹(Western Blot)是将蛋白质转移到膜上,然后利用抗体进行检测。对已知表达蛋白,可用相应抗体作为一抗进行检测,对新基因的表达产物,可通过融合部分的抗体检测。一、原理 与Southern或Northern杂交方法类似,但Western Blot采用的是聚丙烯酰胺凝胶电泳,被检测物是蛋白质,“探针”是抗体,“显色”用标记的二抗。经过PAGE分离的蛋白质样品,转移到 ...

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原位杂交

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分子生物学实验基础

分子生物学是在生物化学基础上发展起来的,以研究核酸和蛋白质结构、功能等生命本质的学科,在核酸、蛋白质分子水平研究发病、诊断、治疗和预后的机制。其中基因工程(基因技术,基因重组)是目前分子生物学研究热点,这些技术可以改造或扩增基因和基因产物,使微量的研究对象达到分析水平,是研究基因调控和表达的方法,也是分子水平研究疾病发生机制、基因诊断和基因治疗的方法。转化(transformation)、转染、转 ...

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