DNA实验技术

腺病毒（adenovirus，Ad）最初由W. P. ROWE等人在人腺样体中分离得到并命名，这是一种直径为70-100nm、无包膜的双链DNA病毒。目前已知的人腺病毒血清型有50多种。其中基于人腺病毒5型（Ad5）改造的载体使用较为广泛，其特点是人为地删除了E1和E3基因，导致腺病毒失去复制能力和一定程度上降低免疫原性，使得Ad5成为一种广泛、安全、有效的基因运输载体。根据重组腺病毒的特点，我们继续了解腺病毒在不同领域中 ...

虽然单细胞测序到现在已经应用到各个研究领域，但是实际的实验过程中依然会遇到很多问题，比如：1.很多样本根本没有办法制备单细胞悬液，比如已经在-80℃冻存的样本；2.有些样本制备成单细胞悬液以后现有的单细胞测序平台无法捕获，比如心肌细胞、骨骼肌细胞、成熟的脂肪细胞等，由于直径过大，超出了10x genomics和BD Rhapsody平台最大能捕获的细胞直径；3.再者有些细胞类型可能在单细胞悬液制备的过程中丢失，比如脑部的 ...

很多老师关心自己研究的某些关键基因上是否有目的蛋白结合或者是否有组蛋白修饰，别着急，小编今天有备而来，就给大家讲这个。 reads在Peak关联基因上的分布图，是选取筛选到Peak的基因，进行作图，展示比对到该基因的reads的覆盖深度分布，通俗的说，就是该基因上目的蛋白的结合分布，横坐标显示基因位置，纵坐标表示reads数（reads count）。这是项目KC2018-CXX，植物某转录因子ChIP测序的一张read ...

ChIP测序结果图怎么用来发文章ChIP测序中关键的结果图，这些结果即体现了ChIP实验和测序的成功，可以帮助我们了解目的蛋白的结合甚至调控特征，都是撰写文章可以利用的极佳素材。说了这么多好像还是不太会用，没关系，我们结合发表的文章，让它们一较高下。1. Peak在TSS上下游的分布图这张图实际包括两部分，上部整体展示了基因转录起始位点（TSS）及上下游的input和IP的reads的覆盖深度分布，可以看出结合峰 ...

Peak在TSS上下游的分布图是ChIP测序中非常关键的一张图。有这张图，我们就能知道目的蛋白（组蛋白或转录因子）在转录起始位点（TSS）及上下游附近的整体分布/结合情况。图中横坐标为基因位置，纵坐标为reads的覆盖深度，它可以反映目的蛋白分布情况。input由于没有富集，其reads通常分布较低，而IP对目的蛋白及其结合序列的富集作用则会使reads覆盖深度提高，产生相应的结合峰。TSS上下游通常是组蛋白和 ...

ChIP测序小编分享对于ChIP-seq的测序小问题如下： 1、ChIP-Seq 有什么样品要求？1） 请供给浓度≥10 ng/ul、总量≥20 ng、OD260/280 为1.8~2.2 的DNA 样品；若单次ChIP 后DNA 量不够，主张将2~3 次ChIP 的DNA 兼并在一起。2）请供给DNA 打断时检测胶图，要求打断后DNA 电泳主带在100-500bp 规模内；请对于ChIP 获得 DNA 规划引物进行QPCR 验证和定量，能够供给检测位点的检测报告，附阳性和阴性对照。3）样品请置于1.5 ml ...

【实验案例】动物基因组试剂盒提取全血基因组使用动物基因组提取试剂盒,从冻存的全血样本中快速分离出基因组DNA。【样品】冻存的全血样本【样品准备】将冻存的血液样品充分融化后混匀。【操作步骤】1.活化硅胶膜将吸附柱放入收集管中，加入250 ul Buffer BL，12,000 g离心1 min，活化硅胶膜。2.样品消化(1)取20 ul Proteinase K至1.5 ml离心管底部，然后加入200 ul充分混匀的全血样品，涡旋振荡10 s。(2)加入200 ul Buf ...

光遗传学（optogenetics）是结合了光学（optics）及遗传学（genetics）的技术，借助其，我们能在活体动物甚至是自由运动的动物脑内、脊髓、外周神经内，精准地控制特定种类神经元的活动。光遗传学在时间上的精确度可达到毫秒级别，在空间上的精确度则能达到单个细胞级别。2010年，光遗传学被Nature Methods选为年度方法，同年被Science认为是近十年来的突破之一。这项技术目前在神经科学领域应用非 ...

化学遗传学技术（或称药理遗传学技术）是近年来与光遗传学一起出现的重要新技术。该技术通过对一些生物大分子实行改造，使其能和先前无法识别的小分子进行相互作用，从而达到可控、可逆（可以随时加入或除去化合物，从而启动或中断特定的反应）控制生物大分子的活性，该技术已经在信号转导、药物开发、功能基因组学等方面的研究中得到了广泛的应用。他们被广泛用于以细胞特异性、无创地增强或抑制神经元的活动。虽然DREADD缺乏像光遗传学那 ...

成像技术（Imaging）一、钙离子成像技术（Calcium imaging）钙离子成像技术（Calcium imaging）是指利用钙离子指示剂监测组织内钙离子浓度的方法。在神经系统研究中，我们常用钙离子成像技术监测神经元内钙离子的变化，提示神经元活动。有了钙成像技术，原本悄无声息的电生理活动就变成了一幅形象地、斑斓闪烁的壮观影像，研究人员可以同时大量追踪神经元活动，研究其关系，因而被全世界神经科学家们追捧。1）钙离子成 ...

神经元之间的环路连接非常复杂，完整而准确地显示这些环路的结构和变化，对揭示许多疾病的病因和新治疗方法的开发具有非常重要的意义。传统的神经示踪方法如电镜、Golgi染色、染料、肽类标记物等可以显示神经元的形态和投射，少数示踪剂如WGA、TTC等还可以实现跨突触标记，但这些方法都具有信号间接、方向不特异、跨突触后信号衰减严重等缺点，最重要的是，这些染料无法携带基因，因此只能显色。自20世纪80年代，Kristenss ...

病毒是由核酸分子（RNA 或 DNA）和 / 或蛋白质组成的非细胞形态，这是一种无法独立生长的生命体，其复制过程必须通过感染宿主细胞，将遗传物质导入宿主细胞，并依靠宿主细胞进行复制，组装成病毒颗粒。对病毒的研究可以分为「抗病毒」和「利用病毒」两种思路，而病毒载体正是「利用病毒」的思路。二十世纪七十年代，分子生物学家 Paul Berg 利用病毒的这一特性，改造 SV40 病毒感染猴子肾脏的培养细胞，做成第一个病毒载体。后来，科学家们开始从利用自然界中存 ...

研究简介噬菌体是迄今为止所研究的所有微生物群落中大量的成员，通过与其细菌宿主的相互作用影响微生物群落。尽管噬菌体在功能上很重要，而且无处不在，但与细菌相比，它们在城市环境中的探索还不够充分。废水是微生物生命的丰富来源，含有细菌、病毒和其他微生物，这些微生物存在于人类排泄物和环境径流源中。2020年6月16日，纽约大学基因组学与系统生物学中心E. Ghedin研究团队在mSystems发表了题为Initial Mapp ...

CST TECH TIPS 系列课程，欢迎关注「CST博士互助平台」ChIP实验中，交联或固定是实验的第一步。您知道合适的交联时间是多长吗？快点击观看 Cell Signaling Technology（CST） ChIP 团队Fang Chen 博士的讲解。点击看视频交联是防止 DNA在 3 天的 ChIP 实验中从蛋白上脱落。否则，抗体只能让靶蛋白沉淀，而不能让 DNA 沉淀。交联对转录因子和辅因子尤为重要，因为与组蛋白相比，它们的丰度更低，与 DNA 的结合更弱。此外，与培养的细胞相 ...

药物及其代谢物可以在用药者的尿液中被检测到，所以用药者的尿液经常被作为检测样本用来判别是否存在滥用药物行为或检测药物代谢情况。目前，临床及毒理实验室对尿液中药物及其代谢物的检测方法主要有气相色谱法（GC）、液相色谱法（HPLC）、气相色谱质谱法（GC-MS）、液相色谱质谱法（LC-MS）等，这些检测方法通常需要对尿液中药物或其代谢物进行提取处理，主要的提取处理方法有：液液萃取法（LLE），固相萃取法（SPE），固相微萃取法 ...

第 1 步：从包装中取出粪便收集器，并从两侧剥离粘合贴第 2 步：将粪便收集器放在马桶座圈上，用力按压粘合贴以固定。第 3 步：将样品存放到粪便收集器上第 4 步：拧开收集管盖，并用勺子收集一勺样品注意：不要倒掉液体保护剂第 5 步：拧紧瓶盖。反复颠倒摇晃 10 次以上以确保护剂和样品完全混合。样品已采集处理好，准备运输吧！ZymoBIOMICS 工作流程受到微生物群落的影响可能是一场噩梦，收集和分析会给您的个人资料分析带来混乱和不实陈述，但是 ZymoBIOMICS 可 ...

第 1 步：打开包含唾液收集管和 Shield 试剂的包装第 2 步：请将唾液充满至 2 ml 左右的标准线第 3 步：打开 DNA / RNA Shield 管，然后把保护剂倒入刚刚承载样品的收集管中。第 4 步：然后拧掉 V 字漏斗，拧上新盖第 5 步：倒置 5 - 10 次样品已稳定，可以运输，可以用于核酸存储或纯化！ZymoBIOMICS 工作流程受到微生物群落的影响可能是一场噩梦，收集和分析会给您的个人资料分析带来混乱和不实陈述，但是 ZymoBIOMICS 可以消除工作流程中的不变，您可以准确地分析微生物群落，验 ...

第 1 步：打开包含棉签和收集管的包装。第 2 步：剥开棉签包装并取出棉签第 3 步：擦拭口腔上下牙龈来回 3 次。第 4 步：打开收集管，然后将棉签插入保护剂并折断，拧好盖子。样品已稳定，可以运输，可以用于核酸存储或纯化！ZymoBIOMICS 工作流程受到微生物群落的影响可能是一场噩梦，收集和分析会给您的个人资料分析带来混乱和不实陈述，但是 ZymoBIOMICS 可以消除工作流程中的不变，您可以准确地分析微生物群落，验证工作流程的准确性及质量，比较您的结果，以 ...

核型分析简介染色体是细胞分裂期高度凝集的 DNA 蛋白质纤维，是间期染色质结构紧密盘绕折叠的结果。核型是指一个体细胞内的全部染色体按其大小、形态特征排列起来构成的图像。将待检细胞进行染色体数目、形态结构分析，确定其核型是否与正常核型一致，称为核型分析。染色体核型分析，是遗传学科学研究和辅助临床诊断的重要手段之一，是分析染色体易位、缺失，诊断各种遗传病变的关键指标。染色体核型分析实验是选择增殖旺盛期的细胞进行秋水仙素处理 ...

第1代测序技术——荧光标记的Sanger法在第一台全自动测序仪出现之前，使用最为广泛的测序方法就是 Sanger 在 20 世纪 70 年代中期发明的末端终止法测序技术。 Sanger 也因此获得 1980年的诺贝尔化学奖。 他的发明第一次为科研人员开启了深入研究生命遗传密码的大门。G1.1 最早版本的第1代测序仪是20世纪80年代中期在CalTech的LeroyHood实验室发明的。这一测序仪通过修改Sanger法得以实现。最关键的改变是采用具有 ...