今天一起来欣赏美国实验生物学会联合会(Federation of American Societies for Experimental Biology,FASEB)评选出的 2015 年度生物艺术获奖作品。看完这些作品,你一定会觉得科研并非都是枯燥,也能开出花来。咋一看以为是画家的染料弄散了,其实这是胰腺癌模型中不同荧光色彩的小鼠细胞,用到了一些技术叫碎花式的荧光标记技术。干啥用呢?当然是监测胰腺癌细胞的发生和发展。面条?棉线?都是不是。这 ...
2016 年 6 月 8 日,ASM(美国微生物学会的简称)别出心裁地举办了首届微生物培养皿艺术大赛,吸引了全世界的微生物学家和艺术家竞相参与,并角逐出了冠亚季军和公众选择大奖。冠军红色的菌落是金黄色葡萄球菌(培养基加了选择性显色的成分,所以不呈金黄色),绿色的是木糖葡萄球菌,黄色来自谷氨酸棒状杆菌,白色的是猪葡萄球菌。亚军这里用到的是过氧化氢酶阳性的 MRSA(耐甲氧西林的金黄色葡萄球菌)。细菌的菌落构成了酒杯的图案,啤酒泡沫则是过氧 ...
说起看文献,我发现一开始是看不懂,后来逼着自己看,慢慢地能看懂了有点沾沾自喜。再后来看得多了,发现又看不懂了。原本我以为是不是我特别笨,是不是就是我是这样的,还不敢问别人。最近,《科学》杂志采访了一些学者,主要是针对如何认真阅读文献的。从中我发现学术大牛对许多文献理解也有困难,也是感觉自己越来越愚蠢。原来这是科学家的流行病。为此我特地编译出来,分享给大家。1、读文献难得很Adam Ruben 分享亲身体会我记得我第一次看这些 ...
随着高通量检测技术的飞速发展,GEO、TCGA 等数据库中积累了大量基因数据,单看 GCBI 的统计结果,目前有 2 400 多万篇文献,120 多万份基因大数据,8 万多份肿瘤样本数据。在这些公共数据中,包含了高通量数据、文献资源、实验背景信息、病理信息和预后信息,在这些信息中蕴含大量的宝贵信息。今天就和大家分享一下如何利用公共数据帮助课题设计及申请,发现更多研究思路。这就涉及到了两个核心问题:怎样找到有价值的数据?怎么用这些数据?先说如何找数 ...
某天,Boss 说:某某,把这份文件打成 Word。然后,有的同学可能会拿起纸质稿打开 Word 开始「啪啪」打字......那么,是否有更快捷的方法呢?答案是有的。这时候,我们需要利用 OCR(光学字符识别),具体的方法有很多,此处介绍三种。假设我们需要将以下图片转成文字:然后,我们逐一介绍这三种方法:1、Office 工具对于安装了 Office 2003 的同学们,可以使用其中的 Microsoft Office Document Imaging 功能。第一步,我们使用 Mic ...
今天在网上看到一个问题,有人问:都说有些动物因为人类的口腹之欲而灭绝了,但思来想去也想不出来到底是什么动物,真的有动物是被人吃灭绝的吗?看到这个题目,心里真堵。多少动物都被吃的满门抄斩,结果大家心里还没什么印象。其实绝大多数人都对我们给自然界带来的破坏没有清晰地认识,更无从谈悔改之心。这是教育的失败,是环保宣传工作的失败。现在也有野生救援还有 WWF 这些组织在各种媒体投放动物保护类的广告,比如「没有买卖就没有杀害」、「犀 ...
各位科研汪们是不是都遇到过这种情况——在 pubmed 上检索出结果后,想看看这些文章的影响因子,却发现 pubmed 上直接看不到。这时候我们或许会利用 med-sci 影响因子查询系统查该期刊的影响因子,还可以在 NoteExpress 的题录里查看某文章所在期刊的影响因子。但是能不能直接在 Pubmed 检索的时候就直接看到影响因子呢?那样是不是会方便很多,今天我就给大家介绍一种可以直接在 pubmed 里查看影响因子的方法。Step 1打开 lantern ...
博士论文是憋出来的,说这句话的人是我十几年前的一个朋友。当时我还在读硕士,有一段时间我在他们学校做实验,和我这朋友住一个宿舍。我这哥们跟我年龄相仿,硕博连读。他的研究方向偏理论,需要推导很多公式。我白天泡在实验室,他一天到晚不出宿舍,推导公式,编程序。晚上睡觉的时候,我们也经常聊一聊,交流一下学习心得。我问他研究进展如何,他说还可以,但推导公式经常卡壳,很郁闷。我问他遇到这种情况,怎么解决?这么天天憋在宿舍里,也不是个 ...
好多年不写经验分享了,今天大师兄邀请自己的好友——Summer 同学,让他跟大家分享下自己的制图经验吧(Professional 的学术交流)。OK,现在开始。很多兔子们虾米们可能都是直接用 Excel 来制作论文图表,就像下面这样:实际上这样的做法并不正确。一般黑白图片的出版要求是 1000 dpi,这样的方式得到的图片是远远不符合要求的。因为,印刷出来后会灰常模糊。正确的做法是需要先安装 Adobe Acrobat 后,选中图表后使用「打印」功能, ...
今天给大家介绍一种简单快速的基因芯片数据分析网站。GCBI 基因云平台(www.gcbi.com.cn),可以让科研人员及医生低门槛并且快速的使用生物信息学进行基因相关的研究。分析思路先以表达谱数据为例介绍基本的分析思路:1. 差异基因筛选:对实验组和对照组进行差异基因筛选,筛选出与实验因素(可以是疾病、干扰或过表达等)相关的差异表达基因。2. 差异基因功能与通路分析:对差异基因基于 GeneOntology 和 KEGG 数据库进行显著性功 ...
接上期,本周让我们一同看看,国际上学术又出现了哪些好玩的新技术。当被插管的小丁丁发炎了怎么办?在临床上,被插管的小丁丁发炎是常有的事,因此导尿管表面生物膜感染是医院感染中最常见的感染类型。虽然以前有一些关于导尿管发炎的动物模型,但是随着时代的发展,以前的经验方法在现在好些已经不灵了。因此,我们法国巴斯德研究所的 Ashwini Chauhan 同学提出了一种具有的高度可重复性的新方法,具体是啥,赶紧去师兄的小伙伴生物菌同 ...
一般而言,我们拟合ELISA标准曲线选用比较经典的Curve Expert 1.3或者Curve Expert 1.4软件。现在我们以Curve Expert 1.4为例,对ELISA标准曲线绘制方法进行详述。1. 点击Curve Expert 1.4,打开应用程序,截图界面如下:2.在X轴输入标准品的OD值,Y轴输入相应的标准品的浓度,截图界面如下:3. 单击上图界面中的 图标,出现如下界面4. 单击上图界面中的ALL OFF 按钮,出现如下界面5. 我们选择Sigmoid ...
今天将和大家介绍绘制 G 蛋白受体介导的信号转导通路,使得最终的效果如下图所示:Figure 1. G 蛋白偶联受体介导的信号转导通路(示意图)绘图思路绘制示意图,常用的软件有 PowerPoint 和 Illustrator,现在我们先将 Figure 1 的示意图拆解成单个元素,来比较一下两款软件的优缺点。此外,在绘制示意图方面,Illustrator 的主要优点是功能齐全,而 PowerPoint 的主要优点则是上手容易。本讲,我们使用 Illustrator 来绘制 ...
染色质免疫共沉淀(Chromatin immunoprecipitation,ChIP)是一种用于研究目的蛋白在染色质上定位的技术。ChIP 的原理是通过甲醛处理细胞固定 DNA 和蛋白,然后提取染色质,使用超声或酶解将染色质剪切成小片段。之后使用结合在染色质的目的蛋白或组蛋白修饰特异性抗体富集 DNA 片段。富集的 DNA 片段可以通过 PCR,DNA 芯片或测序进行分析。虽然原理看起来很简单,但 ChIP 是一项非常具有挑战的技术,很多因素都可能导致实 ...
经季老师推荐,看到了下面这样的通知。作为一个从事这么多年正宗科研的人来说,其实对如何做好科研已经有自己的判断。但是这个王博士,是搞临床的,并且发了我们也梦寐以求的文章。我的心为之一动,那就去听听吧。听了一下这个王博士的简介,算起来应该和我差不多年龄,真要算,我的同学,年龄相仿的师兄师姐如今也是遍布国内外名校,几乎也都发过牛文。并且很多也回到国内重点院校担任教师。所以从我的角度看,他所讲的似乎和我已知的并无差异,也可 ...
文献综述是在对某研究领域近期公开发表的文献进行广泛阅读和理解的基础上,对该领域研究成果的提炼、综合和思考,阐明其研究进展,揭示其发展趋势。文献综述首先是对学术观点和理论方法的整理,其次是对现有的文献进行评价和分析,再次是对该研究的未来提出建议或展望。所以综述的写作是总结该方向前人已经做了的科研状况,了解目前的研究动态,分析存在问题及其原因,指出今后的研究问题和发展方向,列出该方向代表性的参考文献,为进行该领域 ...
我养细胞有 8 年历史了,现在我的细胞已成为大家参观和崇拜、学习的对象。好的经验要分享,这就将我这几年来养细胞的经历和感想跟大家交流一下。启蒙老师的重要性一般进实验室都有师兄师姐带着做,他们就是你做细胞的启蒙老师。他们的操作手法、细节、理论讲解就成了你操作的准则,如营养液、细胞瓶的摆放位置;灭菌处理程序;开盖手法;细胞吹打手法等等。要学会他们的正确操作,在第一次的时候就要重视。像养孩子一样养细胞细胞真的很脆弱,最好每天都去 ...
每次看到顶级期刊的封面文章的 Cover image 含有中国元素,就很兴奋,尤其是中国科学家本土做出并发表的,这些都能给予我们很大的激励和爱国情怀。所以我整理了以前看过的含有中国元素的发表在国际顶级期刊 Cell 、国际干细胞研究领域顶级期刊 Cell Stem Cell 及国际癌症研究领域顶级期刊 Cancer Cell 杂志上的封面文章,具体如下:1.Cell 封面之中国山水图2015 年 12 月 17 日,Cell 杂志以封面文章的形式报道了北京大学邓宏魁和赵扬研究组的 ...
明天就是 3.15 了,我掐指一算,届时我们又将发现更多诸如某某地沟油、毒大米等劣质品。果然还是吃货的力量更强大,科研狗再次被忽视了。你是不是很少发现有假试剂被大范围曝光呢?这样的假试剂,其实是不是很多呢?是不是害惨了我们呢?这是一个悲伤的故事为此我差点毕不了业刚进实验室的时候,那时还很单纯,总想着老板的钱也是守了 10 年发酵罐得来的,所以能省则省,虽然实验室不差钱。我做的是分子实验,其实对聚合酶的要求挺高的。实验室里的师兄师姐 ...
Nature 3 月 3 日这期文章中报道了一款动物实验研究设计校验工具(EDA, Experimental Design Assistant)。它能帮你干嘛呢?●创建实验流程图●准确算出样本量●发现你实验设计中的缺陷●给出实验设计优化建议软件的发明研究者 Nathalie Percie Du Sert 是一位实验设计专业人员,她指出,以往研究者们都是到了论文评审阶段,才被审稿人挑出实验设计方面的问题,然而这对研究人员来说,为时已晚。她发明这个工具,就是为了帮 ...

